传染病监测对POCT的需求.

传染病监测对POCT的需求CDC的传染病监测发病和流行趋势分析发现暴发发现新病原深入了解传染病流行规律估计疾病负担，确定防控优先评估控制项目制订控制策略传染病防控行动传染病监测——多位点多源时间变化与连续多机构与多学科-传染病的特点所决定自然环境传播监测人群传染病的监测目标传染病监测的信息来源医院监测网报告疾控机构调查媒体病人自主报告传染病监测信息监测与应对MissionImpossible为什么细菌感染性腹泻美国的监测：每年有超过五百万的细菌性腹泻发生。WHO：估计每年腹泻30-50亿人次，500-1000万病例死亡ETEC所致病例（每年）：估计21亿，38万例死亡。发展中国家：5岁以下婴幼儿腹泻的最主要病原菌。0-4岁ETEC腹泻发病率：0.5次/人/年；5岁ETEC腹泻发病率：0.1次/人/年。JelinekandKollaritsch.ExpertRevVaccines2008./WennerasC,etal.JHealthPopulNutr2004./SteffenR,etal.JTravelMed2005./NiyogiSK.JMicrobiol2005.TheNewEnglandJournalofMedicine,2009,361;16:1560.监测仍心存疑虑：家底不清有多少病例？是什么病原？检测到细菌，是不是致病原因？单份血中检测到抗体，怎么判断？。。。确诊病例采样检测就诊患者检出率就诊率采样率我们能发现多少传染病病例-疾病流行程度的估算-疾病负担测算传染病监测存在的问题常见病多发病——被忽略：-急性健康损害低或病死率低-病原种类多、检测困难河南，2007，1,526例门诊病例北京，2010.4-2011.124,803例深圳，5年22,085例腹泻病例云南，2012，797例门诊病例腹泻病原谱复杂病原种类菌株数(%)致泻性大肠杆菌140(9.2)轮状病毒79(5.2)志贺菌69(4.5)沙门菌66(4.3)诺如病毒56(3.7)病原种类菌株数(%*)志贺菌286(6.0)弧菌251(5.2)沙门菌192(4.0)致泻性大肠杆菌77(1.6)气单胞菌40(1.0)病原菌种类菌株数量(%)副溶血弧菌1288(5.8)沙门菌486(2.2)产毒大肠杆菌ETEC142(0.64)非ETEC大肠杆菌109(0.49)志贺菌77(0.35)病原菌种类检出率(%)致泻性大肠杆菌11.9气单胞菌9.8类志贺邻单胞菌2.5沙门菌2.3志贺菌1.1既往流行而当前少见或罕见的疾病——被忽略：疟疾立克次体类感染。。。传染病监测存在的问题临床诊断标准缺乏特异性传染病监测存在的问题检测出的微生物是不是致病原因？传染病监测存在的问题病原确定——依然是挑战病原体条件致病菌混合感染？这些标本中存在大量的不同种类的细菌正常定植菌完成（符合）哪些指标，可确定是疾病的病原？Koch’sPostulates“科赫原则”，1890细菌必须存在于每一个病例中细菌能够从病例中分离到并且纯培养细菌纯培养物接种健康敏感宿主能够复制出相同的疾病从实验感染的宿主中能够重新分离到这个细菌但也存在问题！如何提高基层医疗单位的传染病诊断能力？多数病例到基层医疗单位就诊治疗分级诊疗制度传染病网络直报是基于病原学定义疾病和分类、报告的传染病监测存在的问题发展普及传染病POCT技术提高检测监测水平是敏感发现新发突发传染病疫情的重要依托微生物基因组测序推动POCT技术发展国际人类基因组计划（HGP）1990年启动，2003年完成，一个基因组花费27亿美元2014年：花费1千美元Reagent*costpergenome—$797Hardwareprice—$137**DNAextraction,sampleprepandlabor—$55-$65TotalPrice=$989-$999Source:Illumina诊断标识的选择促进特异基因的选择表面标识抗原的基因？毒力基因？基于表面标识抗原（O抗原K抗原H抗原）的检测，还是基于毒力因子的检测？O104：H4集聚黏附性大肠杆菌，产2型志贺毒素检测O157还是O104？促进特异蛋白、糖结构区域的选择拟态弧菌分离株携带了霍乱毒素基因，产生霍乱毒素。那么，什么是霍乱？怎样诊断霍乱？POCT应用于传染病监测报告对技术本身的要求准确性评价，灵敏度特异度提供诊断依据：一定程度上、基本的、完全的纳入诊断标准能否、如何