Omnic使用指导

Omnic软件使用指导2009-4-10绪论•Omnic与系统Omnic是FT-IT光谱仪的一个高级软件包。用其可以方便地对光谱进行采集、处理、简单定量分析等操作。并可实时监测仪器操作，如果出现故障，给出提示并解释如何排除。版本：1.0-8.0,EZ-Omnic（旧简化版）,Omniclite(新简化版）Omnic8.0对计算机要求：WindowsXPprofessionalSP2或WindowsVistaBusiness操作系统IntelCore2Duo处理器2.2GHz;2GB内存160GBharddiscwith1GBfreespaceCORW/DVDcombodriveUSB2.0Port(notahub).parallelorUSB2,0printerPort.Omnic操作界面的语言选择：Start\ControlPanel\RegionalandLanguageOption中RegionalOption和Advanced选项，中文选择Chinese(PRC),英文选择English(UnitedStates)绪论•Omnic8.0软件的安装、卸载、和启动•安装：将ProgramDisc(标有InstallFirst)放入光驱，点击自动运行项中的‘Install’,按提示安装完成后，将‘SpectrometerDriverDisc’放入光驱，自动安装。安装完成后，不要取出光盘。将光谱仪USB通讯线插入计算机，并开启光谱仪。计算机提示发现新硬件，选择由CD安装驱动程序。•卸载：1，将ProgramDisc‘SpectrometerDriverDisc’放入光驱，打开，点击ThermoMSIUninstall,选择需要卸载项。2，2,Start\ControlPanel\AddorRemovePrograms，选择卸载项。•启动：1，鼠标双击桌面上Omnic快捷方式。2，开始—所有程序—ThermoScientific—OMNIC3,c:\Programfiles\Omnic\omnic32绪论•Omnic软件结构三个目录C:\MyDocuments\OmnicSpectra-光谱；Libs-谱库；Param-实验参数；Quant-定量方法；Report-报告C:\ProgramFiles\Omnic—程序文件及驱动Start\AllPrograms\ThermoScientificOmnicDocumentation-仪器及软件用户手册；LibraryConverter-谱库转换程序帮助：1，Omnic中帮助菜单2，赛默飞世尔科技客户服务电话：800-810-5118400-650-5118绪论•红外光谱理论•红外光谱是根据物质吸收辐射能量后引起分子振动的能级跃迁，记录跃迁过程而获得该分子的红外吸收光谱。分子振动时，分子的偶极距发生变化，则该分子是红外活性的，能够产生红外吸收。在中红外区，分子中基团振动模式分为两大类：伸缩振动和弯曲振动。•中红外区频率范围：4000-400cm-1，其中，4000-1330cm-1为基团频率区，与分子结构有对应关系。1330-400cm-1为指纹频率区。分子结构微小的变化会引起指纹频率的变化。•汽态H2O伸缩振-转光谱位于3950-3500cm-1,变角振-转光谱位于2000-1300cm-1,•CO2振-转吸收谱带的P支、Q支和R支分别位于2359cm-1,2338cm-1,669cm-1.•FTIR(FourierTransformInfrared)傅立叶变换红外光谱仪.FTIR采用了干涉仪可以对目标频率范围内的所有频率同时进行采集。采集得到的干涉图信号经过傅立叶变换后得到光谱图信号（单光束光谱）。11绪论•傅立叶变换方程•I(X)=2RTB(V)COS2VXdV;B(V)=I(X)COS2VXdX-iI(X)SIN2VXdXI(X):光程差的强度函数；V:波数；B(V):频率的强度函数;X:光程差;R:分束片反射率T:分束片透射率011关于显示•窗口：可显示多个窗口，只有一个是活动窗口。谱图可以在不同窗口复制、粘贴。也可从窗口粘贴到其他应用程序（如Word,Excel等）。•状态监控：√绿勾—诊断测试通过；◎黄圈—冷却的检测器变热；Ｘ红叉-仪器故障或者仪器与计算机通讯失败。•谱图：一个窗口可以显示多张谱图。被选中谱图的缺省颜色为红色。可以按Ctrl键或者Shift键进行多选。•坐标轴：X-轴：通常用波数（cm-1)表示，也可以用波长表示。Y-轴：采用透射法测定样品时，使用%透射率或者吸光度。根据不同样品测定方法和需要：还可以选择单光束，干涉图，Kubelka-Munk,光声光谱，%反射率或者Log(1/R)。单光束光谱：由干涉图经傅立叶变换得到。表示红外能量对频率的强度。%透射率：T=x100%=x100%背景光谱包含仪器和光谱内部环境或制样附件的信息。吸光度：A=-LogT=LogII0背景单光束谱图样品单光束谱图I-红外光透过样品光强-红外光透过背景光强I0T1关于显示•标题框：谱图标题颜色与谱图相同，可以直接修改谱图标题名。•信息按钮：纪录选中谱图的采集、处理和标注信息。可以在标题、注释和自定义信息栏中进行编辑，并可将所有信息复制到剪贴板。•图标工具—选择工具：选择项目；扩展（拉框放大）、缩小（按住Shift键）谱图，窗口内（间）移动谱图，选择要删除的标注。—区间工具：选择光谱区间或测量一个未校正区间的面积。—光谱坐标工具：显示一个点的X值和Y值。—峰高工具：测量峰的高度。—峰面积工具：测量峰的面积。—标注工具：添加注释，移动注释，删除注释注：使用光谱坐标或峰高工具时按住Shift键可自动找到峰的顶端。•取景窗与缩放条：可改变光谱显示范围。•任务窗口：使用某些OMNIC命令时，会显示一个专用窗口，通过此窗口可以看到操作的过程，或在过程中与软件对话。文件•打开：文件类型：.SPA-spectra缩写，Omnic默认类型；.SPG-光谱组；.CSV-文本文件；.0??-PeakSolve文件。.JDX-可包含多张光谱存于一个文件中的文本文件。•另存为：可将文件设成‘只读’；可以设谱图标题名为文件名。•保存谱图组：将多张谱图保存到一个谱图文件中。•Mail光谱：将所选谱图作为电子邮件的附件发送。•配置文件：可以根据爱好对omnic软件进行设定。包括对OMNIC登录编辑菜单中-选项、编辑菜单、编辑工具栏中参数的设定。•Log记录：记录仪器的操作编辑•撤销操作：只能撤销一步操作步骤。•剪切、拷贝、粘贴：可将选中谱图剪切（拷贝）到剪贴板上，然后粘贴到其他omnic窗口或者其它应用软件中（如电子数据表，文字处理或者绘图程序等）。•谱图镜像粘贴：粘贴的谱图与原谱图使用同一数据组，对其中一个进行改动，另一个会产生同样的改动。•删除标注：用选择工具将需要删除的标注画框包围后删除标注。•选项\编辑菜单\编辑工具栏：用户可以根据自己的爱好编制Omnic操作软件。编制完成后可以用‘文件’菜单中‘保存配置’保存在一个配置文件中。编辑•选项\文件：‘使用选择文件类型’：打开、保存文件时只能使用指定的文件类型。‘打开谱图到新窗口’：如果关闭此选项，打开谱图到放入当前活动窗口。‘覆盖文件前提示’：覆盖同名光谱文件或者配置文件前提示。‘记录存为RTF文件’：Log文件存为格式丰富的文本文件，可以粘贴谱图。‘频率标准化’：用15798cm-1参考激光频率的光谱仪采集的光谱的数据点的位置称为标准位置。频率标准化是将打开的光谱数据点的位置变为标准位置。只有两个频率不等且其差值小于20cm-1时才使用。可用于由CSV、JDX转化得到或色散型仪器采集的光谱的校正。选项\显示：‘标注小数点为数’：最多5位。‘刻度粗细’：坐标轴刻度粗细。允许值1-6（细—粗）。‘谱线粗细’：允许值1-10（细—粗）。‘谱图颜色’：设定光谱、标注、坐标标记、刻度和样品信息的颜色。光谱加到窗口时，依次使用右边八种谱图颜色。第九张又开始使用第一种颜色。编辑选项\打印：‘轴线粗细’：1-6；‘刻度粗细’：1-6；‘谱线粗细’：1-10。（细-粗）‘颜色用不同线性表示’：用相同粗细的不同条文（如虚线）代表不同颜色的谱图（尤其用于黑白打印机）选项\采集：‘光阑过大影响分辨率时提示’：增加光阑孔径会降低分辨率。‘光学台和智能附件状态监测’:监测光学台状态。安装智能附件时出现相关信息。‘设定智能吹扫’：放入、取出样品时，增加吹扫气流速。最大250秒。选项\处理：‘自动关闭任务窗口’：操作结果放入光谱窗口后自动关闭任务窗口。‘标峰’：’谱图分析‘标峰时，选择剪贴板拷贝出的峰表按峰位排序，还是强度排序。‘自动基线校准’：选择‘谱图处理’-自动基线校准时用得多项式级数和反复次数。‘Y-轴检查’：数据处理时检查Y-轴数据格式。‘设定水和二氧化碳参考谱图’：参考谱图至少采集64次，并尽量使用与样品谱图相同分辨率。‘设定环境空气制动抑制参考谱图’：采集时：分辨率为0.5或1，格式为干涉图。选项\窗口：用于新光谱窗口的默认设定。已有窗口的设定在显示菜单中的‘显示参数设定’中。采集•实验设置：设定采集参数、如何检查采集光谱质量的参数、检索设置参数、执行光谱仪诊断检查和准值光谱仪。生成实验（参数）文件。打开参数文件：在‘参数文件’下来菜单中选择，或者在‘实验设置’中打开。安装智能附件时，软件自动选择相应的参数文件。恢复默认设置：将C:\MyDocuments\Omnic\PARAM\FACTOR拷贝要恢复的参数文件覆盖C:\MyDocuments\Omnic\PARAM中同名文件采集采集：‘扫描次数’：取多次扫描的平均值。优点：增加扫描次数(n)可以提高信号(Signal)和噪声(Noise)的比值—信噪比(SNR).SNR。缺点：增加扫次数会延长扫描时间。如何选择：可先采16次，然后视信噪比情况增加。采集完成后可选择‘增加扫描次数’。背景扫描次数可与样品不同。‘分辨率’：指分开两条相邻谱线的能力。单位cm-1。分辨率与谱图数据点间隔成正比。优点：分辨率越高（数值越小），光谱中的数据点靠得越近，从而可以区分越窄的谱带。缺点：提高分辨率，延长扫描时间，降低信噪比。如何选择：通常固体或者液体，用8cm-1或4cm-1分辨率。气体2cm-1或更高。样品与背景应使用相同的分辨率。高分辨率光阑过大(2cm-1)时可能引起光谱畸变。此时仪器会自动调节光阑大小。‘最终格式’：Kubelka-Munk(KM)：KM能够减少或消除漫反射时与波长有关的镜面反射效应。采用漫反射技术时，由于光程长度的变化在许多情况下得到的样品含量不随Log(1/R)形式成线性变化，KM提供了与含量更好的线性关系。KM=(1-R)²/2R.R=样品反射光强/背景反射光强。光声：将光声光谱技术采集到的谱图转化为光声光谱单位。%反射率：使用反射技术（镜面反射，衰减全反射，漫反射）时表示样品反射能量的比率。%R=(Is/Ib)×100Is—样品反射能量强度;Ib—背景反射能量强度。Log(1/R)：表示反射实验中所吸收的红外能量，等价与透射测量中的吸光度。n采集‘校正’：Kramers-Kronig(K-K):采用镜面反射(SR)技术时,入射角小于30°测得的谱图像透射谱的一阶导数图，K-K可将其转化成通常的透射光谱图。从而进行定量、定性分析和谱库检索。ATR:使用衰减全反射(ATR)技术时，红外光的穿透深度是波长的函数：长波比短波穿透深度更大，结果，低频处的谱峰比高频处的谱峰强的多。ATR校正可改变因此造成的谱图失真。H2O/CO2/H2O和CO2校正：由于样品和背景分开采集，H2O和CO2在两张谱图中的不同使已扣除背景的样品谱图中仍有较小的正（负）H2O(3800和1600cm-1)或CO2（2350和668cm-1)的特征峰。此校正可得到样品谱图与H2O或CO2的标准的差谱，消除其影响。除非环境湿度太高，不建议使用此校正。通常建议使用‘自动大气背景扣除