06质粒DNA的提取

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实验一质粒的提取(碱法)实验目的1.了解碱法提取质粒的原理;2.掌握碱法提取质粒的方法。实验原理质粒是一种细菌染色体外的、具有自主复制能力的、共价闭合环状超螺旋结构的小型DNA分子载体。碱法提取质粒是实验室最常用的质粒提取方法之一,提取量较大,便于操作。这种方法是根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA在拓扑学上的差异来分离它们。载体结构的三大要素:•多克隆位点•选择标记(耐药性,LacZ)•独立的复制起点种类:•质粒•噬菌体•酵母人工染色体(YAC)•反转录病毒载体•表达载体等T-载体在碱性条件(pH12.5)下,线性染色体DNA的双螺旋结构解开而变性,质粒DNA的氢键虽然断裂但两条互补链彼此缠绕,紧密结合在一起。当加入乙酸钾恢复至中性时,染色体DNA分子难以复性,而质粒DNA分子很快复性,离心时染色体DNA与细胞碎片一起被沉淀出来,而质粒DNA则留在上清液中。用异丙醇或乙醇沉淀后洗涤,可得到较纯的质粒DNA。本实验采用高纯质粒小量制备试剂盒(离心柱型)提取质粒。本试剂盒采用改进SDS-碱裂解法裂解细胞,离心吸附柱内的硅基质膜在高盐、低PH值状态下选择性地结合溶液中的质粒DNA,再通过去蛋白液和漂洗液将杂质和其它细菌成分去除,最后低盐、高PH值的洗脱缓冲液将纯净质粒DNA从硅基质膜上洗脱。实验仪器、材料、试剂(一)仪器1.恒温摇床2.超净工作台3.高压灭菌锅4.高速台式离心机5.微量取液器(二)材料含重组质粒的大肠杆菌DH5α菌液。(三)试剂1.SolutionⅠ50mmol/L葡萄糖25mmol/LTris.·Cl(pH8.0)10mmol/LEDTA(pH8.0)高压灭菌后,4℃保存备用。2.SolutionⅡ(现用现配制)0.2mol/LNaOH1%SDS3.SolutionⅢ(100ml)5mol/LKAc60ml冰醋酸11.5ml水28.5ml配制成的溶液Ⅲ含3mol/L钾盐、5mol/L醋酸(pH4.8)。操作步骤高纯质粒小量制备试剂盒(离心柱型)1.取3.0ml过夜培养的菌液,9000rpm,离心30秒,弃上清,收集菌体,尽可能的倒干上清。处理超过1.5ml菌液可以离心弃上清后,在同一个1.5ml管内加入更多的菌液,重复步骤1,直到收集到足够的菌体。2.用250μl溶液P1重悬菌体沉淀,涡旋振荡至彻底悬浮。如果有未彻底混匀的菌块,会影响裂解,导致提取量和纯度偏低。3.加250μl的溶液P2,温和地上下翻转6-10次使菌体充分裂解,直到溶液变得清亮。温和地混合,不要剧烈震荡,以免基因组DNA剪切断裂!所用时不应超过5分钟!以免质粒受到破坏。此时菌液应变得清亮粘稠,如果菌体少,很快清亮粘稠后就可以做下一步。4.加400μl溶液P3,立即温和地上下翻转6-10次,室温放置5分钟。室温13,000rpm离心10分钟,小心取上清。5.将上一步所得上清液加入吸附柱AC中(吸附柱放入收集管中),13,000rpm离心1分钟,弃滤液。7.加入500μl漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),13,000rpm离心30-60秒,弃滤液。8.重复步骤7一次,13,000rpm离心30-60秒,弃滤液。空柱13,000rpm离心2分钟。(打开盖子)室温放置3-5分钟,除去残留乙醇。9.取出吸附柱AC,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加20-25μl洗脱缓冲液EB(洗脱缓冲液事先在65-70℃水浴中加热效果更好),室温放置1分钟,13,000rpm离心1分钟洗脱DNA,可立即用于下游分子生物学实验或-20℃保存。洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果需要质粒浓度较高,可以适当减少洗脱体积,但是体积过小降低质粒洗脱效率,减少质粒产量。

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