华大基因HPV基因分型检测深圳华大基因研究院内容提要人类乳头瘤病毒(HPV)与宫颈癌我国宫颈癌的现状华大基因HPV基因分型检测服务华大基因简介华大基因简介华大基因华大基因是全球最大的基因研究中心,建立了大规模测序、生物信息、克隆、健康、能源、农业基因组等技术平台。华大基因已逐步将基因组领域的最新研究成果应用于临床,同时将最新的基因检测技术应用于分子诊断中。深圳华大基因研究院临床检验中心深圳华大基因临床检验中心成立于2007年,隶属于深圳华大基因健康事业部,同年获得《医疗机构执业许可证》。华大基因临床检验中心的临床基因扩增实验室于2008年成功获得卫生部临检中心的准入验收。华大基因临床检验中心为独立的第三方医学检测实验室,有出具医学检验报告资质。华大基因临检中心于2009年正式开展临床检测服务。人类乳头瘤病毒(HPV)与宫颈癌人类乳头瘤病毒(HumanPapillomaviruses,HPV)•双链DNA无包膜病毒–环状DNA,约8Kb;–病毒颗粒直径为50-55nm;–依靠宿主细胞进行复制、转录和翻译;–L1区是既保守又特异的区域,可作为HPV基因分型的目标区域。1995年IARC专题讨论会:高危型HPV持续感染是宫颈癌的主要病因。2008年:HaraldzurHausen因发现HPV和宫颈癌的关系而获得诺贝尔生理学或医学奖。宫颈癌是目前唯一病因明确,可以早发现、早预防的癌症。哪些型别属于高危型HPV?低危型:6、11、42、43、44、53、81高危型:16、18、26、31、33、35、39、45、51、52、53、56、58、59、66、68、73、82(2005年IARC专题讨论会)来自世界各国的宫颈癌组织标本研究发现,高危型HPV16、18型在宫颈癌患者中的感染率最高,约占64%。但是做HPV检测时,只检测16、18型是远远不够的,还有约36%的宫颈癌是由其他型别的HPV病毒引起的。基因检测早于细胞!高危型HPV的持续感染导致宫颈癌发生(能精确到DNA水平)基因水平检测方法(只能精确到细胞水平)HPV基因检测比传统的宫颈癌筛查方法更早发现宫颈癌前病变,可以起到预防的作用,这样有利于宫颈癌癌前病变的早发现、早诊断、早治疗。非分子水平检测方法HPV不同亚型感染与许多疾病具有相关性HPV亚型(高危型)临床病变16肛门生殖器疣、女阴上皮内瘤变、上皮内瘤变、CIN、宫颈癌18生殖器疣、CIN、宫颈癌31、35、45、52、56、58、66、68肛门生殖器疣、CIN、宫颈癌33CIN、女阴上皮内瘤变、宫颈癌39肛门生殖器疣、CIN、宫颈癌、鲍温样丘疹病51、59肛门生殖器疣HPV亚型(低危型)临床病变6、11尖锐湿疣我国宫颈癌的现状我国宫颈癌的现状•发病率世界第二8.414.92.47.70246810121416世界平均水平中国日本香港地区发病率(1/10万)我国宫颈癌的现状•发病率世界第二•发病率逐年升高024681012141619981999200020012002200320042005200620072008宫颈癌发病率1/10万)年份数据来源:《2009中国卫生统计年鉴》我国宫颈癌的现状•发病率世界第二•呈现年轻化趋势(资料来源:《中国预防医学杂志》)•发病率逐年升高0510152025199019921994199619982000200220042006年轻宫颈癌构成比(%)年份华大基因HPV基因分型检测服务目前常用的宫颈癌检测技术非分子水平检测方法基因水平检测方法醋酸白试验荧光PCR检测法阴道镜检测第二代杂交捕获法宫颈刮片细胞学检查分子导流杂交法宫颈和宫颈管活组织检查飞行时间质谱法基因水平检测不但可以对HPV病毒进行分型检测,而且还可以起到预防和警示作用,这样有利于HPV感染的早发现、早诊断、早处理。HPV基因分型检测的临床意义宫颈病变风险提示ASCUS和低度病变的分流术后随诊手段疫苗接种前的有效性指导降低筛查成本ThePCR-MSBaseMethodPCR技术:1993年诺贝尔化学奖飞行时间质谱技术:2002年诺贝尔化学奖华大基因HPV基因分型技术该检测方法的最大特点是将两种先进的检测技术整合起来,从而形成巨大的技术优势。MALDI-TOF-MS原理简介•MassARRAY平台的核心技术为MALDI-TOF-MS,即基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术。通过测定离子的质量电荷之比(M/Z)与离子的飞行时间成正比进行检测MALDI-TOF-MS准确特异性高于目前经典的检测方法灵敏能检测到的病原体最小拷贝数为10精确分型对全部14种高危HPV型别,及两种生殖道疣的主要致病病毒(6、11)的精确分型高通量、集成检测日检测量可达10000份样本科研服务可根据需求增加HPV检测型别,最多可以检测200多种亚型华大基因HPV基因检测特点现行HPV基因检测技术比较(基于真实临床样本检测数据)60%85%84%85%89%97%84%44%84%48%97%40%50%60%70%80%90%100%细胞学涂片线性杂交芯片杂交杂交捕获(HC-2)逆向斑点印迹杂交飞行时间质谱敏感性特异性N/AN/A:不可用成功案例参与了由深圳女医师协会发起,北大医院、美国克利夫兰临检中心联合开展的万人宫颈癌筛查项目。华大基因质谱技术获得了一致好评,被认为独具优势,值得大力推广。与北京肿瘤研究所合作并开展河南安阳地区食管HPV检测项目,累计进行了万余人份的筛查。服务内容:•HPVDNA检测主要用于妇科宫颈筛查,也可用于其他临床或者科研目的的人体样本检测•提供全部14种高危型HPV及两种生殖道疣的主要致病病毒(6、11)的精确分型检测服务•亦可根据临床需求增减检测型别•提供临检中心出具的检测报告接受样本类型:•TCT液基细胞学保存液保存的宫颈脱落细胞•宫颈脱落细胞样本(华大提供宫颈刷和细胞保存管)•活检组织样本•皮肤拭子,生殖道拭子等4647484550515249545753424344415556585960666768657071726974777362636461757678798086878885909192899497938283848195969899100678510111291417132341151618192016611GenitalWarts455152565859666826272825303132293437332223242135363839403133353918HighRiskOncogenic华大基因HPV基因分型检测服务•服务流程:临床样本接收→样本入库→PCR-PEX-MS分型检测→数据分析→临床检测报告•服务时间:珠三角地区从样本接受日到检测报告发出,仅需3个工作日(根据具体地域不同,服务时间稍有差异,详情请咨询客服。)