聚合酶链式反应(PCR)基本原理

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聚合酶链反应(PCR)•一、PCR的概念;•二、PCR的基本原理;•三、PCR反应条件的优化;•四、PCR操作的注意事项。•一、概念:•聚合酶链反应(polymerasechainreaction,PCR)扩增技术,即体外试管内DNA的扩增,以高特异性、高灵敏度、高效率及忠实性等特点,在生命科学研究领域产生着巨大的影响。二、PCR的基本原理•PCR技术实际上是DNA的体外扩增技术。•其原理类似于DNA在体内的复制过程。•反应条件――模板DNA、寡核苷酸引物、DNA聚合酶、四种dNTP原料和合适的缓冲液体系,在一定的温度下,经过重复的过程,就可以完成DNA的体外合成。•这些过程都是通过控制温度来实现的,即通过改变温度引起变性(denature)、退火(annealing)和延伸(extension),使DNA得以复制。1、变性•通过加热至95℃左右,使DNA双螺旋的氢键断裂,形成单链DNA,作为反应的模板。•2、退火•将温度降至引物的Tm值左右或以下(比Tm低5℃,通常为55~65℃),引物与DNA模板互补结合,形成杂交链。•3、延伸•在DNA聚合酶(一种耐热的DNA聚合酶)的作用下,于70~74℃以引物3′端为起始点按5′→3′方向使DNA新链延伸。•上述三步为一个循环,每一循环的产物作为下一个循环的模板,如此经过25-30个循环,可使新生的DNA片段得以扩增。•PCR的反应原理也就是PCR的基本过程。聚合酶链式反应(polymerasechainreaction,PCR)•三、PCR反应条件的优化•1、引物•引物是指与待扩增靶DNA两端序列互补的寡核苷酸。•引物决定PCR扩增产物的特异性和长度。•PCR引物的设计与PCR反应的成败关系密切。•PCR反应中的引物有两条,即5′端引物和3′端引物,分别与相应的模板链互补。•引物设计遵循下列原则:•①引物长度一般为15~30个核苷酸。•②引物中碱基的分布尽可能随机,尽量避免多聚嘌呤或多聚嘧啶。•③引物内避免存在互补序列,以免折叠形成发夹结构。•④两引物间不应存在互补序列,尤其是避免3′端的互补重叠。•⑤引物与非特异扩增序列的同源性70%。•⑥引物的3′端碱基一定要与模板互补配对;而5′则可相对不严,甚至还可做一些修饰。•2、PCR的模板•欲扩增的核酸片段是PCR的模板。•可以是DNA,也可以是RNA。当用RNA作模板时,首先要进行逆转录生成cDNA,然后再进行正常的PCR循环。3、耐热的DNA聚合酶•在PCR反应中,DNA聚合酶是最关键的因素之一。TaqDNA聚合酶是目前PCR中应用最广泛的耐热DNA聚合酶。•TaqDNA聚合酶的功能是:以DNA为模板,以四种dNTP为原料,以引物3′端为出发点,按5′→3′的方向,以碱基配对方式合成新的DNA链。四、PCR实验中应注意的事项•采取以下措施有助于防止污染和结果的假阳性:•1、隔离不同操作区;•2、分装试剂;•3、严格实验操作;•4、严格按无菌操作的原则进行PCR所有操作等。THANKYOU!

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