围绕siRNAs的相关实验详细步骤及总结实验一:细胞传代培养材料:15ml离心管、枪(头1ml、200ul、10ul)、无菌吸管、培养瓶、含10%FBS的RPMI—1640(OVCAR-3)、M5A(SKOV-3)、PBS、trypsin等步骤:(以下均在超净台内,酒精灯旁操作)(SKOV-3)1、打开超净台,将离心管、枪(头)、吸管等工具置于紫外线下照射30min;含10%FBS的RPMI—1640、trypsin、PBS放在37°C水浴恒温箱中预热。2、取一个生长良好的细胞培养瓶(密度适中,细胞成梭形连接,贴壁良好),弃旧培养基,PBS2ml清洗2次(切勿用力吹打)。3、用移液枪取trypsin1ml沿细胞生长壁对侧壁注入,然后放平培养瓶,使贴壁细胞与trypsin充分接触,置于CO2培养箱2min左右(时间不能太长,以免损伤细胞)。4、往培养瓶中加入16401~2ml,随后用移液枪将悬液移到15ml离心管中,离心1000r/min,5min。5、弃上清液,加入少量10%FBS的1640培养基使成细胞悬液。6、分装,按1:2~3传代,每瓶4~5ml。倒置显微镜下观察(细胞突起消失变圆形,细胞间隙等距),标记。7、放入CO2培养箱中培养,第二天观察生长状况。总结:1、在用离心机时,看清楚是RCF还是RPM;调节Temp.以及Time。2、在用移液枪吸出trypsin充分消化后的细胞后,须知用少量培养液清洗一下培养瓶,并将清洗液移入离心管中。3、每取用一个容器,拧开或者拧上盖子时,注意在酒精灯上旋转一圈。另外,记住用酒精棉球经常擦拭台面。4、在用移液枪或者吸管混匀细胞悬液过程中,动作轻柔,避免产生气泡等。实验二:细胞冻存材料:15ml离心管、枪(头1ml、200ul、10ul)、无菌吸管、冻存管、RPMI—1640(OVCAR-3)、M5A(SKOV-3)、FBS、PBS、trypsin、DMSO等步骤:(以下均在超净台内,酒精灯旁操作)(OVCAR-3)1、打开超净台,将离心管、枪(头)、吸管等工具置于紫外线下照射30min;FBS、RPMI—1640、trypsin、PBS放在37°C水浴恒温箱中预热。2、取一个生长良好的细胞培养瓶(密度适中,细胞成梭形连接,贴壁良好,汇合度达到95%左右),弃旧培养基,PBS2ml清洗2次。3、用移液枪取trypsin1ml沿细胞生长壁对侧壁注入,然后放平培养瓶,使贴壁细胞与trypsin充分接触,置于CO2培养箱2~3min。4、往培养瓶中加入16401~2ml,随后用移液枪将悬液移到15ml离心管中,离心1000r/min,5min。5、取冻存管一个,往里面分别加入100ulDMSO(须避光保存)、200ulFBS、700ul1640,用移液枪轻轻吹打混匀。标记好细胞类型,时间等。6、弃上清液,加入冻存液使成细胞悬液。7、细胞悬液加入冻存管后,放在降温盒中,置于-80°C冰箱过夜,第二天再放入液氮罐中保存。总结:1、常用细胞保护剂有甘油和二甲基亚砜(DMSO),可使冰点降低,在缓慢解冻过程中,能够使细胞内水分在冻结前透出细胞外。2、细胞冻存和复苏应遵循缓慢降温、快速复苏的原则。细胞冻存中DMSO浓度一般为5%—15%,常用10%。冻存液中血清可促进细胞复苏后的存活率。2、细胞置于-80°C可保存半年左右,液氮长期保存。3、冻存细胞从-80°C低温冰箱中转移到液氮罐中,这个操作应该在2min内完成。(冻存管会以10°C/min的速度升温,若温度上升超过-50°C,细胞会迅速恶化)实验三:细胞复苏材料:15ml离心管、枪(头1ml)、无菌吸管、培养瓶、RPMI—1640(OVCAR-3)、FBS、PBS等步骤:(以下均在超净台内,酒精灯旁操作)(OVCAR-3)1、打开超净台,将离心管、枪(头)、吸管等工具置于紫外线下照射30min;FBS、RPMI—1640放在37°C水浴恒温箱中预热。2、快速(2min内)从低温冰箱中取出OVCAR-3细胞置于37°C水浴箱内解冻。3、往培养瓶中加入164010ml,随后用移液枪将悬液移到15ml离心管中,离心1000r/min,5min。4、弃上清液,加入新的培养基,用移液枪轻轻吹打混匀成悬液。5、按照1:2分装到培养瓶中,做好标记。6、置于CO2培养箱中培养观察。总结:1、细胞在-5°C—0°C最易受损,故复苏时应快速置于37°C水浴箱中(尽量2min内完成)。2、由于DMSO突然稀释会给细胞造成严重的渗透性伤害,稀释细胞存活率降低,复苏后应该缓慢稀释细胞悬液,3、冻存细胞从-80°C低温冰箱中转移到液氮罐中,这个操作应该在2min内完成。(冻存管会以10°C/min的速度升温,若温度上升超过-50°C,细胞会迅速恶化。)4、倘若细胞冻存状态不是很好,可用含血清培养基稀释DMSO至终浓度为1%,或者低速离心800rpm左右。实验四:细胞铺板及siRNA转染材料:15ml离心管、枪(头1ml、200ul、10ul)、无菌吸管、EP管、6孔板、siRNA、10%FBS的RPMI—1640(SKOV-3)、M5A(OVCAR-3)、PBS、trypsin、SiRNA转染试剂等步骤:(以下均在超净台内,酒精灯旁操作)(本实验采用OVCAR—3,VRoche:MsiRNA=5:1,培养基V=1ml)1、打开超净台,将离心管、枪(头)、吸管等工具置于紫外线下照射30min;1640、trypsin、FBS放在37°C水浴恒温箱中预热。2、取一个生长良好的OVCAR—3细胞培养瓶(密度适中,细胞成梭形连接,贴壁良好),弃旧培养基,PBS2ml清洗2次。3、用移液枪取trypsin1ml沿细胞生长壁对侧壁注入,然后放平培养瓶,使贴壁细胞与trypsin充分接触,置于CO2培养箱2~3min。(细胞突起消失,渐变圆形,细胞间隙增大停止消化)4、加入16401ml配成悬液,随后用移液枪将悬液移到15ml离心管中,离心1000r/min,5min。5、弃上清液,加入1640混成1ml悬液;细胞计数。6、取6孔板分别标记为CTL、NC、S2,孔板先加培养基1ml/孔,然后细胞100ul/孔。倒置显微镜下观察(细胞突起消失变圆形,细胞间隙等距),标记日期,姓名,细胞种类等。7、取6个无酶EP管,分别标记为CTL、CTL1、NC、NC1、S2、S2a。CTL管、NC管、S2管分别加入无血清的Opti-MEMI培养基100ul,然后用移液枪往三管中各加入10ul的SiRNA转染试剂(Roche);CTL1管、NC1管、S2a管分别加入无血清Opti-MEMI培养基100ul,然后NC1管、S2a管依次加入7.58ul的NC、7.58ulSiRNA(S2)。最后,CTL1移入CTL、NC1移入NC、S2a移入S2,用移液枪吹打混匀。7、按CTL组每孔105ulCTL管液;NC组每孔108.79ulNC管液、S2组每孔108.79ulS2管液,依次加入。8、充分混匀后,放入CO2培养箱中培养48h,westernblotting用。实验五:western印迹法材料:EP管、15ml离心管、枪(头1ml、200ul、10ul)、高速离心机、分光光度仪、—20°C低温冰箱、摇床、垂直板电泳转移装置、96孔板、PBS(0.01mol/LPH7.3)、细胞裂解液(RIPA+PMSF+磷酸酶抑制剂)、碧云天SDS-PAGE试剂盒、甲醇、PVDF膜、4xSDS上样缓冲液、电泳缓冲液、转膜缓冲液、丽春红染液、考马斯亮蓝溶液、脱脂奶粉、TBST、抗体、显影液等液体配制:1×电泳缓冲液:Tris3.03g+甘氨酸14.4g+SDS1g加蒸馏水至1L(溶解后常温保存,可重复使用3—5次)10×电泳缓冲液:Tris30.3g+甘氨酸144g加ddH2O,定容至1000ml(此储存液可长期常温保存。配置时,可先加入700ml去离子水,待全部溶解后,加水至1000ml)转膜缓冲液:Tris5.8g+甘氨酸2.9g+SDS0.37g+甲醇200ml加蒸馏水1L(溶解后常温保存,可重复使用3—5次)封闭液(5%):脱脂奶粉5g+TBST100ml(溶解后4°C保存)TBST:20xTBS25ml+蒸馏水475ml+Tween-20500ul(0.05‰~1‰)细胞蛋白提取步骤:1、准备材料,配备好细胞裂解液(RIPA:PMSF:磷酸酶抑制剂=100:1:1),置于4°C冰上待用。2、将六孔板的培养基去掉,用预冷的PBS1ml/孔,洗2次。3、加入预冷的细胞裂解液,70ul/孔;置于冰上30min,裂解过程中经常弹一弹使细胞充分裂解。EP管标记为CTL、NC、S2。4、用细胞塑料刮将贴壁细胞轻轻地刮下。用移液枪将已裂解的细胞分别移入预冷的已标记好的EP管中。5、将分装标记好的EP管置于—80°C保存待用。蛋白含量测定步骤:1、取已冻存的蛋白液室温融化后,4°C离心12000rpm,30min。2、将EP管置于4°C冰上,弃去沉淀,吸取上清液于新的预冷EP管中,分别标记为CTL1、NC1、S2a。3、取一个96孔板,采用其中6孔作为标准孔分别加入各种试剂(ul)。编号123456ddH2O2520151050BSA0510152025(Totalvolume:25ul)4、往三个加样孔中分别加入22.5ulddH2O(DDI),CTL1、NC1、S2a三管中各取2.5ul蛋白液分别加入到三个加样孔中。按照反应液A∶B=50∶1,三个样品孔和六个标准孔中分别加入200ulAB混合液。5、混匀后,放在37°C培养箱中30min。6、在生物分光光度计上比色分析,制作标准曲线。随后得到样品蛋白质浓度。按照上样蛋白35ug计算蛋白上样体积,加入蛋白上样缓冲液制成电泳上样品,100°C金属浴10min左右即可,—80°C保存备用。总结:1、当反应液和待测蛋白放在37°C培养箱中30min后,尽快测定蛋白浓度(随反应时间推移,所测蛋白浓度会增高)。SDS-PAGE电泳步骤:1、清洗玻璃板玻璃板两面先用洗衣粉或者清洁剂轻轻擦洗,然后用自来水冲,再用蒸馏水冲洗干净后置于烤箱中烘干。2、灌胶与上样(1)玻璃板对齐放入夹中卡紧(以免漏胶),然后垂直卡在架子上准备灌胶。(2)目的蛋白为:CSTB14KDβ-actin43KD,按照碧云天的操作说明,根据蛋白分子量选定分离胶浓度为12%。加入10%AP和TEMED后立即摇匀灌胶(操作过程中避免产生气泡),待胶面升至绿带中间线位置即可停止灌胶,注入适量异丙醇或者蒸馏水(加入时要慢,以免胶被冲变形,确保分离胶在一条水平线上),等待凝胶,此过程约30min—45min。(3)待异丙醇和胶之间有一条折线时,倒去胶上层异丙醇或者蒸馏水并用吸水纸将水吸干。(4)按照碧云天说明书配浓缩胶,加入TEMED后立即摇匀,将剩余空间灌满浓缩胶后将梳子水平插入浓缩胶中(梳子底端离分离胶应该适当距离),待浓缩胶凝固,此过程约30min。(5)按照小玻璃板面朝内,大玻璃板面向外的原则,将其放入电泳槽中;槽那一边要垫一块塑料板且有字的一面朝外。(6)测完蛋白含量后,计算含ug蛋白的溶液体积即为上样量。取出上样样品至0.5ml离心管中,加入4*SDS上样缓冲液至终浓度为1*。(7)在电泳槽内加入事先配制好的新鲜电泳液,至少要漫过内侧的小玻璃板,捏住梳子两端竖直向上轻轻将其拔出(加样孔内不能有气泡)。用微量加样器贴壁缓慢吸取样品,插至加样孔中缓慢加入样品(避免产生气泡,加样不要太快,勿交叉使用枪头);最后于电泳外侧槽加入适量电泳液。3、电泳浓缩胶跑80V,20--30min。全部酚蓝进入分离胶,绿色的marker出现后,可适量提高电压至120V。电泳至酚蓝距分离胶底部约1cm时即可终止电泳(整个过程需约2h),然后进行转膜。转膜步骤:1、准备6张适当大小的滤纸,和一张PVDF膜;PVDF膜至于甲醇中使整个膜浸湿(约30s)。转膜用的夹子,两块海绵垫,玻璃棒,滤纸均放在转膜液中充分浸泡。2、将夹子打开使黑的