生物信息学:第七讲-InterPro蛋白功能预测和GO

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第七讲InterPro蛋白功能预测和GO功能分类IntroPro在domain的水平上对未知的序列进行注释例:对给定的未知功能的序列预测其功能InterPro主页InterPro主页上的功能有(左边):InterProhomeTextSearchInterProScanDatabasesDocumentationTextSearchInterProScanDatabasesDocumentation在InterProScan的页面上输入未知功能的序列等待结果显示预测到的结果:ABCtransporter点击结果页面左边的IPR003439查看更加详细的信息点击结果页面左边的PF00005查看更加详细的信息GO:基因本体论三个成次:1.biological_process(P)2.cellular_component(C)3.molecular_function(F)GO主页对前面预测到的结果进行功能分类:输入ABCtransporter显示查找到的结果点击查看molecular_function成次(缩写F)查找到IPR003439作业:对给定的2个未知功能的序列(unknown1,unknown2)使用InterPro预测其功能,并用GO对功能进行分类

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