全国种猪遗传评估方案

全国种猪遗传评估方案(试行）2002-11-06根据我国目前种猪生产发展的实际情况，组织区域性乃至全国性的种猪联合育种工作势在必行。而统一的种猪遗传评估是联合育种工作的基础。为此，在实际调研的基础上，全国畜牧兽医总站组织全国有关种猪遗传育种专家制定了《全国种猪遗传评估方案》...一、目的和意义改革开放以来，由于政策得当和科技投入不断提高，使我国养猪业得到了高速发展，成为世界猪肉生产第一大国。猪肉是我国人民动物蛋白的主要来源，在肉食品消费中占67%左右。猪肉生产直接影响到我国人民的生活水平，同时随着农业结构调整，养猪业已成为增加农民收入和广大农民致富的重要手段，逐步成为农村经济的支柱产业。随着社会与经济的发展，我国养猪业发展面临着良好的机遇和严峻的挑战，在相当长的时期内主要表现为“三个不可逆转”，即人口增长的不可逆转；耕地减少的不可逆转；人民生活水平提高，对畜产品的需求日益增多的不可逆转。国家农业发展纲要提出，到2010年肉类产量达到7000万吨（其中猪肉占70％左右）。要在我国人均粮食产量不可能有明显增加，即精饲料资源不充足的条件下，达到这一目标十分艰巨。出路只有一条，即大幅度提高畜牧生产的科技水平，向科技要效率，向科技要产量。在影响养猪业生产效率的诸多因素中，猪种的遗传素质起主导作用，只有充分利用现有的猪种资源，培育出具有高生产性能的品种、品系或种群，才能在同样饲养条件和投入下，获得养猪生产最大的产出和效益。因此，猪品种的遗传改良非常重要。建国以来，特别是改革开放以来，我国猪的育种技术水平有了很大的提高，并为养猪业发展做出了重要贡献。但从总体上看，仍落后于发达国家，主要表现在：育种技术水平低、良种繁育体系不够完善、种猪质量不高和良种率低等。目前所普遍应用的传统和常规育种技术历史上曾对我国猪的遗传改良起了重要作用，但若再继续下去，要实现21世纪初养猪业的飞跃，将十分困难。为了增强我国养猪业可持续发展的能力，大力开展猪育种新技术的研究与推广工作很有必要。对我国养猪行业调查表明，我国的外种猪场大多数都在不同程度地进行育种工作，但是选择方法比较落后且不统一，种猪质量参差不齐，以选育技术为中心的各项配套技术不规范等。各场为了保持种猪的质量，以满足市场的需要，每年不得不引入相当数量的种猪，特别是从国外引进种猪，这样不但要花费很多引种经费，而且还带来了一些问题，如猪群的健康问题等。为了提高我国种猪的整体质量，逐步减少引种数量，组织全国范围内的种猪遗传评估和联合育种工作势在必行。为此，将制定统一的性能测定、测定体系和遗传评估方法，定期交换种猪遗传材料，不断扩大群体，通过计算机联网共享信息资源，运用育种新技术，即采用动物模型BLUP法（最佳线性无偏估计）进行种猪的遗传评估。以不断提高我国外种猪的育种技术水平和猪种质量，进而培育出市场需要的优良种猪，加速我国种猪产业化进程，并使我国优良种猪逐步进入国际市场，力争在21世纪初，实现新的突破。二、国内外发展概况及国内需求目前世界上养猪发展趋势是专门化品系选育和配套系生产，养猪业发达国家都在大力选育专门化品系，如日本仅大白猪一个品种，就有各具特点的品系二十多个，而且还在不断选育提高。欧美的大型跨国公司PIC、DEKALB、HYPOR、COSTWOLD和SEGHER等，均采用多系配套组合，生产性能和经济效益都很高，尤其适合于规模化饲养，并且随着生产和市场的变化，不断推出新的配套组合。在猪的遗传改良方面，采用先进的育种技术，加速遗传进展，不断为最优的杂交组合和高效的配套体系提供素材，从而实现对资源利用的最佳配置。选种是育种工作中的关键环节，正确的选种要基于对畜禽遗传素质的准确评定。畜禽遗传评估的理论和方法在过去的30多年中不断发展，在牛的育种中表现尤为突出。在猪的育种中，进展缓慢。长期以来，人们使用的主要方法一直是基于个体性能记录或后裔均值的选择指数，这种方法虽然简单易行，但有两个缺陷，一是没有对环境因子或一些非遗传因子进行有效的50年代初，美国学者CharlesRHenderson提出了BLUP法，即最佳线性无偏估计（BestLinearUnbiasedPrediction）法，1973年又对该法的理论和应用进行了系统阐述。70年代以来这一方法在牛的遗传改良中得到了广泛的应用，成为多数国家牛育种值估计的常规方法。80年代中后期，随着人工授精技术的广泛使用，一些国家开始把这一方法应用于猪的遗传评估中，大大提高了遗传改良的速度，如加拿大自从1985年开始应用BLUP法以来，背膘厚的改良速度提高了50%，达100kg体重日龄的改良速度提高100%～200%。目前，这一方法在国际猪育种界已成为标准的遗传评估方法。BLUP育种值估计方法之所以能够提高选种的准确性是由于具有以下主要优点：①充分利用了所有亲属的信息；②可校正固定环境效应，更有效地消除由环境造成的偏差；③能考虑不同群体、不同世代的遗传差异；④可校正选配造成的偏差；⑤当利用个体的多项记录时，可将由于淘汰造成的偏差降低到最低。近年来由于计算机技术发展以及在猪育种中的应用，使BLUP方法又有所发展，如从公猪模型发展为动物模型，单性状育种值估计发展为多性状育种值估计；开发出一些优秀软件，如PEST、GENESIS，PIGBLUP等。在国内，多数场对种猪的选择采用外型评定，一些猪场利用表型综合指数。近年来通过各种宣传和技术培训，有20多个场已开始应用先进的多性状动物模型BLUP法以及相应的软件MTEBV和GBS进行场内种猪的遗传评估，四川省为此建立了全省的猪场电脑网络，各场按统一方法进行场内测定，即称重和测活体背膘，测定结果按标准数据库格式输入计算机并通过猪场电脑网络传送到网络中心，中心采用两性状（达100kg日龄和背膘厚）动物模型BLUP法进行全省种猪的遗传评估。部分猪场使用BLUP法后已取得明显效果，种猪性能显著提高，并要求将该方法应用于繁殖性能的选择。制约我国养猪业持续发展的首要因素是良种化程度低，表现在优秀种猪数量少，种猪整体生产水平和良种覆盖率与发达国家相比还有较大的差距；同时，随着我国养猪产业化的兴起，对优良猪种的需求逐年增加，而且也提出了更高的要求。近十年来，引进的外种猪对我国养猪业的发展起到了积极的作用，但由于我国外种猪的群体较小、选择方法落后，猪种质量难以满足市场需求，还需每年从国外引进，耗费了不少外汇。因此，必须集中财力、物力和人力，在全国范围内组织种猪的遗传评估和联合育种，即在原有的基础上，应用育种新技术（包括生物技术、计算机技术、信息技术和系统工程技术等）进行外种猪的遗传改良，加快育种进展，提高选择效率，以不断满足我国猪种产业化的需求。三、现有基础和条件据1996年统计，全国存栏种猪1000头以上的种猪场13个，存栏500～1000头的种猪场50个，存栏200～500头的种猪场127个。这些种猪场都具有较强的技术力量和较高的管理水平，并具有多年育种的经验，基本具备了种猪遗传评估和联合育种的条件。1、九十年代初，各场在有关部门支持下，为确保本场完成国家和省市科研项目任务，先后装备了超声波活体测膘仪、妊娠诊断仪和电脑等仪器设备，能有效地开展场内测定和信息网络的建设。2、各地不同程度的建立了种猪选育和繁育基地，拥有一定数量的繁殖母猪，不少场间有种猪的交换，能有效地承担联合育种任务。3、各场的种猪不同程度的经过选育提高，主要经济性能已达到较高的水平，新近又从丹麦、英国、加拿大及美国等国家引进了大量优良的长白、约克夏和杜洛克种猪，已有丰富且较好的遗传基础。四、主要技术内容准确可靠的个体性能测定是遗传评估的基础，参与全国遗传评估的个体性能测定分两种形式：一是以省级种猪测定中心指定专人负责对所属猪场进行定期的巡回抽测；二是参与遗传评估的各猪场指定专业技术人员对全场所有测定猪进行测定。这两类测定数据都必须每月按期传送给遗传评估中心，及时进行个体育种值估计。（一）、遗传评估测定性状根据国内目前猪育种的实际情况，并参照国外先进经验，从简单、实用、容易操作出发，将遗传评估性状分为以下两类，共计15个性状，具体测定方法参见附件一。来源：相关文章·全国种猪遗传评估方案(试行）附件一·全国种猪遗传评估方案（试行）附件二：遗传评估数据记录系统标准全国种猪遗传评估方案（试行）附件二：遗传评估数据记录系统标准2002-11-06本标准适用于参与全国种猪遗传评估、以及采用该评估系统进行场内测定的种猪测定站、核心育种场、原种猪场和繁殖场的种猪、后备种猪的性能测定记录系统。不包含全部的种猪生产记录数据。1、个体号（ID）：实行全国统一的种猪编号系统，是保证全国性种猪遗传评估工作开展的必要前提条件。本编号系统由15位字母和数字构成，编号原则为：前2位用英文字母表示品种：DD表示杜洛克，LL表示长白，YY表示大白，HH表示汉普夏，二元杂交母猪用父系＋母系的第一个字母表示，例如长大杂交母猪用LY表示；第3位至第6位用英文字母表示场号（由农业部统一认定）；第7位用数字或英文字母表示分场号（先用1至9，然后用A至Z，无分场的种猪场用1）；第8位至第9位用数字表示个体出生时的年度；第10位至第13位用数字表示场内窝序号；第14位至第15位用数字表示窝内个体号；建议个体编号用耳标＋刺标或耳缺作双重标记，耳标编号为个体号第3位至第6位字母，即场号，加个体号的最后6位。例如，DDXXXX299000101表示XXXX场第2分场1999年第一窝出生的第一头杜洛克纯种猪。2、遗传评估的数据库格式①个体记录字段个体号品种性别＊出生日期父亲号母亲号备注名称IDBREEDSEXBDATESIREDAMNOTE类型字符字符字符日期字符字符备注长度152181515—小数位———————*公猪用M、母猪用F表示。②生长性能测定记录字段个体号达50kg达100kg30～100kg饲料转化率备注称重日期体重测定日期体重膘厚眼肌厚度/面积仪器＊名称IDDATE50WT50DATE100WT100FATLMAEQFCRNOTE类型字符日期数字日期数字数字数字字符数字备注长度1585865514—小数位——2—222—2—*A表示A超系列、B表示B超系列。③屠宰测定记录字段个体号屠宰日期宰前重胴体组成性状肉质性状备注胴体重后腿比例膘厚＊眼肌面积pH值肉色滴水损失大理石纹名称IDSDATESWTCWTHAMCFATCLMAPHCOLORDRIPMARBLNOTE类型字符日期数字数字数字数字数字数字数字数字数字备注长度158555554353—小数位——222222121—*膘厚为三点平均膘厚，按国标执行。④母猪繁殖性能记录字段个体号配种日期*公猪号*配种方式**胎次产仔记录寄养情况21日龄备注日期总仔数活仔数死胎畸形木乃伊寄出寄入头数窝重名称IDMDATEBOARTYPEPARITYFDATETNBNBASBNABNMUMOUTINLN21LWT21NOTE类型字符日期字符字符数字日期数字数字数字数字数字数字数字数字数字备注长度15816128222222225—小数位——————————————2—*以最终配上的日期和公猪为准。**A为人工授精，N为自然交配，B为同一情期同时使用人工授精和自然交配。来源：新引进的种猪管理方案生产上能够正常运转的猪群可以定义为微生物达到平衡状态的微生物复合体（不携带病原微生物的猪群是不存在的）。事实上，很难选择到和自有猪群病原微生物群完全一致的供种方。并且，从技术匹配度来讲，也无法做到也没有非常大的必要去界定供种方和受种方猪群所携带的所有病原。猪群自有的微生物平衡状态受到破坏时，一些病原微生物的经济影响性就会表现出来，这些表现出经济影响性的病原微生物不是外来的，是原有平衡状态被破坏后所呈现出来的。基于此逻辑，既要对供种方临床上观察呈健康状况的猪群进行一些经济影响性病原检测，也有必要搞清楚自有猪群的经济影响性病原的状况。健康匹配需要遵循如下原则：清楚双方猪群存在的主要经济影响性病原。从比自有猪群健康水平高或者相当的猪群引进种猪。坚决不从比自有猪群健康水平低的猪群引进种猪。