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本章内容一、常用的工业微生物二、发酵工业菌种筛选的原则与基本技术三、发酵工业菌种改良://jpkc.hust.edu.cn/jpkc对产物进行菌种筛选时，有两条经验：进化上向上兼容；次生代谢在进化上后移，芽孢菌以上才有筛选意义。://jpkc.hust.edu.cn/jpkc最常用的工业微生物细菌醋杆菌属的醋化醋杆菌、弱氧化醋杆菌乳酸杆菌枯草杆菌丙酮丁醇梭菌大肠杆菌谷氨酸棒状杆菌最常用的工业微生物酵母菌酿酒酵母假丝酵母属产朊假丝酵母解脂假丝酵母热带假丝酵母毕赤酵母属、汉逊酵母属最常用的工业微生物霉菌曲霉属米曲霉黑曲霉青霉属青霉菌：点青霉、产黄青霉桔青霉根霉属德氏根霉米根霉、小麦曲根霉红曲霉属紫红曲霉最常用的工业微生物放线菌链霉菌属小单孢菌属地中海诺卡氏菌米苏里游动放线菌未培养微生物定义：指迄今所采用的微生物纯培养分离及培养方法还未获得纯培养的微生物，其在自然环境微生物群落中占有非常高的比例，约为99％。研究方法模拟自然培养法:原位培养、培养条件优化、单细胞操作宏基因组分析法二、发酵工业菌种分离筛选原则与基本技术（一）发酵工业菌种筛选的总趋势与要求（二）分离筛选原理与技术（三）应用举例菌种选择的总趋势野生菌→变异菌自然选育→代谢控制育种诱发基因突变→基因重组的定向育种菌种选择的要求能在廉价原料制成的培养基上迅速生长，且生成的目的产物产量高、易于回收；生长速度和反应速度较快，发酵周期较短；培养条件易于控制；抗噬菌体及杂菌污染的能力强；菌种选择的要求（续）菌种不易变异退化；对放大设备的适应性强；菌种不是病原菌，不产生任何有害的生物活性物质和毒素。（二）分离筛选原理与技术1.筛选的指导思想2.分离筛选工作在实际中应用的几个方面3.新种分离筛选原理与技术筛选的两种指导思想先分离纯化，再结合工艺要求进行筛选。分离纯化同时富于筛选条件，一步得出所需菌株。结果有两种可能：获得适于工业发酵菌株只获得选育所需的出发菌株分离筛选工作在实际中应用的几个方面从被污染的生产及科研用菌中分离目的菌；生产中长期使用的菌种的定期分离筛选；从各种育种方法处理的微生物材料中分离筛选适于工业目的的优良菌株；从已知菌种和大自然中分离新菌株寻找新的发酵产品的产生菌；寻找老产品的新的优良菌株。从保藏机构获取菌种进行分离筛选有两个好处：经济性指导性设计筛选方案时必须考虑两个要点选择性灵敏度新种分离与筛选的步骤调查研究（包括资料查阅）试验方案设计含微生物样品的采集（如何使样品中含所需微生物的可能性大？）样品预处理（如何在后续的操作中使这种可能性实现）菌种分离根据目的菌株及其产物特点分选择性分离方法随机分离方法(定向筛选←选择压力)(用筛选方案-检测系统进行间接分离）富集液体培养固体培养基条件培养(初筛)菌种纯化复筛菌种纯化初步工艺条件摸索再复筛生产性能测试较优菌株1-3株保藏及进一步做生产试验某些必要试验和或作为育种的出发菌株毒性试验等含微生物样品的采集采样时应注意的问题:土壤微生物的分布采土深度土壤植被情况采样季节土壤的酸碱度对于分离筛选新菌种，还存在另两个选择标准：土壤来源广泛在已适应相当苛刻环境压力的微生物类群中寻找新菌种样品的预处理目的：提高分离效率方法：物理方法：热处理；膜过滤法；离心法化学方法诱饵法分离方法的选择根据目的菌有无选择性特征来选择分离方法菌种的营养特征独特生长特征独特无选择性特征根据产物的特征进行随机分离选择性分离的关键：生长培养条件的选择与控制，从而实现定向富集筛选。选择性分离选择性分离原理和技术生长条件的选择与控制原理控制营养成分控制培养基酸碱度添加抑制剂控制培养温度控制通气条件选择性分离技术富集液体培养技术固体培养技术施加选择压力，进行定向筛选富集液体培养增加混合菌群中所需菌株数量的一种技术技术特点：给混合菌群提供一些有利于目的菌株生长或不利于目的菌以外的其他菌型生长的条件培养方式分批培养方式：以最大比生长速率（μmax）筛选，存在选择压力的控制、移种时间和次数等问题连续培养方式：以比生长速率（μ）筛选μABS0基质浓度对A、B两种菌的比生长速率（μ）的影响当SS0时，富集什么菌株？当SS0时，富集什么菌株？连续富集培养技术分离菌株的优点分离的菌株特别适合连续发酵生产过程有利于分离具有某种工业生产特性的菌株可以筛选出能共生的稳定混合培养物固体培养技术常用于分离某些酶产生菌选择压力：在选择培养基中加入所需酶的基质随机分离原理与技术从产物入手，通过设计高产培养基和建立快速灵敏专一的筛选方法，从随机分离的菌落中筛选出所需的目的菌。技术关键：产物合成条件的选择与控制及相应筛选方法的确定。随机分离技术举例抗生素产生菌的筛选药理活性化合物产生菌的筛选生长因子产生菌的筛选多糖产生菌的筛选高产培养基设计的几个原则制备一系列的培养基，其中有各种类型的养分成为生长限制因素；使用一聚合或复合形式的生长限制养分；避免使用容易同化的碳源或氮源，防止分解代谢物阻遏；确定含有所需的辅因子（Co2+,Mg2+,Mn2+,Fe2+）；使用pH缓冲剂以减少pH变化；前体、促进剂及抑制剂的采用。抗生素产生菌的筛选筛选模型：试验菌筛选方法：铺菌法复印平板法液体培养筛选抗药性筛选筛选模型：氨苄青霉素和β-内酰胺酶产生菌（克雷白氏菌）协同III无试样时（不含棒酸时），I对II菌作用不大有试样时（含棒酸时），I对II菌恢复药效，棒酸抑制水解酶活性固体培养筛选试验菌代表微生物类型金黄色葡萄球菌209p革兰氏阳性球菌枯草杆菌6633革兰氏阳性杆菌大肠杆菌革兰氏阴性肠道细菌耻垢分枝杆菌607结核杆菌白色念珠菌酵母状真菌青霉菌丝状真菌药理活性化合物产生菌的筛选药理活性化合物是指能抑制人类代谢中某一个关键酶的微生物产物即酶抑制剂，从而达到治疗的目的。筛选模型：目标酶生长因子产生菌的筛选筛选模型：营养缺陷型试验菌筛选方法：利用被分离的微生物产物能否促进营养缺陷型试验菌生长氨基酸产生菌的筛选样品预处理初筛（除真菌）在分离平板上生长获得多个单菌落复印平板（copy法）平板培养，其中有产生氨基酸的菌落分泌氨基酸对应到copy前相应u.v线杀死长好的菌落位置，找到目的菌落再铺上一层含营养缺陷型试验菌的琼脂培养后产氨基酸菌落周围有生长圈目的菌落进行液体培养，对产物进行定量测定筛选产物含量高的菌株多糖产生菌的筛选取样特点：碳水化合物工业的废弃物筛选方案：从菌落外观判断，选择外观呈粘液状的菌落，然后根据液体培养测定多糖含量来筛选高产菌。细菌分离：以乳酸菌为例取未成熟的酱醪样品1g至无菌磨口瓶中加麦芽汁至瓶口处，封塞，25℃培养24-48h培养基中长出绢丝状波动物，镜检杆状，阳性染色初步断定乳酸菌用选择性培养基分批富集培养2-3代稀释分离法分离单菌落，培养基为含麦芽汁、CaCO3的琼脂培养基根据透明圈挑选菌落性能测定（镜检杆状，染色阳性；乳酸纸层析鉴定）Rf值定性（有机酸呈黄斑点）乳酸生成量测定（滴定法）放线菌的分离：以产链霉素菌种的分离为例（从退化菌种中筛选）取工业发酵液（含孢子）样品1环放入带玻璃珠的装有10ml无菌水的小三角瓶中，摇匀采用稀释法制平板，获取单菌落斜面保藏高产菌恢复根据高产菌的特点，选择目的菌落放大培养，发酵液性能测试筛选模型：形态依据真菌的分离筛选：以啤酒酵母的分离为例取发酵液少许以10倍稀释成10-1-10-7稀释分离法取0.1ml加入固体培养基铺平皿（×2）在麦芽汁固体培养基上，25℃培养48-72h形态筛选根据正常株特点进行挑选，接种斜面备用纯化，采用平板分离法进一步纯化，至少反复三次①生成子囊孢子速度测定②发酵力测定性能测定③热死温度测定④凝集力测定⑤双乙酰含量测定菌种选育改良的具体目标提高目标产物的产量提高目标产物的纯度，减少副产物改良菌种性状，改善发酵过程改变生物合成途径，以获得高产的新产品发酵工业菌种改良方法常规育种(诱变育种)细胞工程育种基于代谢调节的育种技术基因工程育种蛋白质工程育种代谢工程育种赖氨酸生产菌种的选育改良思路出发菌株：黄色短杆菌、谷氨酸棒杆菌、乳糖发酵短杆菌育种思路1.优先合成的转换——渗漏缺陷型的选育2.切断支路代谢——营养缺陷型的选育：高丝氨酸缺陷型3.抗结构类似物突变株的选育：AEC4.解除代谢互锁：Leu-、抗Leu结构类似物、喹啉s、苯醌s5.增加前体物的合成和阻塞副产物的生成：Ala-、抗Asp结构类似物选育适宜的CO2固定酶/TCA循环酶活性比突变株6.改善细胞膜的透过机能7.选育温度敏感突变株8.应用细胞工程和基因工程育种选育适宜的CO2固定酶/TCA循环酶活性比突变株赖氨酸合成中间代谢有以下两条途径：①通过TCA循环葡萄糖丙酮酸草酰乙酸天冬氨酸赖氨酸②通过磷酸烯醇丙酮酸羧化反应葡萄糖磷酸烯醇草酰乙酸天冬氨酸式丙酮酸丙酮酸赖氨酸代谢工程的定义利用多基因重组技术有目的地对细胞代谢途径进行修饰、改造，改变细胞特性，并与细胞基因调控、代谢调控及生化工程相结合，为实现构建新的代谢途径，生产特定目的产物而发展起来的一个新的学科领域。