搜索
本地blast的安装及使用安装：1.首先进入NCBI2.点击ALLResources3.点击ALLResources里的Downloads选项卡4.点击BLAST（Stand-alone）选项在BLAST+executables中点击链接（这只是说这个链接如何找到的，可以直接点击这个链接进行下载）。5点击ncbi-blast-2.2.29+-win32.exe进行下载，大家的电脑一般为32位的，加入为64位的则需要点击ncbi-blast-2.2.29+-win64.exe下载，根据个人情况定6下载好后点击“下一步“进行安装。运行：1.点击电脑桌面的“开始“——”运行“，在”打开“中输入”cmd“,(这也就是调取DOS命令，快捷键”windows“+“R“键，然后回车)2切换到blast的bin目录下，例如我的路径是C:\ProgramFiles\NCBI\blast-2.2.29+\bin，那么我的命令是：然后回车。切换后的结果是：3把你的物种数据和比对的数据文件移动到bin文件夹下，然后做下面的。1）建库根据你要比对的物种序列建库dos命令：makeblastdb-in~-dbtypenucl/prot-out~in后面的‘~’里填要建库的序列文件名称，如整个水稻蛋白质组第二个‘~’里填库的名称（自己命名）nucl:建核苷酸库，prot:建蛋白质库（根据你数据要求任选一个）2）比对dos命令：blastp/blastn-query~-db~-out~-evalue~-outfmtblastp为比对蛋白质序列，blastn比对核苷酸序列query后面的‘~’填你要比对的序列文件名db后面填你第一步建好库的名称out输出最终结果名称evalue你自己设一个期望值(5)outfmt输出文件格式填数字6或7（1）建库结果（2）比对：结果：去bin文件夹下去寻找。resultname就是我们本地BLAST的最终结果结果是这样子的：（outfmt6）（outfmt7）的结果大家可以下载VIM软件进行查看结果。记事本也能看。我的邮箱是1021486717@qq.com希望大家多多讨论。2014年9月28日23:13:34大家可以找一下一些感兴趣的数据进行建库，比对练习。