NuGEN建库产品介绍

李萍市场部NuGEN产品介绍内容提纲行业背景介绍NuGEN公司介绍产品介绍高通量测序技术（High-throughputsequencing）又称“下一代”测序技术（“Next-generation”sequencingtechnology），以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。同时，高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能，所以又被称为深度测序(deepsequencing)。背景介绍背景介绍测序技术的发展已经经历了很长的时间，而下一代测序彻底改变了人类基因组测序的方式。有关预算，未来的几年内，人类基因组测序的费用将在1000美元，1-2天即可出结果。自实现第一个人类基因组测序以来(花了十年时间，30亿美元)，测序所需的费用和时间大幅度降低。到2020年，全球NGS市场将达48.92亿美元，复合年增长率为20.7%。NGS技术成本的降低和分析速度的提升大大提高了它在临床领域的运用，这样良好的增长趋势也要源于个性化医疗的增长，医疗开支的增加以及从微阵列到NGS的转变。背景介绍全球NGS市场被分为靶向重测序(targetedre-sequencing)、全外显子组测序(wholeexomesequencing)、RNA测序、全基因组测序、ChIP测序、从头测序(denovosequencing)以及甲基化测序。在这些分类中，靶向重测序占最大的市场份额，增长最快的是全基因组测序(复合年增长率超过25%)。随着越来越多基于NGS检测和平台的疾病出现，靶向重测序和全基因组测序技术将具有最广阔的前景。学术研究者是主要的NGS终端用户，约占60%的市场份额。医院和诊所有着较高的复合年增长率，预计到2020年市场份额会超过40%。此外，在临床领域，随着需求和应用的增长，预计到2020年市场份额会达到25%左右。按照应用类型分类，NGS市场被分为肿瘤、遗传筛查、传染病、药物和生物标志的发现、分子流行病学、农业等。在所有的这些应用领域中，肿瘤检测在收益和样本容量上占据最大的市场份额(超过35%)。背景介绍71%16%10%3%IlluminaLifeRochePacBio测序市场分布Illumina测序仪升级Hiseq2500，单条测序长度增长，通量增加，更受欢迎。Life的IonTorrent相对通量高，测序时间短，受到一些客户的喜好。Roche在2013年10月份关闭454平台。PacBio作为新的技术，通量高，侧许长但稳定性不是特别好。背景介绍测序技术文库构建cBotcluster产生测序数据分析Illumina边合成边测序原理测序技术核酸提纯DNATotalRNAcDNA片段化文库构建Cluster生成上机测序测序技术5‘5‘3‘3‘Shear5‘5‘3‘3‘Nebulizer5‘3‘EndRepair5‘3‘T4andKlenowDNApolymerases,T4PNKAddABaseAAAAAA5‘5‘3‘3‘Klenowexo_文库构建测序技术P3’5’+PPTAA5’5’5’T4DNALigase3’5’T3’TAATA5’3’AT5’3’PCRAdapterligationNuGEN公司成立于2000年，总部设在美国加利福尼亚州圣卡洛斯，是一家为基因组学研究客户提供微量样本加工、建库试剂等的高科技生物技术公司。从用户的角度出发，不断的推陈出新，满足基因组研究者对不同样本类型、质量和数量的处理。关于NuGEN拥有多项专利技术，包括:SPIA技术,InDA-C技术,STEP技术,创新性的选择性引物设计方案等。产品介绍核酸提纯(MN&Zymo)DNATotalRNAcDNA片段化文库构建Cluster生成上机测序产品介绍DNARNADNAAmplificationOvation®WGAFFPESystemOvationRNA-SeqSystemV2500pgtotalRNAinputOvationRNA-SeqFFPESystem100ngtotalRNAinputOvation3’DGESystem10ngtotalRNAinput..enablingsimple,fast,andscalableNGSworkflowsAutomatedworkflowOvationUltralowLibrarySystemsv21ngDNAinputOvation®RapidDRMultiplexSystem100ngDNAinputOvationUltralowMethyl-SeqLibrarySystems10ngDNAinputOTEsystem10-500ngDNAinputoptionalLibraryConstructioncDNAGenerationStrandSpecificCompleteWorkflowOvationSingleCellRNA-SeqSystem10pgorsinglecellOvationHumanBloodRNA-SeqSystemsOvationHumanFFPERNA-SeqSystemsOvation®UniversalRNA-SeqMultiplexSystemEncore®CompleteRNA-SeqDRMultiplexSystemStrandedRNA-Seqsolutionsformodelorganisms产品介绍核酸提纯(MN&Zymo)DNATotalRNAcDNA片段化文库构建Cluster生成上机测序产品介绍——DNA-Seq相关产品DNARNADNAAmplificationOvation®WGAFFPESystemOvationRNA-SeqSystemV2500pgtotalRNAinputOvationRNA-SeqFFPESystem100ngtotalRNAinputOvation3’DGESystem10ngtotalRNAinput..enablingsimple,fast,andscalableNGSworkflowsAutomatedworkflowOvationUltralowLibrarySystemsv21ngDNAinputOvation®RapidDRMultiplexSystem100ngDNAinputOvationUltralowMethyl-SeqLibrarySystems10ngDNAinputOTEsystem10-500ngDNAinputoptionalLibraryConstructioncDNAGenerationStrandSpecificCompleteWorkflowOvationSingleCellRNA-SeqSystem10pgorsinglecellOvationHumanBloodRNA-SeqSystemsOvationHumanFFPERNA-SeqSystemsOvation®UniversalRNA-SeqMultiplexSystemEncore®CompleteRNA-SeqDRMultiplexSystemStrandedRNA-Seqsolutionsformodelorganisms产品介绍——NuGENOvation®UltralowSystemV2（0344/0347）低量起始1ngDNA起始。V1到V2升级点32次反应试剂盒，由V1版的8个Barcode升级为V2版的16个Barcode；PCR富集换用保真度更高的KAPAHiFiDNAPolymerase，GC含量不再是问题；价格更具竞争力，单次反应（目录价）便宜312元！简单快速全过程只需四个小时，仅仅两步磁珠纯化，无需胶回收。兼容性较好，应用广泛可用于全基因组、RNA-seqv2产物、扩增子、Chip-seq以及靶标捕获产物等测序前的建库。Workflow整个过程和V1版的没有变化，只是在扩增这一步换成了KAPAHiFiDNAPolymerase产品介绍——NuGENOvation®UltralowSystemV2（0344/0347）69%GC33%GC51%GC•对不同GC含量的物种进行测试，从结果来看，无论GC含量的高低，实验结果和理论值保持高度的一致性。•Ultralow建库试剂盒的结果是不受样本GC含量的影响。产品介绍——NuGENOvation®UltralowSystemV2（0344/0347）通过测序结果可以分析样本的GC含量产品介绍——NuGENOvation®UltralowSystemV2（0344/0347）PCR-Free建库试剂盒（Rapid）100ngDNA起始量；操作简单，一步磁珠纯化；无需PCR扩增，建库不受GC含量影响；时间短，整个过程不超过2小时；可用于起始量较高，样本量较大，GC/AT含量较高的产品，节省时间，减少GC含量对建库的影响。产品介绍——RapidDRMultiplexSystem(0319/0320/0328)提供定制的Primer1可以与Zymo甲基化试剂盒打包10ng起始先建库后甲基化产品介绍——UltralowMethyl-SeqLibrarySystems(0335/0336)TargetregionTargetregion5’5’ProbeLandingZoneProbeLandingZoneGenomicDNA1.Fragmentationto~500bp2.LigationofindexedFWDAdaptor5’5’5’5’5’5’5’5’3.AnnealingofTargetingProbes/REVAdaptor5’5’5’5’5’5’5’4.ExtensionofProbes5’5’5.DenatureandAnnealPCRPrimersREVFWDFWDREV6.LibraryEnrichmentFWDREVREVFWD产品介绍——OvationTargetEnrichment(OTE)System产品介绍——OvationTargetEnrichment(OTE)System可低至10ngDNA起始；整个过程不超过24小时；全程可在但管内操作完成；靶标序列可长达10MB以上；根据客户需要可进行特殊定制服务。10-500ngDNAfragmentedto~500bpTarget-EnrichedLibraryReadyforSequencingEndRepair(45min)AdaptorLigation(60min)BeadPurification(20min)MultiplexProbeBindingandExtension(overnight)BeadPurification(40min)OptionalqPCR(90min)LibraryAmplification(90min)BeadPurification(40min)~45min~90min2.5hrs3-5hrs≥12hrs(3hrsforfastprotocol)DNAtargetRead1sequenceIndexreadsequenceRandomendTargetProbeendIndexPrimer8ntBCN6FWDPrimerFCREVPrimerFCIndexPrimer8ntBCN6FWDPrimerFCREVPrimerFCIndexPrimer8ntBCN6FWDPrimerFCREVPrimerFCIndexPrimer8ntBCN6FWDPrimerFCREVPrimerFC产品介绍——OvationTargetEnrichment(OTE)System•新的Adapter设计，在Index后面加入6个随机核苷酸.–Index用于区分不同的样本。–N6用于分析PCR造成的冗余度，并通过NuGEN已有的程序，利用生物信息学的方法去除冗余度的影响。•测序用的是标准的Illumina引物产品介绍核酸提纯(MN&Zymo)DNATotalRNAcDNA片段化文库构建Cluster