1蛋白质分子构象(conformation):又称高级结构或空间结构,是指蛋白质分子中所有的原子在三维空间中的分布。Tm值:DNA熔解温度,指把DNA的双螺旋结构降解一半时的温度。DNA损伤:是复制过程中发生的DNA核苷酸序列永久性改变,并导致遗传特征改变的现象。分为:substitutation(替换)deletion(删除)insertion(插入)exonskipping(外显子跳跃)。核酸杂交(nucleicacidhybridization):相同或不同来源的二个DNA分子、或DNA和RNA分子,如果含有彼此互补的序列,混合在一起,通过变性和复性处理,DNA-RNA同源序列间及DNA-RNA异源序列间都可形成DNA-RNA或DNA-RNA杂交体,称为核酸分子杂交。别构调节(allostericregulation):一些代谢分子,包括底物、中间产物和终产物,不直接作用于酶的活性中心,而以非共价键结合活性中心以外的别构部位(allostericsite),通过构象的变化而改变酶的活性,这种调节称为酶的别构调节。转录因子:结合在TATA盒子附近核苷酸序列上的蛋白因子转录调控因子:结合在上游特异核苷酸序列上的蛋白因子。DNA变性(DNAdenaturation):指DNA分子由稳定的双螺旋结构松解为无规则线性结构的现象分子伴侣(molecularchaperone):一类在序列上没有相关性但有共同功能的蛋白质,它们在细胞内帮助其他含多肽的结构完成正确的组装,而且在组装完毕后与之分离,不构成这些蛋白质结构执行功能时的组份hnRNA(heterogeneousnuclearRNA):不均一核RNA,存在于真核生物中的一类RNA,其分子大小很不均已,是真核mRNA前体。蛋白质结构层次:一级结构(primarystructure):多肽链中氨基酸的排列顺序,包括多肽链数目,每一条多肽链中末端氨基酸种类,每一条多肽链中氨基酸的数目、种类和排列顺序、链内和链间二硫键的位置和数目;二级结构(secondarystructure)指多肽链主链骨架全部或部分按一定规律排列形成的空间结构,它不涉及侧链构象,包括α-螺旋、β-折叠和β转角等;超二级结构(supersecondarystructure)蛋白质中经常存在由若干相邻的二级结构单元按一定规律组合在一起,形成在空间上可彼此区别的结构单位;结构域(structuredomain)是指在蛋白质结构中,一条多肽链上常常存在一些紧密的、相对独立的区域,是在二级或超二级结构基础上形成的特定区域;三级结构(tertiarystructure)具有特定氨基酸序列的多肽链,在形成空间构象时,通常是先由相邻的氨基酸残基形成一些有规则的结构单元,并由相邻的二级结构聚集形成超二级结构,进而折叠成一些相对独立的结构域,最有构建成完整的、具有生物活性的构象,其中每一个原子或基团都有特定的空间排布,这种构象称为蛋白质三级结构;亚基(subunit)相对分子质量较大的球状蛋白分子往往是由两条或多条肽链通过非共价键连接形成的,其中每一条独有独立的三级结构,称为亚基;四级结构(quaternarystructure)各亚基间相互作用并组成具有生物活性的特定构象。SDS-PAGE的原理和特点:SDS是一种阴离子去污剂,能以一定的比例和蛋白质结合,形成一种SDS-蛋白质复合物。此复合物可用具有SDS的PAGE进行分离,统称称这种电泳为SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)。PAGE能有效地把不同类型的蛋白质分开,主要依据是各种物质的电荷和相对分子质量的差异,而SDS-PAGE则是根据各种蛋白质相对分子质量的不同进行分离的。电泳前,在蛋白质溶液中加入SDS和巯基乙醇进行热变性,巯基乙醇即使蛋白质分子中的二硫键还原,SDS破坏蛋白质亚基间的非共价键,使含有亚基的蛋白质解离成各个亚基。由于SDS带有较强的负电荷,使SDS-蛋白质复合物大大超过天然蛋白原有的电荷,从而消除或掩盖了不同种类蛋白质分子2原有电荷的差异。并且SDS与蛋白质结合后,引起蛋白质构象的变化,在水溶液中都变成长椭圆形,其短轴长度都为1.8nm左右,而长轴长度则与蛋白质相对分子质量成正比,故SDS-PAGE中泳动率不再受其原有电荷和分子性状的影响,而只决定于相对分子质量。故该法测得的只是亚基或单条肽链的相对分子质量,而不是完整蛋白的相对分子质量,因此长被用来判定相对分子质量大小的均一性,检测有无杂蛋白、宿主细胞蛋白、聚合体污染以及亲核层析中生物分子配基脱落等。简述酶活性抑制的类型:主要有两种类型(不可逆抑制和可逆抑制),其中不可逆抑制包括:专一性(选择性)抑制和非选择性抑制,可逆抑制包括:竞争性抑制、非竞争性抑制、反竞争性抑制和混合型抑制。(知识点扩展专非专一性的不可逆抑制作用抑制剂作用于酶蛋白分子中一类或几类基团,对酶不表现专一性;专一性的不可逆抑制作用抑制剂只对某类或某一个酶起作用,这类抑制剂叫做专一性的不可逆抑制剂;竞争性抑制competitiveinhibition:由于抑制剂I和底物S结构相似,因此可竞争性结合于酶活性中心同一结合部位,而且是非此即彼完全排斥的反应;非竞争性抑制noncompetitiveinhibition:底物S和抑制剂I与酶结合互不相关,既无竞争性,也无先后次序,两者都可以与酶及相应中间复合物(EI或ES)结合,但形成的三元复合物(ESI或EIS相同)不能再分解;反竞争性抑制uncompetiviveinhibition:抑制剂I只能与酶-底物复合物ES结合形成无活性的三元复合物ESI,而不能与游离酶E结合的一类反应;混合型抑制:一些介于竞争性和非竞争之间的抑制作用通常称为混合性抑制作用,即E或ES结合I的亲和力,以及E或EI结合S的亲和力都不相当时,就是混合型抑制。)真核生物启动子特点:真核生物中有三种不同的RNA聚合酶,因此也有三种不同的启动子,其中以启动子Ⅱ最为复杂。具有如下特点:(1)有多种元件:TATA框、GC框、CAAT框等;(2)结构不恒定。有的有多种框盒如组蛋白H2B;有的只有TATA框和GC框,如SV40早期转录蛋白,(3)它们的位置、序列、距离和方向都不完全相同,(4)有的有远距离的调控元件存在,如增强子;(5)这些元件常常起到控制转录效率和选择起始位点的作用;(6)不直接和RNApol结合。转录时先和其它转录激活因子相结合,再和聚合酶结合。原核生物启动子特点:原核生物启动子是由两段彼此分开且又高度保守的核苷酸序列组成,对mRNA的合成极为重要。启动子区域:(1)Pribnow盒,位于转录起始位点上游5—10bp,一般由6~8个碱基组成,富含A和T,故又称为TATA盒或—10区。启动子来源不同,Pribnow盒的碱基顺序稍有变化。(2)—35区,位于转录起始位点上游35bp处,故称—35区,一般由10个碱基组成。这是与真核生物中CAAT区相对应的序列。蛋白质超二级结构(supersecondarystructure):蛋白质中经常存在由若干相邻的二级结构单元按一定规律组合在一起,形成空间上可彼此区别的结构单元。分子识别(molecularrecognition):指蛋白质与蛋白质、核酸、脂等分子之间特异性辨认。分子自装配(self-assembly):把某些病毒(如烟草花叶病毒)或细胞器解离成蛋白质、核酸等组分后,这些组分在体外生理条件下能自动装备成具有功能的病毒或细胞器碎片的现象。二硫键(disulfidebond):是由两个半胱氨酸借助两个硫原子形成的一种比较稳定的共价键,可存在于一条肽链的内部或两条肽链之间,对蛋白质构象起重要作用。透析(dialysis):通过小分子经过半透膜扩散到水(或缓冲液)的原理,将小分子与生物大分子分开的一种分离纯化技术。3盐析:一般是指溶液中加入无机盐类而使某种物质溶解度降低而析出的过程。蛋白质分子盐析:向某些蛋白质溶液中加入某些无机盐溶液后,可以使蛋白质凝聚而从溶液中析出,这种作用叫作盐析。酶的化学修饰(chemicalmodification):酶蛋白肽链上某些残基,在另一种酶的催化下发生可逆共价修饰,从而引起酶活性的改变的过程。反竞争性抑制(uncompetiviveinhibition):抑制剂只与酶-底物复合物结合,而不与游离酶结合的一种酶促反应抑制作用。关键酶:代谢途径中决定反应的速度和方向的酶称为关键酶。它有三个特点:1、它催化的反应速度最慢,所以又称限速酶。其活性决定代谢的总速度。2、它常常催化单向反应,其活性能决定代谢的方向。3、它常常受多种效应剂的调节。同工酶:广义是指生物体内催化相同反应而分子结构不同的酶。定向效应(orientationeffect):指底物的反应基团和催化基团之间或底物的反应基团之间正确地取向所产生的效应。临近效应(approximationeffect):指酶由于具有与底物较高的亲和力,从而使游离的底物集中于酶分子表面的活性中心区域,使活性中心的底物有效浓度得以极大地提高,并同时使反应基团之间互相靠近,增加亲核攻击机会,从而使自由碰撞机率增加,提高反应速度。负超螺旋:两股以右旋方向缠绕的螺旋在外力向松缠的方向捻转时,产生一个右旋的超螺旋以解除外力捻转造成的胁迫。这样形成的超螺旋为负超螺旋。点突变:由于剪辑突变使某一氨基酸的密码子变成另一氨基酸的密码子的突变。移码突变:是由于基因中碱基数缺失或插入,造成这一位置以后的一系列或部分编码发生移位错误的突变。问答题:蛋白质高级结构维持:蛋白质特定构象主要是通过化学键维持,这些化学键主要为非共价键,包括:氢键、范德华力、疏水作用力、离子键、配位键和二硫键。它们在蛋白质构象中发挥的作用有所不同,键能高的化学键可保证肽链构象的稳定性,而弱的化学键可使肽链构象有一定的灵活性。球蛋白分子特征:(1)球状蛋白的多肽链往往借助各种结构单元、超二级结构等折叠成紧密的球状构象;(2)球状蛋白分子中的非极性侧链一般存在于分子内部的疏水区域,大多数极性侧链位于分子表面,形成亲水区;(3)球状蛋白分子分子表面往往有内陷的、通常为疏水性的空穴,这类空穴可作为蛋白质与其他分子进行识别或结合的关键部位,参与蛋白质的多种功能;(4)同类球状蛋白质分子,具有基本相同的三级结构特征,不同种类的球状蛋白分子,具有完全不同的三级结构特征,这是球状蛋白分子结构的专一性。Km生物学意义:(1)鉴别酶的最适底物Km值的大小,可以近似地表示酶和底物的亲和力。Km值大,意味着酶和底物的亲和力小,反之则大;(2)判断在细胞内酶的活性是否受底物抑制如果测得离体酶Km值远低于细胞内的底物浓度,而反应速度没有明显变化,则表明改酶在细胞内长处于被底物所饱和的状态,底物浓度的稍许变化不会引起反应速度有意义改变,反之,如果酶的Km值大于底物浓度,则反应速度对底物浓度变化就有十分敏感;(3)催化可逆反应的酶,当正反应和逆反应Km值不同时,Km值小的底物所示的反应方向,应是改酶的催化的优势方向;(4)多酶催化的连锁反应,如能确定各种酶Km及相应底物浓度,有助于寻找代谢过程的限速步骤。在各底物浓度相似时,Km值大的酶则为限速酶;(5)由于存在Km值不同而功能相同的酶,从而发现同工酶;(6)测定不同抑制剂对某个酶Km值及Vmax的影响,可以区别改抑制剂是竞争性抑制剂还是非竞争性抑制剂;(7)为了鉴定不同菌株来源的天冬酰胺4酶对治疗白血病的疗效,可以测定不同菌株的天冬酰胺酶对天冬酰胺的Km值,从中选用Km值较小的酶,这不仅是评价要用酶的理论基础之一,也是选用要用酶来源的依据。酶活性中心:在酶分子上,不是全部氨基酸,而只是少数氨基酸残基与酶的活性有直接关系,这些相关的氨基酸,一般较集中在酶分子的一个特定区域,这个区域即为酶的活性中心,是酶蛋白的催化结构域中与底物结合并发挥催化作用的部位,包括催化基团和底物结合基团。DNA结构层次:包括DNA一级、二级、三级结构,一级结构是:四种脱氧单核苷酸按照一定的方式、数量和排列顺序而形成的多核苷酸;二级结构: