广州辉骏生物科技有限公司Pulldown一、原理Pull-down又叫做蛋白质体外结合实验,是在外源条件下检测蛋白质间相互作用的方法。基本原理:将靶蛋白-GST融合蛋白亲和固化在谷胱甘肽亲和树脂上,充当“诱饵蛋白”,目的蛋白溶液过柱,可从中捕获与之相互作用的结合蛋白,洗脱结合物后通过SDS-PAGE电泳分析,验证两种蛋白间的相互作用或筛选相应的目的蛋白;“诱饵蛋白”一般采用原核表达(也可以通过其他方式)获得,而“捕获蛋白”可以是细胞裂解物、纯化蛋白或表达系统获得的蛋白。二、实验流程1、构建带标签的诱饵蛋白原核表达载体(带his或GST标签);2、载体转化大肠杆菌,表达诱饵蛋白(这一步比较关键,很多蛋白原核表达会形成包涵体,极大影响后续实验,我们采用自诱导培养基培养细菌,使得包涵体形成的几率大大降低);3、裂解细菌,裂解液过柱子(特异结合his或GST标签);4、待测样品裂解,裂解液过柱子,互作蛋白被吸附在柱子;5、清洗,离心,去除未结合的杂蛋白;6、洗脱,得到诱饵蛋白及其互作蛋白的复合物;7、下一步根据实验目的可以去做Westernblot或质谱1)如要验证某个蛋白X与诱饵蛋白互作,则拿上一步的蛋白复合物去孵育X的抗体,做Westernblot;2)如要寻找诱饵蛋白的所存在的可能的互作蛋白,则拿上一步的蛋白复合物去做LC-MS/MS,对照组、实验组的复合物分别做LC-MS/MS;三、结果图1pulldown验证两个蛋白互作结果Pulldown寻找互作蛋白的结果是两组质谱结果,可参考TAP/MS的结果。GST:对照;GST-X:实验;Y:目的蛋白溶液