PubMed使用详解

Dept.ofMedicalInformation2020/1/271PubMed数据库2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation2NCBI(美国生物技术信息中心）网址:是美国国立卫生研究院(NIH)下属的一个机构。NCBI创建了生物医学领域中最著名的信息检索系统。2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation3NCBI生物医学检索系统(Entrez)Pubmed：生物医学文献数据库；Nucleotide：核苷酸序列数据库；Protein：蛋白质序列数据库；Genome：完整的基因组汇编；Structure：大分子三维结构；PMC：数字化生物医学期刊存储与检索系统Taxonomy：分类学数据库；OMNI；孟德尔人类遗传学数据库；Books：生物医学网络版图书。2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation4NCBI生物医学检索系统(Entrez)2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation5NCBI网站()2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation6PubMed主页2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation71.Pubmed简介NCBI于97年5月推出，Internet用户免费检索。检索全世界生物医学期刊论文的重要工具；学科覆盖范围：临床医学、基础医学、护理学、牙科学、兽医学、药理学、环境和公共卫生。收录文献的时间范围：1948-Updateeveryday(Tuesday-Saturday)2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation81.Pubmed简介摘要型(Abstract)的数据库,提供文献的线索；部分文献（约5%）提供免费全文(链接网上免费资源或者自己的图书馆已经购买的电子期刊全文数据库中的全文。2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation91.Pubmed简介来源期刊5000多种English约4800（约占85%)ChineseFrenchJapaneseItalyGermany……期刊论文发表时所用的语言2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation10PubMed中的非英文文献2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation11PubMed主页基本检索主题词检索2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation123、PubMed检索基本检索简单检索高级检索主题词检索智能检索2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation133.1PubMed基本检索——简单检索检索词的输入形式：（1）单词、短语、缩写如，interleukin；stomachcancer；AIDS（2）著者姓名：如，SmithW（3）期刊相关信息：刊名全称、缩写、ISSN如，CancerResearch、JAMA、0741-54002020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation143.1PubMed基本检索——检索规则逻辑运算and(空格)、or、not词语检索“singlecell”；“livercancer”截词检索bacter*，disease?bacterdiseasebacteriadiseasesbacterium作者检索smithja;joneskjuliaswong;wongjulias(2002年始）2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation15例:肝癌的化学疗法2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation16例:肝癌的化学疗法2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation173.1PubMed基本检索——高级检索2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation183.1PubMed基本检索——高级检索字段限定检索2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation19PubMed检索字段2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation203.1PubMed基本检索——Limits功能1)字段限定检索2)限定文献类型、语种、出版日期、年龄、性别、研究对象等2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation21Limits功能（限定检索）2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation22字段限定2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation23Limits：限定文献类型、语种、出版日期、年龄、性别、研究对象等2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation243.1PubMed基本检索——检索历史2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation25查看检索历史，进行逻辑运算2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation263.1PubMed基本检索——实例1、哮喘治疗(限定题目字段)的英文综述文献2、近五年来中国研究者发表的有关Aids病研究的文献2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation273.2PubMed主题词检索(MeSH）2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation28什么是主题词(MeSH词)?主题词是经人工规范化处理的最能表达文章主题概念的语词。所谓规范化处理，就是在文献存储时，对文献中的同义词、近义词、多义词等加以严格的控制和规范，使得同一主题概念的文献相对集中在一个主题词下。主题词关键词Neoplasmsneoplasm、tumors、tumor、cancerAspirinaspirin、acetylsalicylicacid、micristin、solprin2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation29MedicalSubjectHeadings,MeSH字顺表(2万多个医学词汇)如:aspirin,hepatitis,asthma等树状结构表（分类表）16大类副主题词表（80多个副主题词）2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation30MeSH字顺表2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation31MeSH树状结构(TreeStructures)2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation32MeSH副主题词表(Subheadings)Abnormalities、Administration&Dosage、AdverseEffects、Analysis、Anatomy&Histology、Biosynthesis、Blood、Complication、Congenital、Cytology、DiagnosisDiagnosisuse、Diettherapy、Drugtherapy、Epidemiology、Etiology、Genetics、Immunology、Injuries、Metabolism、Microbiology、Mortality、Pathology、Psychology、Surgery、TherapeuticUse、Therapy………………….2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation33MeSH的标引和检索MeSH应用PubMed（Medline）中国生物医学文献数据库(CBMdisc)医学搜索引擎标引人员根据文章的内容，给出多个MeSH词，以确切描述一篇文章内容的重点。检索人员根据检索需求，选择相关MeSH词进行检索。2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation34例:肝癌的手术治疗2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation35例:肝癌的手术治疗2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation362020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation372020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation382020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation39MeSH词检索的特点不必考虑自由词的各种变化形式，提高检索效率。可以很容易地检索宽广的概念，提高查全率；MeSH词一般都反映了记录较为重要的内容，具有较高的检准率；可以选用相关的副主题词进行组配，对检索进行限定。2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation40举例:消化系统疾病的CT诊断扩展主要主题2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation413.3PubMed的智能检索2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation42词语自动匹配，优化检索策略自由词和MeSH词联合2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation43PubMed智能检索原理对于输入检索框中的非限定检索词，系统将依次到MeSH词转换表、刊名转换表、短语表以及作者索引表中进行词语匹配查找。检索词加入有些限定（如字段限止,引号等），自动匹配检索功能关闭。例：heartdisease[ti]“livercancer”2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation44自动匹配检索功能关闭2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation454.PubMed检索结果处理Display(显示)Sendto(输出)2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation46Display(检索结果显示)2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation47Sendto(检索结果输出)2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation48Clipboard剪贴板可集中存放一次或多次检索结果当中的选定记录，方便用户集中打印、下载文献。剪贴板中可存的最多记录为500条，如果八小时内无作何操作，记录将自动消失。2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation495.PubMed链接RelatedArticlesFullText2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation50RelatedArticles(相关文献链接)2020/1/271/27/2020Dept.ofMedicalInformation51FullText(全文链接)网上免费资源或者自己的图书馆已经购买的电子期刊全文数据库中的全文2020/1/271/27/2020De