第1章生物化学基础1、一句话问题1.生命形式虽然千差万别,在就化学本质而言,他们具有一致性。2.生命体区别于非生命体的四个基本特征。3.有机体遵行热力学第一定律,通过增大环境的无序而使得自身有序化。4.生命体的信息流基本类同。5.根据SSURNA序列细胞分为三类,细菌、古细菌和真核细胞。古细菌与真核细胞更接近。6.线粒体和叶绿体是通过内共生进入真核细胞。线粒体来源于紫细菌,叶绿体来源于蓝细菌。7.细胞与细胞器--超分子复合体----大分子--单体8.生物分子结构决定反应性、结构决定功能、结构也代表一种信息。9.细胞内是一个水环境,水为细胞内生化反应提供了反应介质,甚至直接参与反应。第2章氨基酸与肽1、概念蛋白氨基酸,非蛋白氨基酸,兼性离子pIParaloguesorthologuesPITCDNP2、简答1、写出20中氨基酸的三字母和单字母缩写,哪些属于酸性,哪些属于碱性,哪些含羟基,哪些含硫元素。2、什么是sanger反应,什么是Edman反应,它们在蛋白质测序过程中有何用途?3、如何测定蛋白质的序列?亚基还原解离,N末端确定,氨基酸组成确定,两组以上酶解,Edman降解确定每一个小片段的序列,序列拼接,对角线电泳确定二硫键位置。第3章蛋白质的空间结构1、概念肽键肽平面ψ角φ角超二级结构结构域2、简答1、如何确定蛋白质的空间结构2、蛋白质的二级结构形式主要有哪几种,它们结构特点如何,主要由那种最用了驱动。3、驱动蛋白质形成空间结构的作用力是什么?4、四级结构的形成对蛋白质由何意义。5、蛋白质中超二级结构主要有哪几种?6、什么是蛋白质变性与复性,蛋白变性后都能复性吗,细胞内有一些蛋白质可辅助其它蛋白质的折叠,它们是什么,如何起作用(分子伴侣,二硫键异构酶PDI,肽基脯氨酰顺反异构酶PPI)?第4章蛋白质功能1、概念氧饱和曲线BPGHbs抗原表位抗原决定簇单克隆抗体多克隆抗体ELISAWesternblotFabFcHMC2、简答1、以血红蛋白和肌红蛋白为例说明蛋白质结构与功能的关系。2、胎儿与成人的血红蛋白和肌红蛋白有何不同。3、抗体分为哪几类,含量最多的是那种,它的结构特征是什么?4、什么是分子病,举例说明一级结构和高级结构的关系。5、参与肌肉收缩的两种主要蛋白是什么,如何实现肌肉的收缩。6、抗体是由那种类型细胞产生,为什么抗体的数目远大于人类基因的数目,对应于某一种抗原的抗体是如何产生的?第5章蛋白质分离与纯化1、简答1、简述离子交换层析、亲和层析、凝胶过滤、疏水层析分离的原理及样品洗脱方法?2、测定蛋白质分子量方法有哪些,列举3种?3、什么是蛋白质,研究蛋白组常用的方法是什么。4、常用的蛋白质沉淀方法有哪些(列三种)。5、列举三种测定蛋白质含量的方法。第6章酶通论1、名词、符号、结构单纯酶复合酶辅酶辅基单体酶寡聚酶多酶复合体多酶体系活力比活力KcatKatUribozyme活化能诱导契合必须基团活性中心初速度2、简答1、酶促反应分为哪六类,EC1.1.1.1属于那类酶?2、酶与化学催化剂相比,有什么特点?3、制备聚丙烯酰胺凝胶的单体是什么,催化剂是什么,诱发剂是什么,如何对凝胶中的样品进行染色。第7章酶促反应动力学1、名词、符号、结构DIFPKsKmVmax2、简答1、举两个例子说明抑制剂在药物开发中的应用?2、可逆抑制作用分为哪几种,每一种的动力学特征有何不同?3、什么是米氏方程,米氏常数,米氏常数与酶和底物亲和力的关系,如何计算米氏常数和最大反应速度。第8章酶的活性调节1、名词、符号、结构酶原激活共价修饰别构酶变构部位正协调副协同同促效应异促效应齐变模型序变模型2、简答1、列举酶活性调节的方式?2、胰凝乳蛋白酶如何激活,如何实现催化?3、如何研究酶的活性中心,哪些氨基酸残基组成活性中心?4、什么是别构酶,催化有何特征。5、蛋白酶根据活性中心和催化机制分为哪几类?那种酶的活性中心需要金属离子。第9章辅酶与维生素1、名词、符号、结构TPPNADPHFMNFADCoAVcFH42、简答1、水溶性维生素和脂溶性维生素包括哪些,它们衍生的辅酶是什么,具有什么功能?2、哪些辅酶为氢的传递体?第10章核酸性质及结构1、名词、符合、结构mRNAcDNA超螺旋CDS2、简答1、核酸包括哪些种类,功能有何不同。2、碱基和戊糖之间是如何连接的?核苷酸和核苷酸之间如何连接的。3、DNA双螺旋结构的基本特征是是什么?除B-DNA外还有哪些形式。维持DNA双螺旋的作用力有哪些。4、DNA是遗传物质是如何被证明的。第11章核酸性质及研究方法1、名词、符合、结构DNase,RNase限制修饰系统TmSouthern-blotNorthern-blotEBPCRddGTP2、简答题1)影响Tm的因素有哪些?2)影响质粒电泳行为的因素有哪些。3)DNA双脱氧测序的原理4)分子杂交技术的原理及应用。5)DNA复杂度与复性速度之间的关系。6)核酸纯度鉴定方法?核酸分子均一性的鉴定方法?7)PCR技术的基本原理,关键步骤及应用。8)Southernblot的基本流程。第12章糖化学1、名词和符号单糖果糖多糖杂多糖同多糖还原糖非还原糖Glc(glucose葡萄糖)Fuc(Fucose岩藻糖)Fru(fructose,果糖),Gal(Galactose,半乳糖)Man(Mannose(甘露糖)Rib(Ribose,核糖)Xyl(Xylose,木聚糖)Ara(arabinose,阿拉伯糖)2、简答题1)淀粉、纤维素、几丁质、细菌细胞壁的基本结构单元和连接方式。2)糖和蛋白质连接的两种主要方式是什么,主要和那些氨基酸残基连接。3)糖在生物体内的功能。第13章脂化学1、结构名词和符号卵磷脂脑磷脂鞘磷脂鞘氨醇豆蔻酸月桂酸棕榈酸硬脂酸花生酸油酸亚油酸2、简答题1)细菌和古细菌的细胞膜组成有什么不同。2)脂质根据化学本质分为哪几类。第14章生物膜1、名词和符号外周蛋白内在蛋白膜锚定蛋白相变温度flippasecaveolin通道载体泵uniportsymportantiport2、简答题简述细胞膜的生物功能。简述细胞膜的基本结构模式,什么实验可以证明膜是流动的,膜流动的物质跨膜运输的基本模式。膜的流动性与那些因素有关?第15章代谢总论1、名词符号Chemoheterotrophicphotoautotrophin-vivoin-vitro厌氧生物需要生物2、简答1)如何控制同一细胞中的合成和分解代谢。2)如何研究代谢过程,常用的方法有哪些。3)ATP和辅酶在代谢中作用。第16章糖的分解代谢1、名词符号PEP糖酵解2、简答1)图示EMP途径的基本流程,列出其中主要的调控部位,说明2,6而磷酸果糖如何调控EMP途径,而它自身又如何调控。2)图示TCA循环的步骤,为什么说TCA是物质代谢的中枢3)什么是PPP途径,PPP途径分为哪两个阶段,PPP途径意义何在。4)哪些酶参与了淀粉和合成和分解。5)1分子葡萄糖彻底分解需要经历那些过程,可产生多少ATP分子。第17章氧化磷酸化与电子传递链1、名词生物氧化氧化磷酸化底物水平磷酸化F1F0-ATP酶复合体能荷2、简答1)图示电子传递链和组成,电子传递链如何偶联ATP的生成。2)电子传递链和氧化磷酸化主要的抑制剂及抑制位点。第18章糖类合成1、结构、符号和名词RUBPUDPGADPG光反应中心光反应暗反应光合磷酸化环式光合磷酸化非环式光合磷酸化碳三循环碳四循环糖异生糖醛酸途径2、关键酶RubiscoPSIPSII3、一句话问题1)光反应阶段水被光解产生氧气,水的光解与PSII相关。2)PSII被700nm的光激发,而PSI被680nm的光激发。3)光合电子传递过程伴随着H离子从叶绿体基质到基粒片层中的运输,导致H离子梯度的形成。4)同位素示踪C3循环的实验室体内实验(invivo)。5)C3循环的第一步是RUBP和rubisco的催化下羧化形成不稳定的6碳中间体,迅速降解为两个3碳化合物3-磷酸甘油酸。6)Robisco由8个大亚基和8个小亚基组成,大亚基有叶绿体基因编码,而小亚基由和基因编码。7)碳四植物的二氧化碳固定发生在叶肉细胞,而C3循环主要发生在维管束鞘细胞,叶肉细胞想将CO2固定为草酰乙酸,然后以苹果酸形式运送到维管束鞘细胞。8)糖醛酸途径与肝脏的解毒过程相关,与Vc的代谢相关。9)寡糖和多糖合成过程中糖需要先活化为UDPG或ADPG形式,如糖原合成时,活化的糖为UDPG,而淀粉合成时ADPG是糖的活化形式。4、简答题:1)简述光合作用两阶段发生的反应,两者如何联系起来。2)图示光合电子传递链的组成。3)比较EMP和糖异生的中反应的异同。第19、20章脂类代谢1、结构、符号和名词ACPBCCPPLA1PLA2PLBPLCPLDHDLLDLVLDL肉毒碱苯基标记卵磷脂脑磷脂鞘氨醇神经酰胺二酰基甘油HMG-COAMVA2、关键酶脂肪酸合成酶系、乙酰COA羧化酶3、一句话问题10)脂肪酸氧化分解主要包括三种模式、a-氧化、b-氧化和w-氧化。1)长链脂肪酸要进入线粒体需要肉碱转运系统。2)细菌脂肪酸合成酶系包括ACP和种6酶蛋白形成的复合体,其中有两个-SH非常关键一个是ACP上的-SH,一个是KS上的-SH。3)生物素羧基载体蛋白BCCP为乙酰辅酶A羧化酶。4)植物细胞中、脂肪酸的氧化主要发生在乙醛酸体过氧化物酶体,脂肪酸的合成发生在叶绿体,而其它真核细胞的脂肪酸氧化主要发生在线粒体,而合成发生在细胞质。5)脂肪酸分解前,脂肪酸先形成活化的脂酰COA,而脂肪酸合成前,乙酰辅酶A先活化为丙二酸单酰COA,甘油参与三酰甘油脂的合成时,首先形成磷酸甘油的活化形式。6)脂肪酸碳链的延伸发生在线粒体和内质网,而去饱和发生在内质网。7)卵磷脂的合成过程中胆碱先活化为CDP-胆碱。8)胆固醇合成过程中形成的异戊二烯活化形式为异戊烯焦磷酸。9)胆固醇合成中关键的调控部位是HMW-COA还原酶的调控,胰岛素促进该酶活性。4、简答题:1)一分子棕榈酸彻底分级经历那些过程,产生多少ATP。2)以硬脂酸为例,比较脂肪酸合成和分级的异同。3)简述脂肪酸beta-氧化的四个步骤的反应模式及催化的酶。第21章蛋白质降解氨基酸代谢1、结构、符号和名词SAMPLPGOTGPT尿素鸟氨酸瓜氨酸生酮氨基酸生糖氨基酸必须氨基酸非必须氨基酸泛素2、关键酶固氮酶谷氨酰胺合成酶泛素连接酶E326S蛋白酶体谷氨酸脱氢酶精氨酸酶3、一句话问题1)固氮酶系统主要包括固氮酶和还原酶,固氮酶为钼铁蛋白,而还原酶称为铁蛋白,固氮酶对氧高度敏感。2)谷氨酰胺和丙氨酸是游离氨固定和转运的两种主要形式。3)PLP是转氨酶和脱羧酶的辅酶。4)尿素循环发生在肝脏,部分反应在细胞质中进行,部分在线粒体基质中进行。5)26S蛋白酶体又20S的19S两个亚基组成,其中20S主要负责降解。6)尿素循环的主要调控在于氨甲酰基磷酸合成酶的调控。7)生物体内一碳单位载体主要有三种生物素、SAM和FH4。8)与一碳单位代谢相关的氨基酸包括Gly、Ser、Thr、Met、His。9)芳香族氨基酸合成的前提是PEP和4-磷酸赤藓糖。4、简答题:1)联合脱氨基作用的两种基本模式是什么。2)试述尿素循环的过程及意义。3)氨基酸分解C骨架汇入EMP-TCA途径的5个的入口是什么。氨基酸合成途径主要起始物有哪些。4)自然界中N元素如何循环?。5)细胞内蛋白质降解的主要途径是什么,蛋白质选择性降解如何实现有何意义。第22章核酸的降解及核苷酸代谢1、结构、符号和名词IMPXMPPRPP尿酸痛风别嘌呤醇乳清酸5-氟尿嘧啶2、关键酶黄嘌呤氧化酶APRTHGPRTTK核苷酸还原酶3、一句话问题1)核苷酸脱氨可发生在核苷酸、核苷和碱基三个层次上。2)人类嘌呤代谢产物为尿酸,其它物种的代谢产物为?。3)黄嘌呤氧化酶可催化次黄嘌呤到黄嘌呤、黄嘌呤到尿酸两种反应。4)痛风是由于核苷酸代谢障碍,尿酸钠的累积所致。5)别嘌呤醇是黄嘌呤氧化酶的自杀性底物。6)尿嘧啶降解前先还原为二氢尿嘧啶。7)核苷酸合成包括从头合成途径和补