查询启动子区及甲基化位点预测-20130914

如何查询基因的启动子区及甲基化位点的预测案例：NR_028414打开ncbi，选择”Gene”，输入“NR_028414”查看“GenomicContext”注意这个基因的位置范围（即45430060..45434643）在染色体上的方向为正向（从左到右），即位置45430060之前为启动子区域选择基因示意图1）向下查看“Genomicregions,transcripts,andproducts”2）将鼠标放在Genes的“NR_028412.1”示意图上3）在弹出的窗口中点击点击FASTAViewFASTAView的“45430060..45434643”代表的是NR_028412位置出现该基因的实际序列45430060代表起始位置调整显示的位置按刚才的基因范围调整一下这个数字：一般起始位置（即45430060）向前推1000BP,向后推1000bp更改基因范围后得到的序列，可以直接用于甲基化预测将上面得到的序列，拷贝至以下网站：点击submit,进入结果显示有1000-1500区域段是可能发生甲基化的，后面那个蓝色区域距离有点远，因为这个基因的一号外显子本身是很短的，所以最终选择的片段如下：