生物学和地球科学领域数据库共享指南与数据库建设规范

ReportonDataActivitiesinChinaVice-PresidentofCODATA-ChinaGeneralDirectorofCNIC,[e-mail]-DSAO,Bangkok,Thailand,Jan.12-12,2006Outline•RequirementsonScientificData•MainDataActivities•NationalProgramsonDataActivities•SummaryRequirementsonScientificData•Scientificdiscovery&innovation–Dataformthefoundationofscientificdiscovery–Inthepast,Scientificdataexplainstheobservableworld•ExtractionofEssence•ExplanationoftheComplex•PredictionfromData–Today,wehaveexcitingnewcapabilitytoobservenature•Requiresandgenerateslargeamountsofqualitydata•TheinformationrevolutioncomingwithComputerandinternettechnology•DataattheveryheartoftherevolutionRequirementsonScientificData•Datasharingandexchanging–Valuablenationalstrategicresource–Full&openinatimelyandequitablemannertopublic–Closercooperationandcommunicationamongscientists–Thefrontiersofscience,bigscienceplanneedlarge-scaleandlarge-scopedatasupportingMainDataActivitiesScientificDataActivitiesDatasharingandexchangingDatasharingpoliciesDataandmetadataspecificationDatabaseConstructionandintegrationDataqualitycontrolandassessmentInformationsystemsandplatformApplicationsandservicesNetworkSupercomputerStorageSupportandconsultantNationalProgramsonDataActivities1.ScientificDatabaseandInformationSystemFoundedbyCASsince19824.LandandResourceDataCenterFoundedbyMLRsince20032.PlatformConstructionforNationalS&TInfrastructureFoundedbyMOSTsince1999,SupportedbyMOST,MOE,MOFandNDFCsince20043.ScientificBasicResourcePlatformofMOEFoundedbyMOEsince20045.NSFScientificDataCollectionandSharingScientificDatabaseandInformationSystem(SDB)•FoundedbyChineseAcademyofSciencessince1982•1986-2000–725GB–180databases–19memberinstitutesinvolved•2001-2005–CASinitiatedtheInformatizationProject–SDBisoneoftheinfrastructuresofCASinformatizationScientificDatabaseandInformationSystem(SDB)•2002InitiatedthreesubprojectofSDB–ScientificDataResourceConstruction–ScientificDataStandardandSpecificationMaking–SystemPlatformConstruction(ScientificDataGrid-SDG)•2003Prof.JiangMianheng,DeputypresidentofCASsignedtoformallyinitiate“ScientificDatabaseandInformationSystemProject”•2000-2005,CASsupportsUS$7.50MillionObjectivesofSDB•Objectives–Expandandstrengthenthedataaccumulationandintegration,sharing–ImprovethedigitalenvironmentforS&Tresearch–SetupinformationanddataservicesystemforS&Tresearchandsocialdevelopment–PromotetotransferdatatoacknowledgeOrganizationofSDB•ExpertCommittee(EC)•ExecutiveOffice(EO)•ScientificDatabaseCenter(SDC)•MemberInstituteECInst.OfGeographyInst.ofEngineerandProcessInst.ofMicrobiology······SDCCNICCASEOTechnicalTrainingandExchanging•BiennialSDBTechnicalSymposium–During“Ten-Five”,threesymposiumsandthreepublications•Annualtechnicaltraining–5technicaltrainingAchievementsandActivitiesSDB1.MetadataSpecification3.QualityControlAndAssessment4.Storage5.PortalSDB10.e-Science网站服务正常率0%10%20%30%40%50%60%70%80%90%100%2004年7月2004年8月2004年9月2004年10月2004年11月2004年12月2005年1月2005年2月2005年3月2005年4月2005年5月2005年6月2005年7月2005年8月2005年9月2005年10月2005年11月2005年12月2.Databases6.SuperComputer7.Application8.Highspeednetwork9.SupportsGrowthofSDBDataVolume•By2005–45institutesofCAS–503databases–agrossvolumeof16.6TB–10TBareavailableontheInternetSDBStandards&SpecificationsSDBMetadataSpecificationFramework科学数据库元数据标准框架（1.0版、2.0版）SDBMetadataSpecifications科学数据库核心元数据标准（1.0版、1.1版、2.0版）大气科学数据元数据规范（1.0版）生态研究科学数据元数据规范（1.0版、1.1版）科学数据库植物图像元数据规范（1.0版）羊八井宇宙射线科学数据元数据规范（1.0版）生物物种编目数据元数据规范（1.0版、2.0版）天然气水合物科学数据标记语言（GHML）（征求意见稿）禽流感科学数据元数据规范（1.0版）图像科学数据通用元数据规范（1.0版）SDBDataQualityControl&AssessmentSpecifications数据质量研究报告科学数据库数据质量控制和评估框架体系科学数据库数据质量评价过程科学数据库数据质量管理办法（试行）地学领域数据质量标准体系SDBDataSharingPolicies科学数据库共享政策研究报告科学数据库数据共享办法（试行）化学、生物学和地球科学领域数据库共享指南与数据库建设规范SDBMetadataRegistrySystemRegistrySearchExploreMappingSDBSystemPlatform•SoftwareandHardware–Superserver–TBStorage–VisualizationSystem–HighSpeedNetwork–SystemSoftwareSuperServer－Lenovo680059Nodes（4-way）SAN：20TB，50TBTape2GbpsNetworkbandsHighSpeedNetworkCASe-InfrastructureInfrastructureItemBy20002001tonowNetworkingcore1Gbps2.5Gbpsbackbone2MbpsN*155M+2.5GOversealink55Mbps620M+12GHPCPeakTFLOPS0.135.5LinpackTFLOPS0.054.3Storage2.1TB182TBScientificDatabaseMemberinstitutes2145Databases180503Datavolume725GB16.6TBSDBPortal•7X24•Loginonetime,accessalldatabasesSDBOn-lineDataServing•2003.8-2005.10–Visitingnumber：2.50Million–Page-viewingnumber：18.50MillionStat.ofSDBportalSDBTypicalApplications•2000-2005,morethan100applicationcases.•Scientificresearch–SpaceEnvironmentdataisusedtoguaranteethesafetyofthespaceflightwithpeople–Chemicaldataisusedinthestudyoftheanti-SARS–IdentifyAvianFlubyusingthedataintheVirusDatabase–NaturalresourcedataisusedtoresearchtheevolutionoftheecologyandenvironmentandthesustainabledevelopmentofsoilandwaterinWestChina–GeneticdataisusedintheSARSgenestudy–…•SocialandeconomydevelopmentApplicationsBasedonSDB•Internationalcosmicraydataprocessingsystem–IHEPofCAS、CNICofCAS•AvianBirdFluInformationPlatformandAlarmSystem–IMBofCAS,IVofCAS,IZOFCAS,CNICOFYangBajingCosmicRaySystemAvianBirdFl