生物化学复习重点

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第二章蛋白质1、凯氏定氮法:蛋白质含量=总含氮量-无机含氮量)×6.25例如:100%的蛋白质中含N量为16%,则含N量8%的蛋白质含量为50%100%/xg=16%/1gx=6.25g2、根据R基的化学结构,可将氨基酸分为脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、杂环氨基酸和杂环亚氨基酸。按照R基的极性,可分为非极性R基氨基酸、不带电荷的极性R基氨基酸、极性带负电荷的R基氨基酸、极性带正电荷的氨基酸。类别氨基酸名称缩写符号简写符号非极性丙氨酸AlaA缬氨酸ValV亮氨酸LeuL异亮氨酸IleI苯丙氨酸PheF甲硫氨酸(蛋氨酸)MetM脯氨酸ProP色氨酸TrpW极性不带电荷甘氨酸GlyG丝氨酸SerS苏氨酸ThrT天冬酰胺AsnN谷氨酰胺GlnQ酪氨酸TyrY半胱氨酸CysC极性带负电荷(酸性氨基酸)天冬氨酸AspD谷氨酸GluE极性带正电荷(碱性氨基酸)组氨酸HisH赖氨酸LysK精氨酸ArgR3、氨基酸的重要理化性质(1)一般物理性质无色晶体,熔点极高(200℃以上),不同味道;水中溶解度差别较大(极性和非极性),不溶于有机溶剂。氨基酸是两性电解质。氨基酸等电点的确定:酸碱确定,根据pK值(该基团在此pH一半解离)计算:等电点等于两性离子两侧pK值的算术平均数。(2)化学性质①与水合茚三酮的反应:Pro产生黄色物质,其它为蓝紫色。在570nm(蓝紫色)或440nm(黄色)定量测定(几μg)。②与甲醛的反应:氨基酸的甲醛滴定法③与2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应:形成黄色的DNP-氨基酸,用来鉴定多肽或蛋白质的N端氨基酸,又称Sanger法。或使用5-二甲氨基萘磺酰氯(DNS-Cl,又称丹磺酰氯)也可测定蛋白质N端氨基酸。④与异硫氰酸苯酯(PITC)的反应:多肽链N端氨基酸的α-氨基也可与PITC反应,生成PTC-蛋白质,用来测定N端的氨基酸。4、肽的结构线性肽链,书写时规定N端放在左边,C端放在右边,用连字符将氨基酸的三字符号从N端到C端连接起来,如Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu。命名时从N端开始,连续读出氨基酸残基的名称,除C端氨基酸外,其他氨基酸残基的名称均将“酸”改为“酰”,如丝氨酰甘氨酰酪氨酰丙氨酰亮氨酸。若只知道氨基酸的组成而不清楚氨基酸序列时,可将氨基酸组成写在括号中,并以逗号隔开,如(Ala,Cys2,Gly),表明此肽有一个Ala、两个Cys和一个Gly组成,但氨基酸序列不清楚。由于C-N键有部分双键的性质,不能旋转,使相关的6个原子处于同一个平面,称作肽平面或酰胺平面。5、、蛋白质的结构(一)蛋白质的一级结构(化学结构)一级结构中包含的共价键主要指肽键和二硫键。(二)蛋白质的二级结构(1)α-螺旋(如毛发)结构要点:螺旋的每圈有3.6个氨基酸,螺旋间距离为0.54nm,每个残基沿轴旋转100°。(2)β-折叠结构(如蚕丝)(3)β-转角(4)β-凸起(5)无规卷曲(三)蛋白质的三级结构(如肌红蛋白)(四)蛋白质的司机结构(如血红蛋白)6、蛋白质分子中氨基酸序列的测定氨基酸组成的分析:•酸水解:破坏Trp,使Gln变成Glu,Asn变成Asp•碱水解:Trp保持完整,其余氨基酸均受到破坏。N-末端残基的鉴定:鉴定N-末端的氨基酸残基常用2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应或丹磺酰氯反应。异硫氰酸苯酯(PITC)反应也可用于鉴定N-末端的氨基酸残基,但主要是用于测定肽段的氨基酸序列。C-末端残基的鉴定:•肼解法:蛋白质或多肽与无水肼加热发生肼解,反应中只有C端氨基酸以游离形式存在。•还原法:肽链C端氨基酸可用硼化锂还原成相应的α-氨基醇,可用层析法加以鉴别。•羧肽酶法:羧肽酶从羧基端(C端)一个一个切。多肽链的裂解:酶切位点或作用特点:•胰蛋白酶:Lys,Arg的C侧•糜蛋白酶(胰凝乳蛋白酶):Phe,Tyr,Trp的C侧•梭菌蛋白酶:Arg的C侧•葡萄球菌蛋白酶:Asp或Glu的C侧•嗜热菌蛋白酶:Leu,Ile,Val的N侧•氨肽酶:从氨基端(N端)一个一个切•溴化氰(CNBr):Met的C端•羟胺:Asp的C侧,Gly的N侧7、蛋白质的沉淀反应:加高浓度盐类;加有机溶剂;加重金属盐类;加某些酸类;加热。8、氨基酸的颜色反应第三章核酸1、核苷酸由含氮碱基(嘌呤或嘧啶),戊糖(核糖或脱氧核糖)和磷酸组成。核酸是核苷酸的多聚物,其连接键是3’,5’-磷酸二酯键。2、生物体内的AMP(腺苷酸)可与一分子磷酸结合,生成ADP(腺苷二磷酸),ADP再与一分子磷酸结合,生成腺苷三磷酸(ATP)。各种核苷三磷酸(ATP、GTP、CTP和UTP)是体内RNA合成的直接原料,各种脱氧核苷三磷酸(dATP、dGTP、dCTP、dTTP)是DNA合成的直接原料。在体内能量代谢中的作用:ATP—能量“货币”UTP—参加糖的互相转化与合成CTP—参加磷脂的合成GTP—参加蛋白质和嘌呤的合成第二信使—cAMP(3’,5’-环状腺苷酸)3、核苷酸的性质:(一)一般理化性质:①为两性电解质,通常表现为酸性;②DNA为白色纤维状固体,RNA为白色粉末,不溶于有机溶剂;③DNA溶液的粘度极高,而RNA溶液要小得多;④RNA能在室温条件下被稀碱水解而DNA对碱稳定;⑤利用核糖和脱氧核糖不同的显色反应鉴定DNA与RNA。(二)核酸的紫外吸收性质:核酸的碱基具有共轭双键,因而有紫外吸收性质,吸收峰在260nm(蛋白质的紫外吸收峰在280nm)。增色效应;减色效应。核酸结构的稳定性:碱基对间的氢键;碱基堆积力;环境中的正离子。核酸的变性:将紫外吸收的增加量达到最大增量一半时的温度称熔解温度(Tm)。核酸的复性:Tm-25C4、双螺旋结构模型要点(1)两条多核苷酸链反向平行。(2)碱基内侧,A与T、G与C配对,分别形成3和2个氢键。(3)双螺旋每转一周有10个(bp)碱基对,每转的高度(螺距)为3.4nm,直径为2nm。5、双螺旋结构的稳定因素(1)氢键(太弱);(2)碱基堆积力是稳定DNA最重要的因素;(3)离子键(减少双链间的静电斥力)。6、DNA的三级结构线形分子、双链环状(dcDNA)→超螺旋7、tRNA主要作用是转运氨基酸用于合成蛋白质。RNAi(RNA干扰)用双链RNA抑制特定基因表达的技术称RNA干扰。snRNA(核小RNA)主要存于细胞核中,占细胞RNA总量的0.1~1%,与蛋白质以RNP(核糖核酸蛋白)的形式存在,在hnRNA和rRNA的加工、细胞分裂和分化、协助细胞内物质运输、构成染色质等方面有重要作用。第四章糖类1、还原糖是指具有还原性的糖类。在糖类中,分子中含有游离醛基或酮基的单糖和含有游离醛基的而糖都具有还原性。还原性糖包括葡萄糖、果糖、半乳糖、乳糖、麦芽糖等。2、在多羟基醛或多羟基酮中,有些羟基上的氢原子可以和酮基(羰基)发生加成反应,这样会生成一个羟基,这就是半缩醛羟基。3、如果没有半缩醛羟基就没有还原性。4、单糖分船式构象和椅式构象。常见单糖衍生物有糖醇、糖醛酸、氨基糖及糖苷等。5、多糖没有还原性和变旋现象。多糖的结构包括单糖的组成、糖苷键的类型、单糖的排列顺序3个基本结构因素。代表物有:淀粉:淀粉与碘的呈色反应与淀粉糖苷链的长度有关:链长小于6个葡萄糖基,不能呈色。链长为20个葡萄糖基,呈红色。链长大于60个葡萄糖基,呈蓝色。糖原:糖原又称动物淀粉,与支链淀粉相似,与碘反应呈红紫色。纤维素;半纤维素;琼脂;壳多糖(几丁质);第五章脂质和生物膜1、必需脂肪酸包括:亚油酸、亚麻酸和花生四烯酸。2、3、生物膜的组成:膜蛋白质(膜周边蛋白和膜内在蛋白)、膜质(磷脂、固醇及糖脂)和膜糖类。4、流动镶嵌模型:生物膜是一种流动的、嵌有各种蛋白质的脂质双分子层结构。5、膜的流动镶嵌模型结构要点:①膜结构的连续主体是极性的脂质双分子层。②脂质双分子层具有流动性。③膜的内在蛋白“溶解”于脂质双分子层的中心疏水部分。④外周蛋白与脂质双分子层的极性头部连接。⑤双分子层中的脂质分子之间或蛋白质组分与脂质之间无共价结合。⑥膜蛋白可作横向运动。6、生物膜的功能:①物质传递作用。②保护作用。③信息传递作用。④细胞识别作用。⑤能量转换作用(线粒体内膜和叶绿体类囊体膜)。⑥蛋白质合成与运输(糙面内质网膜)。⑦内部运输(高尔基体膜)。⑧核质分开(核膜)。第六章酶的概念与特点1、酶的催化特点:高效性、专一性、敏感性和可调性。2、酶的化学本质:除核酶外,大多数酶的化学本质是蛋白质。3、酶的化学组成:根据化学组成,酶可分为单纯蛋白质的酶和缀合蛋白质的酶(又称全酶)。全酶中的蛋白质部分为脱辅酶,非蛋白质部分称为辅因子。两者单独存在时均无催化活性。脱辅酶通常具有结合底物的作用,决定了酶作用的专一性,辅因子通常是作为电子、原子或某些化学基团的载体。4、酶的类型:根据酶蛋白分子结构不同,酶可分为单体酶、寡聚酶和多酶复合体三类。5、根据酶促反应的类型,把酶分为六大类:(1)氧化还原酶类①氧化酶②脱氢酶(2)转移酶类(3)水解酶类(4)裂合酶类(5)异构酶类(6)合成酶类v=Vmax/2,则:km=[S]当km大,说明ES容易解离,酶与底物结合的亲和力小。(4)从km的大小,可以知道正确测定酶活力时所需的底物浓度。在进行酶活力测定时,通常用4km的底物浓度即可。(5)km还可以推断某一代谢物在体内可能的代谢途径。当丙酮酸浓度较低时,代谢走哪条途径决定于km最小的酶。9、米氏常数可根据实验数据作图法直接求得:先测定不同底物浓度的反应初速度,从v与[S]的关系曲线求得V,然后再从1/2V求得相应的[S]即为km(近似值)。通常用Lineweaver-Burk作图法(双倒数作图法)10、11、在最适的反应条件(25℃)下,每分钟内催化一微摩尔底物转化为产物的酶量定为一个酶活力单位,即:1IU=1μmol/min酶分离纯化的三个基本步骤:抽提,纯化,结晶或制剂。方法:1.根据溶解度不同(盐析法、有机溶剂沉淀法、等电点沉淀法、选择性沉淀法);2.根据酶与杂蛋白分子大小的差别(凝胶过滤法、超离心法);3.根据酶和杂蛋白与吸附剂之间吸附与解吸附性质的不同(吸附分离法);4.根据带电性质(离子交换层析法、电泳分离法、等电聚焦层析法);5.根据酶与杂蛋白的稳定性差别(选择性变性法);6.根据酶与底物、辅因子或抑制剂之间的专一性亲和作用(亲和层析法)。第七章维生素和辅酶各种维生素的主要活性形式及其功能类型人体内的主要活性形式主要功能缺乏导致病症维生素A11—顺视黄醛暗视觉形成夜盲症、干眼病维生素D1,25—二羟维生素D3调节钙与磷的代谢佝偻病、软骨病维生素E(生育酚)α—生育酚抗氧化作用、维持动物正常生殖功能生殖器官受损不育,心肌受损,贫血维生素K(凝血维生素)维生素K1和K2参与凝血因子的激活过程,促进凝血凝血时间延长维生素B1(硫胺素)硫胺素焦磷酸(TPP)参与α—酮转移、α—酮酸的脱羧和α—羟酮的形成与裂解等反应脚气病(多发性神经炎、皮肤麻木、心力衰竭、肌肉萎缩)维生素B2(硫胺素)黄素单核苷酸(FMN)黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD)参与氧化还原反应,传递氢和电子空腔发炎、舌炎、角膜炎、皮炎维生素PP烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP+)参与氧化还原反应,转移氢和电子癞皮症(皮炎、腹泻及痴呆)泛酸(遍多酸)辅酶A(CoA)酰基转移作用很少出现泛酸缺乏症维生素B6磷酸吡哆醛,磷酸吡哆胺氨基酸转氨基,脱羧作用未发现缺乏的典型病例生物素生物胞素传递CO2很少出现缺乏症,疲乏、恶心、呕吐、食欲不振、皮炎及脱屑性红皮病叶酸四氢叶酸传递一碳单位很少出现缺乏症,缺乏时产生巨红细胞贫血维生素B12(氰钴胺素)5’—脱氧腺苷钴胺素、甲胺钴胺素氢原子重排作用,甲基化很少出现缺乏症,缺乏时产生巨红细胞贫血硫辛酸硫辛酸赖氨酰酰基转移,电子转移/维生素C维生素C(抗坏血酸)抗氧化作用,羟基化反应辅因子坏血病第八章新陈代谢总论与生物氧化1、在具有线粒体的生物中,典型的呼吸链有两种,即NADH呼吸链与FADH2呼吸链。呼吸链由线粒体内膜上几个蛋白质复合物组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