分子生物学实验思考题答案

分子生物学实验思考题答案实验一、基因组DNA的提取1、为什么构建DNA文库时，一定要用大分子DNA?答、文库的大小(即数目)取决于基因组的大小和片段的大小，片段大则文库数目小一些也可以包含99%甚至以上的基因组。而文库数目小则方便研究人员操作和文库的保存。所以构建文库要用携带能力大的载体克隆尽量大的DNA片段.2、如何检测和保证DNA的质量？答、用凝胶电泳看，有没有质白质和RNA等物质的污染，还可以测OD，用OD260/280来判断，当OD260/OD2801.8，表示蛋白质含量较高当OD260/OD2802.0，表示RNA含量较高当OD260/OD280=1.8～2.0，表示DNA较纯。实验二、植物总RNA的提取1、RNA酶的变性和失活剂有哪些？其中在总RNA的抽提中主要可用哪几种？答、有DEPC,Trizol，氧钒核糖核苷复合物，RNA酶的蛋白抑制剂以及SDS，尿素，硅藻土等；在总RNA提取中用PEPC,Trizol2、怎样从总RNA中进行mRNA的分离和纯化。答、、利用成熟的mRNA的末端具有polyA尾的特点合成一段oligo(dT)的引物，根据碱基互补配对原则，可将mRNA从总RNA中分离出来实验四、大肠杆菌感受态细胞的制备1、感受态细胞制备过程中应该注意什么？答、A）细菌的生长状态：不要用经过多次转接或储于4℃的培养菌，最好从-80℃甘油保存的菌种中直接转接用于制备感受态细胞的菌液。细胞生长密度以刚进入对数生长期时为宜，可通过监测培养液的OD600来控制。DH5α菌株的OD600为0.5时，细胞密度在5×107个/mL左右，这时比较合适。密度过高或不足均会影响转化效率。B）所有操作均应在无菌条件和冰上进行；实验操作时要格外小心，悬浮细胞时要轻柔，以免造成菌体破裂，影响转化。C）经CaCl2处理的细胞，在低温条件下，一定的时间内转化率随时间的推移而增加，24小时达到最高，之后转化率再下降（这是由于总的活菌数随时间延长而减少造成的）；D）化合物及无机离子的影响：在Ca2+的基础上联合其他二价金属离子（如Mn2+或Co2+）、DMSO或还原剂等物质处理细菌，可使转化效率大大提高（100-1000倍）；E）所使用的器皿必须干净。少量的去污剂或其它化学物质的存在可能大大降低细菌的转化效率；2、感受态细胞制备可用在哪些研究和应用领域？答、在基因工程中将质粒导入受体细胞是如果受体细胞是细菌则将它用Ca2+处理变为感受态细胞质粒进入。实验五、质粒在大肠杆菌中的转化和鉴定1、在热激以后进行活化培养，这时的培养基中为什么不加入抗生素？答、活化培养用的一般是SOC培养基，这种培养基比LB培养基营养，此时进行的活化培养只是为了让大肠杆菌迅速复苏，恢复分裂活性，此时的细胞还不具抗性，加入抗生素会细胞会死亡。2、什么是质粒？根据在细菌中的复制，质粒有几种类型？用于基因重组的主要用到哪些质粒？答、质粒是细菌体内的环状DNA分子。质粒也是作为细菌遗传载体的一部分，但通常其携带的基因对细菌而言必要性要比核内DNA的小很多。比如，抗性基因，荧光蛋白基因等等。根据质粒随细胞分裂而分裂的次数，将其分为两类：一类是严紧型质粒，当细胞染色体复制一次时，质粒也复制一次，每个细胞内只有1～2个质粒；另一类是松弛型质粒，当染色体复制停止后仍然能继续复制，每一个细胞内一般有20个左右质粒。常用于基因重组的质粒是pBR322质粒，因为其基因测序已经完成，而且它携带了两个标记基因，一个是氨苄青霉素抗性基因Apr，另一个是四环素抗性基因Tetr。实验六、质粒DNA的分离纯化和鉴定1、在实验过程中，加入的EDTA、SDS分别起什么作用?答、EDTA可以结合DNA酶等，可以抑制其活性；SDS主要是裂解细菌和沉淀蛋白。2、乙酸钾在实验过程中主要起什么作用?答、主要是在分离过程中起着中和PH的作用，DNA经碱（NaoH)裂解后，染色体DNA氢键断裂，双螺旋解开，质粒DNA氢键断裂，互补链不能完全分离，再经乙酸钾中和成中性后则复性离心就可以达到分离的效果。3、氯仿在核酸的提取过程中有何作用？答、克服酚的特点，加速有机层和液相的分层。最后用氯仿抽提：去除核酸溶液中迹量酚。4、本实验整个过程中应该注意些什么？答、1、提取过程应尽量保持低温；2、提取质粒DNA过程中除去蛋白质很重要，采用酚、氯仿去除蛋白质要比单独用酚或者氯仿要好，要将蛋白尽量除干净需多次抽提。3、沉淀DNA一般使用冰乙醇，在低温条件下放置时间稍长可以使沉淀完全。沉淀DNA也可以使用异丙醇（一般使用等体积),且沉淀完全，速度快，但常把盐沉淀，所以多数还是用乙醇。实验七、聚合酶链式反应——一般原理和技术1、降低退火温度对反应有何影响？答、变性所需的加热温度取决于模板及PCR产物双链DNA中的G+C含量。双链DNA中的G+C的比率越高，则双链DNA分离变性的温度也就越高。变性所需的时间与DNA分子的长度相关，DNA分子越长，在特定的变性温度下使双链DNA分子完全分离所需的时间就越长。若变性温度太低或变性时间太短，则只能使DNA模板中富含AT的区域产生变性，当PCR循环中的反应温度降低时，部分变性的DNA模板又重新结合成双链DNA，从而导致PCR的失败。非特异性条带数增多。2、PCR循环次数是否越多越好？为何?答、循环次数越多，非特异性产物的量亦随之增多。3、PCR技术可应用与哪些方面？举例。答、1、核酸的基础研究：基因组克隆2、不对称PCR制备单链DNA用于DNA测序3、反向PCR测定未知DNA区域4、反转录PCR（RT-PCR）用于检测细胞中基因表达水平、RNA病毒量以及直接克隆特定基因的cDNA5、荧光定量PCR用于对PCR产物实时监控6、cDNA末端快速扩增技术7、检测基因的表达8、医学应用：检测细菌、病毒类疾病；诊断遗传疾病；诊断肿瘤；应用于法医物证学实验八、DNA的限制性内切酶酶切和鉴定1、写出ECORI和Hind3两种内切酶消化产物的末端序列。答、G^AATTCEcoRI的识别序列和切割位点，粘性末端即：AATTC-CTTAA^GG-HindⅢ的识别序列为：A^AGCTT“^”为切割位点，黏性末端为：AGCTT-A-2、什么是粘性末端和平末端？答、用限制酶切割后得到的末端齐平就是平末端，一长一短就是粘性末端3、限制性内切酶在基因工程中有什么作用？答、用同种限制酶对含目的基因的DNA分子和运载体（如：质粒）进行切割，产生同种黏性末端（核苷酸序列），从而进行重组（加DNA连接酶），以导入目的基因。