第11章建立一个序列表

11-1第11章建立一个序列本章解释了一个序列的功能，并描述了如何利用这个SequenceEditor序列编辑器来建立和编辑序列文件。学习到如下内容:页面:序列如何工作HowaSequenceWorks2利用序列编辑器UsingtheSequenceEditor4定义全局参数DefiningGlobalParameters11通过模板建立一个序列BuildingaSequencebyTemplate13通过瓶号定位建立一个序列BuildingaSequenceVialbyVial17编辑序列电子表格EditingtheSequenceSpreadsheet27从序列编辑器内部更改操作环境ChangingEnvironmentsFromWithintheSequenceEditor50建立一个来自文本文件的序列BuildingaSequencefromaTextFile52利用索引文件UsingIndexFiles59打印序列信息PrintingSequenceInformation5911-2序列如何工作HowaSequenceWorks序列控制了TotalChrom中一系列进样产生的色谱数据的采集和分析。TotalChrom在一个电子表格中显示了序列信息，由一个或多个columns栏和rows行组成。栏是电子表格中纵向的元素，行是水平的部分。这些栏包含那些有关控制数据采集、处理和报告的参数。行可以指定一次分析或指定TotalChrom将要运行的一次程序。一次分析指定的行被归类为一个cycle循环。每个循环包含TotalChrom在采集和分析一次（或两次）进样产生的数据时需要的所有信息。一些仪器中，循环可能包含控制两次同时进样的信息。这些被称为dualinjections双重进样。一次循环可以指定一个未知样品的一次校准或一次分析。如果这个循环指定了一次校准，TotalChrom利用运行中获得的数据来更新方法中的校准数据。如果这个循环显示的是一个未知样品的分析，TotalChrom处理运行（采用以前校准的方法）中获得的数据来生成定量结果。TotalChrom如何利用一个序列HowTotalChromUsesASequence一个序列能够让TotalChrom通过一系列进样需要的程序提供的所有信息来获取的数据。您可以采用一个自动进样器自动收集和分析数据，自动进样器可以被连接到一个900系列界面或一个LINK界面（Interface）上。有关连接自动进样器来实现不同程度自动化的信息，参见900系列界面的介绍手册。当您设定一个仪器运行一个序列时，TotalChrom下载这个方法（这些方法）的仪器参数部分到您正在使用的界面上。没有这些参数，界面就不能开始获取数据，也不能运行一个LINK控制的仪器。当TotalChrom上载这些从每次运行界面上获得的数据时，它利用这个序列中的剩余参数和它的参考方法来进行处理。BuildingaSequence建立一个序列11-3序列中的信息TheInformationinaSequence一个序列文件包含两种类型的信息，也涉及到如下这些参数：用来识别一个特定分析样品的数值，如sampleparameters样品参数。影响TotalChrom如何处理和存储样品数据的信息，如processingparameters处理参数。两种类型的参数之间的主要区别是：对于两种通道（A和B）一些参数有不同的值；而对于两通道其它的必须是同样的值。为了显示这些差别，采用不同的颜色编码SequenceEditor序列编辑器电子表格中的这些条目栏：黄色栏中必须有相同的值；蓝色栏中可以有不同的值。一个双重进样序列的这个特殊情形下，当然除（仪器）方法之外，两个通道中的所有参数可以不同。有关对Sequencespreadsheet序列电子表格中的这些栏的描述，参见第11章第6页。11-4利用序列编辑器UsingtheSequenceEditor您可以利用SequenceEditor序列编辑器来创建新的序列和修饰现存的序列。您可以通过下面的方式来创建新序列：利用模板来建立一个新序列。利用小瓶来建立一个新序列瓶号。通过对其编辑和重命名来从现存的序列文件中建立一个新序列。从一个文本文件来建立一个新序列。从一个SQL*LIMS工作列表来建立一个新序列（如果您有Connect联接的话；有关信息参见Connect联接文档）。您可以通过更改、添加或删除数据来修饰现存序列。序列编辑器中的菜单和命令MenusandCommandsintheSequenceEditor您可以从SequenceEditor序列编辑器菜单条中选择这些命令，您可以在一个快捷键菜单或工具栏随时显示您想显示的命令。这个SequenceEditor序列编辑器包含下列菜单：文件菜单FileMenu允许您来创建、打开、保存和打印序列文件；在打印之前预览一个序列文件；输入和查看有关一个序列的文档；退出SequenceEditor序列编辑器。编辑菜单EditMenu允许您对序列文件编辑行，例如通过cutting剪切、copying复制、pasting粘贴和删除deleting它们来实现。您也可以复制和粘贴单元格模块，从外部电子表格应用程序中来复制数据或粘贴过去数据。更改菜单ChangeMenu允许您对序列文件中的数值进行更改，例如用重复或增量值填充行。您也可以对文件名进行浏览；更改全局参数；创建样品备注和导入程序信息。BuildingaSequence建立一个序列11-5创建菜单BuildMenu允许在当前序列中追加（添加）新循环；基于一个模板上追加循环；在当前序列中追加入另一个序列文件。Buildmenu创建菜单也包含了那些允许您通过导入、添加或合并入一个文本文件创建一个序列的命令。格式菜单FormatMenu允许您隐藏和不隐藏栏；调整栏宽度；对通道A和B同步栏宽度；和对这个电子表格选择一种字体。操作菜单ActionsMenu用于切换到Setup启动项；在序列中再处理数据（利用这个BatchReprocessing批再处理程序）；切换到MethodEditor方法编辑器，更改当前序列中引用的方法参数。视图菜单ViewMenu用来显示和隐藏这个SequenceEditor序列编辑器工具条和EditBar编辑条。窗口底部的这个StatusBar状态条会显示关于这个序列的重要信息和有关您选择的每个命令和工具条按钮的Help帮助信息。您不能隐藏SequenceEditorStatusBar序列编辑器状态条。如果您更改了当前序列的某一部分，状态条StatusBar也显示这个单词“Modified修饰过的”。序列电子表格TheSequenceSpreadsheetTotalChrom在电子表格格式中显示序列信息。通道A和通道B在独立的窗口出现。当一个仪器仅能收集一个单一通道的数据时，就仅一个电子表格出现。这个电子表格窗口有下列特征：11-6编辑条EditBar――显示当前选择的这个单元格中所有内容。您可以移动光标到这个编辑条，并在此处输入文本。在编辑条里输入的文本应该是单元格中内容的真实反映，反之亦然。您不能利用这个编辑条编辑包含一个下拉式列表的单元格。栏标签ColumnLabel――用来识别这个栏的所有单元格中信息的类型。栏标签显示在电子表格每一栏顶部的抬头位置。在“ColumnsintheSpreadsheet电子表格中的栏”中对分栏有详细解释。行编号RowNumbers――总是在电子表格的第一栏。因为一个电子表格可能包含比当前窗口中显示的还要多的行，行编号帮助您在这个电子表格中寻找您的位置。单元格Cell――一行和一栏交叉形成的一个方框。一个单元格包含数据的一个条目：一个文本串，一个整数或者一个实数。在所给栏中的所有单元格包含相同类型的数据。黑色显示的单元格不适用于当前行的上下文。视窗制表ViewTab――显示与这个制表相关联的栏。电子表格中的栏ColumnsintheSpreadsheet一个序列电子表格由这部分列出的这些栏组成。以黄色背景显示的这些栏对两个通道必须有相同的值。蓝色背景显示的栏对每个通道可以有不同的值。对于一个双重进样序列，这个（仪器）方法栏仅是黄色栏。如果这个TotalChrom应用程序管理员已经指定这些栏仅可读，那么它们将是灰色背景显示，暗示不能编辑这些栏。类型Type――定义一行的属性，哪一行是一个分析、一次校准、一个外部程序或一次清除（运行结束）。每个类型的描述遵循这个列表。研究名称StudyName――这个分析研究的名称。名称Name――这个样品的名称。备注Note――对某一行已经输入文本、程序或连续稀释信息时，这一行的备注栏会显示一个“X”。编号（样品编号）Number(SampleNumber)――这个样品的确认编号。位置（进样位置）Site(InjectionSite)――定位自动进样器在前进样口还是后进样口进样（仅用于LINK控制的气相色谱）。进样塔盘Rack――当使用的是Varian瓦里安或Micromeritics自动进样器时，要进行进样的小瓶在进样盘上的编号。小瓶Vial――这个用于样品的小瓶编号。BuildingaSequence建立一个序列11-7方法Method――在GlobalParameters全局参数对话框中，如果您选择的是OnePerRow一行一个，TotalChrom将对这个仪器、处理和校准参数采用相同的方法。如果选择的是MultiplePerRow一行多个，会有下面这些栏出现，来替代Method方法栏：仪器方法InstMethod(InstrumentMethod)――这个方法包含有仪器参数。处理方法ProcMethod(ProcessingMethod)――这个方法包含这些处理参数。校准方法CalibMethod(CalibrationMethod)――这个方法包含了组分和校准参数。报告格式文件RptFmtFile(ReportFormatFile)――这个报告格式文件用于一行的要被打印的第一个报告。（您可以在这个方法的处理部分指定附加的报告选项）数据文件DataFile――在GlobalParameters全局参数对话框，如果您选择SameName相同的名称，TotalChrom同时对原始和结果文件应用相同的基名称。如果您选择SeparateNames独立名称，替代DataFile数据文件出现的是下面这些栏：原始数据文件RawDataFile――这个文件包含了原始数据。结果文件ResultFile――这个文件包含了分析结果。当运行这个序列时，TotalChrom追加一个唯一的后缀在这个数据文件的基本名之后。校准报告CalibRpt(CalibrationReport)――决定在打印一个校准报告时，是否包含大量的细节内容。校准水平CalLevel――这个校准水平的名称。更新保留时间UpdateRT(RetentionTimes)――决定是设定这个校准为更新色谱峰保留时间数据还是保持原始数据。样品量SampleAmt――进样样品中排除内标物的量之外的实际量。基于（校准）方法的设定上，这个值可作为校准标准的一个修正，和/或转换未知样品到已知浓度单位。内标物量IntStdAmt(InternalStandardAmount)――样品中内标物组分的总量。样品体积SampleVol(SampleVolume)――进样的实际体积。稀释因子DilFactor(DilutionFactor)――这个值是指制备样品时稀释剂或水的量。11-8乘数Multiplier――TotalChrom用这个值乘以原始组分量来获得调整后的量。除数Divisor――TotalChrom用原始组分量除以这个值来获得调整后的量。加数Addend――TotalChrom将这个值添加到原始组分量上来获得调整后的量。一个负值是合法的。标准化因子NormFactor(NormalizationFactor)――这个标准化因子用于报告标准化量和标准化面