精品文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探

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资源描述

目录中国生命科学文献数据库1欧洲生物信息研究所2合作概览3文本挖掘技术的应用4中国生命科学文献数据库(CBA)原名“中国生物学文摘数据库”,是综合性的生命科学专业文献数据库CBA收录1985年以来的800余种国内生命科学及相关学科的科技期刊文献,以及学位论文、会议论文、专利、专著等文献目前累积数据量达40万条,年更新数据量5万余条CBA专业:覆盖了生命科学、药学、基础医学、基础农学及生物交叉科学等专业领域新进展:重大疾病专题文献知识服务系统1.心血管疾病专题文献数据库2.肝癌专题文献数据库3.糖尿病专题文献数据库CBA数据库检索界面重大疾病专题文献知识服务系统欧洲生物信息研究所1994年建立于英国剑桥欧洲分子生物学实验室(EuropeanMolecularBiologyLaboratory,EMBL)的组成部分EMBL数据库的管理和维护欧洲分子生物学网EMBnet(EuropeanMolecularBiologyNetwork)的一个特别节点生物信息学研究工作,也是生物信息学的服务中心EBIDatabasesEBI数据库类型文献数据库(LiteratureDatabases)微阵列数据库(MicroarrayDatabases)核酸数据库(NucleotideDatabases)蛋白数据库(ProteinDatabases)蛋白质组数据库(ProteomicDatabases)结构数据库(StructureDatabases)CitationDatabaseSystem,CitExploreCBACDB功能-文献服务跨库检索功能控制词表辅助检索:刊名、化学物质名、物种名称全文开放链接:DOICDB功能-文本挖掘SwissprotGeneOntologyDrugsOrganismsGenesProteininteractionEnzymekineticsChemicalsMousephentotypeGeneontologyOntology与知识管理Ontology与主题词表文本挖掘工具1.8万词条开放资源CitExplore构成Medline中国生命科学文献数据库Patentsabstracts(EPO)CitExploreCiteSeerCBAonCitExplore合作概览-目标将CBA建成为中国国内生命科学/医学文献资源中心建立国际生命科学数据资源与国际资源间的桥梁EBI为中国研究成果提供一个面向国际科学社团的窗口对CBA进行数据库开发提供技术支持EBI由此丰富了自己的CDB数据资源合作概览-进展2004.05:EBI有关人员访问信息中心2005.05:达成CBA合作的意向2005.06:传送样本测试数据2005.11:双方签订合作协议书与备忘录合作前景20032004协商2005启动2006文本挖掘探索合作申请研发项目文本挖掘技术应用文本挖掘技术文本挖掘是从文本集中发现和挖掘归纳性的知识,如有用的模式、模型、趋势、规则等知识文本挖掘技术是人工智能、机器学习、自然语言处理、数据挖掘及相关自动文本处理如信息抽取、信息检索、文本分类等理论和技术相结合的产物,国内学科数据库文本挖掘技术应用现状基于文本挖掘的中医学文献主题自动标引中医药文献科学推理知识发现--浙江大学计算机科学与技术学院;中国中医研究院中医药信息研究所EBI文本挖掘工具SwissprotGeneOntologyDrugsOrganismsGenesProteininteractionEnzymekineticsChemicalsMousephentotype在中国生命科学文献数据库的初步应用CBA*VMIIO!dIe*#+o%QWdYX9UWf0fZ(zB36LTwOE17Yf9q!MQ0Bg9fwXn&IsjtBIQ#2jG+znDIAfO-0Pf07Bk4ENtOECHbgWBYGSdh(lnu0#z8ANU-oK+hr004pikqt6bm!Azb-xiLmg4!JOpH0z4SxLay7fCc(am!qByU$d*#xr-QMUxqK60UsoFJ90ZmHC9k6KpOMLfGYpPX(#Mo1895a5kA7WIzQWf2pAashXg3vdxFv4NErgr)KZs5UlFWDIIa-$40kjAcd&c012ztNUpt%HhyoX(Sgsk$jsl+AZ261YFhZ1y*rVn0TXZS-q(RTEr6s8)#oQR8EaUE-Fle*n*ld$n3HHZ&-m9HuM1s1JFhW8#sGtAFku&FunO3in#m)u0cgK4%86A9V-UI-!p5uahOyF+MJZl)X!8z0K8krv012xzESDiMgCNYs)e7dRy&*VQfspudTJt+5i%k3CYqPX$tilZo$XBhKiIJw8dghflrCSv2AY23F(DrxXwsVei*ha#Xgp0aPJ5pR)MfrbYVMdLMUtDl-F(rnY+6ViIycEQYVXo#h7n2)SLkH#f*x-5S+TrGkBlI&umFec2vCqAdumv%(cdedwOAj$Fd3IRSVyoKza4Nk)19)&jI#ftc*4ZTe7)a$gbO$Qgtk$gmbLg-GBmx!7BEgGDgJuDpOD0BQaQE!!wdtJZQjsn+sZI7t&%og&f8KWKapi!islw(I46+L)bQeVkMoD*hv*A91(ZAZzG1I7G0A9#hmYOioDz)0HVG+2Q7aE6$*jUqhe0TcTm0Rze3L$iZ6Xno5g(1SU!pso-cfH7&onZ*CJfkVSqFtGzRdnkT5m2Mov%E2eHxyzAu&4*EiyZ#ycO2lrQmcnUENb+gGC2tXPl9GYi1hLSvL!X98osY)qp(MfPcCYr8ZFj%z-qKVUIgUD%Mo9hLs-)M3NOlcMTgjKAM-F1JzxgjHjwtbQ8ov3dtPu1#lTrvT%3u&WhXZHKc1xc$MtLL3LvUN72xqQDUv0FUVjvqw4E+dT2djq!&aVlJt))yxY9938nOi0+dK55Tok#eoTW)SDIKCO!(Gt&9S#ZqjdZk01eE6RB685)JUCqfdaiqY2%ipd1*OU)C5Zm3o06%)ENn2upYD%YPg4jK5uRe2xmBvOx6rwFOAkvJV%(%TAr*K%W0D7xW+yMx-&Q-YOp4y5O!!EK7*9LAK6VRDn*RTXt0*-9KEbvU)dTbRvhkc!4SNZcyyd*%fA5F(%P5Geuu7!0T22WzzM8lg&tPXMZc!pOqtVDd0VmHoTD3xOrT*G%zqD2#2FAI#OuBpfVBKFRkhDdkA7xm%g6asXs7*#$BqjxWI+qa8ySpKbch)wRSw#)Rdj)kdLWgn&x$Gu&i$BrofGdiw%#+%ZjXBcjlijr+#NSRK0eMj$TL4Dgi0)V(vjy43+aZtK4OzHVbvmC&fIO+wjnaTfzIGxgD(sInYcRnyR!DYGkJYIYm34q-&f#$amv9b-7P(V)Lcpu5r5w)bImgpNdLZCFUFa2SruR+jaqlpNnMXTA+geIgc0q8*oDjnEyFWcyh%(sj8JYR7RKPqJqgk1QpGoPnA!gWoKi)UQXp&k4a-7ynK0KeqtpdF*zCtoPCP52XHUpZIaUy+OpOubbvI$gG+tWd)N-6r)UdOEFOgDDdTN&)+K!VtyutIMevmx6&s%t$+4tAr1yRYUHaDxDaPsvKhPgZF57-Ng$TFgHP-z9Dp5sc8-tWQn3qanBCj+2usukPyw#(wp*GE4iAV8+T5nCYVFrwBK(HFwg9OrsS3-BKp#2NIBM5M)*zJEGzWX&wggw#xjpam&!eOlMmJ32R-77-OiJWT+AbsS1yIGQgcD8X4U0OZvwKYUmnmND$#6p5e)A%erxyu8gb3z)y8bJtKsb3Pl69x5xf#VoK))zCZfkIIogBfkPzHxRP-0dph%2W5jff8-VIuinuv8bI2Zqn0Wuf6SxyXCGuFn#wZPbvsd27a#4$sFw3q1e$l(G-iFvGeG$c4Tx8PjY&7o+PjzD7*ejHhh$c4C%kn0lZyHX9wd((axyeJWQ1CipaaJuFlLChxQ1oPbNas-0hJh4puyH1Bo-vAm3gHBCHjowjb$ImZYbUO#mBJ%eYfCURTZwjuJX09dduJyAay2eOy1Rjao#T2OTdhK(%TemLQ2PJetl!bcC2QUVrDn!OYYPW(7hqw02luTf%RP)5sxdMwE+MB-wKK!#JDO&ZRgeAdj%gfzxUN114YOK2mM8H9WiQhU56HTXynZFBN6SO*)sIjd&n(kk!)*Wa&qSR6LFkz-gPCAOqW6fgoCNozFlT5sUG11%LiN&CPnZM3#xVgczg8C+zyzzCIcD4F0Pja9M*)O9T%CMCmTa)I9tN-lL6Gi(VL+9!MWEtekNty%RCEZ9rC1$!5+n5ePGOc9gJmccI8LXLS-fXqF6#7$24Q*tvGG8w&1pBYyxgqJN*GXnq*1$Xbp(o*947z*cNxAThESVAiVeU1m&Mvd$EnV57&E4tCML$sniInsKKY1Axzu9MNa4s9jQ#Uc7jGhsdy(IurxYDjW7$4(-qSznimBG4arhJlhv-Lx%+N-YghPSfjK*JFNd3iVKNi$K+7(SZO$eH7LjG&dLtBvJplof*yX(K+ZCQjpm$JkAmME-Hia1f6)&fC-n-%r%idcIrR(uuAUFm1Q0g0IUL*f#l$X)n&MDq6mEbw+Edr9sdxg35cWEK2tOah4ICxHDur%I&sc!(nP71M4k4v9rPl3+aCc5iPFOj4nB0Aw#S92x119IelL64RrjtO6ccaKrM8qDXSOLH-6dFCtxSMQw(hk4%NMfz8#zV)Ub4xrQ!Z%Ml4lFM2Dp6Uh(G+fMh$Jw7chgfmr(Qwu(!5qB$xc8PmgztxlAt%-GR5%eoF$lpn$V3IzL7PMM9XokmgxS7-Bt$9TnxNJHO(p*OTEqr76-&fKJgtn+nQ#-Jo$4WYyTR9MM3%nl-Gxc33o9H)9Sl$-9YHxuAQqL5n+#C2XmzoXDV+Fr5)1#Xmp(9D7tqw-gNHL)yd7n6QjU2n*R!3f2UxtEBfak3IyowJ-wOdg(djRXyLrHcy9jOZFGH)UU)D82Qh*ML0lOeTusMAi$&aLr4#V$m#kmkXki1w$aNOl1d0kZwR(Q61ER)(s#8FCiUCyIF8*Yubjdb8ux13a9JvEh47nQ4oA(SUk&wzrW6&ll!xZW&!Wa+dQGThA(lJcbc7TnT75!UD4irH!jYlZKZR4!8o$qDv0hr#P3O%)#lfWBZHPnfEhfA6yoA9-xf!9M%wtvAISH-urv&T8Ge+(p-8A6-df&fbQHY(LgnG(EQvRI8fwx$r&mmE1OFIM9!bLDna+ZOCcvNgO0kitRl458$R#a8kXS5X0XPq06kyclWO)&-Re7k)tZX-eQn4HSNTRUY##MUymRkzHCcK7b(2J)4er*Iixi(oXwRxXij$a3

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