蛋白质相对分子质量的测定SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法【实验目的】•理解电泳法测定蛋白质分子量的原理。•掌握SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法的基本操作•学会绘制标准曲线。【实验原理】聚丙烯酰胺凝胶由丙烯酰胺(Acr)和N,N-甲叉双丙烯酰胺(Bis)聚合而成,是一种具有交叉网状结构的凝胶,可以产生分子筛效应,其孔径大小可以通过配置药品的浓度来控制,常用作电泳的载体。本实验利用了聚丙烯酰胺凝胶的电泳和分子筛双重作用。十二烷基硫酸钠(SDS)是一种阴离子表面活性剂,它的疏水端可以与蛋白质分子结合。绝大多数蛋白质与SDS结合的质量比为1.4:1,使蛋白质带上密度相同的负电荷,其电荷强度远远强于蛋白质原有的电荷,这就掩盖因为蛋白质种类不同而造成的电荷差异,使电泳的迁移率仅与蛋白质的分子量有关。因此,我们可以测定标准蛋白质的迁移率,通过标准蛋白质相对迁移率的对数对相对分子量作图,得到标准曲线,根据标准曲线计算出未知蛋白质的相对分子质量。本实验就是依据这个原理进行测定的。【实验器材】DYCZ-24D型垂直板电泳仪移液管若干100mL烧杯微量进样器细长头吸管【试剂配制】1.分离胶和浓缩胶试剂名称Acr/gBis/g1mol/L盐酸/mL三甲基氨基甲烷(Tris)/g定容体积/mL分离胶贮存液300.8100(棕色瓶,冰箱中保存)分离胶缓冲液4836.3100浓缩胶贮存液100.5100(棕色瓶,冰箱中保存)浓缩胶缓冲液485.98100【试剂配制】2.电泳缓冲液(Tris-甘氨酸缓冲液,pH=8.3):取Tris6.0g,甘氨酸28.8g,SDS1.0g,用去离子水溶解后定容至1L。3.样品溶解液(用于溶解标准蛋白质及样品蛋白质):取SDS0.1g,巯基乙醇0.1mL,甘油1.0mL,溴酚蓝28.8g,0.2mol/L磷酸缓冲液0.5mL,加重蒸馏水至10mL。4.染色液:0.25g考马斯亮蓝R-250,加入454mL50%甲醇溶液和46mL冰乙酸。5.脱色液:75mL冰乙酸,875mL水与50mL甲醇6.10%过硫酸钠、10%SDS、1%四甲基乙二胺(TEMED)【试剂配制】【实验材料及预处理】选用5种相对分子质量已知的蛋白质作为标准蛋白质:溶菌酶(Mr=14300)胰凝乳蛋白酶原(Mr=25000)胃蛋白酶(Mr=35000)卵清蛋白(Mr=43000)血清白蛋白(Mr=67000)可以配成单一标准蛋白质溶液,也可配制成混合蛋白质标准溶液。将标准蛋白质和待测蛋白质用样品溶解液溶解,使浓度为0.5mg/mL,沸水浴加热3min,冷却至室温备用。对以上标准蛋白质相对迁移率的测定,以相对迁移率的对数对标准蛋白质的相对分子质量作图,可得标准曲线,由标准曲线求出待测蛋白质的相对分子质量。【实验步骤及操作方法】1.安装垂直板电泳槽将密封胶条放在平直玻璃板上,将凹形玻璃板与平直玻璃板重叠。用手将两块玻璃板夹住,放入电泳槽内。用蒸馏水检漏【实验步骤及操作方法】2.凝胶制备(1)分离胶分离胶按下表加入试剂试剂体积操作分离胶贮存液5.0分离胶缓冲液2.510%SDS0.2去离子水10.21%TEMED2.0混匀10%过硫酸铵0.1置于磁力搅拌器中搅拌2min混合后的分离胶溶液,用细长头吸管加入玻璃板缝隙内,加胶高度距离样品模板梳齿下端约1cm,用吸管在凝胶表面轻轻加一层蒸馏水(约3-4cm),使凝胶隔绝空气,并保持胶面平整。等待分离胶凝固后,将水倒出并用滤纸吸干剩余的水。(2).浓缩胶浓缩胶按下表加入试剂试剂体积操作浓缩胶贮存液3.00浓缩胶缓冲液1.251%TEMED2.00去离子水4.6010%过硫酸铵0.05置于磁力搅拌器中搅拌2min用细长头习惯将分离胶溶液加入分离胶上方,距离段玻璃板上沿0.5cm处,然后轻轻加上模板梳,等待浓缩胶凝固后,小心取出模板梳,用手夹住两块玻璃板,取出胶室,去掉密封胶框,用1%电泳缓冲液琼脂胶密封底部,再将胶室放入电泳槽,然后加入电泳缓冲液,内槽加到凹口以上,外槽加到具平直玻璃板上沿3mm处。3.电泳用微量进样器取10-15μL样品,小心加入到凝胶凹槽内,待所有样品全部加完之后,打开电源开始电泳。电泳开始时,将电流调至10mA,待样品到达分离胶与浓缩胶交界时,将电流调整至20-30mA,当溴酚蓝迁移到分离胶底部时,可以关闭电源停止电泳。4.染色与脱色取出玻璃胶室,轻轻撬开玻璃板,取出凝胶。将凝胶转移到装有染色液的培养皿中,染色1h左右,然后取出,用蒸馏水漂洗凝胶,转入脱色液中脱色,同时放在摇床上震荡,期间更换3-4次脱色液,直到可以清晰的分辨蛋白质条带。5.结果处理)溴酚蓝移动距离()样品移动距离((相对迁移率)mmmmfR以标准蛋白质的相对迁移率的对数对相对分子质量作图,得到标准曲线,根据标准曲线求出待测蛋白质的相对分子质量【注意事项】•每次实验必须绘制标准曲线,不得使用上一次的标准曲线•处理好的蛋白质样品液如果长期存放,使用前应先在沸水浴中加热1min以除去亚稳态聚合。•若样品为溶液,则需要降样品溶解液浓度提高一倍,再与样品等体积混合。•在向玻璃缝隙中注胶时,应保持在一点加入,而加水时,要不断移动吸管。•进样时,要注意不要太快或将凹槽加的太满,防止样品溢出,对其他凹槽造成交叉污染。•Acr和Bis均为神经毒剂,甲醇也是剧毒物质,使用应注意安全【对实验的思考】•在配制样品溶解液时,加入巯基乙醇是为了将蛋白质中的二硫键破坏,使蛋白质更容易与SDS结合。•此实验时间较长,主要是由于染色脱色事件较长。由于SDS可以吸附考马斯亮蓝,染色前可用脱色液浸泡凝胶,洗去SDS,可缩短染色及脱色时间。