耳聋基因检测

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耳聋基因检测主要内容背景介绍耳聋基因检测的意义产品介绍案例分享2什么是耳聋?•听觉障碍,不能听到外界声响的表现,轻者听而不真,重者不闻外声。•WHO耳聋分级标准:4级别表现纯音听阈轻度聋近距离听一般谈话无困难26~40dB中度聋近距离听话感到困难41~60dB重度聋在耳边大声呼喊方能听到61~80dB全聋听不到耳边大声呼喊的声音超过80dB耳聋分类耳聋分为传导性耳聋、感音性耳聋、混合性耳聋耳聋的致病因素遗传因素;母亲怀孕期间的药物使用史;孕母宫内感染:如巨细胞病毒、疱疹、毒浆体原虫病;母亲的生产史;新生儿高胆红素血症;颅面部畸形;早产或体重低;各种后天因素,如外伤6我生育下一个孩子还会耳聋吗?7常染色体隐性遗传方式:有25%的几率生育聋儿。线粒体母系遗传:母系成员均会有聋病常染色体显性遗传:有50%的几率生育聋儿。背景介绍——耳聋发病情况•听力障碍的发病率:新生儿1‰;青年人1%;45-64岁人群14%;65-75岁为30%-60%;75岁以后达50%-70%存在不同程度的听力损失。•中国残疾人联合会公布:1987年的第一次全国残疾人抽样调查各类残疾人总数约为5164万,其中听力言语残疾为1770万人,占总残疾人总数的34.28%,是各类残疾的首位。2006年的第二次全国残疾人抽样调查,全国各类残疾人总数为8296万人,听力残疾2004万人占残疾人总数24.16%,位于第二位,仅次于肢体残疾。在对四岁及四岁以内的听力损失患儿病因进行分析时,遗传因素所占比例为71%,高于出生时新生儿听力损失中遗传因素占据了65%的病因NEnglJMed,2006.354:p.2151-2164.背景介绍——耳聋发病原因SLC26A43%GJB2基因21%综合征11%非综合征型30%其他环境因素14%临床明确的感染因素10%临床不明确的感染因素11%出生时发病率(186/100,000)SLC26A412%迟发型听力损失10%GJB2突变15%综合征型11%非综合征型22%线粒体mtDNA1555G1%其他环境因素14%临床确定的感染因素7%临床不确定的感染因素8%4岁时的发病率(270/100,000)背景介绍——流行病学的警示意义确立了中国聋哑人群常见的3个易感基因及突变热点药物敏感性耳聋(mtDNA1555AG):占我国2780万听力残疾者的5-12%,意味着139-333万人可以通过用药警示而避免致聋。先天性重度耳聋(GJB2):占听力残疾者的20%,意味着556万人可以明确病因,早期发现,早期干预,聋而不“哑”。大前庭水管综合征(SLC26A4):占听力残疾者的16%,意味着445万人通过早期发现可以避免永久性听力损失。背景介绍——干预措施助听器:纯音测听,阈值在40~90dB(中度~重度耳聋)都应建议配用。人工耳蜗移植目前对于感音神经性重度耳聋的有效治疗方法-人工耳蜗植入手术,20万元/只适应症:1)先天性双耳重度-极重度感音性耳聋;耳蜗移植的最佳时间是:2岁以内(AudiolNeurootol.2004Jul-Aug;9(4):224-33)。2)语后聋及成年患者有基本语言识别能力及辨音能力且佩戴助听器无效者。耳聋基因检测意义•节省财政支出•提高出生缺陷防治水平;同时推进计生、卫生服务水平•分析耳聋基因在当地的流行病学分布•发现的药物敏感性耳聋和迟发性耳聋的个体提高诊断效率,减少漏诊率•指导婚育。实现优生优育•早发现、早干预,实现聋而不哑产品汇总4个基因20个位点非综合征型耳聋基因检测-51单个耳聋基因sanger全测序遗传性听力损失基因检测-127三个耳聋基因高通量测序四个基因20个位点-飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术原理BaseMolecularWeightA313.21C289.18G329.21T304.19CddATPddCTPddGTPddTTPG单碱基延伸技术(iPLEX™)检测位点多:可同时检测20个基因位点;灵敏度高:能分辨质量差别为1Da的分子;准确率高:99%;通量大:每天可检测3000份以上;自动化程度高:检测数据自动分析;检测周期短:收到样本后5个工作日可出报告。技术特点检测基因及位点突变基因GJB2SLC26A4(PDS)12SrRNAGJB3突变位点35delG、167delT、176-191del16、299_300delAT、235delC281CT、589GA、IVS7-2AG、1174AT、1226GA、1229CT、1975GC、2027TA、2162CT、2168AG、IVS15+5GA1494CT1555AG538CT547GA染色体13q11-127q31mtDNA1p33-p35表达蛋白缝隙连接蛋白Connexin26多次跨膜蛋白Pendrin线粒体功能损失缝隙连接蛋白Connexin31临床表现常染色体隐性遗传。变异较大,可由轻度到极重度,但多数为重度或极重度耳聋常染色体隐性遗传。先天性或后天性耳聋,耳聋发生或加重与外伤、感冒有关氨基糖甙类药物性致聋,无法逆反常染色体显性遗传。我国本土克隆和鉴定的第一个耳聋致病基因适用人群新生儿婚前、孕前和产前人群各种原因不明的耳聋,包括先天性聋和后天性聋人群听力正常,但有耳聋家族史的人群受检人群检测医院初筛TEOAE/DPOAE结果不通过结果通过复筛(TEOAE/DPOAE)+AABR/ABR阈值)筛选听力异常知情同意、自愿选择采取最少3个采血斑自愿选择,知情同意临床检验中心耳聋基因检测出具检测报告检测结果正常检测结果为杂合突变或纯合突变随访检测医院确诊出具确诊报告确诊结果为突变确诊结果正常干预追踪随访基因检测流程5个工作日听力及基因联合筛查的临床实施模式51个基因+2个位点PCR、第一代测序目标区域捕获、第二代高通量测序适用范围:1)基因诊断:对于临床表型难以确诊的病例给予分子水平的鉴别诊断;2)携带者筛查:对于无临床表型的致病突变携带者进行基因筛查;检测周期:35工作日检测流程医院就诊样本采集DNA提取文库制备高通量测序数据分析亲属验证发送报告检测周期:35个工作日检测基因/位点疾病基因非综合征型耳聋ACTG1,CCDC50,CDH23,CLDN14,COCH,DFNB31,DFNA5,DFNB59,DIAPH1,ESPN,ESRRB,EYA4,GJB2,GJB3,GJB6,GRHL2,GRXCR1,HGF,KCNQ4,LHFPL5,LOXHD1,LRTOMT,MARVELD2,MIR96,MYH14,MYH9,MYO15A,MYO1A,MYO3A,MYO6,MYO7A,OTOA,OTOF,PCDH15,POU3F4,POU4F3,PRPS1,RDX,SIX1,SLC17A8,SLC26A4,SLC26A5,STRC,TECTA,TMC1,TMIE,TMPRSS3,TPRN,TRIOBP,USH1C,WFS1,m.1555AG,m.1494CT综合征型耳聋基因Waardenburg(瓦登伯格)综合征EDN3,EDNRB,MITF,PAX3,SNAI2,SOX10遗传性共济失调性多发性神经炎样病(Refsum综合征)PEX1,PEX2,PEX26尤塞氏综合征(Ushersyndrome)CDH23,CLRN1,GPR98,USH2AMohr-Tranebjaerg综合征TIMM8A特雷彻-柯林斯综合征(TreacherCollinssyndrome)TCOF1Alport综合征(遗传性肾炎)COL4A3,COL4A4,COL4A5Wolfram综合征1型WFS1单个耳聋基因全测序检测基因GJB2GJB3SLC26A4测序采用sanger法,在以下情况可建议进行单个基因全测序1)耳聋患者检测某个耳聋基因杂合子突变,为明确病因做该基因的全测序2)若胎儿母亲为某个耳聋基因的携带者,为了评估胎儿患有耳聋的风险,对父亲做该耳聋基因的全测序。遗传因素的具体分析先天性耳聋(1/1000~3/1000)遗传因素(65%)综合征型(SHL)(30%)非综合征型(NSHL)(70%)常染色体隐性(75~85%)GJB2/DFNB1(50%)其他DFNB(50%)常染色体显性(15~24%)X-连锁(1~2%)非遗传因素(35%)遗传性耳聋基因检测内容疾病分类疾病中类基因数目非综合征型(72个基因)常染色体隐性45常染色体显性28X-连锁3大前庭水管综合征3听神经病4综合征型(66个基因)伴外耳畸形11伴眼病17伴代谢性疾病2伴肌肉骨骼异常10伴泌尿生殖疾病6伴内分泌疾病3伴皮肤疾病6伴神经病变2伴心脏缺陷4线粒体遗传性听力损失-5技术简介:采用新一代高通量测序技术,对受检者的耳聋相关基因区域进行检测和分析。目标区域捕获测序遗传性耳聋基因检测技术检测时间:35个工作日(7周)检测样本:全血:5ml,EDTA抗凝(紫盖);DNA:6ug,OD在1.7-2.0,未降解运输条件:冰袋+干冰运输检测结果:形成报告文件27样本处理样本检测数据分析报告发送血样接收解读咨询服务流程适用条件主要适用于以下情况:1:通过热点突变检测未能发现致病原因的耳聋患者2:非综合征型耳聋,无法确定致病基因及遗传方式的3:综合征型耳聋患者4:存在耳聋家族史的人群筛查案例一家9口人,6人是耳聋佛山家系为3代遗传的耳聋家系,现有家系成员9人,其中6名为耳聋患者,除由于婚姻关系成为该家系成员的2名耳聋患者外,剩余的4名患者均为母系家庭成员。家系基因30外婆同质突变外公正常姨妈同质突变祖父杂合突变祖母杂合突变叔叔纯和突变女:1555A纯和235delc杂合12SrRNAA1555GGJB2235delc母亲重聋同质突变父亲重聋纯和突变启示非常值得警惕的是:这个孩子通过了听力筛查,如果没有做基因筛查,一旦误用了氨基糖苷类药物将一针致聋,导致严重后果31临床案例患儿杜某,女,11岁;自述4岁左右,“感冒”后出现耳聋症状;临床诊断:大前庭水管综合征;否认孕期病毒感染及耳聋家族史;检测结果:患儿:SLC26A4基因1174AT+2168AG复合突变;患儿父亲:SLC26A4基因1174AT杂合突变;患儿母亲:SLC26A4基因2168AG杂合突变。临床案例患儿父亲AT患儿患儿母亲SLC26A4基因1174AT杂合突变SLC26A4基因2168AG杂合突变AGATAGSLC26A4基因1174AT+2168AG复合突变指导婚育案例?客户为待孕女士,与前夫生了一个耳聋孩子,组成新的家庭后担心是否还会生一个耳聋的孩子,特来做孕前基因诊断

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