研究用CodeNo.RR036A说明书PrimeScript™RTMasterMix(PerfectRealTime)v201605Da目录内容页码●制品说明1●制品内容1●试剂盒外必备材料1●保存1●特长1●使用注意2●操作方法2●RealTimePCR2●实验例5●附录5●关联产品7-1-●制品说明本制品是2StepRealTimeRT-PCR用的理想反转录反应试剂。5×PrimeScriptRTMasterMix中含有定量RT-PCR的反转录反应所需的所有试剂(PrimeScriptRTase、RNaseInhibitor、Random6mers、OligodTPrimer、dNTPMixture、反应Buffer),加入模板RNA和水即可迅速进行反应。使用具有较强延伸能力的PrimeScriptRTase,与制品PrimeScriptRTreagentKit(PerfectRealTime)(CodeNo.RR037Q/A/B)相同,可以在较短时间内高效合成RealTimePCR用模板cDNA。本制品合成的cDNA可以用于SYBR®GreenqPCR分析法和探针分析法,可以根据实验目的与SYBRPremixExTaq™II(TliRNaseHPlus)(CodeNo.RR820Q/A/B)、SYBRFastqPCRMix(CodeNo.RR430S/A/B)和ProbeqPCRMix(CodeNo.RR391S/A/B)等定量试剂配合使用,能够进行高性能的基因表达分析。注意:TakaraBio使用SYBRGreenI作为研究试剂已得到MolecularProbesInc.的许可。●制品内容(10μl反应×200次)1.5×PrimeScriptRTMasterMix(forRealTime)*1400μl2.RNaseFreedH2O1ml×2支3.EASYDilution(forRealTimePCR)*21ml*1:含有PrimeScriptRTase、RNaseInhibitor、Random6mers、OligodTPrimer、dNTPMixture、反应Buffer(含有Mg2+)。*2:制作标准曲线时梯度稀释cDNA或RNA标准品的稀释液。模板DNA或RNA如果用水或TEBuffer稀释时,由于受Microtube吸附作用等的影响,往往不能准确地进行稀释,导致实验结果精度降低。使用本制品时,即使稀释至低浓度也能够进行准确地稀释,容易在宽广范围内获得准确定量的标准曲线。本制品不影响反转录和PCR反应,用其稀释后的样品可直接使用。EASYDilution(forRealTimePCR)也可以单独购买(CodeNo.9160/9160Q)。注意:EASYDilution请与本公司RealTimePCR试剂组合使用,对于其他公司的同类制品的适用性本公司尚未进行确认。●试剂盒外必备材料热循环仪(或37℃水浴和85℃加热块)反转录反应所用0.2ml和1.5ml的微量反应管微量移液器和枪头(高压灭菌)●保存:-20℃。●特长1.制品为预先混好的Premix形式,只需加入模板RNA和水便可以开始反应。2.可以在较短时间内高效合成RealTimePCR用cDNA,是进行2StepRealTimeRT-PCR反应的理想试剂。3.使用了Random6mers和OligodTPrimer2种反转录引物,可以合成适合RealTimePCR用cDNA。4.Real-timeRTPCR定量需要建立标准曲线,建立标准曲线的条件就是需要将总RNA和反转录cDNA稀释到较低的浓度。如果用水或TEBuffer稀释时,由于模板浓度低不稳定,因而会缩小曲线范围,结果精度降低。本制品中附加了标准曲线制作用稀释液EASYDilution(forRealTimePCR),将TotalRNA或cDNA稀释至低浓度时也能够进行准确稀释,容易在宽广范围内获得准确定量的标准曲线。-2-●使用注意以下为使用本试剂盒时的注意事项,使用前一定认真阅读。1.5×PrimeScriptRTMasterMix在使用前要小心地离心收集到反应管底部。由于5×PrimeScriptRTMasterMix粘度高,用移液枪慢慢反复吸打充分混匀后使用。2.分装试剂时务必使用新的枪头(Tip),以防止样品间污染。3.本制品中已经加入了反转录Primer(OligodTPrimer和Random6mers),如果要使用GeneSpecificPrimer进行反转录反应,则不能使用本制品。●操作方法反转录反应RNA的制备方法参见“附录”。1.按下列组份配制RT反应液(反应液配制请在冰上进行)。试剂使用量终浓度5×PrimeScriptRTMasterMix(PerfectRealTime)2μl1×TotalRNA*RNaseFreedH2Oupto10μl*反应体系可按需求相应放大,10μl反应体系可最大使用500ng的TotalRNA。2.轻柔混匀后进行反转录反应,条件如下:37℃15min(反转录反应)85℃5sec(反转录酶的失活反应)4℃注意:得到的RT反应液加入到下一步的RealTimePCR反应体系中,其加入量不要超过RealTimePCR反应体积的1/10(V/V)量。●RealTimePCR以下是使用本制品进行反转录反应后,选择SYBRPremixExTaqII(TliRNaseHPlus)(CodeNo.RR820A)进行RealTimePCR反应的操作方法。◆应用AppliedBiosystems7300/7500/7500FastReal-TimePCRSystem和StepOnePlusReal-TimePCRSystem的操作方法*请按照仪器使用说明书要求进行实验操作。1.按下列组份配制PCR反应液(反应液配制请在冰上进行)。试剂使用量使用量终浓度SYBRPremixExTaqII(TliRNaseHPlus)(2×)10μl25μl1×PCRForwardPrimer(10μM)0.8μl2μl0.4μM*1PCRReversePrimer(10μM)0.8μl2μl0.4μM*1ROXReferenceDyeorDyeII(50×)*20.4μl1μl1×RT反应液(cDNA溶液)*32μl4μldH2O(灭菌蒸馏水)6μl16μlTotal20μl*450μl*4*1通常引物终浓度为0.4μM可以得到较好结果。反应性能较差时,可以在0.2~1.0μM范围内调整引物浓度。-3-*2ROXReferenceDyeII(50×)比ROXReferenceDye(50×)浓度低,使用7500Real-TimePCRSystem和7500FastReal-TimePCRSystem时,请使用ROXReferenceDyeII(50×)。使用StepOnePlusReal-TimePCRSystem和7300Real-TimePCRSystem时,请使用ROXReferenceDye(50×)。*3建议在20μl反应液中使用相当于10pg~100ngTotalRNA量的cDNA为模板。反转录反应液的加入量不能超过PCR反应液总体积的10%。*4按不同仪器的要求确定反应液的体积。2.进行RealTimePCR反应建议采用下列图表显示的两步法PCR反应程序,如果该程序得不到良好的实验结果时,再进行PCR条件的优化。当使用Tm值较低的引物或两步法PCR反应扩增性能较差时,可以尝试进行三步法PCR扩增反应。AppliedBiosystems7300/7500Real-TimePCRSystem,StepOnePlus两步法PCR扩增标准程序:Stage1:预变性Reps:195℃30秒Stage2:PCR反应Reps:4095℃5秒60℃30~34秒*DissociationStage*使用StepOnePlus时请设定在30秒。使用7300时请设定在31秒。使用7500时请设定在34秒。AppliedBiosystems7500FastReal-TimePCRSystem两步法PCR扩增标准程序:Stage1:预变性Reps:195℃30秒Stage2:PCR反应Reps:4095℃3秒60℃30秒DissociationStage◆特别提示:本制品中使用的TaKaRaExTaq®HS是利用抗Taq抗体的HotStart用DNA聚合酶,在PCR反应前进行模板的预变性,通常设定为95℃、30秒。如果高温处理时间过长,会使酶的活性下降,其PCR的扩增效率、定量精度等都会受到影响。-4-3.实验结果分析反应结束后确认RealTimePCR的扩增曲线和融解曲线,进行PCR定量时制作标准曲线等。分析方法参见仪器的操作手册。◆应用ThermalCyclerDice™RealTimeSystemII扩增仪的操作方法1.按下列组份配制PCR反应液(反应液配制请在冰上进行)。试剂使用量终浓度SYBRPremixExTaqII(TliRNaseHPlus)(2×)12.5μl1×PCRForwardPrimer(10μM)1.0μl0.4μM*1PCRReversePrimer(10μM)1.0μl0.4μM*1RT反应液(cDNA溶液)2μl*2dH2O(灭菌蒸馏水)8.5μlTotal25μl*1通常引物终浓度为0.4μM可以得到较好结果。反应性能较差时,可以在0.2~1.0μM范围内调整引物浓度。*2建议在25μl反应液中使用相当于10pg~100ngTotalRNA量的cDNA为模板。反转录反应液的加入量不能超过PCR反应液总体积的10%。2.进行RealTimePCR反应。建议采用下列图表显示的两步法PCR反应程序。如果该程序得不到良好的实验结果时,再进行PCR条件的优化。当使用Tm值较低的引物或两步法PCR反应扩增性能较差时,可以尝试进行三步法PCR扩增反应。两步法PCR扩增标准程序:Stage1:预变性Repeat:195℃30秒Stage2:PCR反应Repeat:4095℃5秒60℃30秒Stage3:Dissociation◆特别提示:本制品中使用的TaKaRaExTaqHS是利用抗Taq抗体的HotStart用DNA聚合酶,在PCR反应前进行模板的预变性,通常设定为95℃、30秒。如果高温处理时间过长,会使酶的活性下降,其PCR的扩增效率、定量精度等都会受到影响。3.实验结果分析。反应结束后确认RealTimePCR的扩增曲线和融解曲线,进行PCR定量时制作标准曲线等。分析方法参见仪器的操作手册。-5-●实验例反转录反应时间和cDNA合成量的研讨实验[方法]1.反转录反应试剂:PrimeScriptRTMasterMix(PerfectRealTime)模板:HumanPlacentaTotalRNA2pg~2μg反应体积:20μl反应条件:37℃15、30、60min反应后85℃5sec热变性,4℃保存2.RealTimePCR反应试剂:SYBRPremixExTaqII(PerfectRealTime)模板:上述反转录反应液2μl反应体积:25μlTargetGene:ACTB反应条件:ThermalCyclerDiceRealTimeSystem标准反应条件[结果]RealTimePCR扩增曲线图及标准曲线图如下:扩增曲线图标准曲线图以上RealTimeRT-PCR扩增结果显示,不同反转录反应时间(15、30、60min)在宽广模板浓度范围内都可以得到同等的扩增效率。●附录RNA样品制备本制品是将RNA反转录成cDNA的专用试剂。RNA的纯度会影响cDNA的合成量,而制备RNA的关键是要抑制细胞中的RNA分解酶和防止所用器具及试剂中的RNA分解酶的污染。因此,在实验中必须采取以下措施:戴一次性干净手套;使用RNA操作专用实验台;在操作过程中避免讲话等等。通过以上办法可以防止实验者的汗液、唾液中的RNA分解酶的污染。15min(紫色)30mi