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第一次作业1.广义的分子生物学概念包括对蛋白质和核酸等生物大分子结构与功能的研究，以及从分子水平上阐明生命的现象和生物学规律。例如，蛋白质的结构、运动和功能，酶的作用机理和动力学，膜蛋白结构与功能和跨膜运输等。2.狭义分子生物学是研究核酸、蛋白质等生物大分子的结构与功能，并从分子水平阐明蛋白质与核酸、蛋白质与蛋白质之间相互作用的关系及其基因表达调控机理的学科。3.基因是原核、真核生物以及病毒的DNA和RNA分子中具有遗传效应的核苷酸序列，是遗传的基本单位。包括编码蛋白质和tRNA、rRNA的结构基因，以及具有调节控制作用的调控基因。基因可以通过复制、转录和决定翻译的蛋白质的生物合成，以及不同水平的调控机制，来实现对遗传性状发育的控制。基因还可以发生突变和重组，导致产生有利、中性、有害或致死的变异。4.断裂基因：在真核生物基因组中，基因是不连续的，在基因的编码区域内部含有大量的不编码序列，从而隔断了对应于蛋白质的氨基酸序列。这一发现大大地改变了以往人们对基因结构的认识。这种不连续的基因又称断裂基因或割裂基因。5.外显子：基因中编码的序列称为外显子。6.内含子是在信使RNA被转录后的剪接加工中去除的区域。7.C值与C值矛盾：C值指生物单倍体基因组中的DNA含量，以pg表示（1pg=10-12g）。C值矛盾（Cvalueparadox）是指真核生物中DNA含量的反常现象。8.半保留复制：在DNA复制程程中，每个子代分子的一条链来自亲代DNA，另一条链则是新合成的，这种方式称为半保留复制。9.转座子是在基因组中可以移动的一段DNA序列。10.超螺旋结构：如果固定DNA分子的两端，或者本身是共价闭合环状DNA或与蛋白质结合的DNA分子，DNA分子两条链不能自由转动，额外的张力不能释放，DNA分子就会发生扭曲，用以抵消张力。这种扭曲称为超螺旋，是双螺旋的螺旋。第二次作业1.研究DNA的一级结构有什么重要的生物学意义?答：所谓DNA的一级结构就是指DNA分子中的核苷酸排列顺序。生物的遗传信息通过核苷酸不同的排列顺序储存在DNA分子中，DNA分子4种核苷酸千变万化的序列排列即反映了生物界物种的多样性。为了阐明生物的遗传信息，首先要测定生物基因组的序列。迄今已经测定基因组序列的生物数以百计。DNA分子的一级结构是DNA分子内碱基的排列顺序，DNA分子以密码子的方式蕴藏了所有生物的遗传信息，任何一段DNA序列都可以反映出它的高度个体性或种族特异性。DNA一级结构决定了二级结构，折叠成空间结构。这些高级结构又决定和影响着一级结构的信息功能。研究DNA的一级结构对阐明遗传物质结构、功能以及它的表达、调控都是极其重要的。2.RNA的功能主要是参与蛋白质的生物合成，起着遗传信息由DNA到蛋白质的中间传递体核心功能，此外它的功能多样性还表现在哪些方面?答：20世纪80年代对RNA的研究揭示了RNA功能的多样性，发现它不仅仅作为遗传信息由DNA到蛋白质的中间传递体的核心功能，还有以下5种功能：①控制蛋白质的生物合成；②作用于RNA转录后的加工与修饰；③参与基因表达的调控；④具有生物催化剂的功能；⑤遗传信息的加工与进化。RNA所具有的诸多功能都与生物机体的生长发育密切相关，它的核心作用是基因表达的信息加工和调节。3.实施基因工程（DNA重组技术）的重要理论基础之一是什么?答：从细菌到哺乳动物的全部生命有机体，它们的基因都是由DNA构成的。在分子水平上，由于所有生物DNA基本结构都一致，这是它们作为生物体的共性，又由于它们DNA序列上的不同，就形成了千差万别的生物界。因此，来自两种生命形态的基因（DNA）可以相互融合重组，可见，基因的DNA共性是实施基因工程（DNA重组）的重要理论基础之一。4.基因编码的主要产物是什么?答：基因的主要编码产物是多肽链，另外还包括许多编码RNA的基因，例如rRNA基因、tRNA基因以及其他小分子RNA基因等都是基因编码的产物。第三次作业1、DNA重组包括哪几个过程?Holliday于1964年提出了同源重组模型。模型中，有四个关键步骤：①两个同源染色体DNA排列整齐；②一个DNA的一条链断裂并与另一个DNA对应的链连接，形成的连接分子，称为Holliday中间体；③通过分支移动产生异源双链DNA；④Ho11iday中间体切开并修复，形成两个双链重组体DNA。根据链断裂切开的方式不同，得到的重组产物也不同。2、由转座子引起的转座过程有什么特征？答：由转座子引起的转座过程有以下特征：①能从基因组的一个位点转移到另一个位点，从一个复制子转移到另一个复制子；②不以独立的形式存在（如噬菌体或质粒DNA），而是在基因组内由一个部位直接转移到另一部位；③转座子编码其自身的转座酶，每次移动时携带转座必需的基因一起在基因组内跃迁，所以转座子又称跳跃基因；④转座的频率很低，且插入是随机的，不依赖于转座子（供体）和靶位点（受体）之间的任何序列同源性；⑤转座子可插入到一个结构基因或基因调节序列内，引起基因表达内容的改变，例如使该基因失活，如果是重要的基因则可能导致细胞死亡。3.DNA转座引起的遗传学效应是什么？转座因子首先是因其可导致突变而被认识的。当它插入靶基因后，使基因突变失活，这是转座子的最直接效应；当转座因子自发插入细菌的操纵子时，即可阻止它所在基因的转录和翻译，并且由于转座因子带有终止子，其插入影响操纵子下游基因的表达，从而表现出极性（方向性），由此产生的突变只能在转座子被切除后才能恢复。转座因子的存在一般能引起宿主染色体DNA重组，造成染色体断裂、重复、缺失、倒位及易位等，是基因突变和重排的重要原因。转座因子也可通过干扰宿主基因与其调控元件之间的关系或转座子本身的作用而影响邻近基因的表达，从而改变宿主的表型。归纳以上，转座子引起的遗传学效应可有以下几个方面：①以10-8～10-3的频率转座，引起插入突变；②在插入位置染色体DNA重排而出现新基因；③影响插入位置邻近基因的表达，使宿主表型改变；④转座子插入染色体后引起两侧染色体畸变。4、几种不同真核生物的RNA聚合酶分别转录哪些RNA？答：真核生物RNA聚合酶Ⅰ转录45SrRNA前体，经转录后加工产生5.8SrRNA、18SrRNA和28SrRNA。RNA聚合酶Ⅱ转录所有mRNA前体和大多数的核内小RNA（scRNA）。RNA聚合酶Ⅲ转录tRNA、5SrRNA、U6snRNA和不同的胞质小RNA（scRNA）等小分子转录物第四次作业1、现代分子生物学研究的主要内容有哪几方面？答：按照狭义分子生物学的定义，可以将现代分子的研究内容概括为五大方面：(1)基因与基因组的结构与功能；(2)DNA的复制、转录和翻译；(3)基因表达调控的研究；(4)DNA重组技术；(5)结构分子生物学。2、分子生物学的发展趋势是什么？答：当前，人类基因组研究的重点正在由结构向功能转移，一个以基因组功能研究为主要研究内容的“后基因组”（Post-genome）时代已经到来。它的主要任务是研究细胞全部基因的表达图式和全部蛋白图式，或者说是“从基因组到蛋白质组”。由此，分子生物学研究的重点又回到了蛋白质上来，生物信息学也应运而生。（1）功能基因组学功能基因组学的任务，是对成千上万的基因表达进行分析和比较，从基因组整体水平上阐述基因活动的规律。核心问题是基因组的多样性和进化规律，基因组的表达及其调控，模式生物体基因组研究等。这门新学科的形成，是在后基因组时代生物学家的研究重点从揭示生命的所有遗传信息转移到在整体水平上对生物功能研究的重要标志。（2）蛋白质组学蛋白质组学是以蛋白质组为研究对象，研究细胞内所有蛋白质及其动态变化规律的科学。蛋白质组与基因组不同，基因组基本上是固定不变的，即同一生物不同细胞中基因组基本上是一样的，人类的基因总数约是6万～10万个。单从DNA序列并不能回答某个基因的表达时间、表达量、蛋白质翻译后加工和修饰等情况以及它们的亚细胞分布等。这些问题可望在蛋白质组研究中找到答案，因为蛋白质组是动态的，有它的时空性、可调节性，进而能够在细胞和生命有机体的整体水平上阐明生命现象的本质和活动规律。蛋白质组研究的数据与基因组数据的整合，将对功能基因组的研究发挥重要的作用。（3）生物信息学蛋白质组计划中，由于蛋白质组随发育阶段和所处环境而变化，mRNA丰度与蛋白质的丰度不是显著相关，以及需要经受翻译后的修饰，因而对蛋白质的生物信息学研究，在内容上有许多特殊之处。现在建立的数据库，有蛋白质序列、蛋白质域、二维电泳、三维结构、翻译后修饰、代谢及相互作用等。目前通用的软件主要包括蛋白质质量与蛋白质序列标记、模拟酶解、翻译后修饰等。（4）当今生命科学的潮流是利用生物信息学研究基因产物一一蛋白质的性质与功能并推测基因的功能。传统的基因组分析是得到连续的DNA序列信息，而蛋白质组连续系（proteomiccontigs）则是基于多重相对分子质量、等电点范围、空间结构和分子构象等参数，构建活细胞内全部蛋白质表达的图像，从而使人们在研究不同条件下细胞和组织乃至整个生命体的活动成为可能。3.怎样证明DNA是遗传物质?答：（1）DNA是遗传物质的概念起源于1944年Avery等人首次证明DNA是细菌遗传性状的转化因子。他们从有荚膜、菌落光滑的Ⅲ型肺炎球菌（ⅢS）细胞中提取出纯化的DNA，加热灭活后再加入到无荚膜、菌落粗糙的Ⅱ型细菌（ⅡR）培养物中，结果发现前者的DNA能使一部分ⅡR型细胞获得合成ⅢS型细胞特有的荚膜多糖的能力。而蛋白质及多糖类物质没有这种转化能力。若将DNA事先用脱氧核糖核酸酶降解，也就失去了转化能力。这一实验不可能是表型改变，也不可能是恢复突变，因为ⅡR型菌产生的是ⅢS型的荚膜。它有力地证明DNA是转化物质。已经转化了的细菌，其后代仍保留合成Ⅲ型荚膜的能力，说明此性状可以遗传给后代。（2）1952年Hershey和Chase等利用大肠杆菌噬菌体实验证实了DNA是遗传物质的本质。在噬菌体中，DNA是惟一含磷的物质，而蛋白质是惟一含硫的物质。利用含P或S的放射性培养基培养噬菌体，得到了放射性标记噬菌体。使标记|的噬菌体吸附细菌，几分钟后离心除去未吸附的噬菌体。然后利用捣碎机捣碎使噬菌体和细菌分开。离心后细菌在沉淀中，而噬菌体在上清液中。这时发现放射性的硫有80%在上清液中，只有20%在沉淀中，而磷的情况则相反。说明在噬菌体感染的过程中，DNA进入了细菌体内，而蛋白质留在细菌体外。证明具有遗传作用的是DNA而不是蛋白质。4.作为主要遗传物质的DNA具有哪些特性?答：作为遗传物质的DNA具有以下特性：①贮存并表达遗传信息；②能把遗传信息传递给子代；③物理和化学性质稳定；④有遗传变异的能力。第五次作业1.基因与多肽链有什么关系?答：多肽链是基因的编码产物，基因的碱基序列与蛋白质分子中氨基酸的序列之间的对应关系是通过遗传密码实现的。2.分别写出病毒、原核、真核生物基因组的概念，它们各有何特点，请比较其异同。答：基因组是指细胞或生物体中，一套完整单体的遗传物质的总和；或指原核生物染色体、质粒、真核生物的单倍染色体组、细胞器、病毒中所含有的一整套基因。真核生物基因组与原核基因组相比，其区别可总结如下：①真核生物基因组远远大于原核生物基因组，且具有相当的复杂度；②基因组中不编码区域远远多于编码区域；③基因组中的DNA与蛋白质结合，形成的染色体存在于细胞核内；④大部分基因有内含子，因此基因的编码区域不连续；⑤存在着重复序列，重复次数从几次到几百万次不等；⑥基因组中以多复制起点的形式复制；⑦转录产物为单顺反子；⑧真核生物基因组与原核相同，也存在着可移动的因子。3.真核生物的DNA序列可分为几种类型?分别写出并简要叙述。答：根据DNA复性动力学研究真核生物的DNA序列可以分为4种类型：(1)单拷贝序列又称非重复序列，在一个基因组中只有一个拷贝，真核生物的大多数基因都是单拷贝的。在复性动力学中对应于慢复性组分。(2)轻度重复序列在一个基因组中有2～10个拷贝（有时被视为非重复序列），如组蛋白基因和酵母rRNA基因。在复性动力学中也对应