pubmed检索教程

美国医学文献数据库2013.42020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室1一、数据库概况（一）编制单位：美国国立医学图书馆(NLM)（二）收录学科内容：主要收录生物医学、卫生保健以及生命科学相关文献。包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学、基础研究；临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或相关教育活动的内容。2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室2一、数据库概况（三）文献来源：70多个国家和地区；近5000种生物医学期刊美国卫生研究院文献选择技术评估委员会LiteratureSelectionTechnicalReviewCommittee(LSTRC)评估挑选NLM和各专业协会的数据协作采集专家推荐。近年数据涉及37种语种，回溯至1949年的数据涉及60种语种。47%为美国本土出版文献，90%为英文文献，79%的文献有文摘。（以上由2009年7月数据库提供）2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室3二、MEDLINE的检索平台广域网免费平台：NCBI-PubMed（含非MEDLINE数据）2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室4二、MEDLINE的检索平台校园网内可用平台（IP控制）OvidSPWebofKnowledgeEBSCOOCLCFirstSearch2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室5校园网内可用平台的Medline2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室6PubMed数据库复旦大学图书馆文献检索教研室7一、PubMed简介开发机构：NCBI（美国国立生物技术信息中心）任务:利用计算机信息处理技术，建立分子生物学、生物化学、遗传学知识的自动存储和分析系统，并开展相关先进方法的研究。促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室8NCBI网站2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室9NCBI提供的数据库检索大分子生物学数据获取GenBank,EMBL等数据库的核酸序列；获取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等蛋白质序列，从核酸序列翻译到蛋白质的序列；获取基因和染色体图谱；蛋白质三维结构数据及大分子模式（MMDB）等其他生物信息数据库检索。PubMed等文献数据。2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室10（二）PubMed的特点广域网免费提供题录和文摘提供与原文的网址链接(部分免费获取）提供检索词智能转换匹配界面简洁，操作简便(须IE7.0以上版本)2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室11（三）PubMed收录数据MEDLINEIndexed1966toprensent的MEDLINE已标引数据，有MeSH字段和摘要，每条记录标有：[PubMed-indexedforMEDLINE]OldMEDLINE1949-1965年间的MEDLINE数据，无MeSH字段和摘要，每条记录标有：[PubMed-OLDMEDLINEforPre1966]2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室12（三）PubMed收录数据MEDLINEInprocess最新的MEDLINE处理中数据，未标引，无MeSH字段。每条记录标有：[PubMed-inprocess]。Publisher-Supplied出版商提供的电子文献题录，每条记录标有:[PubMed-assuppliedbypublisher]，分为两类：MEDLINE收录，逐步转为InProcess,Indexed状态。NotMEDLINE：PubMed收录，MEDLINE不收录，一直标注[PubMed-assuppliedbypublisher]或[PubMed]2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室13二、PubMed的检索功能2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室14基本检索输入框高级检索检索指南检索工具：特定文献检索临床查询专题查询其他资源：规范词数据库期刊数据库临床试验等个人空间2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室15检索栏可输入一个或多个检索词（系统默认空格为AND检索）如：strokethrombolysis（中风与溶栓）三、PubMed基本检索规则2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室16检索栏可输入布尔逻辑运算式：（运算符须大写）如：asthmaAND(therapyORtreatment)字段限定符：[]，空格按词组匹配试比较：strokeANDthrombolysis[ti]strokethrombolysis[ti]stroke[ti]ANDthrombolysis[ti]stroke[ti]thrombolysis[ti]三、PubMed基本检索规则著者检索：姓全称在前，名首字母在后，[au]。如:smithab[au]“paulsene”[au]思考题：中国学者的名字该如何转换呢？如：闻玉梅卢正宏2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室17三、PubMed基本检索规则2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室18刊名检索：全称或MEDLINE认可的标准缩写,[so]如：Journalofinvestigativedermatology[so]Jinvestdermatol[so]三、PubMed基本检索规则输入刊名检索发表在该刊上的文献（限定出处字段SO）PubMed记录字段说明2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室19文摘第一著者单位地址出版商提供文献识别号著者群版权说明参考评论文献合著者文献参考评论定稿版校样版输入日期输入完成日期电子出版日期2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室20电子出版日期文献出版日期数据加入PubMed日期文献勘误参考文献勘误全部著者姓名全部调研者姓名作为文章主题的著者全称文献相关注释基金编号基因符号期编号资助调研者资助调研单位国际标准期刊号美国立医学图书馆识别号期刊全称2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室21最后修订日期规范词表词规范词确立日期系统组织的文摘版权拥有者题录提供机构的识别号病史相关与原始记录其他关键词提供其他关键词的机构数据提供者机构文章总页数出版商提供数据时间期刊出版国数据库文献编号2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室22作为主题词的个人姓名出版状态文献类型出版模式（纸张或电子）参考文献数已撤回的文献酶或化学物质代码正在撤消中的文章初版文献修订和再版的文章子专题文档太空署提供的数据二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号原文来源引用了病例的文献内部处理代码标准期刊缩写文献标题翻译标题更新文献文献正在更新期刊卷号三、PubMed基本检索规则截词检索：treat*可检出：treat,treated,treatment...强迫短语检索：“”，不进行自动转换匹配和扩展检索如：“acutelowbackpain”“ang1”（血管紧张素1缩写）检出1085篇比较：ang1检出9956篇，误检多，其中有：2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室232020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室24三、PubMed基本检索规则自动转换匹配检索词：对常用医学名词自动在规范词索引（主题词、副主题词、物质名称）中转换、并默认在所有记录字段中匹配。如：livercancerliverneoplasms[MeSHTerms]OR(liver[AllFields]ANDneoplasms[AllFields])ORliverneoplasms[AllFields]OR(liver[AllFields]ANDcancer[AllFields])ORlivercancer[AllFields]2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室252020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室26结果显示页右侧Details显示系统自动匹配转换的检索词2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室27四、PubMed检索限制PubMed可以针对检索结果作进一步的限制Articletypes文献类型限定Textavailability全文、免费全文、摘要限定Publicationdates出版日期限定Species研究对象人/动物限定Languages语种限定Sex性别限定Subjects各主题领域限定Journalcategories各种专题子数据库限定Ages年龄限定Searchfields字段限定2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室282020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室29五、PubMed高级检索一个网页中集多种功能于一体其他检索资源检索历史检索式编制检索词索引基本检索2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室30SearchBuilder（检索式编制）：检索框中只能输入检索词，不能输入检索式。多个字段检索要分多次输入。SearchHistory（检索历史）：检索历史中显示历次检索式、时间和检出篇数。可组配检索式，如：#1OR#2，#1ANDchild点击编号可对检索式进行删除、保存等操作。五、PubMed高级检索六、PubMed其他资源1.MeshDatabase（规范化医学主题词表）功能：确定规范化主题词查看主题词词义注释、树状结构表选择副主题词、扩展下位主题词、指定主要主题词进入途径：MeSHDatabase链接：PubMed主页，AdvancedSearch界面MeSH选项：基本检索框前Search下拉菜单的2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室31文章A著者用词：Livercancer规范主题词MeSH：Liverneoplasms词表中：livercancerSeeliverneoplasms（2）医学主题词表（MeSH）用规范词查找“肝肿瘤”的文献文章B著者用词：Livertumor规范主题词MeSH：Liverneoplasms2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室33进入MeSHMeSH注释界面MeSH详细注释界面2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室36MeSH词检索例1：检索2009-2013年关于舌根癌治疗的文献。课题分析：舌根癌的不同表达形式（OR）：tonguebasecancer、cancer/carcinoma/tumoroftonguebase、cancerofthebaseoftongue…治疗的不同表达形式（OR）：therapy/treat/treatment,surgery,radiotherapy…两个概念之间：舌根癌AND治疗输入检索词，查找规范词未匹配到规范词改用上级概念“舌癌”匹配2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室38输入自由词，查找规范词规范词同义词副主题词规范词隶属关系树2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室39选择副主题词建构检索语句限定检索主要主题词，只查重点论述的文献2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室40输入舌根的自由词检索式，进行AND运算。2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室41初步结果，未限定年份2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室42设定的限制2020/1/10复旦大学图书馆文献检索教研室43自由词检索最新文献输入(tongue[ti]ANDbase[ti]AND(cancer[ti]ORcarcinoma[ti]ORtumor[ti]))AND(therapyORtreatORsurgeryORradiotherap*ORrehabilita