学习vesalius3D总结

整理文档很辛苦,赏杯茶钱您下走!

免费阅读已结束,点击下载阅读编辑剩下 ...

阅读已结束,您可以下载文档离线阅读编辑

资源描述

总结经过将近一个月对ps-medtech的培训和学习,我们团队从中收获了不少知识,当然也遇到一些问题,但最终经过共同的努力,也找到了解决办法。现将一些学习过程和心得体会给老师和同学共同分享和交流。学习流程:1.翻译Vesalius3D英文手册。2.查找相关资料。3.对ps-medtech进行分工与合作。4.归纳操作当中遇到的问题以及解决方案。5.应用。6.致谢。翻译Vesalius3D英文手册由于对ps-medtech不了解,所以我们团队选择先对Vesalius3DManual进行翻译。最后将其翻译成Vesalius3D中文手册。在Vesalius3D中文手册中,因为涉及的专业词汇比较多可能我们翻译的有许多差异。希望读者及时指出并修正。图1多视图Vesalius3D中文手册主要包含引言、3D显示仪数据库、3D显示仪。其中主要论述3D显示仪。由于没有PACS系统的IP地址,该系统由医院提供。所以我们针对3D显示仪的主窗口布局、加载数据、人体坐标系、数据视图、协议、陈述状态、数据的可视化、编辑、量化工具进行详细讲解。其中详细的讲解了数据视图、数据的可视化和量化工具。数据视图主要包括二维视图、三维视图视图和改变视图布局。二维视图用于可视化的横截面,或切片,三维数据集。有三种不同类型的二维视图:轴位,冠状位和矢状位,与病人的坐标相对应。三维视图是用于直接呈现在三个维度的数据。三维视图特征自然的三维交互,先进的体积可视化,和选择提供多个容量集组合。视图的几何形状可以改变三种方式:脱体视图、最大化视图、全屏视图(如图1多视图)。数据的可视化从窗口的层次和宽度、立体的透视图、与观看到的数据相互配合使用、采集点的位置、控制数据、驱动不定常的数据、3D视图的设置、遮幅数据、控制容量数据的可视化、控制数据的几何形状、等值面方面具体介绍了对数据可视化的操作。窗口的层次和宽度是可视化数据的重要参数。在图片中,窗口参数定义的密度范围转而变为明显的遮光物的颜色。窗口参数的设置根本上控制了最后图像的亮度和对比度。窗口宽度的密度被绘制成可视的颜色,同时也会影响参照物。在Vesalius3D的3D视图模式中支持为传统2D显示和立体的3D显示提供可视化数据。在立体显示中,Vesalius3D为用户提供了3D眼镜,可以让用户在这种立体感的状态下,快速的理解数据,可以让用户更快的分析数据。Vesalius3D通过颜色和透明度来显示图片数据密度。转移的功能可以将密度程度用颜色表示。这个功能是在数据上调节物体结构的光亮强度或者隐藏不想干的信息。Level和Width的滑条可以控制窗口级别和宽度。他们提供更快的方法去选择那些感兴趣和隐藏不相关的数据特征的数据范围。对于更多的复杂的转移功能的控制,可以通过EditCurves按钮弹出一个转移功能的编辑界面。图2EditCurvesPanel和PositionPickingPanelvesalius3D量化工具。测量距离、测量角度、测量区域轮廓、测量体积。可以在2D视图和3D视图进行测量。在2D视图里主要运用鼠标和键盘进行操作。然而在3D视图中需要运用3D设备操作。测量距离可以是两点之间的距离、线段、轮廓之间的距离。测量角度主要是三点之间组成的角度。它是先定义一个起点,然后转折点,随后终点。测量体积主要运用于3D视图,也可以对其进行体积分割,从而确定区域,在空间上连接,相对均匀的强度分布在长期。在某些情况下,用户可以手动修改分割结果。分割模块包含分割区域的变化,变形或正确的部分的选项。其中包括生产区、萎缩区域。图3测量Contour、Distance、Angle、Volume查找相关资料经过对Vesalius3DManual的粗略翻译,我们了解了它的一些基本功能。但是对于它的具体应用和相关操作并不是很了解。所以我们通过浏览ps-medtech的官方网页()、百度查找了相关资料、浏览PST-Iris官方网页()。3D显示仪是对医学图像数据可视化和加工的软件包,适用于通过影像设备产生的3D/4D图像数据(CT,MRI,PET,PET-CT,SPECT-CT,Ultrasound等)。它是明确的设计来开发3D互动和可视化性能。3D显示仪展示先进的特性和高质量容积显示技术并可以常规且立体地呈现出来。3D显示仪数据库可以导入多种3D图像格式,包括2D图像的普通格式,各种原始格式以及DICOM图像(“.dcm”)。它的图像通信和图像文件格式以及从PACS中检索图像都符合DICOM标准。3D显示仪设计来可视化和分析3D数据的各种模态。它完全支持4D数据的各种绘制模式,包括等值面绘制,直接体绘制,最大灰度投影法而且可以使多个不同形式的数据结合起来。另外,3D显示仪支持各种3D模型格式的几何数据(分层的),可用来使分割的医学几何模型可视化。其中PACS系统是PictureArchivingandCommunicationSystems的缩写,意为影像归档和通信系统。它是应用在医院影像科室的系统,主要的任务就是把日常产生的各种医学影像(包括核磁,CT,超声,各种X光机,各种红外仪、显微仪等设备产生的图像)通过各种接口(模拟,DICOM,网络)以数字化的方式海量保存起来,当需要的时候在一定的授权下能够很快的调回使用,同时增加一些辅助诊断管理功能。它在各种影像设备间传输数据和组织存储数据具有重要作用。由于现在还没有与医院进行合作所以此功能未实现,但是基本操作方式在Vesalius3D中文手册有详细说明。Vesalius3D的工作原理。用户通过观看镜子显示出来的3D效果去操作设备。其中反射镜的特效是为了使该显示器的虚拟焦平面(VB),与用户手中的球体位置相同从而使用户感觉数据就在自己的手中。Vesalius3D采用的是PSTIris跟踪技术,该设备持有和使用高度精确的无线光学跟踪技术。PSTIris交互设备被用于定位在3D对象具有六个自由度。使得用户分析它(内部和外部)直观,更快,更好。创建一个更好的逼真体验。PSTIris是一种光学测量/跟踪系统,其测量固定到物体主动或被动标记的三维位置。使用该信息,每个PSTIris能够确定一个特定的测量体积内的位置和标记的设备的方向。PSTIris是一个光学测量系统,可以让你把任何物体构成3D测量设备。它是Vesalius3D设备中的一个重要设备。它的基本操作和功能在PST用户手册中有详细的说明。图3PSS工作原理图5PSTIris对ps-medtech进行分工与合作ps-medtech可以分为Vesalius3D和PSTIris。其中Vesalius3D用于处理图像,而PSTIris是一种光学跟踪系统。所以我们为了快速熟练操作文档,我们团队进行分组学习。一组操作熟练Vesalius3D中文手册。一组操作PSTIris并且编写PST用户手册。最后进行相互学习操作。所以更多对ps-medtech的详细操作请参考Vesalius3D中文手册和PST用户手册。归纳操作当中遇到的问题以及解决方案由于操作文档不是详细,所以在对ps-medtech设备操作当中我们遇到了很多问题。我们将遇到的问题及解决方案列出如下:●如何启动ps-medtech设备。通过按ps-medtech背后的黑色开关按钮(总开关),然后按红色的弹簧式按钮就会打开设备。由于外接的显示屏与主设备不是用同一个电源所以需要启动外接显示屏的电源开关按钮打开显示器。●软件损坏如何还原。由于没有相关软件的安装默认在系统安装中,所以当软件出现损坏或者错误时,可以通过一键ghost中的一键还原重新还原到出厂设置(还原路径:D:~1)。或者重新安装Vesalius3D软件(F:\PSS\Soft)。●如何将Vesalius3D中的3D交互设备的箭头、十二面体与3D图像显示在同一个平面。打开PSTClient软件,点击Referencesystem选项-选择参考的设备名字-点击Setreference-点击Enterreference-点击Setreference。随后,可以在Trackingoptions的界面中查看指针和面板的状态(如图6调节Referencesystem)。图6调整Referencesystem●如何连接PACS。因为PACS系统是由医院所搭建的一个医疗影像归档和通信系统。所以我们现在无法连接到PACS。其连接操作:在Vesalius3D中的File-OpenLibrary-Vesalius3DLibrary中的File-Import-PACS-在Basic的操作界面的PACS选择需要处理的远程AE名字。如果需要添加可以点击右下角的Configure-工具栏中的PACS-RemoteAEtitle-Hostname-Port-将Secureconnections勾上它将会自动的获取Secureport-addPACS-OK-在Basic界面中填写病人的基本信息-Query。双击病人的名字就可以获得病人的图像信息(如图7PACS系统)。图7PACS系统●如何解决3D设备方向控制不准确。有时候我们在Vesalius3D操作中,发现3D互动设备的操作方向与我们实际想要的方向不匹配,这时需要我们队PSTIris进行调整。打开PSTClient-Referencesystem选项-选择设备名字-将虚拟的PSTIris调整到与显示器的界面平行-调整3D互动设备将蓝色的指针垂直于显示器界面绿色的指针垂直于虚拟的PSTIris的横轴-点击Enterreference-Setreference-OK-点击Trackingoptions,移动3D互动设备查看是否与界面一直方向(如图8调节指针),如果相反再次进入Referencesystem中进行设置(只需将绿色指针方向与原来的方向相反)。其原理是PSTIris用于朝着z轴坐标(蓝色指针))。图8调节指针●Vesalius3D中坐标的含义。在Vesalius3D中坐标地位可以在3D视图中操作也可以在2D视图中操作。其具体操作方式为用鼠标点击Vesalius3D界面中的绿色的十字架按钮,然后根据自己需要处理的数据进行定位操作。在2D视图中它将会出现一个坐标(x,y,z),其中x表示在Axial面中从R-L方向的距离;y表示Sagittal面中从A-P方向的距离;z表示Coronal面中从S-I方向的距离(注意:所有的距离都是从这种图片中的最边缘开始)。图92D视图的坐标●在Vesalius3D中Contour测量时,图像测量值与列表值不一致。对图像进行测量任意轮廓。在Vesalius3D中点击Quantification,点击绿色的加法按钮添加Contour,移动3D互动设备选择想要测量的轮廓。通过移动小球和右踏脚板处理完之后,也许会发现3D视图中所显示的轮廓大小与列表显示的数值不一致,这时可以通过新加Volume或者其它的测量工具,软件就会使其显示一致。或者点击一下其它已经编辑的测量工具也会使数值一致。事实上3D视图中显示的数据是实际值,而列表中的数据少了一段距离没有计算。图103D视图Countour与列表的数值不一致●如何正确理解Level和Width。Level和Width指窗位和窗宽。可以在Viewing中通过Level和Width滑动条进行处理,也可以在EditCurves进行编辑。调节Level相当于调节视图的对比度,调节Width相当于调节观看视图的层次和亮度(由内到外)。图11编辑EditCurves●在Vesalius3D中没有3D互动设备。有时候我们在打开PSTClient和Vesalius3D软件后没有发现3D互动设备。其原因有可能是PSTClient软件中Interfacing界面里没有点击Start。或者在Interfacing中的Serveraddress中修改有效的地址。当输入的是有效地址时,Connections会出现相应的

1 / 21
下载文档,编辑使用

©2015-2020 m.777doc.com 三七文档.

备案号:鲁ICP备2024069028号-1 客服联系 QQ:2149211541

×
保存成功