第一讲-生物医学信息检索

医学信息检索邢美园浙江大学[e-mail]医学信息检索导学课程简介课程任务教学内容与教学要求课程教材及相关资源教学安排课程考评方法课程简介课程名称：医学信息检索课程学时数：其中讲课24学时开课专业：护理学专业、药学专业修课性质：专业必修课，其它专业可作选修课。课程任务通过本门课程的学习，使同学们对文献信息检索的概念、原理、检索手段及最新进展有一个全面的了解和认识，掌握几种国内外常用医学数据库的检索方法及互联网上的一些免费医学资源，通过实践操作进一步与实际工作相结合，能够利用所学文献检索手段解决工作中遇到的疑难问题，或更进一步能够通过文献检索手段开展科学研究和撰写论文的选题与文献参考工作。教学内容与教学要求绪论熟练掌握文献基本概念，文献信息的基本形式、类型及相应的概念；文献检索语言（主题词、关键词、副主题词等）、计算机信息检索逻辑运算符等。掌握图书分类号、索书号、OPAC系统、虚拟馆藏、电子期刊、电子图书、馆际互借等基本概念，及国内常用文献传递系统。文摘型检索工具掌握《中国生物医学文献数据库》（CBMdisc）、MEDLINE光盘数据库和PubMed数据库，包括检索途径、检索方法、检索规则，布尔逻辑运算符、常用字段名称等。了解中国生物医学文献服务系统、BA、CA、EM、SCI等检索工具。全文数据库掌握中国知识基础设施工程CNKI的《中国期刊全文数据库》检索方法，能够在互联网通过该数据库网站进行相关检索，了解CNKI其它数据库资源；掌握维普咨讯网的《维普中文科技期刊数据库》检索方法，能够在互联网通过该数据库网站进行相关检索，了解维普其它数据库资源；万方数据资源系统检索方法。了解外文期刊全文库。电子图书掌握电子图书的基本概念、特点，熟悉常用中文电子图书的数据库名称及特点。特种文献掌握学位论文概念及国内学位论文数据库名称，了解国外学位论文数据库；掌握国内医学会议文献资源；掌握专利定义及国内专利信息数据库，了解国外专利数据库。网络生物医学资源掌握搜索引擎的概念、类型及相对应的代表性搜索引擎；掌握常用搜索引擎百度和Google的使用，其它搜索引擎作了解；掌握一些常用医学搜索引擎，掌握一些专业护理学网站。掌握WHO、卫生部等官方网站的信息资源特色，熟悉其它常用生物医学网站。了解常用循证医学证据资源。医学论文的撰写与投稿掌握医学论文的概念、类型，医学论文的组成及主体部分格式，参考文献著录格式。课程教材及相关资源主要教材:邢美园等.医学文献检索.第2版.杭州:浙江大学出版社.2009参考教材:方平等.医学文献信息检索.第1版.北京:人民卫生出版社.2005教学安排本课程学习主要形式：学院的网上学习系统为学生提供了一个较完整的学习平台，教学资源丰富，教学手段灵活。学生运用该系统，按照院历，自主按排学习计划。作业安排进入网上学习系统，在选中相应课程名后，点击“课程作业”，显示该课程应该完成的作业。实验安排数据库检索操作实习(各教学站各自安排进行学习)网上实时答疑安排按学院规定时间进入学习系统，选中相应课程后，点击“实时答疑”，进入网上实时答疑。参考学习进度安排课程导学，绪论文摘型检索工具（CBM）全文数据库电子图书、特种文献网络生物医学资源医学论文的撰写与投稿考试课程考评方法考试方式：复习专用纸。成绩计算方法：平时作业占总成绩10%；实验占总成10%；期末考试占总成绩80%。第一讲第一章绪论第一节文献基本概念文献类型文献的概念文献是指记录知识的一切载体（或媒体）。三个要素：要有一定的知识内容；要有用以保存和传递知识的记录方式，如文字、图形符号、视频、声频等技术手段；要有记录知识的物质载体，如纸张、感光材料、磁性材料等。信息、知识、情报、文献概念结构图文献情报文献的形式与类型一、按照文献的加工深度二、按照文献的发布类型三、按照文献的载体形式一、按照文献的加工深度零次文献一次文献二次文献三次文献1.零次文献通过口头交谈、参观展览、参加报告会等途径获取，不仅在内容上有一定的价值，而且能弥补一般公开文献从信息的客观形成到公开传播之间费时甚多的弊病。学术界还常将通过非正常交流渠道获得的、非正式出版物称作灰色文献。零次文献主要包括两个方面的内容：一是人们的口头交谈，直接作用于人的感觉器官的非文献型的情报信息；二是未公开于社会即未经正式发表的原始的文献，或没正式出版的各种书刊资料，如书信、手稿、记录、笔记，也包括一些内部使用、通过公开正式的订购途径所不能获得的书刊资料。2、一次文献指原始创作，即作者以本人的研究成果为基本素材而创作（或撰写）的文献。包括：期刊论文、专利说明书、会议论文、科技报告和学位论文等。3、二次文献指信息工作者对大量分散、零乱、无序的一次文献进行整理、浓缩、提炼，并按照一定的逻辑顺序和科学体系加以编排存储后得到的产物。由文献信息工作人员编辑、出版和积累起来的工具性的文献。包括：书目、索引、文摘等作用：可以帮助人们查找一次文献4、三次文献利用二次文献，选用一次文献内容而编纂出的成果。词典、手册、年鉴、百科全书专著、教科书、论文丛集、述评、文献指南以及书目之目录等。一次文献一次文献一次文献一次文献二次文献三次文献二、按照文献的发布类型1．图书（Book）2．期刊（Journal）3．特种文献（Specificdocuments）1．图书（Book）记录一些比较系统、成熟的知识或文献。分专著、文集、教科书、丛书、会议论文集和词典、百科全书、指南、手册等参考工具书两大类。国际标准书号ISBN（InternationalStandardBookNumber）2．期刊（Journal）指具有相对固定的刊名、编辑机构及版式装帧的定期或不定期连续出版物。所记录的知识具有新颖、信息密度大等特点.不包括报纸和多卷图书国际标准连续出版物编码ISSN(InternationalStandardSerialNumber）内容专深新颖、能较快的反映科技发展的水平和动态、科研工作的主要文献源、信息源、情报源（1）期刊文献的标识码根据《中国学术期刊（光盘版）检索与评价数据规范》的规定，对文献的标识码规定如下：A——理论与应用研究学术论文（含综述）B——实用性技术成果报告C——业务指导与技术管理性文章D——一般动态性信息（通讯、报导、会议活动、专访等）E——文件、资料（2）核心期刊核心期刊：刊载某学科文献密度大、载文率、被引用率及利用率较高，深受本学科专家和读者关注的期刊中的精华。确定核心期刊和评价期刊质量的常用方法：载文率法和引文法。评价期刊的常用工具：《中文核心期刊要目总览》（北大出版社）、《中国科技期刊引证报告》（中国科学技术信息研究所）、《期刊引文报告》（JCR）（3）期刊联合目录揭示与报道多个文献收藏单位所收藏的期刊目录，是沟通文献信息、实现馆际互借和文献资源共享的重要工具。如：《全国外文生物医学期刊联合目录》《全国高等医药院校图书馆外文期刊联合目录》《华东地区西文生物医药期刊馆藏联合目录》中科院国家科学数字图书馆的《联合编目服务系统》(4)刊期期：周刊、旬刊、半月刊、月刊、双月刊、季刊、半年刊、年刊，卷：VOL，V（No.）——5（12）多数学术性期刊在刊期的基础上，对其划分为卷（Volume）、卷内分期（NumberorIssue），也有不分卷，只连续计期的.3．特种文献（Specificdocuments）无法规入图书或期刊的文献一般不公开出版，普通图书馆也不收藏如会议文献、学位论文、专利文献、学术报告、标准文献、政府报告以及WHO的出版物等反映了许多最新的研究和技术以及国家的法规、标准等不可缺或的信息，也是医学科研的重要的信息源。三、按照文献的载体形式1．印刷型2．缩微型3．声像型4．机读型1．印刷型以纸质材料为载体，以印刷为记录手段而形成的文献形式书、刊及卡片等以纸作为载体的印刷品成本低廉，阅读方便，比较符合人们传统的阅读习惯2．缩微型采用照相技术按一定比例缩小存储在感光胶片上通过缩微阅读机阅读存储容量较印刷型大，易保存3．声像型录音、录影、幻灯、电影信息多媒体形式4．机读型通过计算机进行阅读的文献（如光盘、磁盘等）四、文献信息的形式与类型文献加工深度发布类型载体形式一次文献二次文献三次文献图书期刊特种文献印刷型声像型缩微型机读型第二节文献检索一、检索工具二、数据库一、文献检索基本原理指依据一定的方法，从已经组织好的大量有关文献集合中，查找并获取特定的相关文献的过程。文献的存贮和文献的检索文献存贮是文献检索的基础，文献检索是文献存贮的目的。检索语言是构成这两个过程的纽带和桥梁文献存贮文献检索检索语言文献集合（二次文献）相关文献二、检索工具用来存贮和查找所需情报资料的工具1.目录按照某种顺序编制的文献清单或清册，通常以一个完整的出版单位或收藏单位为著录的基本单位。对文献的描述比较简单，主要记述其外部特征（如图书名称、著者、出版事项和稽核事项等）题录式检索工具在名称中常出现“题录”、“索引”或者“目录”字样，如《全国报刊索引》、美国《医学索引》（IndexMedicus）、《中文科技资料目录》。题录一般包括文献的题名、作者及其所在单位地址、来源（刊名、年、卷、期、页码）、语种等内容。2.文摘对一篇文献（或一个文献单元）的内容所作的简略、准确的描述，通常不包含对原文的补充、解释或评论结构式文摘是医学论文摘要新的书写格式2.1结构式文摘构成：背景（Background）或对象（Objective），方法（Methods），结果（Results）或发现(Findings)结论（Conclusion）或阐明（Interpretation）在“题录”基础上增加一段内容文摘三、数据库可以共享的某些具有共同的存取方式和一定的组织方式的相关数据的集合多个字段构成一个记录，多个记录构成一个文档，多个文档共同组成计算机信息检索系统完整的数据库。文献信息数据库的结构数据库文档1文档2文档…记录1记录…字段1字段…数据数据第三节文献检索语言一、文献检索语言二、《医学主题词表》三、《中国中医药医学主题词表》一、文献检索语言文献信息检索系统中的标识系统，能提供多种多样的检索点，如著者名、分类号、主题词、关键词等。文献外表特征检索语言文献内容特征检索语言1.文献外表特征检索语言文献篇名或题名索引系统文献著者姓名或团体名称作为标识的字顺索引系统文献序号索引系统引文索引系统2.文献内容特征检索语言主题检索语言分类检索语言代码检索语言医学信息检索语言（1）主题检索语言用于表达文献主题内容的词语标识系统，应用较多的是主题词法和关键词法。又称叙词，是能够表达文献主题内容的规范化名词术语。其主要特点是采用的词语有较严格的限定。对一个概念的同义词、近义词及拼法变异词等进行“规范”，以保证词语与概念的一一对应，是典型的规范化语言。《医学主题词表》（MeSH表），《中医药学主题词表》a.主题词（subjectheadings）主题词的作用为同一概念具有不同表达方式的词语进行规范利于查全和查准,便于扩大或缩小检索范围便于限定文献的主要概念及方面指出现在文献中的，能表达文献主题内容的，或被人们用作检索入口的关键性专业名词术语，通常取自原文，不作规范化处理，没有特别的限定。直接取自最新文献，即时反应科学领域的新观点、新方法、新发现以及新的名词术语。一个概念的不同表达多种多样，不加以限制，会使同一类文献分散，如果不能找全同义词，则很容易造成漏检。b.关键词（keyword）2．分类检索语言分类语言的“词语”就是等级体系中的类目及相应的分类号。分类检索语言必须依据某一种分类体系构成其标识系统，如《中国图书馆分类法》、《中国科学院图书馆图书分类法》、美国《国会图书馆分类法》、杜威十进分类法等。3．