SmartChip超高通量定量PCR系统简介中文

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SmartChip超级通量荧光定量PCR系统SmartChip超级通量荧光定量PCR系统是美国WaferGenBiosystems公司推出的一款高通量、高密度、纳升级别的实时定量PCR系统。该系统包括一台纳升级多样品自动加样器、高密度实时定量PCR仪及分析软件,可广泛应用于基因表达定量、基因分型等研究领域。SmartChipreal-timePCRsystem平台优势:高通量一张SmartChip包含5184个微孔,一次运行可同时完成多达5184个独立的扩增反应。低起始只需500ng总核酸样品,单孔样品用量低至100pg即可完成扩增反应,大量节省样品的投入,尤其是珍贵样品的投入。低成本单个孔反应体积仅100nL,传统QPCR反应体系多为10μL~50μL,比传统QPCR节省试剂、引物用量高达80%以上。周期短平均2小时即可完成40cycle的QPCR反应,大大缩短项目周期,推进项目进展。简单灵活工作流程两种SmartChippanel:PredispenedSmartChipPanel和SmartChipMyDesignChips。PredispenedSmartChipPanel里面已经含有的PCR引物/探针,用户只需要将样品及试剂通过加样器加到芯片中即可;SmartChipMyDesignChips不包含PCR引物/探针,用户自行加入样品、试剂和PCR引物/探针。图1SmartChip实时定量PCR系统在一个整合平台上提供了极佳的灵活性:无论是单个样品成千个位点,多个样品数十个到数百个位点,还是成百个样品多个位点,都可以轻松完成实验。简单的、自动化的,两小时快速流程,准确的、低成本的表达谱及基因分型方案。多种应用SmartChip实时定量PCR系统是一个潜在的多功能技术平台,结合高通量测序技术和深入的信息分析,该平台可以为基因功能、致病机理、环境研究及单细胞分析等提供更广阔的思路。SmartChip实时定量PCR系统:1.SmartChip此芯片是一个包含5184个孔的纳米孔阵列(72×72),每个孔的反应体系为100nL。2.纳升级多样品自动加样器(SmartChipMultisampleNanodispenser,MSND)MSND是一款纳升级自动移液设备,可以将384孔板里的样品或试剂转移至SmartChip中,转移液体体积为纳升级别。3.高密度实时定量PCR(SmartChipcycler)SmartChipcycler是WaferGen推出的一款高密度实时定量PCR仪,用来运行和分析SmartChip中的QPCR反应,两小时即可获得研究人员想要的高质量QPCR扩增数据。SmartChip实时定量PCR系统性能表现:灵敏度10-20copiesofDNA特异性可辨别相似度90%的同源基因精确度重复样品间标准偏差0.2Ct重现性芯片间R20.95或4%CV表1在多个SmartChip实时定量PCR系统中SmartChipMyDesign芯片和predispensedSmartChip基因分型panel均能产生高检出率,高均一性以及重复性极高的结果。图2MyDesign芯片中运行的样品与predispensedSmartChip基因表达panel中运行的样品获得的mRNA表达水平一致。一个基因集合里的96个基因选取5个通过5个连续的倍比稀释实验后得到,浓度从0.025ng/孔到0.4ng/孔,两者的线性相关系数R20.99。图3(A)SmartChipMyDesign芯片(MD)和predispensedSmartChip基因分型panel(PD)在SmartChip实时定量PCR系统中实验结果没有显著差异,用两个有代表性的SNPassays检测五个完全独立的SmartChip实时定量PCR,每个系统中得到的数据都在SmartChipQPCR软件里分析,很容易做到多12SmartChipcycler技术参数位点的研究。(B)SmartChipMyDesign芯片(MD)和predispensedSmartChip基因表达panel(PD)在SmartChip实时定量PCR系统中实验结果没有显著差异,用两个有代表性的基因ARHGBIB和CCL2检测五个完全独立的SmartChip实时定量PCR,在多个系统以及多个使用者中所获得Ct值的一致性确保了SmartChip实时定量PCR系统在多位点研究中的广泛应用。反应反应数:5184孔/反应反应体积:100nL/孔精确度对照模板5000~10000个拷贝的标准差0.2Ct滤镜(中心宽度,nm)激发光发射光FAM™(475/35)FAM™(520/15)VIC®(520/15)VIC®(565/24)ROX™(543/22)ROX™(676/29)SYBR™(475/42)SYBR™(550/50)照相机冷却式CCD镜头,9.3万像素照明250瓦石英卤钨灯,额定1000小时热循环升降温速度:65~95℃20秒,95~65℃15秒运行40个循环需平均2小时溶解曲线用户可自行设置(范围:0.5~2℃每秒,推荐0.5℃每秒)热均匀性:76℃时±0.5℃电源要求100-120VAC/200-240VAC±10%,8.0/4.0A在47-63赫兹;两个出口(循环仪,CPU+监控器)气体要求清洁干燥的气体(建议露点温度-40℃)调节至6.9~8.3BAR(100~120PSI)稳压器输出:外径4毫米聚氨酯管,或M5或1/8NPT母口(其他螺纹形式咨询请WaferGen)环境条件环境温度15-30°C,相对湿度10%~70%,非凝结,2000米海拔,污染指数2尺寸热循环仪:长70厘米,高50厘米,宽60厘米CPU,显示器,键盘,鼠标:长60厘米,高50厘米,宽50厘米重量热循环仪:75kgCPU和监视器:12kg最大样本数384加样体积100nL/孔电源要求100-120VAC/200-240VAC,8/4A在60/50赫兹;四个出口(多样品移液器,冷却器,泵控制盒,电脑)环境条件环境温度15-30°C,相对湿度10%~70%,非凝结尺寸流体模块:长28厘米,高33厘米,宽45厘米泵控制盒:长26厘米,高38厘米,宽51厘米移液模块:长26厘米,高40厘米,宽60厘米冷却系统:长13厘米,高18厘米,宽20.5厘米控制电脑:长35厘米,高30厘米,宽27厘米重量多样品加样器:65kgCPU:2.7kg点样精度λDNA,CTSD0.2点样速度48个样品10分钟,384个样品60分钟SmartChipMultisampleNanodispenser技术参数

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