第一章安装和执行程序1第一章 安装和执行程序 VectorNTI目前为网络版本,需要连到主机确认用户权力后才能运作。厂商并没有针对授权时间进行限制,因此只要设定好LicenseServer的相关设定即可使用,不需要额外进行申请。但用户IP位置必须位于海洋大学校内,方可与授权服务器联机。请下载下面这个档案进行安装以下将说明如何设定的过程,变更为自服务器取得授权的方式:1.选取开始→程序集→Invitrogen→VectorNTIAdvance10→LicenseManager(图1.1)。图1.1授权设定2.在Applications页面中(图1.2),点选下面的Dynamic按钮,上面四个字段请填上使用者的姓名,系所单位,电话和电子邮件位置,最下面一栏URLofDLS请入以下字符串:。DLSServerrequiresauthentication目前不需要勾选。VectorNTI教育训练手册2图1.2授权设定窗体3.在InternetSettings(图1.3)里面建议选取DirectConnection,这样当IE设定Proxy之后,才不会导致VectorNTI因为IP不在校内而不能联机。图1.3VectorNTI授权网络设定 4.设定之后可以点选TestConnection,程序会自动联机测试,如果在右边的联机结果显示ConnectionOK(图1.4),就表示设定成功;如果显示Connectionerror,则表示联机不成功,如果有开启防火墙/防病毒软件,请关闭或调整设定后再试一次。图1.4VectorNTI授权网络设定,成功右下角会显示ConnectOK第一章安装和执行程序35.设定成功后,在Dynamiclicense的页面记得按下Apply,最后在Applications(图1.5)把所有项目的Demomode改成Dynamiclicense。图1.5授权设定,将所有的Demomode改为Dynamiclicense 6.依上述流程开启VectorNTI应该都可以正常用户许可证运作,如果发生联机问题请与本中心的人员联络。 联机设定完成后就可以开始执行程序来操作了,首先NTI的文件夹有许多项目可供选择:其中一个为主程序(VectorNTI),而其他的功能项目是附加在主程序底下,可以各别开启操作,也可以在主程序下面执行(图1.6)。图1.6VectorNTI主程序及附属程序主程序开启各别开启VectorNTI教育训练手册4首次进入主程序后系统将提示是否允许将新数据填入VectorNTI数据库中,点选OK。这样DNAmolecules,proteins,enzymes,oligos,andgelmarkers将组成NTI的数据库,并出现下列三个窗口(图1.7)。图1.7左边为文字窗口,右边为图谱窗口,下方为序列窗口 这三个窗口为文字窗口、图谱窗口和序列窗口。文字窗口会将分析结果,作简单的文字叙述,并且可以自动做注记;图谱窗口会将序列以一个卡通图形进行说明,同时具有绘图的功能;序列窗口会将分析结果,标定在序列上面,以序列呈现出来。 接下来就是将序列加载程序中,我们可以将实验或是搜寻所获得的序列数据放进程序,本文将以一个针对斑马鱼基因筛选实验所得到的序列作为范例。加载序列最直接的方式是从程序的左上角点选File→Open将序列档案开启,但是注意档案必须为GenBank/GenPept,EMBL/SWISS-PROT或FASTA、ASCII等格式,要在符合格式的情况下才能顺利开启序列。另一种方式是用剪贴的方式将序列贴入程序中,将在第二章介绍。文字窗口图谱窗口序列窗口