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0考试内容1、名词解释（10题，共30分）2、填空题（30空格共30分）3、是非题（16小题共16分）4、问答题（4小题共24分）第一章引论1．什么是病毒？病毒：专性细胞内寄生的亚显微寄生物。2．病毒与其它专性寄生的生物的差别（病毒的补充定义）①病毒颗粒由前体成分装配而成，而其他专一性细胞寄生生物则以整体形式扩增，并以分裂方式繁殖。②病毒颗粒(病毒体)自身不能生长或分裂。③病毒缺乏能量产生或蛋白质合成所需蛋白质(如核糖体)的基因。病毒没有能力合成各种生命活动所必需的物质(例如大分子化合物)，这一点使它们必须绝对依赖宿主。3．什么是类病毒viroids、拟病毒virusoids、朊病毒prions？①类病毒viroids：一类很小的环状RNA分子(200～400bp)，具有竿状二级结构，没有衣壳和囊膜，跟某些植物疾病有关。它们也是专一性细胞内寄生，复制方式跟病毒很相似。②拟病毒virusoids：约1000bp的环状RNA分子。因其依靠病毒的复制而增殖，因此被叫作病毒的“卫星”。它们借助病毒衣壳进行包装而成为“乘客”。③朊病毒prions：由单一蛋白分子组成的一类感染因子。4．什么是Koch法则”？Koch法则”：Koch总结的4个规律，至今仍被普遍认为是鉴定一种致病因子的标准①在特殊疾病中能发现同一种病原体；②能从特殊疾病中分离出病原体的纯培养；1③接种至敏感动物能引起相同的疾病；④能从实验动物再获得病原体的纯培养。5．什么是SCID小鼠SCID小鼠：1983年由Bosma等用转基因等方法培育出的一株重症联合免疫缺陷近交系小鼠。6．原代细胞培养primarycellcultures①原代细胞培养primarycellcultures：从实验动物或患者身上取得体细胞在培养基中短期存活。7．建株细胞immortalizedcelllines②建株细胞immortalizedcelllines：在适宜环境下能无限生长传代的细胞。8．什么是血凝现象(haemagglutination)？血凝现象(haemagglutination))：流感病毒颗粒表面有血凝素(haemagglutinin)，具有使鸡、豚鼠血红细胞凝聚的能力，将它们以合适的比例混合时，血细胞会凝集。9．如何进行血红细胞凝集试验（简称为血凝试验）？血凝试验的用途？把一定浓度的鸡红细胞加到待检的样品中如鸡胚尿液或羊水中，如出现血细胞凝聚现象，即表示样品中有病毒存在。这种试验可以测定标本中病毒的效价(相对数量)及确定其抗原类型。10．什么是血凝抑制现象和血凝抑制试验？血凝抑制现象：流感病毒的血凝性，可被免疫血清中的特异性抗体所抑制。血凝抑制试验：血凝试验中，在病毒样品中加入抗血清，再加一定浓度的鸡红细胞，观察血细胞凝聚现象。这种方法常用于流感病毒等粘病毒或副粘病毒的鉴定。①将稀释后的抗血清与一定量的血凝单位（一定量的病毒和红细胞）混合，可以测定抗血清的效价和特异性。②用已知的特异性抗血清去抑制血凝，可以确定出未知病毒的抗原类型。第2章病毒体11．病毒衣壳的基本功能是什么？外壳的最基本的功能就是保护脆弱的基因组核酸免受物理、化学因素和酶的损伤,成为2一个有效的屏障病毒的外壳还负责识别宿主细胞及与宿主细胞的相互作用。因此，病毒衣壳在病毒建立感染时的作用是必需的。12．病毒装配的驱动力是什么？病毒装配的驱动力：疏水力和相互静电作用，只有极少情况下病毒蛋白亚单位维持在一起与共价键有关。13．病毒衣壳的两种主要结构是什么？病毒两种主要结构的特点：螺旋对称和立体对称14．什么是二十面体的2-3-5对称？2-3-5对称：·每一个边的中心都有一个双重旋转对称轴通过。·每一个面的中心都有一个三重旋转对称轴通过。·每一个角(顶角)都有一个五重旋转对称轴通过。15．最简单的二十面体是怎样的？其代表病毒有哪些？最简单的二十面体：因为蛋白质分子的形状是不规则和非等边三角形的，所以最简单的二十面体就是利用3个相同的蛋白亚单位构成每一个三角形面，这意味着构成一个完整的衣壳需要60个相同的亚单位。少数简单的病毒体是以这种方式构成的，例如Microviridae科的噬菌体ΦX174：其全部结构已在近期通过X射线晶体技术测定完。16．什么是原衣壳？无基因组的空的病毒颗粒17．较复杂的二十面体衣壳如双生体病毒衣壳的结构：具有较大的三角形划分数目的病毒体用不同的亚单位装配二十面体的面和顶角，并且以内在的支柱蛋白作为骨架。这些蛋白指导衣壳的装配，主要是把预先形成的蛋白亚单位联结在一起。二十面体对称性概念的变化一再发生,例如，双生体病毒由一对融合的T=1二十面体组成，每个二十面体在结合部位少了一个五聚体18．较复杂的二十面体衣壳如细小核糖核酸病毒(细小核糖核酸病毒科)衣壳的结构病毒结构：直径约30nm、三角形划分数T=3的二十面体衣壳(图2-5)。衣壳由60个重复的蛋白部件组成，每一个部件又含有3个主要的蛋白亚单位VPl、VP2和VP3，整个细小病毒病毒体含有60×3=180个表面单体。三种蛋白按照相似的结构，由150～200个氨基酸残基以被描述为“8股反向平行β桶”(图2．6)的形式组成。19．什么是包膜(囊膜)病毒？病毒衣壳被磷脂层包被的病毒。20．包膜病毒装配的场所多数情况下，病毒体在细胞内的形成、成熟和释放是一个连续的过程。不同的病毒其装配场所也不同。21．包膜的功能是什么？非常惰性，能有效防止病毒体的干燥或酶损伤。22．包膜的负面作用是什么？阻止病毒对宿主细胞膜上的受体分子的识别，这将使病毒失去活性。23．什么是基质蛋白（matrix）？为病毒体的内在蛋白，其功能是有效连结核衣壳部件与囊膜。324．什么是复合对称性衣壳病毒？复合对称性衣壳病毒：通常含有几层蛋白质和脂质，虽然病毒衣壳常常用前已述及的一般性对称原则来构成衣壳的一部分，但较大和较复杂的病毒并不能像螺旋体或二十面体一样简单地用一个数学方程式来描述。25．外壳最复杂的病毒是什么？痘病毒26．什么是杆状病毒科（Baculoviridae）“闭合体”27．闭合杆状病毒（baculoviruses）的种类1.核多面体病毒2.粒性病毒28．说明包装特异性的机理在大多数情况下，到病毒感染的晚期病毒体开始装配时(见第4章)，细胞基因的转录已经减少，积累了大量的病毒基因组。病毒核酸的过度生产减轻但并没有消除特异性基因组的装配问题。现在已知，包装特异性的决定因素至少有如下3个：1．特异的衣壳或核衣壳蛋白：病毒依靠一个特异的病毒编码的衣壳或核衣壳蛋白来实现基因组的选择。许多病毒甚至那些基因组相对较短和简单的病毒如逆转录病毒和杆状病毒都编码这种类型的蛋白质。2．包装信号：基因组中特异的核苷酸序列，它使病毒能够从细胞背景中挑选基因组核酸。许多病毒基因组中的包装信号已经得到鉴定：①比如鼠逆转录病毒基因组的χ信号，已被用来构建“逆转录病毒载体”，使重组基因组包装进病毒体。②一些DNA病毒(某些腺病毒和疱疹病毒)的包装信号也已得以确认。3．二级结构区域的信息：除包装信号外，准确而又有效的基因组包装还需要通过基因组核酸折叠形成的复杂的二级结构区域的信息。29．阐述烟草花叶病毒TMV的包装机制包装机制：1．产生圆盘：外壳蛋白预先聚集产生，有效的‘圆盘'每圈有17个亚单位，与成熟病毒体中的每圈16．34个亚单位接近。圆盘并非完全对称，有明显极性。2．盘与OAS结合：圆盘6.4kbRNA基因组中的5444-5518残基（称为装配序列原点，OAS）的结合来启动TMV颗粒的组装。3．改变构象：结合后，圆盘转变为螺旋的“锁合的垫圈”结构，新的圆盘加入到这一结构中，转变为“锁合的垫圈”构象。RNA被拖入装配结构，形成“移动环”，这个名称已成为颗粒形成机制的普通名称。4．延伸：随着螺旋渐长，RNA被收集并包埋于盘的中央。螺旋结构可沿着两个方向以不同的速率延伸：①沿5’端方向延伸：速率较快，因圆盘可以直接加入到蛋白链丝上，然后RNA“移动环”再穿过圆盘。②沿3’端方向延伸：速率较慢，因为RNA必须在圆盘被加入到蛋白丝之前穿过圆盘。4第3章基因组30．病毒基因组种类、构型和大小范围1.种类：①单链：正链(核苷酸序列与mRNA相同)、负链或二者兼有②双链2.构型：①线形②环形3.大小：最小3500个核苷酸(例如Leviviridae家族的噬菌体中的MS2和Qβ)最大1.2Mbp的Mimivirus基因组4.成分:DNA或RNA31．已知的最大的病毒基因组Mimivirus基因组32．哪种病毒是二倍体病毒？1）二倍体：具有两个完整基因组拷贝的对病毒逆转录病毒。反转录病毒33．什么是再生病毒（therescue)？“拯救”病毒：用纯化或克隆的核酸转染细胞，产生有感染性的病毒颗粒。34．哪些是可被拯救的核酸？①正链RNA：正链vRNA本质上是mRNA，转染后马上产生基因组复制所需的病毒蛋白。②双链DNA：先被宿主的聚合酶转录成mRNA，产生基因组复制所需的病毒蛋白。③克隆的正链RNA病毒的cDNA：可能是因为cDNA被细胞酶类转录而产生了RNA，转染力低于vRNA，如细小核糖核酸病毒。④负链RNA：因缺少反转录酶，纯化的赋RNA链不能直接被拯救，必须应用“反向遗传学”体系（即通过DNA中间体的负链RNA基因组操作）来拯救35．什么是株(strain)、型(type)、准株(quasispecies)、变异体(variant)？①株(strain)：指同种病毒的不同系别或不同的分离株，如来源于不同地区或患者的病毒。②型(type)：指同种病毒的不同血清型(例如各种抗体中和表型)。③准株(quasispecies)：指宿主体内由同一株病毒因变异而形成的分子变异体的混合物。④变异体(variant)：指表型与原始野生型不同的病毒，但其变异的遗传基础尚不清楚。36．病毒自发突变率的大概范围是多少？自发突变：①某些病毒的基因突变率可高达10-3～10-4／nt(例如逆转录病毒HIV)。②然而另一些病毒突变率仅为10-8至10-11／nt(如疱疹病毒)，相当于细胞DNA的自发突变率。37．RNA病毒和DNA病毒突变率差异的主要原因是什么？依赖于RNA的RNA聚合酶的错误率通常要高于依赖于DNA的DNA聚合酶。虽然一些RNA病毒聚合酶的确具有校对功能，但总的说来，大多数RNA病毒的突变率要显著高于DNA病毒。538．回复突变型的类型有几种？①简单的“返回突变”：即对原始突变的校正；②“补偿突变”：突变位点与原始突变相距甚远，甚至在其它基因上。39．什么是突变的抑制作用？一种突变体表型被另一种抑制基因突变所抑制。它既可发生于病毒基因组内，也可发生于宿主细胞基因组内。40．什么是互补作用、互补实验？互补群？互补实验：通过两种病毒混合感染培养的细胞也就是超感染来分析遗传的相互作用。互补作用：两种突变体相互为对方提供它们各自所缺的功能基因产物。在超感染期间病毒基因产物的互补作用，可形成数量增加的一种或两种在遗传上未改变亲本病毒。互补群：功能类似、不能互补的一组突变体。41．什么是非对称互补作用、辅助病毒？非对称互补作用：只有一种(突变体)亲代病毒可以复制，这种非对称性可以是一种绝对限制或是一种相对限制。这种互补作用自发产生时，通常是具有复制能力的野生型病毒帮助复制能力有缺陷的突变体。辅助病毒：非对称性互补中，帮助复制能力有缺陷的突变体复制的野生型病毒。42．什么是分段基因组？分段基因组：两个或两个以上的核酸分子被包装在同一个病毒颗粒内。43．分段基因组优点和缺点是什么？片段化优点：增加信息量，克服非片断化的RNA基因组大小的上限和RNA的部稳定性。最长的单链RNA基因组是冠状病毒，约30kb。最长的双链DNA病毒基因组要长得多，如mimivirus长达1200kb。片段化缺点：每个独立的基因组片段必须包装进一个病毒颗粒，否则病毒将丧失某些基因信息而成为缺陷型病毒。实现这种包装的机制尚不清楚。44．什么是多分基因组？多分基因组：两个或两个以上的核酸分子各自单独被包装在不同的病毒颗粒内。这些颗粒结构相似，可能含有相