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PubMed网址:www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed主讲:何卫华(广西医科大学图书馆)教学要求了解PubMed数据库的基本概况熟悉PubMed的检索界面掌握PubMed的基本检索方法PubMed美国国立医学图书馆国家生物技术信息中心开发特点:1.免费提供题录和文摘2.可与提供原文的网址链接(部分免费获取)3.提供检索词自动转换匹配4.操作简便、快捷数据收录范围OldMEDLINE:1966年以前的文献MEDLINE:1966至今,收录世界上70多个国家和地区的4500多种生物医学期刊,数据每周更新。[indexedforMEDLIEN]PreMEDLINE:提供MEDLINE尚未经规范处理的数据,经标引后再加入MEDLINE。记录中有[inprocess]的标记,日更新。PublisherSuppliedCitations:出版商直接向PubMed提供电子记录,包括MEDLINE未收录的部分记录,时时更新。PubMed主页基本检索输入框特征栏提供辅助检索功能侧栏提供其他检索如期刊数据库检索、规范词数据库检索、特定文献检索执行检索PubMed检索方法1.基本检索:在基本检索界面下完成的检索方法。2.高级检索:在特征栏和左侧栏的辅助下进行的检索方法。在检索栏中输入:一个或多个检索词(系统默认空格为AND检索)如:hepatitisvirus著者姓名,姓在前,名在后,如:smithab刊名,可输全称或MEDLINE认可的标准缩写形式如:clinexpimmunol布尔逻辑运算式(运算符须大写)如:stem[ti]ANDneurosciencePubMed基本检索规则多个检索词输入:MooreAM撰写的有关接触性皮炎的文章刊名的输入(字段限定来源出处SO)著者检索检索式输入仅检索有文摘的文献常用字段标识符:AD作者地址AB文摘AU著者姓名JA期刊名称LA语言文种MAJR主要MeSH主题词MH全部MeSH主题词PG期刊页码DP文献出版日期PT文献类型SH副主题词TW文本词TI题名词VI卷IP期检索系统的主要特点:1、检索词自动转换功能自动对照MeSH词表、刊名转换表、短语表、著者名索引,依次寻找转换短语寻找转换单词转换单词在上述四个字段寻找转换在所有字段中转换2、截词检索功能:treat*3、强制检索功能:“singlecell”(不再自动转换匹配和扩展检索)4、链接功能:(1)链接相关文献。(2)链接NCBI其他数据库。(3)链接外部资源。(4)链接相关图书。高级检索一、PubMed的辅助检索(特征栏)1、限制检索(Limits)字段限制:著者、刊名、篇名等数据录入时间:限制选择30天~10年出版日期限制文献类型限制:7种语种限制:7种子文档:13种输入检索词,系统默认空格为AND关系限制检索界面子文档检索词来源字段限制文献类型选择限制数据录入时间限制文献发表日期限制只要有文摘的文献限制语种限制研究对象年龄限制2、预览/索引(Previw/Index)预览检索式和检索结果的记录数修改检索策略(可用检索式编号#1OR#2)从索引表(Index)中选词检索检索预览检索结果索引加词检索步骤3索引选词步骤4确定与检索栏中检索提问的逻辑关系步骤2输入待选词步骤1点击预览和索引3、检索史(History)检索式回顾:检索号、检索式、检索时间、检索记录数编辑检索式如:#3ANDchild注:最多可保留100个检索式。检索历史回顾检索式检索时间检出篇数检索号清除检索史4、粘贴板(Clipboard)存放检索结果,最多可存放500条记录。1.选择记录2.选择Clipboard记录编号的颜色变绿5、细节(Details)显示检索词转换匹配运算详细过程用途:(1)转换、确定规范词如:livercancerliverneoplasms(2)修改检索策略数据库匹配过程规范词转换你输入的检索式检索明细修改检索策略的方法:1.检索框中随时修改2.利用“Limit”、“Preview/Index”、“History”、“Details”功能键实现。二、左侧栏检索功能1.MeshDatabase功能:确定规范检索词;查看词义注释、树状结构表;副主题词、扩展主要主题词等。例:欲查SARS(严重急性呼吸窘迫综合症)是否有相关规范词,什么时候在系统中建立该词,有关治疗有无文献?1.选择MeSH数据库检索2.输入检索词4.点按此处可获详细注解3.执行检索点击此处确认点击此处执行检索选择副主题词通过MeSHDatabase检索的结果2.引文匹配器(CitationMatcher):功能:输入题录信息,查找特定文献进行补缺。注意:刊名要准确,缩写要标准;著者姓名大小写均可如查找:由ChangPY撰写在1975年taiwanyixuehuizazhi上发表的文献的其他著者输入待检刊名输入待检第一著者特定文献查找(已知文献第一著者,欲查其他信息如其他著者等)输入出版年得出其他著者3.期刊数据库(Journaldatabase):通过输入刊名全称或缩写名等浏览期刊文献。提供电子原文的超链接。期刊数据库检索输入待检期刊名得出期刊详细信息4.临床问题(ClinicalQueries):专门检索临床研究方法学(循证医学)文献,主要涉及治疗、诊断、病因、和预后四个分类,并提供强调选择,即敏感度(强调查全)或专指度(强调查准)。5.临床警示(ClinicalAlerts):1991年开始,美国卫生健康研究所(NIH)不定期公布能引起死亡率和致病率升高的临床试验项目重要新闻稿。6、PMC(PubMedCenter)生命科学期刊资源中心免费提供185多种期刊全文(至2005/5/11止)检索结果输出显示检索结果保存检索结果保存检索策略打印检索结果显示字段选择(Display)Abstract:来源期刊、标题、著者、著者地址、记录性质、文献类型、勘误、评论、PMID或UI、摘要。Citation:显示除上述内容外,加MeSH词、化学物质名称、资助项目号等字段。MEDLINE:字段最完整,有标识符显示格式选择有免费全文链接有文摘翻页相关文献链接可获电子全文的链接输出格式选择(sendto)选中记录后——Text当前网页文本格式用浏览器文件保存File所有记录文本格式:最多10000条Clipboad剪贴板:允许最多存储500条,多项检索后一起保存Email:通过邮件发送保存检索策略Details中的URL,可以让检索匹配的详细策略放入检索框,该检索页面可以存储入浏览器收藏夹。Cubby灰色栏中的功能按钮,存储在数据库的个人文档中。需先注册,填写用户名和口令打印检索结果1.浏览器打印(当前显示的网页)2.show功能键,增加网页显示的记录数3.保存后一起打印六.获取原文及相关资源1.联机获取原文(文摘中超链)2.向NLM索取原文(order)(由图书馆出面向成员馆订购)3.相关文献查找(relatedarticle)4.其他数据库资源(生物信息学等)Pubmed演示题1、查找乳腺癌与BRCA1基因突变相关的文献。2、已知:第一作者是ChallisDE,出处是PediatricResearch,2000,47(3):309~15。要求写出其他合著者。

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