PubMed

问题的提出?查找南方医院侯凡凡教授2006年发表于NEJM354卷2期上关于苯那普利(benazepril)临床应用的那篇文献及其相关信息。国外有关SARS疫苗研究进展的文献。GuidetoSearchingPubMed顾萍教授Tel:61648055Email:[e-mail]南方医科大学医学情报学教研室PubMed网址与其它数据库资源不同，为全免费系统欲通过PubMed查找“利用抗生素（antibiotics）治疗耳痛（earache）”主题的文献，应如何进行操作？利用PubMed您可以干什么？查找某一主题的文献：标准（默认）检索、主题词检索以及文本词检索方式；查找某一作者撰写的文献：ZhongSZ；查找某一期刊发表的文献：JournalofSouthernMedicalUniversity；利用PubMed您可以干什么？查找某一篇特定文献：SingleCitationMatcher；查找某疾病的临床相关信息：ClinicalQueries；定期获取预设的主题信息：MyNCBI；与NCBI其它资源的链接信息。教学目标熟练掌握标准检索与字段限定检索的方法，了解主题词检索查找文献的基本技巧；学会将筛选出的文献，按常用格式进行显示、存盘、EMAIL发送等输出操作；熟悉全文获取的方式。PubMed概况检索方式选择*检索结果过滤检索结果处理*：显示、输出检索式浏览与保存*：个性化或定题服务全文获取技巧*PubMed特点分析概况免费使用，是查找众多与健康医学主题密切相关信息的优秀数据库系统；1997年6月26日，美国副总统戈尔宣布免费开放；文摘型数据库，但能提供部分文献的全文链接信息（如PubMedCentral和其他网站上的免费全文链接）；数据来自包括美国在内的80多个国家出版的约5,600多种生物医学期刊；记录从1946年至今已超过2200多万条；数据周二至周六每天更新,包括MEDLINE(mid-1960’s)、OLDMEDLINE(1948-1965)以及PREMEDLINE中的Medlinereferencesinprocess和referencessuppliedbypublishers。MEDLINE数据库是美国国立医学图书馆的重要书目数据库系统,覆盖医学、护理、牙科、兽医、卫生保健等学科。PubMed提供的结果文献题录或摘要信息；文献免费或收费的全文链接信息。检索方式选择主题检索(SubjectSearch)*作者检索(AuthorSearch)*期刊检索(JournalSearch)截词检索(Truncation)词组检索(PhraseSearch)单个引文匹配器(SingleCitationMatcher)*相关文献(RelatedCitations)主题检索标准检索(StandardSearch)*：默认的智能检索方式文本词检索(TextWord)*：字段限定主题词检索(MeSHDatabase)标准检索提问框(Thestandardsearchbox)检索词：逻辑式、叙述性语句、实质意义词；作者名：查找2002年以前文献需采用姓全称、名缩写方式，如：ZhongSZ；刊物名：全称、简称、ISSN号。布尔逻辑运算符(大写)ORANDNOTOtitismediaANDantibioticsOtitismediaORantibioticsOtitismediaNOTantibiotics在PubMed中,逻辑运算遵循从左到右的次序：antibioticsAND(earacheORotitis)不同于antibioticsANDearacheORotitisPubMed检索结果页面输词方式:earache[TW]此外，利用*截词功能也将只运行文本词检索。文本词检索(TextWord)PubMed记录字段说明文摘第一著者单位地址出版商提供文献识别号著者群版权说明参考评论文献合著者文献参考评论定稿版校样版输入日期输入完成日期电子出版日期电子出版日期文献出版日期数据加入PubMed日期文献勘误参考文献勘误全部著者姓名全部调研者姓名作为文章主题的著者全称文献相关注释基金编号基因符号期编号资助调研者资助调研单位国际标准期刊号美国立医学图书馆识别号期刊全称最后修订日期规范词表规范词确立日期系统组织的文摘版权拥有者题录提供机构的识别号病史相关与原始记录其他关键词提供其他关键词的机构数据提供者机构文章总页数出版商提供数据时间期刊出版国数据库文献编号作为主题词的个人姓名出版状态文献类型出版模式（纸张或电子）参考文献数已撤回的文献酶或化学物质代码正在撤消中的文章初版文献修订和再版的文章子专题文档太空署提供的数据二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号原文来源引用了病例的文献内部处理代码标准期刊缩写文献标题翻译标题更新文献文献正在更新期刊卷号MeSH:MedicalSubjectHeadings；医学主题词(MeSH)是由标引员为所有的PubMed记录所指定的词；标引员使用能恰当描述文章内容的最相关MeSH词；通常一篇文章可有几个MeSH词。主题词检索(MeSHDatabase)举例：通过MeSH查找“利用抗生素(antibiotics)治疗耳痛(earache)”主题的文献主要标题词(MajorTopic)当标引员为一篇文章确定MeSH词的同时，通常要进一步分析它为文章的主要论点还是次要论点；限制检出文献量的一种方法是将检索限制在majorMeSH字段，这意味着检出文献虽少但内容更相关。PubMed能自动地为输入的检索词寻找相应的MeSH词；用户利用一个MeSH词能找出所有含有该主题的文献；多数MeSH词还包括副主题词(subheadings)。副主题词(MeSHSubheadings)一个MeSH词的某特定方面,如:cost-effectiveness或adverseeffects用户可根据课题内容挑选专门的副主题词。这些副主题词不仅适用于用户输入的MeSH词，而且还适用于该MeSH词的其它下位词。MeSH词优点不同拼写:paediatric/pediatric；同义词:tumor,tumour,cancer,neoplasm；同音异义词:depression；排除不相关的文献；MeSH词独有特征扩展(EXPLODE)：选择MeSH词及其更加专指的下位词检索。主要标题词(MAJORTOPIC):MeSH词为文章的主要研究内容(*)。副主题词(SUBHEADINGS)MEDLINE-MeSHHeadings作者检索(AuthorSearching)用于查找某一特定作者撰写的文献。格式为作者姓全称在前、名缩写在后，如SMITHBJ。利用作者全称可检索2002年以来出版的文献，但采用第一作者进行检索时，需用传统的名字书写方式。检索词后加上作者字段标识符，如FOOT[AU]，则系统只在作者字段进行检索。利用History功能可将作者字段检索与其它检索词进行组配。期刊检索(JournalsinNCBIDatabase)用于查找某特定期刊中的文献。可输入刊名全称、MEDLINE简称或期刊的ISSN号，如：MOLECULARBIOLOGYOFTHECELL(fullname)MOLBIOLCELL(abbreviation)。如若在检索词后加上期刊的字段名，则系统只在该字段进行检索，如CHEST[TA],BLOOD[TA]等。截词(Truncation)PubMed中的截词符是“*”，用于查找具有相同词根的词(＜150)，如输入cell*会查出文章中包含有cell,celliferous,cellophane,cells,cellular等内容文献。注意：使用截词功能后，将关闭MeSH自动扩展及检索词匹配功能。词组检索(PhraseSearching)需使用引号标记词组“...”,如：“glueear”。由于词组检索将关闭自动匹配和MeSH扩展功能，检索时将不包含更加专指的词即下位词。单个引文匹配器（SingleCitationMatcher）用于查找著录信息不全的文献；用户可通过对刊名、出版年、卷号、期号、首页、作者名等组配方式查找某特定文献；作者与期刊检索字段提供有名称自动匹配功能；利用第一作者方式检索时姓名不能采用全称形式；需注意的是许多期刊不在MEDLINE收录范围之列(5,600种)。查找南方医院侯凡凡教授发表于NewEnglandJournalofMedicine上文献及其相关信息。相关文献(RelatedCitations)PubMed通过分析篇名、文摘及MeSH字段中出现词的权重值来筛选PubMed中与已查出文献相似的信息；PubMed将产生一系列以某一文献为起始的相关文献，且其总列在首位。检索结果过滤(Filters)检索结果处理检索结果的处理结果显示(DisplaySettings)：Summary、Abstract、MEDLINE结果输出(Output)：检索结果的长期保存(SendtoFile&MyNCBICollections)、多次检索结果的一次性暂时保存(Savingfrommultiplesearches)、检索结果邮件发送(Email)。检索结果显示(DisplayResults)检索结果通常以Summary格式显示，包含基本的引文信息:author(s)articletitleabbreviatedjournaltitlepublicationdetailsaPubMedIdentificationnumberstageofindexingSummaryDisplayAbstractDisplay包含全部引文信息:题录+文摘(若有).如若可能，还包含全文链接按钮(iconsforfulltextarticleretrieval)以及出版物类型(Publicationtype(s))。MEDLINEDisplay用两个字母作为字段标识符显示引文信息，主要用于书目型数据库的管理，如EndNote,ReferenceManager和Papyrusetc,不包括全文链接按钮。检出文献显示设定(Show)每屏默认显示值是20。检索结果输出(Output)通过点击各篇文献左边的复选框选择文献，以进行显示、存盘及打印操作(出现一个√)；选择文献后再点击Display按钮，则屏幕只显示被选中的文献。检索结果的长期保存(SaveReferences)选择Sendto下拉式菜单中的File功能；可保存那些选中的文献；用户可保存多至10,000条的文献。对多次检索结果进行一次性暂时保存(SavingfromMultipleSearches)选择Sendto下的剪帖板(Clipboard)；用户可将从多次检索操作中获得的多至500条记录放到Clipboard中；如若浏览选中的文献,点击位于检索提问框下的Clipboard。从检索结果中筛选出的所需文献，在去掉重复部分后，会形成一个特定数据集。•点击下拉式菜单中的ClipRemove。清空ClipboardMyNCBICollectionsMyNCBI是用户在NLM计算机系统中用于存储检索式的个人使用空间，并对检出文献进行再过滤（filters）；为使用MyNCBI，用户需将其web浏览器设置接受cookies状态；需要注册（Registration）；需先将检索结果发送至Clipboard；在Clipboard中将所选出的检索结果发送至MyNCBICollections中；每个用户名下最多能设100个文件夹；每个文件夹下最多能保存1500条记录;利用Clipboard方便对一次检索操作中的几个查询课