重组载体质粒扩增流程

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重组载体质粒扩增的实验步骤:Ⅰ、感受态细菌的制备(CaCl2化学转化法)准备:LB液体培养基、LB固体平板(含抗生素和未含抗生素)、0.1mol/L氯化钙溶液(预冷)、细菌冻存液(0.1Mol/LCaCl2+7%/10%的DMSO或15%的甘油)、高压过的EP管等1、将适合的冻存菌(stbl3)挑取一点(枪头沾取一点)加入盛有1mlLB液体培养基的15ml离心管中;37℃,220rpm,摇菌培养1个小时(复苏)。2、取10μl以下刚复苏的stbl3涂布于非抗性的LB固体培养基上37℃过夜培养(纯化)。3、挑取20多个前一天培养的细菌菌落加入3mlLB液体培养基里37℃,220rpm,摇菌培养12个小时(扩增,需使细菌老化,因为下一步摇出的菌才可处于对数生长期)。4、以1:100的比例将3ml培养物转接于300mlLB培养基中,在37℃220rpm摇床上剧烈振荡培养约1.5-2小时(使细菌处于对数生长期,易于转化,可每半小时测一下OD600值,使其0.3-0.5);5、制冰。以下步骤开始注意无菌操作:6.将所有培养好的菌液分装移至离心管中,在冰上冷却10分钟;7.4℃下3000g冷冻离心10分钟;8.弃去上清,加入30ml预冷0.1Mol/LCaCl2溶液,轻轻上下吸动打匀,使细胞重新悬浮,在冰放置20分钟;9.4℃下3000g冷冻离心10分钟;10.弃去上清,加入5ml预冷0.1Mol/LCaCl2溶液,用移液枪轻轻上下吸动打匀,使细菌重新悬浮;11.4℃下3000g冷冻离心10分钟;12.弃去上清,加6ml0.1Mol/LCaCl2+7%/10%的DMSO或15%的甘油混匀后,分装成100μl或200ul/EP管(4℃预冷),-80℃冷冻贮存备用。【练手实验中扩增摇菌时中途摇床关闭了一段时间(具体不详),后续接着摇菌过夜。离心时用的6000rpm,第二次离心时很快溶解,遂进行了第三次离心获取沉淀。配制冻存液忽视了甘油对氯化钙的稀释,用1.8ml50%的甘油加入4.2ml0.1mol/L的氯化钙,即氯化钙的浓度没有达到0.1mol/L。分装时每个EP管含有300μl的感受态细菌。】Ⅱ、重组载体质粒转化细菌及转化成功细菌(即转化子)的筛选准备:含筛选抗生素的固体培养基、冰、42℃水浴锅、37℃预热的培养基1、取100μl感受态细菌在冰上解冻,每管加质粒载体(体积≤10μl,DNA≤50ng),轻弹以混匀内容物,在冰中放置30min。2、将EP管放到预加温到42℃的循环水浴中的浮板上,放置90s~2min,不要摇动EP管。3、快速将EP管转移到冰浴上中,使细菌冷却1~2min4、每离心管加400μlLB培养基,事先用水浴将培养基加温到37℃,然后将管转移到37℃摇床上,温育45min至1H使细菌复苏,并且表达质粒编码的抗生素抗性标记基因。5、将适当体积(10μl??)已转化的感受态细菌涂布到含相应抗生素抗性(100μg/ml的终浓度)的LB固体培养基上旋转均匀涂布直至有发涩的感觉,即使平板干燥,然后倒置平皿,于37℃培养,12~16h后可出现菌落(或者将质粒涂布均匀后在37℃孵箱里先正放培养30min左右,再倒放培养)。【练手实验中转化VSVG质粒的平板长了2个菌落,而Δ8.2质粒的平板貌似没有菌落形成。分析原因排除了平板氨苄青霉素浓度(100μg/ml)太高,可能有两个原因:1、复苏的细菌浓度低,操作时将100μl感受态细菌加入了800μl的培养基摇菌,并且只摇菌40min;2、涂板时量太少,只加了20μl的复苏菌涂布。总的来说可能种在平板上的细菌太少。】Ⅲ、转化细菌的扩增:准备:LB培养基1、挑取以上培养的转化细菌的单菌落(1至数个)于2.5ml有氨苄抗生素的LB液体培养基里37℃220rpm摇菌12H(扩增细菌)2、将上一步摇的2.5ml细菌加入250ml抗性LB液体培养基(氨苄青霉素)里,37℃220rpm摇菌24H(扩增质粒)注:扩增的质粒不能立即提取时可将所有菌液转移至离心瓶里6000rpm离心收集细菌沉淀,然后-20℃保存。【此次提质粒的细菌连同LB培养基一起冻存了,应把离心弃去培养基后仅冻存沉淀】Ⅳ、重组载体质粒提取及纯化(《详见试剂盒质粒提取步骤》)1用15ml离心管收集1-5ml菌液。12,000rpm离心1min,弃上清。●根据所培养菌体的浓度与质粒的拷贝数,确定收集的菌液量。2加入250μl溶液Ⅰ/RNaseA混合液,漩涡剧烈振荡直至菌体完全重新悬浮。室温静置1-2min。3加入250μl溶液Ⅱ,轻柔地反复颠倒混匀5-6次。室温放置1-2min,使菌体充分裂解,直至形成澄清的裂解溶液。●不可剧烈混和,否则会使染色体DNA断裂。●此步骤不宜超过5min。4加入350μl溶液Ⅲ,立即轻柔地反复颠倒混匀5-6次。此时会出现白色絮状沉淀。512,000rpm室温离心10min,收集上清。6将上清置于DNA纯化柱中,静置1-2min。●如果收集的上清液过多,超过DNA纯化柱容积(800μl),可将上清分次加入DNA纯化柱中。712,000rpm离心1min,弃滤液。●此时质粒DNA被吸附于DNA纯化柱的硅胶膜上。8加入500μl溶液PB,12,000rpm离心1min,弃滤液。●此步骤的作用是将硅胶膜上吸附的蛋白、盐等杂质洗脱,以获得高质量质粒DNA。9加入500μl溶液W,12,000rpm离心1min,弃滤液。●溶液W初次使用前用无水乙醇按1:1.5稀释,即含60%乙醇。10加入500μl溶液W,12,000rpm离心1min,弃滤液。1112,000rpm离心3min,以彻底去除纯化柱中残留的液体。12将DNA纯化柱置于新的离心管中。向纯化柱中央处,悬空滴加50-100μl溶液Eluent,室温放置2min。●12,000rpm离心1min,管底即为高纯度质粒DNA。质粒DNA于-20℃保存●溶液Eluent可用无菌双蒸水代替,但其pH需为8.0-8.5。溶液Eluent的加入体积视质粒拷贝数多少、依质粒浓度要求而定。Ⅴ、重组载体质粒的浓度及纯度测定(紫外分光光度法):测OD260、OD280(先将DNA50倍稀释即2μlDNA加入98μl溶液Eluent中,然后加入比色皿检测)质粒浓度=50×OD260×n(50为每OD260值代表50μg/ml的双链DNA;OD260为260nm的吸光光度值;n为稀释倍数)质粒纯度=OD260/OD280(比值在1.8-2.0比较纯)【此次提的质粒稀释50倍后OD260为0.121、OD280为0.123;所以浓度为302.5ng/ul;质粒纯度OD260/OD280为0.983,考虑蛋白参入太多】Ⅵ、重组载体质粒的鉴定:方法1:双酶切→电泳(插入片段在2Kb以上时);直接DNA电泳可判断整个重组载体质粒是否正确。方法2:PCR(插入片段在2Kb以下时)→电泳方法3:送公司测序附:LB培养基将下列组分溶解在0.9L水中:蛋白胨10g酵母提取物5g氯化钠10g再补足水至1L。注:琼脂平板需添加琼脂粉12g/L,上层琼脂平板添加琼脂粉7g/L。氨苄青霉素(ampicillin)(100mg/ml)溶解1g氨苄青霉素钠盐于足量的水中,最后定容至10ml,浓度为100mg/ml。分装成小份于-20℃贮存。常以25ug/ml~50ug/ml(还是100μg?)的终浓度添加于生长培养基。重组载体质粒转化细菌方法2:电转化Ⅰ、电感受态细胞的制备第一天:1.将适合的冻存菌(DH5α)挑取一点加入盛有1mlLB液体培养基的15ml离心管中;37℃,220rpm,摇菌培养1个小时(复苏)。2、取10μl以下刚复苏的DH5α涂布于非抗性的LB固体培养基上37℃过夜培养。3.高温灭菌大的离心瓶(250-500ml)以备第二天摇瓶用4.准备几瓶灭菌水(总量约1.5升),保存于冷冻室中以备第二天重悬浮细胞用第二天:5、挑取单个前一天培养的细菌菌落加入3mlLB液体培养基里37℃,220rpm,摇菌培养12个小时。6.以1:100的比例取1ml菌液加入盛有100mlLB液体培养基的250ml摇瓶中37°C,220rpm,振摇2-3小时,定时监控OD.600值(培养1小时后每半小时测定一次)7.当O.D.600值达到0.3-0.4时,从摇床中取出摇瓶,置于冰上冷却15min至30min8.将100ml培养基转移至离心瓶中,4°C2500rpm下离心10min,弃上清液。9.加入几毫升灭菌冰水用涡旋仪或吸液管重悬浮细胞,然后加水至离心管的2/3体积稀释。10.4000rpm离心10分钟(还是2500rpm10min?),小心弃去上清液11.同步骤9用灭菌的冰水重悬浮细胞12.4000rpm离心10分钟,弃上清液13.用20ml灭菌的、冰冷后的10%甘油重悬浮细胞14.4000rpm离心10分钟,小心弃去上清液(甘油稀释的细菌离心后沉淀更松散,需小心弃液)15.用10%甘油重悬浮细胞至最终体积为2-3ml16.将细胞按100μl或200ul/管等份装入微量离心管,于-80°C保存。【可同时取100μl感受态细菌加0.01ngpuc18直接电穿孔转化,检测转化效率。次日观察转化子生长情况】Ⅱ、细胞转化1、事先用无水乙醇清洗浸泡在无水乙醇中的电击杯,于超净台吹干,将载体质粒(名称?)、800ul无抗生素LB和0.1CM的电击杯一起置于冰上预冷。2.在冰上解冻一管100μl的电感受态细胞,添加1-10μl载体质粒(体积?),冰上培育约5分钟。3.转移DNA/细胞混合物至冷却后的2mm电穿孔容器(无泡)中,混匀后转入电击杯中.轻轻敲击电极杯使混合物均匀进入电极杯的底部.4.加载P1000(移液器),准备好800μlLB5.对电穿孔容器进行脉冲(200欧姆,25μFd,2.5千伏)(检查时间常数,应该在3以上)6.按一下pulse键,听到蜂鸣声后,向电击杯中迅速加入800μl的LB液体培养基,重悬细胞后,转移到1.5ml的离心管中。7.37°C220rpm下培养细胞40分钟至1小时以复原8.5000rpm,5分钟,弃上清剩100ul,涂布到带有抗生素(氨苄青霉素?)的琼脂平板上,放于37℃过夜培养,次日查看转化结果.

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