生物分析和药物筛选软件介绍

生物分析和药物筛选软件介绍生物化学分析工具GeneiousProv4.8.5英文版32位中文名:生物化学分析工具英文名:GeneiousPro版本:v4.8.5发行时间:2010年制作发行:BiomattersLtd地区:美国语言:英文版简介:Geneious为所有分子的生物学家和的生物化学家而设计，分析复杂DNA及蛋白等生物资料的一个应用软件。Geneious是一个功能全面的生物信息学分析工具，适用于分子生物学和生物化学等领域。它使用方便，可以用来对基因序列或蛋白质的三维结构信息进行分析，是分析复杂生物资料的最佳选择。Geneiouspro是基因组学和蛋白组学综合研究工具软件，该软件为分子生物学研究人员提供了蛋白、基因序列分析、显示、文献检索、序列比对、进化树分析、ORFs查找、引物设计等多种分析功能。且针对科研单位和学术部门有一个较为优惠的价格。Geneious是一个综合，跨平台的生物资讯软体,包括操纵，发现，分享，并探讨生物数据，例如脱氧核糖核酸或蛋白质序列，phylogenies，三维结构信息，自动更新出版文献等，它的功能包括序列比对和phylogenetic分析，contigassembly，primers和restrictionanalysis，使用NCBI和EMBL,BLAST,蛋白质结构，自动化NCBIPubmed搜索，和更多。它甚至包括API因此您可以创造您的生物资讯插件为什么不现在下载Geneious,体验免费的GeneiousPro!您可以在我们的userforum与其他用户讨论Geneious，尝试免费的插件，下载GeneiousAPI来创建您自己的插件或如果您喜欢使用GeneiousPro,购买license您可以永远使用所有的Geneious功能！PopularGeneiousProusecases这里只是其中的一些GeneiousPro能为您做的日常研究工作例子.序列分析:*共有序列，DNA与Protein转换和补充complement*双序列与多重序列分析选择，包括Progressive双序列并列分析及alignmentofnucleotidetranslation*进化树建设与UPGMA，与NJwithbootstrapping和consensustrees*方便用户插件MrBayesbayesian贝氏分析*打印trees,演化分析研究*Findmotifs,openreadingframes(ORFs)and更多...序列可视化:*可定制的图形浏览器和序列编辑器，alignments和annotations说明*互动phylogenetic进化树查与快速选择源序列alignment*图形的更新，实时其中包括序列标识，色谱痕迹和蛋白质性质*三维蛋白质结构观察*Fast,interactivedotplotsand更多...实验室序列分析*自动整理Contigassembly，装配，色谱编辑*限制酶*设计引物与含糊和错配*Testindividualprimersorsearchasetofprimersforthebestmatches更多...组织序列和出版文献数据库*在一处地方存储和组织您所有的科研材料，*根据序列相似性搜索和排序，基本和先进的全文检索数据*广泛的文件输入与输出，包括Endnote，Nexus，Newick,fasta，PDF,ABI,更多!！*为序列sequences,alignmentsandtrees加入您自己的定制的注释，更多...下载蛋白质序列和基因序列:*从NCBI（包括基因，基因组，核苷酸，单核苷酸多态性，结构和蛋白质)拖放序列*与Pfam数据库紧密结合*保持您的NCBI和EMBL下载自动更新*NCBIBLAST序列*公共数据下载迅速过滤，更多...生物资讯教学*利用Geneious创造互动教程与直接联繫的材料*只需一个按键就可以使用所有的生物资讯工具*学生能回答问题，做分析，然后使用collaboration提交其结果更多...PubMed搜索:*自动检索新近发表文章，可以根据您的兴趣自动给新发表文章分类*存储的摘要和书目信息中文名:生物化学分析工具英文名:GeneiousPro资源格式:压缩包版本:v4.8.5发行时间:2010年制作发行:BiomattersLtd地区:美国语言:英文简介:Geneious为所有分子的生物学家和的生物化学家而设计，分析复杂DNA及蛋白等生物资料的一个应用软件。Geneious是一个功能全面的生物信息学分析工具，适用于分子生物学和生物化学等领域。它使用方便，可以用来对基因序列或蛋白质的三维结构信息进行分析，是分析复杂生物资料的最佳选择。Geneiouspro是基因组学和蛋白组学综合研究工具软件，该软件为分子生物学研究人员提供了蛋白、基因序列分析、显示、文献检索、序列比对、进化树分析、ORFs查找、引物设计等多种分析功能。且针对科研单位和学术部门有一个较为优惠的价格。Geneious是一个综合，跨平台的生物资讯软体,包括操纵，发现，分享，并探讨生物数据，例如脱氧核糖核酸或蛋白质序列，phylogenies，三维结构信息，自动更新出版文献等，它的功能包括序列比对和phylogenetic分析，contigassembly，primers和restrictionanalysis，使用NCBI和EMBL,BLAST,蛋白质结构，自动化NCBIPubmed搜索，和更多。它甚至包括API因此您可以创造您的生物资讯插件*共有序列，DNA与Protein转换和补充complement*双序列与多重序列分析选择，包括Progressive双序列并列分析及alignmentofnucleotidetranslation*进化树建设与UPGMA，与NJwithbootstrapping和consensustrees*方便用户插件MrBayesbayesian贝氏分析*打印trees,演化分析研究*Findmotifs,openreadingframes(ORFs)and更多...序列可视化:*可定制的图形浏览器和序列编辑器，alignments和annotations说明*互动phylogenetic进化树查与快速选择源序列alignment*图形的更新，实时其中包括序列标识，色谱痕迹和蛋白质性质*三维蛋白质结构观察*Fast,interactivedotplotsand更多...实验室序列分析*自动整理Contigassembly，装配，色谱编辑*限制酶*设计引物与含糊和错配*Testindividualprimersorsearchasetofprimersforthebestmatches更多...组织序列和出版文献数据库*在一处地方存储和组织您所有的科研材料，*根据序列相似性搜索和排序，基本和先进的全文检索数据*广泛的文件输入与输出，包括Endnote，Nexus，Newick,fasta，PDF,ABI,更多!！*为序列sequences,alignmentsandtrees加入您自己的定制的注释，更多...下载蛋白质序列和基因序列:*从NCBI（包括基因，基因组，核苷酸，单核苷酸多态性，结构和蛋白质)拖放序列*与Pfam数据库紧密结合*保持您的NCBI和EMBL下载自动更新*NCBIBLAST序列*公共数据下载迅速过滤，更多...生物资讯教学*利用Geneious创造互动教程与直接联繫的材料*只需一个按键就可以使用所有的生物资讯工具*学生能回答问题，做分析，然后使用collaboration提交其结果更多...PubMed搜索:*自动检索新近发表文章，可以根据您的兴趣自动给新发表文章分类*存储的摘要和书目信息*Quicklinkstofindoriginalarticlesandcitationrecordonline.更多...GeneiouscombinesalltheleadingDNAandproteinsequenceanalysistoolsintoonerevolutionarysoftwaresolution!Itseaseofusemakesbioinformaticsaccessibletoanybiologist.Itrunsonallmajoroperatingsystemsandisveryaffordable.GeneiousPro4.8isthesecondreleaseinathreephasereleasestrategyforNext-GensequencingsupportandnowimportsSOLiDandSolexasequencesaswellas454sequences.Thenew,fastdenovoassembleriscapableofassemblinga5mbbacterialgenomeforhalfamillionsequencesgeneratedbytheSangerand454high-throughputmethodsinunder30minuteswhilemaintainingthemostuser-friendlyenvironmentavailableforresearchinthelifesciences.OthernewfeaturesinGeneiousPro4.8include:*Ultra-fastdenovoassembler*Primerextensionsupport*Primerdesignonalignmentsandassemblies*Mapprimertosequence*Trimbyprimers*Batchexport*ImportFastQ,CsFasta,Qualfileformats*Add,removeandcombineenzymesfromlists*Findintranslatedsequence*Qualitystatisticsonchromatograms*Statistics:readlengthandchromatogramquality*BundledEMBOSSTools专业分子模拟平台TRIPOSSYBYLV2.0英文版中文名:专业分子模拟平台英文名:TRIPOSSYBYL版本:V2.0英文版/Windows版发行时间:2013年制作发行:Tripos地区:美国语言:英文版简介:SYBYL套装软体，Tripos出品的专业分子模拟平台，涵盖了分子模拟与显示、定量构效关係和ADME、药效团模型、生物资讯学、基於结构的药物设计、化学资讯学和数据库、组合化学和分子多样性、NMR数据处理、化合物实体提供等多种与药物研究和开发相关的方向，为用户提供全面的药物设计和生物化学研究的解决方案。Sybyl是Tripos公司专门为药物小分子与生物大分子科学领域研究者所设计分子模拟软体。模拟的内容包括了药物小分子的建模、构象分析、三维定量构效关係研究、药效团建模、虚拟筛选、生物大分子的同源模建、活性位点分析、数据库搜索等。SYBYL-X2.0的新亮点有：1、在分子操作方面：点击与重原子连接的、处于隐藏状态下的氢原子时，该氢原子也会被选择，在之后的相关操作中此氢原子也会受到影响；典型的使用方案包括：查看蛋白质的结合位点并着色；删除配体或把它提取到另一个分子显示区域；单独显示配体为球棍状模型；标注特定的原子；为配体创建一个表面。2、在数据库方面：配体数据库和生物高分子词典参考RCSB库重新生成。新的文件包含了12975个条目，极大地改进了配体中的原子和键的类型并且修改了PDB文件中不合理的氨基酸残基。3、在使用说明方面：可以在bookshelf中找到制作好的一些介绍SYBYL工作流的视频。4、在大规模并行计算方面：支持安装有Surflex-Dock和Surflex-Sim的商业队列系统。6、新增MolecularDataExplorer(MDE)分子数据分析工具：SYBYL-X2.0引进了分子数据分析