分子生物学zuq题库

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问答题:1衰老与基因的结构与功能的变化有关,涉及到:(1)生长停滞;(2)端粒缩短现象;(3)DNA损伤的累积与修复能力减退;(4)基因调控能力减退。2超螺旋的生物学意义:(1)超螺旋的DNA比松驰型DNA更紧密,使DNA分子体积变得更小,对其在细胞的包装过程更为有利;(2)超螺旋能影响双螺旋的解链程序,因而影响DNA分子与其它分子(如酶、蛋白质)之间的相互作用。3原核与真核生物学mRNA的区别:原核:(1)往往是多顺反子的,即每分子mRNA带有几种蛋白质的遗传信息(来自几个结构基因)。(2)5端无帽子结构,3端一般无多聚A尾巴。(3)一般没有修饰碱基,即这类mRNA分子链完全不被修饰。真核:(1)5端有帽子结构(2)3端绝大多数均带有多聚腺苷酸尾巴,其长度为20-200个腺苷酸。(3)分子中可能有修饰碱基,主要有甲基化,(4)分子中有编码区与非编码区。4tRNA的共同特征:(!)单链小分子,含73-93个核苷酸。(2)含有很多稀有碱基或修饰碱基。(3)5端总是磷酸化,5末端核苷酸往往是pG。(4)3端是CPCPAOH序列。(5)分子中约半数的碱基通过链内碱基配对互相结合,开成双螺旋,从而构成其二级结构,开头类似三叶草。(6)三级结构是倒L型。5核酶分类:(1)异体催化的剪切型,如RNaseP;(2)自体催化的剪切型,如植物类病毒等;(3)内含子的自我剪接型,如四膜虫大核26SrRNA前体。6hnRNA变成有活性的成熟的mRNA的加工过程:(1)5端加帽;(2)3端加尾(3)内含子的切除和外显子的拼接;(4)分子内部的甲基化修饰作用,(5)核苷酸序列的编辑作用。7反义RNA及其功能:碱基序列正好与有意义mRNA互补的RNA称为反意义或反义RNA,又称调节RNA,这类RNA是单链RNA,可与mRNA配对结合形成双链,最终抑制mRNA作为模板进行翻译。这是其主要调控功能,还可作为DNA复制的抑制因子,与引物RNA互补结合抑制DNA的复制,以及在转录水平上与mRNA5末端互补,阻止RNA合成转录。8病毒基因组分型:(1)双链DNA(2)单链正股DNA(3)双链RNA(4)单链负股RNA(5)单链正股RNA9病毒基因组结构与功能的特点:(1)不同病毒基因组大小相差较大;(2)不同病毒的基因组可以是不同结构的核酸。(3)病毒基因组有连续的也有不连续的;(4)病毒基因组的编码序列大于90%;(5)单倍体基因组,(6)基因有连续的和间断的,(7)相关基因丛集;(8)基因重叠(9)病毒基因组含有不规则结构基因,主要类型有:a几个结构基因的编码区无间隔;bmRNA没有5端的帽结构;c结构基因本身没有翻译起始序列。10原核生物基因组的结构的功能特点:(1)基因组通常仅由一条环状双链DNA分子组成。(2)基因组中只有1个复制起点。(3)具有操纵子结构。(4)编码顺序一般不会重叠。(5)基因是连续的,无内含子,因此转录后不需要剪切。(6)编码区在基因组中所占的比例(约占50%)远远大于真核基因组,但又远远小于病毒基因组。(7)基因组中重复序列很少(8)具有编码同工酶的基因。(9)细菌基因组中存在着可移动的DNA序列,包括插入序列和转座子。(10)在DNA分子中具有多种功能的识别区域。11真核生物基因组结构与功能的特点:(1)每一种真核生物都有一定的染色体数目,除了配子为单倍体外,体细胞一般为双倍体。(2)真核基因组远远大于原核生物的基因组,结构复杂,基因数庞大。(3)都由一个结构基因与相关的调控区组成,转录产物为单顺反子。(4)含有大量重复顺序。(5)基因组内非编码的顺序占90%以上。(6)真核基因是断裂基因,(7)功能相关的基因构成各种基因家族,它们可串联在一起,亦可相距很远,但即使串联在一起的成簇的基因也是分别转录的。(8)真核生物基因组中也存在一些可移动的遗传因素,这些DNA顺序并无明显生物学功能,似乎为自己的目的而组织,故有自私DNA之称。12根据同源性程度,主要分五种类型:(1)核酸序列相同,实际上是多拷贝基因;(2)核酸序列高度同源,如人类生长激素基因家族;(3)编码产物具有同源功能区;(4)编码产物具有小段保守基序;(5)基因超家族。13DNA复制的基本过程:(1)DNA双链解开;(2)RNA引物的合成;(3)DNA链的延长;(4)切除引物、填补缺口、连接相邻DNA片段;(5)切除和修复错配碱基。14DNA的损伤方式:(1)转换:由一种嘧啶变成另一种嘧啶,或种嘌呤变成另一种嘌呤;(2)颠换:嘧呤与嘌呤互换。转换和颠换只引起DNA局部的改变,而DNA其它部分的结构不受影响,故称为点突变。(3)丢失或插入一个或一段核苷酸,可能使下游DNA的编码发生改变,此称为移码突变(4)链内或链间发生共价连结。15DNA损伤的修复:(1)光修复(2)切除修复(3)重组修复(4)SOS修复16切除修复的机制:通过一种特殊的内切核酸酶将DNA分子中的损伤部分切除,同时以另一条完整的DNA链为模板,由DNA聚合酶I催化填补被切除部分的空隙,再由DNA连接酶封口,使DNA恢复正常的结构。17大肠杆菌的一种需糖基化酶的切除修复过程:(1)DNA糖基化酶识别受损的或错误的碱基,水解糖苷键,释出游离碱基,在DNA单链上形成无嘌呤或嘧啶的空位,称为AP部位;(2)特异的AP内切核酸酶在AP部位切开磷酸二酯键,再由外切核酸酶切下AP部位的核苷酸;(3)DNA聚合酶I修补缺口;(4)DNA连接酶封口,完成修复过程。18逆转录酶功能:(1)具有RNA指导的DNA聚合酶活性,能和其它DNA聚合酶一样沿5-3方向合成DNA,并需要引物提供3-OH;(2)具有RNA酶H活性,能特异性水解RNA-DNA杂交体上的RNA;(3)具有DNA指导的DNA聚合酶活性,以逆转录合成的单链DNA为模板合成互补DNA链。19遗传密码的特点:(1)起始密码子和终止密码子;(2)方向性:5-3;(3)连续性(4)简并性;(5)通用性(6)摆动性。20常见的摆动现象(1)反密码子的第一位常出现稀有碱基次黄嘌呤,它可以与密码子的第三位的A、C或U配对;(2)反密码子中的U可以与密码子中的A或G配对;(3)反密码子中的C可以与密码子中的C、G或U配对。21核糖体在蛋白质生物合成中的作用:(1)容纳mRNA的通道,(2)能够结合起始因子,延长因子及终止因子等参与蛋白质生物合成的因子;(3)具有结合氨酰-tRNA的部位(A位或P位);(4)具有转达肽酶活性,催化肽键形成;(5)大亚基上具有延长因子依赖的GTP酶活性,它可能为肽提供能量。22严谨反应机制:在氨基酸缺乏时,游离核糖体与空载的tRNA增加,在ATP存在下,产生pppGpp(鸟苷-5-磷酸)和ppGpp(鸟苷-4-磷酸)。后者与RNA聚合酶形成ppGpp-RNA聚合酶复合物,进而使RNA聚合酶构象改变,活性降低,rRNA和rRNA合成减少或停止。22葡萄糖效应及机制:细菌通常优先以葡萄糖作为能源,当培养环境中有葡萄糖时,即使加入乳糖、阿拉伯糖等其它糖,细菌也不利用这些糖,不产生代谢这些糖的酶,直到葡萄糖消耗完毕,代谢其它糖的酶才会根据相应的糖是否存在而被诱导产生,这种现象称为——这是由于葡萄糖代谢产物能抑制细胞腺苷酸环化酶和激活磷酸二酯酶的活性,结果使细胞人cAMP水平降低。当葡萄糖耗尽时,细胞内cAMP水平升高,即可通过CAP调控其它操纵子的表达。23真核生物基因表达在DNA水平的调控方式:(1)染色质丢失(2)基因扩增(3)基因重排(4)DNA甲基化(5)染色质结构对基因表达的调控作用。24反式因子的主要特点:(1)一般具有三个功能结构域:DNA识别结合域、转录活性域、结合其它蛋白的结合域。这些功能区含有几十到几百个氨基酸残基(2)能识别并结合上游调控区中的顺式作用元件。(3)对基因表达有正性和负性调控作用,即渡海和阻遏基因的表达。25反式作用因子的激活方式及作用方式:激活方式(1)表达式调节;(2)共价修饰;(3)配体结合(4)蛋白质与蛋白质相互作用。作用方式(1)成环(2)扭曲(3)滑动(4)Oozing。26mRNA的选择剪接方式:(1)外显子选择(2)内含子选择(3)互斥外显子(4)内部剪接位点。27细胞通讯方式:(1)细胞间隙连接(2)膜表面分子接触通讯(3)化学信号通讯。28受体发挥其识别和信号转换作用时特点:(1)高度特异性(2)高亲和力(3)可饱合性(4)可逆性。29MAPK作为细胞内的的关键信号转导分子,如何发挥作用:MAPK由其上游分子MAPKK和MAPKKK通过逐级磷酸化反应而激活。细胞受到生长因子或其它因素刺激后,MAPKK可将AMPK的一个Thr磷酸化,从而使MAPK转变为有活性状态。具体表现为各自的逐级磷酸化,MAPK被激活以后,可转移至细胞核内。在核内,它可使一些转录因子发生磷酸化,从而改变细胞内基因表达的状态。另外,它也可以使一些其它的酶发生磷酸化使之活性发生改变。30细胞转导信号的基本路线和方式可以表示为:小分子信使浓度或分布变化外源信号—受体—大分子信使化学修饰效应分子构象变化—细胞应答反应蛋白质相互作用31G蛋白偶联受体的信号传递的基本过程包括:(1)配体与受体结合;(2)受体激活G蛋白(3)G蛋白激活或抑抑细胞中的效应分子;(4)效应分子改变细胞内小分子信使的含量与分布;(5)细胞内小分子信使作用于相应的靶分子,使之构象改变,从而改变细胞的代谢过程及基因表达等功能。32G蛋白的循环或活化过程:当物理或化学信号刺激受体时,受体活化,与G蛋白结合并使之发生构象改变。A亚基与GDP的亲和力下降,结合的GDP为GTP所取代。A亚基结合了GTP后即与BR亚基发生解离,成为活化状态的A亚基。活化了的A亚基此时可以作用于下游的各种效应分子。这种活化状态将一直持续到GTP被A亚基自身具有的GTP酶水解为GDP。33小分子细胞内信使一般具有的三个特点:(1)不位于能量代谢途径的中心;(2)在细胞中的浓度或分布可以迅速地改变;(3)作为变构效应剂作用于相应的靶分子,已知的靶分子主要为各种蛋白激酶。34表皮生长因子受体(EGFR)介导的信号转导途径EGFR——Ras——MAPK(1)受体二聚体的形成及其磷酸化;(2)募集接头蛋白Grb2:(3)调控分子SOS的活化(4)低分子量G蛋白Ras的活化;(5)MAPK的级联激活;(6)转录因子的磷酸化及其转录调控作用。35r——干扰素受体介导的细胞转导途径:r-干扰素与受体结合以后。也可以导致受体二聚体化,二聚体化的体可以激活JAL-STAT系统,后者将干扰素刺激信号传入核内。JAK为一种存在于胞浆中的蛋白酪氨酸激酶,它活化后可使干扰素受体磷酸化。STAT可以通过其SH2结构域识别磷酸化的受体并与之结合,然后STAT分子亦发生酪氨酸的磷酸化,酪氨酸磷酸化的STAT形成二聚体并进入胞核。二聚体STAT分子作为有活性的转录因子,影响相关基因的表达,进而改变靶细胞的增殖与分化。36Klenow片段的用途:(1)补齐双链DNA的3末端;(2)通过补齐3端使3末端标记;(3)在cDNA克隆中,第二股链的合成。(4)DNA序列分析。37几种常见修饰酶:(1)DNA聚合酶I:这个酶除有聚合酶活性外,尚有3-5及5-3核酸外切酶活性。由于它具有5-3核酸外切酶活性,当用缺口平移法标记DNA探针时,常用DNA聚合酶I。(2)逆转录酶:逆转录酶以RNA为模板合成DAN,合成时需要4种脱氧核苷酸及引物,合成方向为5-3延伸,无3-5外切酶活性。广泛用于mRNA为模板合成cDNA,构建cDNA文库。(3)T4DNA连接酶:催化双链DNA一端3-OH与另一双链DNA的5端磷酸根形成3、5-磷酸二酯键,使具有相同粘性末端或平端的DNA末端连接起来。(4)碱性磷酸酶:去除DNA或RNA5端的磷酸根,制备载体时,用碱性磷酸酶处理后,可防止载体自身连接,提高重组效率。(5)末端脱氧核苷酰转移酶:(TdT):将脱氧核苷酸加到DNA的3-OH上,主要用于探针标记;或者在载体和待克隆的片段上形成同聚物尾,以便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