原核转录与真核转录的比较答:1原核生物中mRNA的转录与翻译几乎是同步发生的,而真核生物,转录是发生在细胞核内,翻译则在核外进行.转录合成的RNA必需穿出核膜才发挥作用.2RNA聚合酶不相同,原核生物中RNA由一种聚合酶合成.真核生物中有三种类型的RNA聚合酶.3启动子不同真核生物的启动子与原核生物的很相似,也位于转录起始部位的5/端,但存在着几个重要区域.例如在距起始部位最近的一个是-25区,称为TATA匣子,与原核生物的-10顺序(TATAAT)很相似.4转录后RNA加工修饰不同其中mRNA最为突出.真核生物mRNA分子的寿命较长,不像原核生物的只有几秒钟.而且不用加工修饰.真核生物mRNA在5/和3/端都要修饰,5/端要形成一种称作帽子的复杂结构.3/端则要加上一段多聚腺嘌呤核苷酸[poly(A)]的顺序。Replicator:起始子,决定DNA复制起始的序列。Initiator:起始因子,识别并作用起始子,启动复制的蛋白质。必需氨基酸(essentialaminoacid):必须从食物中摄取,以维持生物体正常功能的氨基酸,赖(Lys)、苏(Leu)、异亮(Ile)、苯丙(Phe)、甲硫(Met)、缬(Val)、色(Trp)。蛋白质一级结构(primarystructure):蛋白质的多肽链中氨基酸的排列顺序,包括二硫键位置。特点为是基础结构、稳定结构。测定蛋白质一级结构的一般步骤(1)测定蛋白质分子中的多肽链数目(2)拆分蛋白质分子的多肽链(3)测定多肽链的氨基酸组成(4)测定多肽链的C端(肼解法)和N端(丹磺酰氯法)残基(5)断裂多肽链内的二硫键(6)用两种以上的方法将多肽链断裂为数个肽段(E法和化学法(溴化氰法))(7)测定肽段的氨基酸顺序(Edman法)(8)用拼版法确定多肽链的氨基酸排列顺序(9)确定肽链间的二硫键蛋白质一级结构测定的常用方法㈠末端残基的测定:⑴N-端残基的测定:丹磺酰氯法(DNS),该法原理与Sanger法相同,但产物有荧光,因此灵敏度高。②Edman法③氨肽酶法。(2)C-端残基的测定:肼解法、还原法、羧肽酶法。㈡二硫键的断裂与巯基的保护。㈢多肽链的断裂:至少要用两种不同的方法①酶法②化学法。酶法:用不同的蛋白酶水解同一肽链,得到不同的肽段,常用的蛋白酶及其专一性为:胰蛋白酶:羧基端为Lys和Arg的肽键;胰凝乳蛋白酶:羧基端Phe,Trp和Tyr的肽键;化学法:常用溴化氰法。㈣肽段氨基酸顺序的测定:常用Edman法。㈤多肽链氨基酸顺序的确定:拼版法。稳定蛋白质三维结构的作用力(1)氢键(2)离子键(3)配位键(4)疏水作用:是在极性环境中,氨基酸的疏水基团之间的聚集力。(5)二硫键是Cys残基的硫氢基之间通过氧化形成的共价键,存在较少,但是由于它是共价键,所以在维持蛋白质分子构象中也起主要作用,分为链间二硫键和链内二硫键。(6)范德华力当分子间结合的结构最匹配时,范德华力最大。蛋白质的立体化学原理(1)肽键平面(peptideplane)形成原因:共轭,肽键不能自由旋转。结果:形成刚性平面,又叫酰胺平面。(2)二面角(dihedralangle)共用同一原子的两个平面间的夹角称为二面角,决定主肽链骨架的构象。(3)非键合原子最小接触距离决定R基及其原子在空间的排列。蛋白质的二级结构(secondarystructure)在规则氢键指导下,局部主肽链在空间的排列。1、螺旋(helix):螺旋的表示方法“nsR或L”,其中n表示上升一圈的氨基酸数,s表示氢键形成的环中所含的原子数,R或L表示螺旋的旋转方向。2、β折叠片(β-pleatedsheet):多个β折叠股平行排列通过氢键形成β折叠片。平行的每个重复周期为0.65nm,反平行0.7nm。3、回折(reverseturn)或称转角(turn)。4、β-发夹(β-hairpin):它是由一条构想伸展的肽链弯曲,彼此靠近并呈反向平行的发夹状状结构(刚性结构),包含10或11个氨基酸残基,两条等长的肽段依靠1~6个氢键连接起来。5、无规则卷曲(randomcoil):这是一种没有一定规律的结构(软性结构),但是又是蛋白质执行功能的结构部位。6、三股螺旋(triple-strandedhelix):存在于胶原蛋白(甘—脯—羟脯)中的一种特殊结构,胶原蛋白分子由三条分子量约为120000的肽链组成。每条肽链形成左手螺旋(特点是轻微的螺旋),但内部没有氢键,三条这样的螺旋又形成右手三股螺旋,肽链间借助Gly残基的肽键之间形成氢键交联在一起,是一种超螺旋结构。7、β-突起(β-bulge):在β-折迭结构中片层出现弯曲,使局部肽链之间不是平行结构。蛋白质的超二级结构(supersecondarystructure):指相邻二级结构单元按一定规律组合,形成空间上可以区别的结构单位。类型:1、卷曲的卷曲α--螺旋(αα,coiled-coilα-helix)2、βxβ单元两段平行的β-折迭借助一个二级结构单元连接组成。当X=β-折迭时,则形成βββ;当X=α-螺旋时,则形成βαβ;当X=无规则卷曲时,则形成βCβ。最常见的βαβ是三段平行β-折迭和两段α-螺旋,这类结构称为Rossmann结构。3、β-迂回(β-meanter):由几个相邻反平行的β—折迭互相结合,中间由短链连接形成的结构。4、回型拓扑结构5、β-折迭桶(β-barrel):是大的β—折迭片层发生扭曲,最后卷曲成桶状的结构,其β-折迭可以是平行的,也可以是反平行的。6、α-螺旋-回折-α-螺旋(α-helix-turn-α-helix)这是两个α-螺旋经一个回折连接起来的结构,两个螺旋互成一定的角度。蛋白质的结构域(doman):蛋白质一条多肽链上出现紧密的、相对独立的区域。类型:⑴α-螺旋结构域⑵β-折叠结构域⑶α+β结构域⑷α/β结构域⑸无规则卷曲结构域⑹β-回折结构域蛋白质的三级结构(tertiarystructure):是指蛋白质分子中全部原子的空间排列。球蛋白都具有三级结构。三级结构特点1球状蛋白往往利用各种结构单元折叠成紧密的球状结构,各种结构单元所占的比例与蛋白质种类有关;2球状蛋白质分子的疏水基团主要趋向于内部,而亲水基团主要分布于表面,内部的疏水基是稳定的蛋白质结构的主要部分,而外部的亲水基团有利于蛋白质稳定的存在于极性的细胞环境中;3蛋白质表面的下陷区往往是蛋白质执行功能的部位;4同类球状蛋白具有基本相同的三级结构,不同的球状蛋白其三级结构是不同的,这是球状蛋白结构的专一性,但这种专一性也不是一成不变的,而是常发生一些必要的构象变化,这种专一性和灵活性的统一是蛋白功能多样性、复杂性的结构基础。蛋白质的四级结构(quaternarystructure)就是亚基在空间的排列方式。含有亚基的蛋白质称寡聚蛋白。亚基之间的主要的作用力是疏水作用力。四级结构的优越性减少遗传错误;扩大功能;节省模版;形成一定得几何构型,从而形成特殊结构的蛋白质。蛋白质的结构原则1、手性原则(handedprinciple):即蛋白质从低级结构形成高级结构时要遵从右手原则。螺旋是以右手螺旋为主,平行的折迭相互连接是右手连接,折迭片层比较大时,要发生扭曲,扭曲的方向也是右手扭曲。2、疏水表面积最小原则3、自我装配原则。波尔效应PH对血红蛋白对氧亲合力的影响,生理意义:在机体组织中因其PH低,有利于氧的释放,使组织能比氧分压降低获得更多的氧,氧的释放又促进血红蛋白与H、CO2的结合以补偿PH的降低;在肺部由于氧分压高,有利于H、CO2的释放与氧的结合。*摄入过多的脂肪会怎样?答:酸性体质,血液PH低,不利与血红蛋白结合氧,会使机体无力,脂肪分解过快,产生酮体,易造成酸中毒。*烫发:人工使二硫键改变。头发卷直软硬与二硫键的位置和多少有关。核酸的分类包括DNA和RNA(tRNA、mRNA、rRNA、SnRNA、其它)。DNA的结构:1、特点a.反平行双链右手螺旋;b.糖-Pi在螺旋线上;c.碱基伸向内部其平面垂直于轴;d.A=T、G=C;e.直径=2nm,一圈上升10对核苷酸,螺距为3.4nm;f.大沟、小沟。2.稳定作用力氢键(碱基之间,横向力);碱基堆积力(包括纵向的疏水作用力和碱基间电子的相互作用)(主要);相反电荷作用。DNA双螺旋构象的多样性1、B型DNA:天然,大多数生物的DNA都是属于这种类型。2、A型DNA:B型DNA脱水后变成A型DNA。3、Z型DNA:为左手双螺旋,DNA二级结构的多样性A、B、Z、3链、4链DNA的状态和功能+意义:有利于基因的表达调控,有利于DNA的稳定。三链及四链DNA1.三链DNA:三链结构是在正常的双螺旋结构中第三链结合在大沟中,从而形成局部三链结构。三链中正常T-A链间为反平行,第三股链与A链为平行。功能与基因调控有关,且第三股链只与特定区域结合它的存在使调控蛋白及酶难以结合,从而关闭基因,抑制解螺旋。2.四链DNA(Ttraplex):在染色体的端粒处,有(T4和G4)序列,两条链上各8个G形成局部四链结构。双螺旋结构的局部构象1、碱基对平面:形成这种构象的原因是碱基之间的互相积压。2、碱基对旋转角:平均为36°。局部构象是DNA结合蛋白识别的标志。DNA的三级结构DNA的三级结构是指DNA的超螺旋结构。1、超螺旋DNA(SupercoiledDNA):松弛态(relaxedstate)DNA中心轴与平面平行即不扭曲的状态。超螺旋:双螺旋结构的DNA再次扭曲形成的螺旋结构。右旋超螺旋---负超螺旋;左旋超螺旋---正超螺旋。2、细胞中的DNA:细胞中原核、真核DNA都以负超螺旋存在。超螺旋的重要性1.超螺旋化使分子致密,易包装;2.超螺旋化是DNA转录复制的需要。超螺旋是一种受力状态,负超螺旋引起互补链分开,局部变性。Z-DNA的形成对超螺旋化有意义,如B→Z(1个圈),DNA超螺旋结构就会发很大变化。RNA的结构特征1、碱基组成:AGCU,区别DNA:AGCT;2、一级结构:基本组成单位:核苷酸(AMP、GMP、CMP、UMP);核苷酸链接键:3’-5’磷酸二酯键;存在状态:单链,少数为双链,长度:65至60000bp。RNA构象元件(RNA有7种结构,DNA有5种结构):双螺旋、内部环(双螺旋中间出现的环,是两条链形成的)、单碱基突起(一个碱基未形成氢键)和突环(在双螺旋的中间部位且是一条链是单链,而另一条链是完整的碱基配对,是由一条链形成的)、发夹环(一个双螺旋自身的两条链形成的环)、多分支环或结合环(连接多个双螺旋结构)、假结(在一级结构上不连续的碱基,空间上形成的另一种氢键,三级结构才能看见,二级结构不配对)、单链区mRNA结构原核生物mRNA为多顺反子mRNA(polycistron),即一条mRNA可编码几条肽链,无帽子结构和尾巴,不含稀有碱基,半寿期短,二级结构有丰富的自身回折产生的双链区。真核生物mRNA为单顺反子mRNA(monocistron),即一条mRNA只编码一条肽链,5’有帽子结构3’有尾巴,含少量稀有碱基,半寿期可达一小时。tRNA结构一级结构:①分子量25000左右,73~99个核苷酸,大多数是76个核苷酸②含有较多的稀有碱基③3’为CCA④5’端磷酸化。二级结构:三叶草型。三级结构:倒L型snRNA(smallnuclearRNA):小分子核RNA,分布于细胞核,80~260个核苷酸,沉降系数4~8S,普遍存在于各种真核生物中,由于富含尿嘧啶,所以以U系列命名。功能:多样化,U1、U2、U4、U5、U6与蛋白质(剪接体)结合参与mRNA的剪接,U3与rRNA加工有关(转录后加工)等。SnoRNA(smallnucleolarRNA):小分子核仁RNA,存在于真核生物细胞核的核仁部分,功能为参与rRNA的加工,影响rRNA及其前体的形成,指导甲基化位点的形成等。反义RNA(antisenseRNA)指能与mRNA进行互补结合的单链RNA,具有调节作用。(与mRNA结合,使转录不进行,由于基因的过量表达,双链