大肠杆菌表达重组蛋白的超声破碎及纯化一可溶性蛋白的纯化(一)菌体的破碎1.仪器与材料:-80℃冰箱;超声波细胞破碎仪;50mMPBS或50mMTris-HClpH7.5;50ml离心管;冷冻高速离心机2.方法2.1反复冻融2.1.1收集菌液500ml,等分10份,4000r/min4℃离心15min,弃上清。2.1.2菌体沉淀中加入相同菌液体积的50mMPBS或50mMTris-HCl(选择使蛋白稳定的缓冲液和pH)重悬洗涤一次。2.1.3然后按原菌液体积的1/4加入缓冲液重悬菌体,并加入蛋白酶抑制剂PMSF和EDTA(带His标签不加),PMSF终浓度为100μg/ml,EDTA的终浓度为。取20μl重悬菌液进行电泳,检测蛋白表达的情况(是否表达,是可溶性表达还是包涵体表达)。2.1.4将菌液(经检测有表达)在-80度冰冻,室温融解,反复几次(反复冻融三次),由于细胞内冰粒形成和剩余细胞液的盐浓度增高引起溶胀,使细胞结构破碎。2.2超声波处理(对超声波及热敏感的蛋白慎用)2.2.1将反复冻融的菌液(必要时可加入1mg/ml溶菌酶,缓冲液pH>8.0,加入后需静置20min),进行超声破碎,超声条件:400W,工作5秒,间隔5秒,重复一定次数,(根据我们的仪器找出一个比较好的工作条件)。直至菌体溶液变清澈为止,大约花费时间。2.2.2取少量经超声破碎后的菌液,10000rpm离心10分钟,分别对上清和沉淀进行检测,并用全菌作为阳性对照,检测菌体破碎程度及目标条带占总蛋白的含量。注意事项:(1)超声破碎具体条件可根据实验情况而定,要掌握好功率和每次超声时间,降低蛋白被降解的可能。(2)功率大时,每次超声时间可缩短,不能让温度升高,应保持在4度左右,超声时保持冰浴。(3)菌体破碎后总蛋白浓度的测定可用Bradford法或者紫外吸收法。(4)可通过SDS-PAGE电泳观察菌体破碎程度及目标条带占总蛋白的含量。二包涵体蛋白的纯化1菌体的破碎(加溶菌酶处理包涵体效果可能不好,包涵体中总是有残留的溶菌酶,你看看有没有不加溶菌酶的,这个先保留好了)1.1仪器与材料:超声波细胞破碎仪;20mMPBS或20mMTris-HClpH7.5;裂解液bufferA;溶菌酶10mg/ml;50ml,15ml离心管;冷冻离心机1.2方法(1)收集菌液500ml,等分10份,4000r/min4℃离心15min,弃上清。(2)菌体沉淀中加入相同菌液体积的20mMPBS或20mMTris-HCl(选择使蛋白稳定的缓冲液和pH,一般为7.5-8.0),重悬洗涤2-3次,弃掉上清。(3)然后沉淀按原菌液体积每500ml以15ml预冷的裂解液bufferA重悬。(有的文献为每克湿菌加4ml-10ml裂解液)(4)每毫升悬液中加入100ul10mg/ml溶菌酶(即溶菌酶终浓度1mg/ml)。在冰上孵育15min(5)对15ml悬液进行超声破碎,超声条件:400W,工作5秒,间隔5秒,重复一定次数。超声破碎时保持冰浴。具体条件可根据实验情况而定。(6)4℃,4000rpm/min离心20分钟所得沉淀即为包涵体。注意事项:融合蛋白的分子量如果大于150KD时,用超声波破碎很容易将目标蛋白打碎而造成降解,故可用溶菌酶先做处理.2包涵体的洗涤(1)将包涵体沉淀重悬于含有适量脲(1-4M)的BufferA中,每克湿重加4-6ml洗涤液。(2)超声波处理5秒打碎沉淀,继续用注射器吸入并挤出悬液,重复数次,4℃涡旋悬液30min。或者高速搅拌悬液10min。(3)4℃,4000rpm/min离心15分钟。(4)重复上述操作2次至上清液透明无色。(5)将包涵体沉淀重悬于BufferA,4℃,4000rpm/min离心15分钟,弃掉上清。注意事项:(1)包涵体洗涤时增加NaCl浓度到0.5M,有助于包涵体中杂蛋白的溶解。(2)经提取洗涤后得到的包涵体,由还原SDS-PAGE电泳结合光密度扫描可知包涵体中目标蛋白的含量。(3)包涵体洗涤是纯化极重要的一步,不同培养条件下收集的菌液经洗涤可得到不同的纯度。50mMTris-HClpH8,0.2mMEDTA,100mMNaCl,1%Tritonx-100(或2%脱氧胆酸钠)1mMDTT1mMPMSF10mg/ml大肠杆菌表达重组蛋白的超声破碎及纯化(4)用通常的洗涤方法,如果包涵体达不到所需的纯度,可试用分级沉淀法初纯包涵体,步骤如下:(1)菌体破碎后将所得的包涵体悬浮于含6mol/L盐酸胍的BufferA中,4℃涡旋悬液30min,4000r/min离心20min,上清进行分级沉淀。(2)取一小部分上清用BufferA稀释到盐酸胍浓度为4M,然后4℃涡旋悬液15min,静置30min,4000r/min离心20min,上清继续稀释到3M,重复上面操作一直到2M,把每次沉淀和上清跑SDS-PAGE电泳分析,看目标蛋白在哪个盐酸胍浓度下纯度最高。(3)摸索好条件后,直接将剩余上清直接用BufferA稀释到所需的盐酸胍浓度,然后4℃涡旋悬液15min,静置30min,4000r/min离心20min,沉淀既为分级沉淀后的包涵体。超声破碎在建立表达条件过程中,小量制备样品可用小型超声细胞粉碎仪。离心1.0~1.5ml诱导后的菌液收集菌体,然后视菌体的量加入300~500μl的缓冲液重悬细胞,然后置于冰上超声破碎。因很多实验室有自己的小型超声粉碎器,各个操作不尽相同,具体操作参考仪器说明书。常规操作步骤如下(以100ml培养液为例):(1)100ml诱导后的菌液(OD600=1.2左右),12000rpm,4℃离心2min,收集菌体。(2)加入预冷的缓冲液50ml,重悬细胞洗涤菌体一次,12000rpm,4℃离心2min,收集菌体;常规的操作所使用的缓冲液多为PBS或者Tris-NaCl,针对不同的载体和纯化方法,选择相应的缓冲液。对于一些蛋白酶敏感的目的蛋白,可以在整个操作过程中加入一些蛋白酶抑制剂。(3)向沉淀中加入15ml的缓冲液同上(若菌体太浓,可加倍),充分悬浮,将菌悬液装在一个玻璃小烧杯中,置于冰水混合物中。(4)破碎:将用缓冲液洗涤过的超声探头伸入到菌液中,不要接触烧杯底部,每处理30sec间隔1min使菌液冷却,输出强度为5~6,频率为60~70%。(5)分离上清和沉淀:12000rpm,4℃离心20min,分离上清和沉淀。(6)SDS-PAGE分析蛋白表达情况。(7)准备纯化蛋白。超声破碎注意事项与一些小的改进:(1)破碎完全的判断:超声前菌悬液是浑浊的,超声完全后变的透明、清澈。(2)如果超声时出现黑色沉淀,说明超声功率太强。(3)超声时间太长、功率太高对蛋白活性肯定有影响。(4)尽量防止泡沫的产生。(5)大量破碎时将菌液置于一玻璃器皿中,破碎时放在冰水混合物中,以增加散热,减小对蛋白的破坏作用。(6)破碎前的预处理,在破碎前可用溶菌酶(100μg/ml)处理破环细胞壁(10min,30℃),增加细胞的通透性。