基因测序行业知识普及

基因测序行业知识普及：二代测序无法替代一代测序大多数人的想法是二代测序迟早替代一代测序，这是一个典型的外行人的误区！首先先说明，这里所说的一代测序主要是金标准的Sanger测序，以及其他分型技术和非主流的其他检测方法，例如PCR、芯片、质谱等等，简称为一代测序技术！要说一代测序跟二代测序最大的区别，用我朋友的话说就是现在美国要打本拉登，那么就要搜索本拉登在哪儿，用二代测序它只能告诉你大概范围，比如本拉登60%的概率在阿富汗，20%的概率在德国，20%的概率在美国，然后美国不可能把整个阿富汗炸平吧，更不可能炸完阿富汗去炸德国，然后再炸美国吧，那怎么办，这时候一代测序就要出动了，它可以精确扫描每一个洞穴（基因），找到以后扔一个导弹，本拉登就挂了！你不可能一上来就用一代测序去找，因为全世界洞穴太多，你也不可能用二代测序去定位本拉登，因为它显示的只是概率，究竟本拉登在哪儿还是要精确扫描过！那么回到基因测序上，雪球上有朋友说了，他到深圳想做一次全身测序，结果发现没地方做，深入问了之后发现即使做了意义也不大，因为告诉你的只是概率，甚至误差还不小，价格还很贵！美国之前有一个记者写了一篇文章，她去N个不同的实验室做了基因测序，结果得到的报告结果是截然不同的（这文章可以去百度），原因就是一方面测序的方式不同，导致准确率不同，另外一点就是各个实验室对数据的解读也不同，于是对个体某种疾病的患病风险的评估也会不同！其实这就意味着二代测序对个体而言几乎是完全无意义的。。。。这可能会颠覆很多人想象中包治百病，神之奇技一样的二代测序吧！但是，虽然二代测序对于个体而言没用，但是如果样本足够多了，就有用了！举个例子，首先，解读不同很大的一个原因还是因为样本数不足，所以大家有分歧，现在全球的样本数也不过就几百万，依然太少，其次，对你个人而言这个基因患病几率50%完全没意义，但是对于整个黄种人而言，如果集体带这个基因，有10%的黄种人有可能患这个疾病，那就有非常重大的意义了，对于药厂而言只要研发成功针对这个基因的靶向药就是赚大钱了！接着，二代测序的成本依然很贵，虽然ILMN宣称成本降低到1000美金，其实还是不够的，就算1000美金也要6000多RMB，谁会吃饱撑了去花6000块做这个检查，关键是检查完了你能得到的只是海量数据（几个TB的数据），然后你去找专业人士解答，结果5个不同的专业人士还给了你5种完全不同甚至截然相反的建议。。。所以二代测序注定是一种无痛点，普通老百姓不会花钱买单的东西，所以二代测序真正的买单人是药厂，而数据库的建立过程注定是亏钱拿样本的（比如免费给你做测序，或者100块给你做一次，你就当玩）以上是二代测序，所以雪球上那位指望去做个全身测序，看看自己未来会有哪些病的朋友该失望了，你的想法很美好，但是现在没法做，你要精确知道自己全身的基因要一代测序，但是这个测完估计得1-2年。。。而且价格极其昂贵，最后就是测出来也没用，因为解读不了，因为基因跟大多数疾病的对应研究现在才刚开始（某些特殊疾病的对应已经很成熟，比如乳腺癌之类的，其他大多数病种因为环境还有影响，所以很复杂，真正的研究现在才开始，因为测序成本大幅下降，可以用互联网模式烧钱拿样本了，只有有了足够样本才能更深入挖掘数据，找出基因跟疾病的关系）！二代测序未来的模式就是烧钱，亏本拿样本，足够多样本以后做成数据库，数据库给药厂研发指明方向，所以二代测序的买单人一定不是你我，而是药厂，或者CRO公司（罗氏一直在收购这方面公司，最近旗下的基因泰克又收了23andme的帕金森氏病数据，药明康德收购了NEXTCODE）。所以说二代测序是一个大筛子，是做科研大数据检测用的，一代测序是小筛子是做医学精准检测用的。等到药厂研发完靶向药以后需要做临床实验，以及到你头上准备用药的时候就需要一代测序技术了！举个例子，药物X对A型糖尿病有特效，Y对B型有特效，Z对C型有特效，某病人有糖尿病，去看病的时候医生就会让你去做个基因诊断，基因诊断最典型的就是现在的基因芯片，基因芯片就是一个玻璃片，上面有N条碱基链，学过生物的都知道，DNA是两条碱基链配对的，C对G，A对T，那么这个玻璃片上比如有100条碱基链，把你的碱基链拆开以后跟它去配对，一旦结合了就会发光，然后就知道你是哪种基因型了，然后就可以个性化用药了，这个过程你不可能用二代测序来完成，一方面成本太高，另外一方面准确率也有问题！所以一代测序跟二代测序是基因测序行业的2个截然不同的方向，不可能互相替代，但是又缺一不可，没有二代测序的爆发，就不会有大量靶向药，一代测序的市场就会有限（比如现在几乎只用在癌症上），而没有一代测序技术的成熟，应用二代测序数据库做出来的靶向药就无法用在个体身上！未来这2个方向都可能出大公司，我打比方，一代测序是出像罗氏，西门子，雅培那样的诊断试剂巨头，而二代测序是出像谷歌，百度那样的大数据库巨头，但是两个方向也不是没风险！一代的风险在于你要领先你必须不断研发投入，因为一旦专利到期，必然无数仿制者竞争，你要做到罗氏，西门子那样就必须不断投入研发，幸好这块中国还是有专利保护的，同时幸好中国这块跟美国是同一起跑线！二代的风险是数据库最终没有做成一家或者几家独大，而做成了现在JD的格局。。。那就得烧很多年钱，最终要么寻求被并购（被并购也肯定能卖好多钱，尤其是卖给药厂），要么做最后剩下来的才能赚钱！