微生物在自然界的分类地位微生物分类的单位与命名两界系统(亚里斯多德)动物界:不具细胞壁,可运动,不行光合作用。植物界:具有细胞壁,不运动,可行光合作用。三界:原生生物界五界系统R.H.Whitakker,Science,163:150-160,1969原核生物界:细菌、放线菌等原生生物界:藻类、原生动物、粘菌等真菌界动物界植物界六界:加上病毒界。三界(域)系统界门纲目科属种基本单位亚级亚种真菌门Eumycophyta子囊菌纲Ascomycetes内孢霉目Endomycetales内孢霉科Endomcetaceae酵母属Saccharomyces啤酒酵母S.Cerevisiae常用的几种分类概念种:亲缘关系较近的微生物有机体的集合,它们在进化发育阶段上有一定的共同形态和生理特征。现代分类学上规定种内菌株的DNA同源性≧70%亚种:种的进一步细分,一般指其某一明显而稳定的特征与模式中不同的种。菌株(品系):来源不同的同种微生物的纯培养,均可称为菌株。二、微生物的命名命名的方法:国际法规命名,即林奈所创立的双名法。学名=属名+种名+(最初定名人)+后来定名人+命名时间主要部分次要部分(一般可省略)例:Bacillussubtilis(Ehrenberg)Cohn.1872缩写:B.subtilisBacillussp.属名的第一个字母要大写,斜体属名是拉丁词或希腊词或拉丁化了的其它文字所构成。它是一个名词,用以表示该属的主要特征。例如芽孢杆菌(Bacillus)表示能形成芽孢的杆状菌。属名有时可用人名或地名来表示。例如Pasteurellapestis(鼠疫巴斯德氏菌),志贺氏杆菌属(Shigella)。属名在上下文重复出现的情况下,可以缩写。例如Bacillus可用Bac.表示。种名是拉丁语中的形容词,表示微生物的次要特征。例如:金黄色葡萄球菌(Staphylococcnsaureus)aureus是形容词,意思是“金黄色的”。种名也有用人名或地名来表示的。例如:巴氏芽孢杆菌(Bacilluspasteurii)种名首字母不大写,斜体微生物分类的依据形态特征:个体形态(形状、大小、染色反应等)、群体形态(菌落特征、液体培养特点等)生理生化特征:代谢产物、营养要求、细胞壁成分等的测定生态特征:微生物间各种相互关系的利用遗传特征:DNA同源性分析G+C的含量其它:全细胞蛋白的分析、多位点酶的分析等分类的方法经典分类法:采用双歧法整理实验结果数值分类法:测定100项以上的各种性状,利用计算机进行菌株的相互比较,并得出总的相似值。一般认为同种微生物菌株之间的相似值≧80%。遗传分类法:DNA杂交(液相复性速率法原理与方法)、G+C含量的测定(热变性法、浮力密度法等)微生物的常用分类系统细菌:伯杰氏鉴定细菌学手册(第八、第九版)、细菌系统学手册(第一版)放线菌:中国科学院微生物研究所编著的放线菌目分科、分属检索表真菌:Smith、Alexopoulos、Ainsworth的分类系统