微阵技术为能够处大的基因而广泛的应用在生物及医学上

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资源描述

摘要微陣列技術為了能夠處理大量的基因而廣泛的應用在生物及醫學上面,而致命疾病的基因是現代醫學家所想研究且探討的一個主題。本篇論文依據此動機法展一套迅速準確且有重複性的系統提供下面的功能:1.偵測正常人和癌症人表現量差異較大的基因2.選取能夠分辨兩種不同疾病基因的集合的方法3.把結果視覺化並列出基因的AccessionNumber這篇論文我們用兩種不同的方法再做前背景的偵測分別是Otsu和GaussianMixtureModel此外在正規化部分使用LOWESS演算法和MovingAverageFilter兩種方法實作。最後使用Fisherlineardiscriminant方法找尋一組最能區別兩種疾病的基因並用K-means和Hierarchical等方式檢查可靠性。此外為了測試此方法之可行度做了小樣本的分類測試,使用了Quadratic和3-NN演算法。Themicroarraytechnologywasbornfordealingwithalotofgenes.Itisdevelopedtorevealvariousgenesrelatedtofataldiseaseswhatpeoplewanttodiscover.Thepurposeofthisthesisistoimplementasystemfordealingwithmicroarrayimagepatternanalysisfast,accuratelyandrepeatedly.Andthesystemprovidesthefollowingfunction:(i)Detectdifferentiallyexpressedgenes.(ii)Selectasubsetofgeneswhichbestdistinguishesdifferentdiseases.(iii)Visualizingourexperimentalresultsbythedendrograms.Inthisthesis,weusetwodifferentmethods,OtsuandGMMtodogeneexpressioncomputation.AndthenweuseLOWESSandMovingAverageFilteringtodonormalization.Finally,weuseFisherlineardiscriminantforfindingdifferentiallyexpressedgenesandchecktheresultsbyK-meansandHierarchicalclustering.

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