西北农林科技大学分子生物学

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资源描述

一、名词解释1、RNA干扰(RNAinterference,RNAi):是指在生物体细胞内,双链RNA(dsRNA)引起同源mRNA的特异性降解,因而抑制相应基因表达的过程。2、基因组:对一般二倍体高等生物而言,能维持配子或配子体正常功能的最低数目的一套染色体DNA,构成一个基因组。基因组中包含一整套基因。3、功能基因组:由表达基因构成的基因组。(cDNA)4、C值:是一种生物单倍体基因组DNA的总量。5、C值反常:真核细胞基因组的最大特点是它含有大量的重复序列,而且功能DNA序列大多被不编码蛋白的DNA所隔开。这就是C值反常现象6、DNA的转座:是由可移位因子介导的遗传物质重排现象。根据转座作用机制的不同,可分为复制性转座和非复制性转座。7、基因工程:是指在体外将核酸分子插入到病毒、质粒或是其它载体分子,构成遗传物质的新组合,使之进入原先没有这类分子的寄主细胞中。进行持续稳定的繁殖和表达。8、分子克隆的载体(vector):具有自主复制能力的DNA分子。1.基因表达:包括转录(transcription)和翻译(translation)两个阶段。转录是指拷贝出一条与DNA链序列完全相同(U替换T)的RNA单链的过程,是基因表达的核心步骤;翻译是指以新生的mRNA为模板,把核苷酸三联遗传密码子翻译成氨基酸序列、合成多肽链的过程,是基因表达的最终目的。2.编码链(有意义链):与mRNA序列相同的那条DNA链。(指不作模板的DNA单链)模板链(反义链):另一条根据碱基互补原则指导mRNA合成的DNA链。(指作为模板进行RNA转录的链)二、判断对错,为什么?(每题3分,共计6分):1.在研究mRNA所包含的功能基因信息时,一般将其反转录成的cDNA,再插入到可以自我复制的载体中。正确由于mRNA十分敏感和脆弱,在自然状态下难以被扩增,故将其反转录成结构稳定的双链DNA就是cDNA,然后再插入到可以自我复制的载体中。构建cDNA文库。2.一个生物体内能产生百万种以上的Ig分子,是源自于相应数目的基因。不正确生物体内能产生百万种以上的Ig分子,是由于组成Ig分子的重链和轻链的基因片段发生重排的结果。三、填空(每空0.5分,共计20分)1.核小体是染色质的基本结构单位,由200bpDNA和组蛋白八聚体组成。DNA在中期染色体中压缩10,000倍。2.蛋白质合成时UAA、UGA和UAG三个暗码通常不代表任何氨基酸,它们代表终止密码子。4.在大肠杆菌中,许多蛋白质的降解是通过一个依赖于ATP的蛋白酶(con)来实现的。真核蛋白的降解依赖于一个只有76个氨基酸残基、其序列高度保守的泛素。5.PCR技术是体外快速扩增特定基因或DNA序列最常用的方法。整个反应包括DNA解链(变性)、引物与模板结合(退火)、DNA合成(延伸)三步,此三步可以被不断重复。经多次循环之后,反应混合物中所含有的双链DNA分子数,理论上的最高值应是2n。6.SNP(单核苷酸多态性)指基因组DNA序列中由于单个核苷酸(A,T,C和G)的突变而引起的多态性。7.基因敲除又称基因打靶,该技术通过外源DNA与染色体DNA之间的同源重组,进行精确的定点修饰和基因改造,具有专一性强、染色体DNA可与目的片段共同稳定遗传等特点。12.原位杂交是用标记的核酸探针,经放射自显影或非放射检测体系,在组织、细胞、间期核及染色体上对核酸进行定位和相对定量研究的一种手段。13.定点突变通过改变基因特定位点核苷酸序列来改变所编码的氨基酸序列。14.RNA干涉技术利用双链小RNA高效、特异性降解细胞内同源mRNA,从而阻断体内靶基因表达,使细胞出现靶基因缺失的表型。15.蛋白质组学研究某一物种、个体、器官、组织或细胞在特定条件、特定时间所表达的全部蛋白质图谱。通常采用双向电泳方法将蛋白质分离,然后采用质谱技术进行鉴定.15、受体酪氨酸激酶:[A、E]A、有一个胞质激酶区;B、其配体一般是甾类物质;C、配体结合后不发生二聚化D、配体结合胞质区使受体构型发生改变;E、能够发生自磷酸化而激活。16、凝胶阻滞法,[B、C]A、用于研究蛋白质-蛋白质相互作用的方法;B、用于研究蛋白质-DNA相互作用的方法;C、其原理是根据复合物大小的改变而发生的电泳速度改变;D、其原理是根据复合物的结构改变而发生的电泳速度改变17、甾类受体转录因子,[C]A、都结合于同一激素;B、不以特异性序列模式结合DNAC、有不同的区域分别用于激活转录,结合DNA和激素。18、细胞凋亡,[A、D]A、是特定细胞的程序性死亡;B、当Fas或TNF的受体结合了它们的配体后能被诱导;D、一般引起caspase的级联反应。19、下列哪些关于ras说法是正确的;[B、C、D]A、ras蛋白直接结合到胞外配体上;B、基因常发生突变,突变能在V-ras或C-ras发生;C、基因突变可能在结构上活化Ras,从而不水解GTP;D、有时可能通过野生型Ras蛋白的过量表达而引起肿瘤发生;E、不能介导信号通路。20、p53基因,[A、B、D、E]A、是一个抑癌基因;B、编码一个转录因子;C、一般不发生突变D、参与细胞周期的调控。E、其表达产物功能可以被某些病毒蛋白抑制五、问答题(共计25分)2.解释在DNA复制过程中,后随链是怎样合成的。(4分)因为DNA聚合酶只能从5’到3’方向合成DNA,后随链不能象先导链那样总是朝着同一方向合成。后随链是以大量的独立的片段的形式(冈崎片段)合成的。每个片段都是按照5’到3’方向合成的。这些片段最后连在一起形成一条连续的多核苷酸链。每个片段都是独立地被引发、聚合和连接。3.解释什么是“套索结构”,在内含子套索中的磷酸二酯键有什么特别之处?(5分)当RNA分子的一端自身回折成环并与其自身的核苷酸形成共价结合时,便形成了一个套索结构。在内含子的套索结构中的磷酸二酯键很少见。因为它是由核苷酸的5’和2’上的碳原子连接起来的。而磷酸二酯键通常是靠相邻的两个核苷酸的5’和3’的碳原子连接起来的。4.列表说明原核生物与真核生物转录的差异。(7分)原核生物真核生物1.一种RNA聚合酶。1.多种RNA聚合酶。2.不同启动子间有相当大的同源性。2各种不同启动子间的差异很大。3.聚合酶直接同启动子结合。3.聚合酶通过同转录因子相互作用进行结合。4.没有增强子。4.有增强子。5.转录作用的终止由在几个Us前面形成颈环。5.转录的终止是靠在转录过程特殊的核酸内切酶切割的序列介导的。6.启动子通常位于基因的上游。6.聚合酶III的启动子位于被转录的序列之中。7.转录单位常常含有多个基因。7.转录单位只含有一个基因。5.简述真核与原核细胞中翻译起始的主要区别。(5分)原核细胞与真核细胞翻译起始的主要区别是来自mRNA的本质差异以及小亚基与mRNA起始密码子上游区结合的能力。原核细胞mRNA较不稳定,而且是多顺反子,在IF-3介导下。通过16SrRNA的3’末端在核糖体结合位点与小亚基直接结合后,原核细胞翻译起始复合物(IF-3,30S,mRNA,IF-2,GTP,fMet-tRNA)就装配起来了。而在真核细胞中,需要几种起始因子(eIF-4,4A,4B)帮助mRNA启动,起始复合物(SIC,40S亚基,eIF-2,GTP,Met,tRNA)才能结合(在eIF-4和eIF-3因子的促使下)到mRNA帽上。一旦结合,SIC开始向mRNA下游区搜索,直到找到第一个AUG密码子。3.分子标记的特点:(1)直接以DNA的形式表现,在生物体的各个组织、各个发育阶段均可检测到,不受季节、环境限制,不存在表达与否等问题;(2)数量极多,遍布整个基因组,可检测座位几乎无限;(3)多态性高,自然界存在许多等位变异,无须人为创造;(4)表现为中性,不影响目标性状的表达;(5)许多标记表现为共显性的特点,能区别纯合体和杂合体。4.GT-AG规则:外显子与内含子的连接点尽管非常短但是仍有极端保守的共有序列.明确了内含子末端是特定的共有序列.在每个保守位点处,下标代表该位置规定碱基出现的百分率。一般内含子中此序列为GT…AG。因为内含子两端剪接点的识别是根据起始点是双核苷酸GT,结束点是AG来确定的,所以剪接点的这种特征又称为GT-AG规则(Rule)(实际上RNA中的序列是GU-AG)。内含子剪接的分子机制之一。3.RNA链合成特点:t在依赖DNA的RNA聚合酶作用下进行转录tA=U、C≡G合成RNA分子t转录合成RNA链的方向为5’→3’,模板单链DNA的极性方向为3’→5’,而非模板单链的极性方向与RNA链相同,均为5’→3’。(书写)t基因转录方式为不对称转录(一条单链DNA为模板,RNA聚合酶的结合)6.转录的基本过程:无论是原核还是真核细胞,转录的基本过程都包括:模板识别、转录起始、通过启动子及转录的延伸和终止。?模板识别:RNA聚合酶与启动子DNA作用并与之结合。在DNA形成转录泡?转录起始:从启动子到终止子称为转录单位(转录起始点);转录起点即转录原点记为+1,其上游记为负值,下游记为正值。?通过启动子:转录起始后直到9个核苷酸短链?转录延伸:RNA聚合酶离开启动子,沿DNA链移动并产生新RNA链伸长。?终止:不再形成磷酸二酯键,RNA-DNA分离,转录泡瓦解,DNA恢复双链。8.原核生物的RNA聚合酶:大肠杆菌的RNA聚合酶:全酶由5种亚基2个α、β、β’、σ组成,σ因子与其它部分的结合不是十分紧密,它易于与β’、β、2个α分离,没有σ的酶称为核心酶——只催化链的延长,对起始无作用。五种亚基的功能分别为:α亚基:与启动子结合功能。β亚基:含催化部位,起催化作用,催化形成磷酸二酯键。β’亚基:与DNA模板结合功能。σ亚基:识别起始位点。9.σ因子控制酶与DNA的结合?全酶(α2ββ’σ)可被分为两部分:核心酶(α2ββ’)和σ因子(sigma因子,σ多肽)。?只有全酶才能起始转录。σ因子能够保证细菌RNA聚合酶稳定地结合到某个特异的、唯一的DNA启动子上。RNA链合成达8~9个碱基时,σ因子释放,离开核心酶,由后者负责延伸。核心酶能在DNA模板上合成RNA,但不能在正确的位点起始转录。?核心酶对DNA有一定亲和性,在这种结合反应中,核心酶所结合的某段DNA变为疏松结合位点,聚合酶从DNA上解离的半衰期大约为60分。?核心酶不能区别启动子和其它DNA序列。14.ρ因子如何行使功能?ρ因子是E.coli的一种基本蛋白质,只在终止阶段发挥作用。其分子量约46kD,活性形式为六聚体(275kD),作为RNA聚合酶的辅助因子行使功能。ρ因子沿着RNA追赶聚合酶,当聚合酶在依赖于ρ因子的终止子处作短暂停顿时将其捕获,从而导致转录终止。15.RNA的编辑(RNAediting)是某些RNA,特别是mRNA的一种加工方式,它导致了DNA所编码的遗传信息的改变,因为经过编辑的mRNA序列发生了不同于模板DNA的变化。RNA编辑的另一种形式是尿苷酸的缺失和添加。16.RNA的化学修饰:除了RNA的编辑之外,有些RNA,特别是前体rRNA和tRNA,还可能有特异性化学修饰。研究证实,仅人细胞内rRNA分子上就存在106种甲基化和95种假尿嘧啶产物,虽然尚未发现特征性保守序列,但有实验证据表明,RNA的化学修饰可能具有位点特异性。有实验表明,分子量只有70-100个核苷酸的核仁RNA(snoRNAs)参与RNA的化学修饰,因为这些RNA能通过碱基配对的方式,把rRNA分子上需要修饰的位点找出来。第四章原核基因表达调控模式1.基因表达调控:随着生物个体的发育,DNA分子能有序地将其所承载的遗传信息,通过密码子-反密码子系统转变成蛋白质,执行各种生理生化功能。科学家把从DNA到蛋白质的过程称为基因表达,对这个过程的调节就称为基因表达调控。2.基因表达调控主要表现在以下二方面:?转录水平上的调控(transcriptionalregulation);?转录后水平上的调控(post-transcriptionalregulation),包括:(1)mRNA加工成熟水平调控(dif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