生物医学信息检索与利用

MEDLINE光盘数据库检索与利用主要内容1.Medline数据库介绍2.WinSPIRS简介3.数据库的组成结构4.WinSPIRS检索界面5.检索方法与技巧6.检索练习MEDLINE数据库美国国立医学图书馆（NationalLibraryofMedicine,NLM）编辑出版•MedicalLiteratureAnalysisandRetrievalSystemOnlineMEDLINE数据库1.数据库的类型：书目型数据库2.收录5240多种世界范围的生物医学期刊，范围涉及70多个国家和地区，40多种语言的文献，以期刊文献为主3.学科范畴：基础医学、临床医学、实验医学、公共卫生学、药理学和药学、牙科学、护理学等。数据库的组成结构数据库的组成结构是指该数据库的每条记录是由哪些部分组成。MEDLINE光盘数据库是由许多记录组成的，一条记录就是一篇文献，每条记录又是由若干字段组成的。TI:GOLEM--multimediasimulatorformedicaleducation.AU:Kofranek,-J;Vu,-L-D;Snaselova,-H;Kerekes,-R;Velan,-TAD:DepartmentofPathologicalPhysiology,1stMedicalFaculty,CharlesUniversity,Prague,[e-mail]SO:Medinfo.2001;10(Pt2):1042-6JN:Medinfo-IS:1569-6332PY:2001LA:EnglishCP:NetherlandsAB:WecreatedmultimediamedicaltrainingsimulatorGOLEMforlearningdiagnosticsandtherapyofthecriticalclinicaldisorders.Thetheoreticalbasisofthesimulatoristhemathematicalformulationoftherelationshipofhomeostasisoftheinternalenvironment(acid/baseandelectrolyteequilibrium,oftransportofbloodgases,ofosmoticandvolumehomeostasis),respiration,circulationandkidneysincludingregulatoryinfluenceofrelevanthormonesandtheinfluenceofsometherapeuticprocedures.Mathematicaldescriptionconsistsof39non-lineardifferentialequationsandcontaining89inputand179outputvariables.Forthedevelopmentofthesimulationmodelsdeveloper'stoolsfromMathWorks(MatlabandSimulink)hasbeenused.Theintegrationofthemultimediacomponents,hypertextandsimulationmodelsinterfacewasachievedbyusingControlWeb,developedbyMoravianInstruments,originallydesignedforlongdistancecontrolsusingPCandInternet.Wehaveusedoursimulatorasanefficienteducationaltooltohelpmedicalstudentslearncirculatory,respiratory,acid-base,electrolyte,osmoticandvolumedisordersandtrainthediagnosticandtherapeuticdecisionsbyexecutingsimulatedinterventionsonvirtualpatients.MJME:*Computer-Simulation;*Computer-Assisted-Instruction-methods;*Education,-Medical-methods;*Homeostasis-;*Multimedia-MIME:Acid-Base-Imbalance-diagnosis;Acid-Base-Imbalance-therapy;Hypermedia-;User-Computer-Interface;Water-Electrolyte-Imbalance-diagnosis;Water-Electrolyte-Imbalance-therapyTG:Humans;Research-Support,-Non-U.S.-Gov'tPT:Journal-ArticleSH:diagnosis;therapy;methodsJC:Medical-InformaticsSB:Index-MedicusUD:20041117DA:20011017DR:20041117CD:20020214RO:National-Library-of-MedicineAN:11604890PI:Citationprocessedfrom:PrintJournalavailablein:PrintXREC:ABSTRACT(AB)MEDLINE光盘数据库的结构篇名作者来源语种文摘……LivercancerJohn,SCancerReseng……Livercancer…………antibioticsJuurlink,-B-HJ-Neurochemeng……antibiotics…………AstrocytesWang.HChinesejournalofmedicinechi……Astrocytes…………记录字段标识符字段名称属性TITitle(篇名)AUAuthor(著者)ADAddressofAuthor(地址)SOSource(文献来源)PYPublicationYear(出版年)*LALanguage(语种)*CPCountryofPublication(出版国)*ABAbstract(文摘)XRECRecordFeatures(记录特征)*MESHMedicalSubjectHeadings(医学主题词表)MIMEMinorMeSHHeadings(次要医学主题词表)MJMEMajorMeSHHeadings(主要医学主题词表)SHSubheadings(副主题词)*PSPersonalNameasSubject(人名主题词)CNContractorGrantNumbers(合同号或基金号)标识符字段名称属性RNCASRegistryNumber(化学物质登记号)NMNameofSubstance(物质名称)ISInternationalStandardSerialNumber(国际标准刊号)*TGChecktages(特征词)*ANAccessionNumber(存取号)*UDUpdatecode(更新代码)*SISecondarySourceIdentifier(第二次文献来源标识)SBSubset(子集)*CMComments(评论)GSGeneSymbol(基因号)PTPublicationType(出版类型)*带*为限制性字段，其他为基本字段或默认字段WinSPIRS简介WinSPIRS是美国银盘公司基于Windows平台开发的适用于该公司所有光盘数据库的专业信息检索软件。WinSPIRS的含义是SilverplatterInformationRetrievalSystemforWindows。WinSPIRS是一个用户界面友好的易操作软件。它的检索功能强大，检索文献时，提供多种检索入口和检索方案，给用户以很大的自由度和灵活性，查全率与查准率较高。WinSPIRS的检索界面主要有5个界面：1.数据库选择屏；2.数据库版权页；3.检索屏；4.索引屏；5.叙词屏。数据库选择屏是供我们选择检索文献时间范围的一个界面。有两个对话框，第一个框列出了时间范围(choosefromthesedatabase,选择这些数据库)；第二个框用来添加数据库时间范围(usethesedatabase,使用这些数据库)用“add”按钮实现选择，即从第一个框选出的范围添加到第二个框来选择。“remove”按钮可以更改数据库的时间范围，选好后点击“OK”按钮，就能实现。数据库版权页该页也有两个框，第一个框介绍数据库信息：数据库出版信息、涉及的学科内容、银盘公司的网址等。第二个框介绍银盘公司的法律责任，点击“OK”按钮进入数据库，点击“Next”、“Previous”可浏览其他数据库信息。检索屏主要的检索途径和过程都在这个界面下完成。第一行是菜单栏；第二行是按钮栏；第三行是检索词输入栏；第四行是检索史显示区，其中列有No.记录号、record记录数、Search检索词。下面有两个框，第一个框是命中结果状态区，第二个框是命中结果显示区。命中结果显示区检索史区检索区命中结果状态区索引屏列出了数据库中所有可以检索的词、词组或字母数字组合，它允许用词根检索，查找某个单词或词组，并浏览包含这些词的所有记录。当通过索引找到所需要的词，可以直接选择并进行检索。叙词屏叙词和主题词一样是规范化的检索语言，用它来检索文献可以检索结果既全面又准确。在叙词屏中输入的检索词只有是主题词才能查到文献。若不是主题词会设参见条目，必须用参见词条去检索文献。检索技巧与方法检索方法：1.Search屏基本检索：自由词2.Thesaurus屏主题检索：主题词3.限制性检索：Search屏状态下用限定词完成的检索。限定词：in、=1.自由词检索MEDLINE光盘检索过程中，如果没有特别指定叙词字段或用词表功能检索，一般的检索词都是自由词。数据库中的自由词是指出现在记录中任何字段的文献的原文词，来源于所有记录基本字段的单词、词组、数字、字符组合（禁用词除外）。1.自由词检索自由词检索可以在三种状态下实现：1.检索屏Search:提示符后2.命中结果显示区内3.索引屏状态下①任意的单词或词组（禁用词除外），如：AIDS②连缀词组，如：Il-6③词根（截词）检索，如：cardio*可以检索到cardiology，cardiologist，cardiological等词（*为截词符，代表任意个字母）④带通配符“?”的单词，例如：Wom?n可检索woman或women的文献，“?”表示0或1个字母。⑤以前的检索序号，如：#6⑥带引号的运算符的检索，“invitro”⑦逻辑检索式：用逻辑运算符连接检索词形成的检索式就是逻辑检索式。(1)检索屏Search:提示符后，可输入：WinSpirs中有以下几个逻辑运算符可进行逻辑复合检索：①逻辑“与”运算AND：检索式写成AandB，表示文献中同时包含检索词A和检索词B的文献才是命中文献。AIDSandtherapy②逻辑“或”运算OR：检索式写成AorB，表示包含检索词A的文献或者包含检索词B的文献或者同时包含检索词A和B的文献为命中文献。AIDSorAcquiredImmunodeficiencySyndrome③逻辑“非”运算NOT：检索式写成AnotB，表示包含检索词A同时不包含检索词B的文献为命中文献。HepatitisnotAnimal检索举例1肝癌的药物疗法方面的文献。1.课题分析：肝癌（livercancer）药物疗法（drugtherapy）2.列检索表达式：livercanceranddrugtherapy3.浏览检索结果：(2)命中结果