1《肽与蛋白质》课程教学大纲杨旭2000年9月1日星期五于北京第一章:绪论(2学时)一、蛋白质的重要地位(pp1-1)二、蛋白质的组成(pp1-7)三、蛋白质的分类(pp7-8)第三章:蛋白质一级结构测定(7学时)第一节:蛋白质序列测定的基本战略和步骤(pp86-88)一、序列测定的基本战略(pp86-87)二、序列测定前的准备工作及测定的一般步骤(pp87-88)第二节:蛋白质和肽的氨基酸组成分析(pp88-92)一、蛋白质的水解(pp88-89)二、氨基酸的分离和定量测定(pp89-90)三、特殊氨基酸的测定(pp90-92)第三节:末端氨基酸的测定(pp92-98)一、N末端的测定(pp92-96)二、C末端的测定(pp96-98)第四节:肽链的专一性水解和肽段的分离纯化(pp98-105)一、肽链的专一性水解(pp98-104)二、肽段的分离纯化及纯度鉴定(pp104-105)第五节:肽段的序列测定(pp105-111)一、手工序列测定技术(pp105-110)二、自动序列分析(pp110-111)第六节:由已知序列肽段建立蛋白质一级结构(pp111-113)一、重叠肽(接头肽)(pp111-111)二、二硫键位置的确定(pp112-112)三、酰胺基位置的确定(pp112-112)四、糖类、脂类和磷酸基位置的确定(pp113-113)第七节:蛋白质一级结构研究进展(pp113-118)一、Edman降解试剂和方法上的改进(pp113-113)二、序列仪设计上的改进和创新(pp113-114)三、质谱法在蛋白质序列分析中的应用(pp114-116)四、用测定核酸序列推断蛋白质序列(pp116-116)附录三常用蛋白质的一级结构(pp116-118)第六章:蛋白质分子构象(10学时)第一节:概述(pp191-192)一、蛋白质结构层次(pp191-191)2二、构象和构型的区别(pp191-191)三、研究构象的必要性(pp191-192)四、蛋白质构象研究进展(pp192-192)第二节:多肽链立体结构原理(pp192-197)一、肽单位平面结构(pp192-194)二、二面角(pp194-195)三、拉氏构象图(pp195-197)第三节:二级结构(pp197-206)一、螺旋结构(pp197-200)二、β―折叠股和β―折叠片(pp201-202)三、回折(pp203-203)四、发卡结构和Ω结构(pp204-205)五、三股螺旋(pp205-205)六、无规卷曲(pp205-205)七、侧链构象(pp205-206)第四节:超二级结构(pp206-208)一、复绕α―螺旋(pp206-206)二、βxβ单元(pp206-207)三、β―迂回(pp207-207)四、β―折叠筒(pp207-208)五、α―螺旋―转角―α―螺旋(pp208-208)第五节:结构域(pp208-210)一、结构域的概念(pp208-209)二、结构域和功能域(pp209-209)三、结构域运动(pp209-210)四、结构域分类(pp210-210)第六节:三级结构(pp210-228)一、三级结构的概念(pp210-210)二、几种求蛋白分子的构象(pp210-219)三、稳定三级结构的作用力(pp219-223)四、蛋白质三级结构的形成(pp223-226)五、膜蛋白的特殊构象(pp226-228)第七节:四级结构(pp228-234)一、引言(pp228-229)二、亚级的种类和数目(pp229-231)三、亚基排布(pp231-232)四、亚基之间的互相作用(pp232-234)第八节:球蛋白分子的一般结构(pp235-236)第八章:蛋白质的结构和功能(12学时)第一节:活性蛋白质与前体(pp277-2)一、激素与激素原(pp277-279)二、酶与酶原(pp279-283)三、两类前体的不同功能(pp283-285)3第二节:血红蛋白的结构与功能(pp285-299)一、概述(pp285-285)二、血红蛋白的分子结构(pp285-291)三、血红蛋白对氧分子的结合(pp291-292)四、血红蛋白的变构效应(pp292-293)五、血红蛋白的变构过程(pp293-295)六、S型氧合曲线的生理意义(pp295-296)七、影响血红蛋白氧亲和力的因素(pp296-299)第三节:分子病(pp299-305)一、概述(pp299-300)二、镰刀状红细胞贫血症(pp300-302)三、活性部位突变的血红蛋白(pp302-303)四、三级结构突变的血红蛋白(pp303-304)五、四级结构突变的血红蛋白(pp304-305)第四节:蛋白质的进化(pp305-313)一、概述(pp305-306)二、细胞色素C分子的进化(pp306-313)第五节:蛋白质变性(pp313-326)一、概述(pp313-315)二、各种变性因素对蛋白质构象的影响(pp315-321)三、变性蛋白质的构象(pp321-321)四、变性和复性(pp321-325)五、变性的预防和利用(pp325-326)第六节:蛋白质与活性多肽的界线(pp326-328)一、活性多肽的构象(pp326-327)二、蛋白质与活性多肽的区别(pp327-328)第九章:蛋白质分子互相作用(5学时)第一节:蛋白质分子互相作用(pp330-337)一、分子和亚基的聚合(pp331-333)二、分子杂交(pp333-334)三、分子识别(pp334-334)四、分子自我装配(pp334-335)五、多酶复合体(pp335-337)第三节:抗原与抗体(pp345-358)一、抗原的结构与功能(pp345-347)二、抗体的结构与功能(pp347-353)三、抗原与抗体互相作用(pp353-358)第四节:受体与配体(pp358-367)一、概述(pp358-358)二、受体研究方法(pp358-362)三、受体的结构与功能(pp362-364)四、受体与配体互相作用(pp364-365)五、激素受体与腺苷酸环化酶的耦联(pp365-365)4六、cAMP引发的级联放大反应(pp365-367)第十章:蛋白质与核酸、脂类、糖类的互相作用(5学时)第一节:蛋白质与核酸的互相作用(pp370-386)一、原核生物的染色结构(pp370-372)二、真核生物的染色结构(pp372-377)三、调节蛋白与DNA的互相作用(pp377-383)四、核糖体中蛋白质与RNA的互相作用(pp383-386)第二节:蛋白质与脂类的互相作用(pp386-394)一、蛋白质与脂膜的互相作用(pp386-392)二、研究膜蛋白-膜脂互相作用的模型(pp392-393)三、脂蛋白(pp393-394)第三节:蛋白质与糖类的互相作用(pp394-401)一、引言(pp394-395)二、糖蛋白的糖链结构(pp395-398)三、糖蛋白的蛋白质结构(pp398-399)四、糖蛋白与细胞识别(pp399-399)五、蛋白多糖(pp400-401)第十一章:蛋白质结构设计的理论基础(5学时)第一节:导言(pp403-406)一、生命过程的分子基础(pp404-405)二、蛋白质互相作用的研究方法(pp405-406)三、蛋白质结构及互相作用研究的理论意义与应用价值(pp406-406)第二节:蛋白质结构数据库及蛋白质同源性的比较(pp406-417)一、蛋白质结构数据库简介(pp407-407)二、典型数据库(pp407-409)三、蛋白质序列之间的同源性(pp409-414)四、蛋白质中残基的疏水性质极其应用(pp414-417)第三节:蛋白质二级结构的计算与预测(pp417-431)一、基本概念(pp417-418)二、二级结构的描述与分类(pp418-419)三、二级结构预测方法(pp419-431)第四节:蛋白质三级结构计算(pp431-435)一、经典研究思想(pp431-431)二、蛋白质三级结构计算的主要思想(pp431-435)第五节:蛋白质工程及展望(pp435-4)一、蛋白质设计的一般性原则(pp435-437)二、蛋白质结构设计的基本思想(pp437-438)第七章:蛋白质构象的研究方法(5学时)第一节:X射线衍射结构分析法(pp239-247)一、晶体结构基本知识(pp239-241)二、X射线衍射结构分析的基本原理(pp242-245)5三、X射线衍射结构分析的主要步骤(pp245-247)第六节:氢同位素交换法(pp266-268)一、基本原理(pp266-267)二、测定方法(pp267-268)第二节:圆二色性光谱法(pp247-254)一、偏振光(pp247-248)二、旋光和圆二色性(pp248-250)三、蛋白质的圆二色性(pp251-251)四、根据圆二色性推断蛋白质主链结构(pp251-254)第三节:紫外差光谱法(pp254-258)一、蛋白质的紫外吸收光谱(pp254-255)二、紫外差光谱法的基本原理(pp255-256)三、紫外差光谱的种类及应用(pp256-258)第四节:荧光光谱法(pp258-263)一、荧光光谱的基本知识(pp258-260)二、蛋白质的自身荧光(pp260-262)三、蛋白质的荧光探测(pp262-263)第五节:激光拉曼光谱法(pp263-266)一、拉曼光谱的基本知识(pp263-264)二、蛋白质的激光拉曼光谱与构象的关系(pp264-266)第七节:核磁共振法(pp268-274)一、核磁共振的基本原理(pp268-271)二、核磁共振波谱仪的主要构件(pp271-272)三、核磁共振波谱的类型(pp272-272)四、多维核磁共振波谱的特点(pp272-273)五、ZD-NMR法测定蛋白质分子构象的步骤(pp273-274)六、核磁共振法的优点及应用(pp274-274)复习(3学时)总共54学时