1PubMed2PubMed系统PubMed系统是由美国国立医学图书馆附属美国国立生物技术信息中心NationalCenterforBiotechnologyInformation(NCBI)开发的用于检索MEDLINE、PreMEDLINE数据库的网上检索系统。网址为:http://美国生物技术信息中心(NCBI)网上检索系统的网页。4PubMed检索系统•一、PubMed检索系统数据来源包括:1、MEDLINE2、PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库,其数据经过标引和加工,每周向MEDLINE移加一次。PreMEDLINE的记录有[PreMED—inprocess]的标识。3、RecordsuppliedbyPublisher出版商提供而未被MEDLINE、PreMEDLINE收录的数据。5二、检索原理•1、具有自动转换匹配功能(AutomationTermmapping)对输入检索框中的检索式,PudMed将与它的四个索引进行对照、匹配和转换,然后进行检索。•(1)输入的是关键词,系统会找出与之对应的Mesh词,以文本词(关键词)与Mesh词同时进行检索。例如输入taxol,系统转换为(“paclitaxel”)[MeshTerms]OR“taxol”[TextWord]•(2)如果输入的是多个词,系统未能在四个索引中找到与之一致的词组形式,会自动将每一个词用“AND”联接起来进行检索。如taxollungcancer系统转换成:•(((“paclitaxel”[MeshTerms]ORtaxol[TextWord]AND(“lungneoplams”)[MeshTerms]ORlungcancer[TextWord]))ANDnotpubref[sb])子文档6•(3)如果不愿意对提问词进行转换,可以用“”双引号加以限制。如“paclitaxelANDlungneoplasms”•匹配用的四个索引按顺序是:•MeshTranslationTable(Mesh转换表)•JournalsTranslationTable(刊名转换表)•PhraseList(短语列表)•AuthorIndex(著者索引)•2、自动扩展检索功能,如果没有说明系统会对主题词、副主题词进行扩展检索。如果不扩展可用标识符“noexp”。•“hypertension/therapy[mh:noexp]”7•3、短语检索(PhraseSearching)也可称为强迫词组检索,即,将短语用双引号“”引起来,作为一个词组检索。如“singlecell”,作为一个词组检索,系统不进行自动转换匹配,也不进行Mesh词的扩检。•4、支持布尔逻辑符AND、OR、NOT和截词*的使用。逻辑符用大写。在采用多个逻辑符表达的检索式中,括号()内的检索式优先运行。8三、检索方法基本检索、辅助检索、其他检索•(一)基本检索•在检索框中可输入任何具有实质性意义的词,系统将进行自动匹配。点击检索框边的“GO”按扭,即可执行检索。•著者:姓在前,名在后。•刊名可输入全称;或MEDLINE认可的标准缩写形式;以及ISSN。•输入逻辑符号、及截词符(*)•举例如下:9输入选择PUBMED检索界面。10例1:在框内可输入任何有实质意义的词,系统将进行自动匹配。还可输入逻辑符号(大写)、及截词符(*)。输入lungANDsmok*点击“GO”11lungcancerANDsmok*点击“GO”,检索结果9254篇12选择Medline格式,点击disply,显示检索结果。13例2:允许用双引号(“”)来强制系统进行短语检索。输入“singlecell”,点击GO按扭。14用“Singlecell”检索的结果181861篇。15(二)辅助检索•辅助检索栏又称特征栏(FeaturesBar),位于检索框下面。包括四种功能:Limites条件限定;Preview/Index预览/索引;History检索史;Clipboard粘贴板;•1、Limites“条件限定”•相当于PubMed的高级检索界面。除基本检索以外,还以下拉菜单的形式提供对某些检索字段的限制,如:年龄、性别、人或动物、语种、文献类型、出版年份以及子集数据库(包括MEDLINE,PREMEDILE,PUBLISHER和AIDS数据库)的限定。16点击“条件限定”(Limits)。系统进入高级检索界面,显示多种限定条件供选择。17•限定条件如:•AllFields•Onlyitemswithabstracts•PublicationTypes•Ages•Languages•Subsets三个数据库和AIDS•HumanorAnimal•Gender:male、female•EntrezDate:PubMed收录数据的日期。•PublicationDate18Limits的下拉菜单19例:查找近两年有关字宫内膜异位症的综述文献。点击limits按扭,在检索框输入endometriosis,在limitedto的publicationtype中选择review,在entrez中选择2years。点击“GO”。20检索结果,近2年有关子宫内膜异位症的综述文献有233篇。212、Preview/index预览/索引•在预检索界面可执行以下功能:•(1)、在显示检索结果前先显示检索结果的记录数量(Result)。在检索框内输入检索式,点击preview按钮,将会显示检索结果的篇数。点击记录数的链接,系统显示当前检索策略的检索结果。•(2)、加词检索:如对检索结果不满意,可在原有检索式的基础上加词检索。在下面的加词检索框输入检索词及逻辑符,点击Preview。•(3)、特定字段加词检索。如对所加词的字段有特殊要求,可在预检索界面左下方下拉菜单中进行选择。•(4)、Index功能,在加词检索框中输入若干个字母,在左下边的下拉菜单中选择该词所在的字段,点击最右边的Index按扭,系统就会显示该字段中以这几个字目开头所有的词、词组,可选择,点击preview按钮进行预检。如aspirin,title字段。(见后图)22例1:点击特征栏Preview/Index按扭,进入预览/索引功能界面,检索框右侧增加了Preview按扭。在检索框输入检索式,点击Preview按扭,显示检索结果的数量。23检索界面的下面有加词检索框及Index按扭,又称预检索界面。左下面默认Allfield框,有特定字段选择。24例2:婴幼儿巨细胞病毒感染与听力损伤。(1)、点击Preview/index,进入预览/索引界面。在检索框内输入cytomegalovirus,点击Preview按扭,系统返回检索序号1,共26627条记录。25(2)删除第一次输入的检索式,在检索框内键入Hearingloss,点击Preview按扭。系统返回检索序号2,共37873条记录。26(3)删除第二次输入的检索式,在检索框内键入infants,点击Preview按扭。系统返回检索序号3,共645790条记录。27(4)在检索框内输入#1AND#2AND#3的检索结果为122条。28加词检索:在加词检索框输入的检索词可通过左下角的AllFields的下拉菜单进行限制。29Index:从索引表中选词检索。例如aspirin,在AllFields选title字段,点击Index按钮,系统显示aspirin的索引词表。每词按字顺排列,词后数字为纪录数,可选其中的词进行检索。30•3、History检索史;主要用于查看检索策略,查看检索结果;并可用已有的检索式来编制检索策略。可存储100条检索式。•4、Clipboard剪贴板;可容纳500条记录。将检索的结果存入到剪贴板中,主要便于集中显示、下载。31结果显示•点击GO以后,系统将自动进行检索。在结果显示屏中,会显示当前检索式、检出文献总篇数等信息。并有disply、show、sendto等按扭,可对检索进行操作。(见后图)321、结果显示(disply):在显示结果屏中,有检索式、文献总篇数,并有show、sendto等按扭。33(1)选择显示格式Display按钮右边有下拉式菜单,可提供选择显示格式,如文摘、引文格式等待,其中Medline格式最为完整。34例:lungcancerANDsmok*的检索结果显示。先在下拉菜单中选择显示格式,然后点击Display按扭。35(2)Details:点击Details按扭,显示经PubMed自动匹配转换后的检索策略。如lungcancerANDsmok*一例,可以修改后,按Search按钮重新检索。36(3)Sendtoclipboard,给选中的文献前的小方框打钩,选择clipboard,点击Sendto按扭。37点击clipboard按扭,选中的两篇文献已在其中。38(三)其他检索•1、主题词数据库检索(MeshDatabase)。相当于medline光盘的theasaus命令。使用该功能可选择规范化主题词、副主题词、查看词义注释、浏览树状结构表等,可执行主题词检索,可以提高检索效率。点击PubMed界面左边的MeshDatabase按扭,进入主题词检索界面。在MeshDatabase的检索框中,输入检索词,如果不是Mesh词,系统将提供同义词或近义词Mesh给于选择,同时显示Mesh树。39点击MeshDatabase按扭,进入主题词检索界面。40例:主题词检索界面的输入框内输入livercancer,点击GO按扭,系统提示livercancer不是Mesh词,规范主题词应该是liverneoplasms。41点击主题词liverneoplasms,显示副主题词,可供选择。42系统同时还显示检索的限定。如主要主题词限定;限制下位词扩检。43系统同时还显示其树状结构表。44用liverneoplasms选择副主题词radiotherapy、therapy,点击GO按扭,出现searchPudMed按扭,及检索策略。(见后页)45点击searchPudMed按扭。系统把检索词转PudMed检索系统自动进行检索。46检索结果448篇,题名左边书的符号为文摘,点击即可。47MeSHBrwser:•MeSHBrwser:可用于查找某自由词的MeSH专业主题词和主题检索。•在MeSH字段,输入任意词,如cancer,点击GO,系统显示neoplasms为主题词。点击(红色)的主题词。48点击主题词neoplasms将出现NLMMeSHBrwser按钮。49点击主题词neoplasms,系统出现NLMMeSHBrwser按钮。50点击NLMMeSHBrwser按钮。系统出现MedicalSubjectHeadings检索界面。51在输入框内输入neoplasms,点击findexactterm按钮,系统出现MedicalSubjectHeadings、Seealso和MeSHTreeStructures。52MedicalSubjectHeadings53参照系统54MeSHTreeStructures55可以按分类逐级选择合适的主题词5657582、期刊数据库。•点击PubMed左面的Journalsdata按扭。系统转到期刊数据库首页界面。•期刊数据库,可通过刊名全称、刊名简称[Medline缩写格式]、ISSN号、刊名中的单个或若干个词来查找特定的期刊。•点击界面中部的Journalswithlinksfull-textwebsite将列出与PubMed有全文链接的期刊刊名,按字顺排列。可查找期刊中的文献。59点击Journalsdata按扭,进入期刊数据库首页界面。点击界面中部的Journalswithlinksfull-textwebsite将列出与PubMed有全文链接的期刊刊名。60如输入的刊名与Mesh词表的主题词相同,需要用刊名字段标认识符[ta]加以限定。“Science