GCBI文献查询与基因分析

其明生物信息GCBI文献查询与基因分析撰写者：成东林上海其明信息技术有限公司文献查询：基因查询：miRNA查询：lncRNA查询：样本查询：IF查询：综合查询：常用连接论文举例成文思路高通量检测HTA2.0RNA-seq生物信息学分析发现长非编码RNALnc-DCFISH细胞定位分析Northernblot/qPCR表达特异性功能研究表达调控研究调控机制研究过表达干扰构建小鼠干扰模型Lnc-DC干扰/过表达后对其他基因/蛋白的影响，以及对细胞生存与分化的影响转录因子荧光素酶报告分析转录因子结合区域分析CHIP-seq/CHIP-qPCR组蛋白甲基化和乙酰化RIP寻找lnc-DC可能的调控对象及调控机制，检测目标蛋白是否与lnc-DC存在结合关系PullDown与lnc-DC相互结合的蛋白FISH细胞定位分析初步确定lnc-DC可能的调控机制找到STAT3蛋白RIP验证PullDown实验STAT3与lnc-DC共同细胞定位免疫荧光检测lnc-DC异位表达/STAT3抑制剂干扰Truncationmutantslnc-DC与STAT3相互结合区域lnc-DC影响STAT3的磷酸化与核转运lnc-DC阻止STAT3被SHP1去磷酸化，稳定STAT3的活化状态查阅相关文献关注方向免疫、非编码RNANCBI、GCBI确定研究思路免疫系统•树突状细胞•分化、功能lncRNA•转录因子•细胞因子检测•基因芯片•二代测序•…调控机制•磷酸化•种子序列结合•…确定方向确定的方向查询文献展开不确定的因素开展实验文献查询NCBIGoogle学术文献查询帮手试试综合查询库，更快、更简，更好的选择NCBI：内容繁杂，头疼！！Google学术：不翻墙上不去！！怎么解？GCBI查询关键词DendriticCelldifferentiationandfunctionlncRNASTAT3RNAiChip-seqRNApulldown获取相关文献及基因信息，整理科研思路文献查询文献查询简单易用、一键式搜索文献查询想看有样本数据的文献，一点鼠标，即刻呈现按发表日期、影响因子排序，直接查看更新更高分的文献输入关注基因，无效信息统统让道文献查询这么多有样本的文献，同时也是我关注的文献，这些样本能否为我所用？？我们一起来试一试！！关注文献中的样本处理这篇文章我很关注，且有这么多的样本！对于我的研究很有帮助，要好好利用？这个编号好熟悉，去NCBI下数据！关注文献中的样本处理你out了，GEO数据库下下来你能直接用吗？一堆原始数据看得懂吗？接下来看我的关注文献中的样本处理关注文献中的样本处理发送到我的实验室去看看？实验室是什么？赶紧去注册一个账号玩玩吧！能为你做什么？导入样本数据处理获取结果GC-Lab？GC-Lab是什么?对生物数据进行信息学解读，你可以在线自己操作的实验室GC-Lab能做什么？设计具有可行性逻辑的思路对样本数据进行分析，想怎么玩就这么玩结果报告导出，为我所用GC-Lab数据处理中心GC-lab怎么用？创建个人实验室、加入别人实验室样本：ninehumanimmunecellsubsets(neutrophils,eosinophils,monocytes,Bcells,NKcells,CD4Tcells,CD8Tcells,mDCsandpDCs)目的：identifycell-typespecificmRNA检测平台：AffymetrixHumanGenomeU133Plus2.0ArrayGSE28490结果GC-Lab分析思路设计创建、编辑项目GC-Lab分析思路设计简便的方案设计，一键运行剩下的事交给实验室差异及聚类结果对运算结果不满意，参数任你调GC-Lab分析思路设计小case，添加两个节点轻松帮你解决！想看看差异表达基因参与那些功能、通路？GC-Lab本地数据上传放心，让你数据挖掘不求人文献数据处理了，我的实验室数据还在本地呢！！对已有检测样本数据直接选择样本数据上传检测•基因芯片•二代测序•…实验数据Science高通量检测HTA2.0RNA-seq生物信息学分析发现长非编码RNALnc-DC高通量检测14个样本HTA2.0芯片2个样本RNA-seq检测数据都做了些什么？实验数据处理样本编号说明GSM1308838human_monocytes_0dayinDCcultureGSM1308839human_cells_1dayinDCcultureGSM1308840human_cells_2dayinDCcultureGSM1308841human_cells_3dayinDCcultureGSM1308842human_cells_5dayinDCcultureGSM1308843human_dendriticcells_7dayinDCcultureGSM1308844LVcontrol_rep1GSM1308845LVcontrol_rep2GSM1308846LVlinc-DCRNAi_rep1GSM1308847LVlinc-DCRNAi_rep2GSM1308848DMSO_rep1GSM1308849DMSO_rep2GSM1308850STAT3inhibition_rep1GSM1308851STAT3inhibition_rep2验证样本实验样本数据利用：GCBI科研工作者A：Science文章里检测了一大批样本，但是只用到了差异分析，似乎有点可惜！科研工作者C：你们想些什么呢，你以为你想用就能用吗？科研工作者B：这些数据能为我所用吗？科研工作者：实验室我们可以随便用，看看去！到我的实验室去折腾折腾看看：GCBIMonocytes经过6个时间点分化为DendriticCellHTA2.0芯片检测，获得mRNA、lncRNA表达数据可分析mRNA、lncRNA随分化时间而发生表达变化的趋势对mRNA进行GO、Pathway分析分析lncRNA调控mRNA的共表达网络，找到核心调控lncRNA和mRNA样本分析样本编号说明GSM1308838human_monocytes_0dayinDCcultureGSM1308839human_cells_1dayinDCcultureGSM1308840human_cells_2dayinDCcultureGSM1308841human_cells_3dayinDCcultureGSM1308842human_cells_5dayinDCcultureGSM1308843human_dendriticcells_7dayinDCculture有了对样本的深入分析，开工吧！实验室折腾方案原来可以做这么多的东西GC-Lab图形展示结果红色显示为显著性变化趋势，作为重点关注对象。点击可以查看显著性趋势中所属基因详细信息GC-Lab可下载的分析结果结果报告下载到本地GC-Lab可下载的分析结果完整下载结果报告，随意查看各部分详细结果核心基因FOSB发现核心基因CCL22、TFRC、SELL、IL23A、FOSB分析共表达网络这些线索可以带给我什么？对FOSB在免疫方面的研究就三篇文献文献库中，发现以Immune为关键词进行查询共有905027篇，限制研究基因CCL22(36)、TFRC(20)、SELL(106)、IL23A(176)、FOSB(3)查询FOSB基因信息参与破骨细胞分化信号通路，样本为诱导单核细胞分化为树突状细胞，吻合！对FOSB研究，后续可以做点什么？ceRNA最近研究很热，作为下一个研究课题祝您实验顺利成东林[e-mail]上海其明信息技术有限公司