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腺病毒载体操作手册1腺病毒载体操作手册一、实验流程制备腺病毒穿梭质粒，分别高纯度无内毒素抽提腺病毒穿梭质粒和骨架质粒，共转染293A细胞，转染后6h更换为完全培养基，培养十几天，在中间四五天左右更换一次新鲜培养基，然后收集细胞和1ml培液置于15ml离心管后，液氮/37度冻融三次（冻-融要彻底），2000rpm离心5分钟，取上清即为病毒液初代原液。连续三代反复扩增收集病毒后，行病毒的大量扩增，然后通过CsCl密度梯度离心-透析联用法纯化病毒。二、实验材料（一）腺病毒载体、包装细胞和菌株该病毒包装系统为两质粒系统，组成为穿梭质粒（包括pHBAd-CMV-IRES-GFP,pHBAd-CMV-IRES-RFP,pHBAd-U6-GFP,pHBAd-U6-RFP）和骨架质粒pBHGlox（delta）E1,3Cre。其中穿梭质粒pHBAd-CMV-IRES-GFP和pHBAd-U6-GFP能表达绿色荧光蛋白（GFP）。pHBAd-CMV-IRES-RFP和pHBAd-U6-RFP能表达红色荧光蛋白（RFP）。腺病毒载体操作手册21、载体信息1)腺病毒克隆载体图谱如下：各载体用途如下表：腺病毒载体名称干扰pHBAd-U6-GFP,pHBAd-U6-RFP过表达pHBAd-CMV-IRES-GFP,pHBAd-CMV-IRES-RFP标记示踪pHBAd-CMV-IRES-GFP,1pHBAd-U6-GFP5118bpITRpSV40PolyAAmppUCoriPrCMVGFPU6LoxPITR[HindIIISalI()()()()()()NheI(1384)XbaI(456)EcoRI(742)BamHI(748)AgeI(731)SacISacIINsiINotINotINdeINdeINcoINcoI1pHBAd-U6-RFP4993bpITRpSV40PolyAAmppUCoriPrCMVRFPU6LoxPITR()()()()()()NheI(1384)XbaI(456)EcoRI(742)BamHI(748)AgeI(731)AgeINsiISacIIHindIIISacISaIINdeINdeINotINotI1pHBAd-MCMV-IRES-EGFP5322bpITRpSV40PolyAAmppUCoriIRESrMCMVEGFPITRLoxPAgeIClaIEcoRI(1042)1pHBAd-MCMV-RFP5337bpITRpSV40PolyAAmppUCoriLoxPrMCMVRFPITRCMVEcoRIBglIISmaINsiINotIPstIPAgeIClaIBamHINheIPacINcoINdeI腺病毒载体操作手册3pHBAd-CMV-IRES-RFP,pHBAd-U6-GFP,pHBAd-U6-RFP2）骨架质粒信息如下：2、细胞株293A，腺病毒的包装细胞，为贴壁依赖型成上皮样细胞，经培养生长增殖形成单层细胞,生长培养基为DMEM(含10%FBS)。3、菌株大肠杆菌菌株DH5α。用于扩增腺病毒载体和腺病毒骨架载体质粒。三、包装细胞293A细胞的培养（一）293A细胞的冻存腺病毒载体操作手册4293A细胞来源于一个用作空斑测定的亚克隆，具有易使用和易转染的特性。该细胞株对于高细胞密度很敏感，当细胞超过70%汇合时，一些细胞可能会丢失它们的表型。若细胞密度持续在70%以下，QBI-293A细胞则能连续培养3~4个月维持原有细胞特性。若以购买得到的293A作为第一代，则30代内能得到最佳结果。随着传代的次数增加，293A细胞会出现生长状态下降、突变等。为了防止此类现象的出现，我们需要在开始就对细胞进行大量冻存，以保证实验的稳定性和持续性。在细胞对数生长期进行冻存，增加细胞复苏成活率。1、去掉上清液，加入PBS洗去残留的培养基；2、加入0.25%的胰酶，消化1~2min后，镜下观察细胞变圆，细胞间间隙加大时，去除胰酶，加入新鲜培养基吹打混匀，移入离心管中。3、细胞计数，将细胞全部晃下，加入3mL37℃预热的10％DMEM，用10mL移液管进行吹打，较大力吹打6-8次即可，不留死角，之后，将所有细胞吸出，置于15mL离心管中，取50ul混匀后的细胞于1.5mLeppendorf管中，加入450ul10％DMEM，即为10倍稀释，混匀，取10ul细胞于计数板中计数。计数板上共4大格，每大格16小格。计数时，4大格均计数，总数除以4（得每大格细胞数），再乘以10（10倍稀释），即为实际n万/mL细胞浓度。4、细胞离心，1000rpm，5min。去掉上清。腺病毒载体操作手册55、根据细胞计数结果加入细胞冻存液（70%完全培养基+20%FBS+10%DMSO）,重悬细胞，密度为3x106个/ml。6、分装进细胞冻存管，放入冻存盒中，放入-80℃超低温冰箱。7、第二天将细胞放于液氮罐中长久保存，并作记录。保存过程中，要不时复苏细胞检测细胞存活率，观察细胞状态等。（二）293A细胞的传代当细胞生长到汇合率达到80%~90%时需要对细胞进行传代操作，以扩大细胞数量，维持细胞良好的生长状态。1、消化细胞，方法同细胞冻存。2、细胞离心结束后，加入完全培养基重悬。3、根据具体情况，将细胞分到10cm培养皿中，每个培养皿补足到10ml培养基。4、将培养皿平稳放回37℃、5%CO2和95%相对湿度的培养箱中培养。（三）293A细胞的复苏当细胞传代次数过多，细胞状态变差时，或者细胞出现污染事故时，需要丢弃并对最初冻存的细胞进行复苏。1、设置温度为37~42℃的水浴。2、查看细胞库记录，根据记录从液氮罐中取出冻存的细胞（需戴上棉手套，防止被冻伤），迅速丢入水浴锅中并快速晃动，尽量在腺病毒载体操作手册61~2min内使细胞溶液完全溶解。3、将细胞溶液转移到15ml离心管中，并在其中加上1ml新鲜的完全培养基，混匀后离心，1000rpm，5min。4、去掉上清，加入5ml新鲜的完全培养基，混匀沉淀后，转入6cm培养皿。5、将培养皿平稳放入37℃、5%CO2和95%相对湿度的培养箱中培养。6、第二天观察细胞存活率。给细胞换一下培养基。以后每天观察细胞生长情况。四、腺病毒包装、扩增和纯化（一）腺病毒包装事先准备好用于包装病毒的293A细胞和病毒质粒，转染每个直径为6cm的培养皿complex成分如下：穿梭质粒2μgp-BHG(delta)E1,3cre4μgOptiMEM需在37度水浴中预热，LipofiterTM转染试剂需恢复至室温方可使用，使用前需摇匀。转染后6h换新鲜培液。注：LipofiterTM转染试剂为汉恒生物产品，使用说明参考LipofiterTM说明书。转染前细胞必须处于良好的生长状态。病毒实验带有一定的危险性，为了您的安全和健康，请穿实验服并戴一次性手套，在生物安全柜里进行实验操作。腺病毒载体操作手册7（二）病毒收集病毒收集前要观察病毒空斑是否形成，为限制病毒的扩散及空斑更好的形成，通常在培养液中加入琼脂糖，感染后7天左右可以在显微镜下看到小的空斑，一般在10至21天内形成，空斑形成后连着琼脂糖一起将空斑挑起，放入新鲜培养基中过夜。（三）病毒扩增第二天，将培养基中病毒加入新鲜293A细胞培养液中进行病毒少量扩增。至细胞再次出现空斑，收集细胞及上清，反复冻融三次收集病毒，以此病毒为P1代病毒，以P1代腺病毒感染293A细胞，连续进行三代感染，至P4代进行腺病毒的大量扩增，待空斑形成后收集病毒并对病毒进行体外纯化和浓缩。（四）病毒纯化病毒纯化采用CsCl密度梯度离心-透析联用法纯化病毒，CsCl梯度的制备方法如下：加入2.0ml密度为1.40g/ml的CsCl溶液（溶剂同上），然后缓慢加入3.0ml密度为1.30g/ml的CsCl溶液，再加入5ml的病毒悬浮液。20000rpm，室温离心2小时。收集密度在1.30g/ml和1.40g/ml之间的病毒条带至透析袋中（透析袋使用前用10mM的EDTA－Na2煮沸10min）。在透析缓冲液（50g蔗糖，10ml1MTris-HCl，PH8.0，2ml1MMgCl2定容至1L）中，4℃搅拌透析过夜，中间换一次透析液。收集病毒，测定病毒滴度。腺病毒载体操作手册8（五）病毒重悬和保存500ulPBS重悬病毒沉淀，一周内使用则置于4度冰箱保存，如需长时间存放需置于-80度甚至液氮保存。五、感染目的细胞因为不同细胞的MOI不同，所以在将病毒感染正式感染目的细胞前，需要做一个预实验以确定目的细胞中加入的病毒数。（一）细胞准备将状态良好的目的细胞接种到24孔板，使细胞浓度为1×105/ml细胞，接种细胞数量因细胞的生长速度而略有不同，一般是保证第二天进行病毒感染的时候细胞汇合率介于50%至70%直接。（二）病毒感染1.polybrene的选择：Polybrene:是带正电的小分子，与细胞表面的阴离子结合，提高腺病毒对细胞的感染效率，通常加入polybrene能提高感染效率2～10倍。Polybrene有一定的细胞毒性，有的细胞对polybrene的毒理反应明显，因此细胞感染时是否适合polybrene需要摸索；不同细胞对polybrene的敏感度不同，可以用1～10μg/ml的范围筛选合适的浓腺病毒载体操作手册9度，以24h内细胞无明显毒性反应为佳，可参考文献并进行预实验摸索，polybrene最常用的工作浓度为5～8μg/ml。注：1）汉恒生物的自产的Polybrene产品，用户可用以进行辅助感染。提供的Polybrene母液保存在-20℃（可保存1年以上），避免反复冻融3次以上，否则活性受影响。4℃可保存2周。2）Polybrene预实验请先以对照病毒进行摸索，大部分腺病毒感染的细胞可不加Polybrene即获得很高转染效率。具体情况以预实验结果为准！2.感染细胞最佳MOI的测定MOI（MultiplicityofInfection，感染复数）是指每个细胞感染的病毒数。通常MOI越高，腺病毒感染后宿主细胞内保留的腺病毒基因组数量以及目的蛋白的表达量越高。腺病毒对于不同种类不同来源的细胞，其最适MOI各有差别，原则上最适MOI是感染效率较好的最低MOI。原则上每种细胞对应每种类型的病毒都应该进行最适MOI摸索实验，设置MOI梯度摸索实验，选择适合的MOI进行实验。MOI一般以1：3：5或者1:3:10进行梯度摸索，一般的细胞基础腺病毒感染MOI可以10为开始，即10，30，50或者10，30，100。MOI对应病毒体积的换算转染时细胞数（一般以传代计数细胞数×2计算）×MOI=病毒个数；则加入的病毒体积数=病毒个数/病毒滴度。例子：转染细胞数为105个，MOI为100，则需要病毒的个数为腺病毒载体操作手册10107个，病毒如果滴度为1010PFU/ml,则需要加入的病毒体积为107/（1010PFU/ml）=10-3ml=1ul。同理，300，500相应为3ul，5ul。详细的细胞数/MOI/病毒体积换算参见附1表格（三）I、贴壁细胞感染实验分为两组，分别添加相应腺体病毒载体和等滴度同体积的对照病毒载体，1/2体积培养液感染（详见下表格）。加入的病毒量范围推荐MOI为=10，30，100，300，500内，每个MOI值加两个孔。对于增殖能力较弱的细胞，比如特别是一些原代细胞如神经元、心肌细胞，1/2体积感染2小时足够，2小时后只换成新鲜培液。对于增殖能力较强的细胞，如BMSC（骨髓间充质干细胞），1/2体积感染2小时后，不换液，而是追加1/2新鲜培液，继续37度感染过夜，有利于提高感染效率。对于polybrene适用的细胞，1/2体积感染的培液中，polybrene浓度为固定值（5～8ug/ml）；如2小时后停止感染置换新鲜培液，则无需再加入polybrene（针对上述增殖能力弱的细胞）；如2小时1/2体积感染后继续追加培液感染过夜，则补充的新鲜培液中要含有等终浓度的polybrene。病毒小培养体积感染表培养皿表面积对应细胞培养液体积病毒感染对应细胞培养液体积类型/cm296-wel