二妙丸疗效显著的疾病皮肤科:湿疹、脚气、阴囊湿疹、生殖器疱疹、带状疱疹、手癣、臁疮、脓疱疮、脚癣、下肢急慢性湿疹、皮炎、肛门瘙痒症、老年瘙痒症、酒糟鼻。妇科:白带异常(各种阴道炎导致)、急慢性泌尿系感染、月经不调、盆腔炎。内科:腹泻、细菌性痢疾、肠炎、黄疸、肝炎(急性传染性黄疸型肝炎)、胃炎和胃溃疡(湿热型)、失眠多梦(湿热证)。外科:足膝红肿热痛、风湿性关节炎(湿热症)、下肢静脉曲张兼湿热者、下肢溃疡、糖尿病足、下肢丹毒、坐骨神经痛(湿热证)、湿热腰痛。泌尿科:泌尿系感染。治疗急性肾小球肾炎。口腔科:口臭、口舌生疮、牙龈炎、牙周炎。耳鼻喉科:慢性咽炎、慢性鼻窦炎、慢性上颌窦炎等。男科:阳痿(湿热下注)、睾丸炎或附睾丸炎湿热常常表现为一种体质,很难短时间去除,因此往往需要长期用药,多数燥湿清热的药物药性都很强,因此用药应加以注意。由于二妙丸组方简单,几乎无毒副作用,长期服用,非常安全。因此是燥湿清热的首选药物。