遗传性肿瘤科室会v1.1

二代测序助力遗传性肿瘤精准医学胡元华大基因肿瘤产品部Cancerisageneticdisease—thatis,canceriscausedbycertainchangestogenesthatcontrolthewayourcellsfunction,especiallyhowtheygrowanddivide.《NCI-TheGeneticsofCancer》癌症是一种基因病·除遗传性肿瘤，所有恶性肿瘤（癌症）的发生都是体细胞基因突变导致的。·在人的一生中，肿瘤细胞是通过一系列进行性的改变而逐渐变成恶性的。Genetics,GenomicsandCancerRiskAssessment:Stateoftheartandfuturedirectionsintheeraofpersonalizedmedicine人类基因研究史肿瘤也会遗传吗？各类肿瘤中遗传性肿瘤的占比AACRcancerprogressreport2015肿瘤的治疗效果与发现时期有关癌症防控：早发现早诊断早治疗Ref：WHOworldcancerreport世界卫生组织（WHO）-“抗击癌症重在预防！”1/3的癌症可以预防1/3的癌症可以根治1/3的经过治疗可以长期生存检测肿瘤易感基因找出可以预防的肿瘤疫苗（宫颈癌疫苗，乙肝疫苗）生物制剂（胸腺肽、卡介菌多糖）自检血清学（CEA、CA199）影像学（X片、B超、CT）内窥镜（胃肠镜）病理诊断手术放疗化疗靶向治疗血清学（CEA、CA199）影像学（X片、B超、CT）内窥镜（胃肠镜）传统方法遗传性肿瘤基因检测基因科技根据肿瘤基因变异及免疫组库情况，进行病情监测并及时调整治疗方案无创肿瘤早早筛基于基因突变的精准检测及个体化用药方案1预防4监测2早诊3诊疗基因科技助力肿瘤精准预防1预防4监测2早诊3诊疗临床基因检测的方法聚合酶链式反应(PCR：qPCR，dPCR，ARMS,……)荧光原位杂交技术(FISH)一代测序（Sangersequencing）二代测序（Next-generationsequencing）如果将人生比作一本自传，那么不同的基因检测方法，就像不同的检索方式，以此探索生命的密码。•位点检测是在目录中检索某个关键词•基因芯片是在全书中检索某个关键词•二代测序是在全书中检索所有关键词临床基因检测方法的差别肿瘤有遗传性和散发性之分美国癌症学会（）BrozekIetal.JApplGenet2009;50(4):379–384‘第一次打击’是胚系突变所有体细胞均成为杂合BRCA‘第二次打击’是肿瘤细胞的突变导致细胞失去杂合性所有体细胞均为野生型仅病灶处肿瘤细胞突变遗传性肿瘤5-10%散发性肿瘤90-95%家族性肿瘤与生俱来（胚系突变）VS与时俱进（体细胞突变）由于遗传性原因导致的染色体和基因异常，特别是常染色体及其上的基因，而使患某些肿瘤的机会大大增加，病理学上称之为遗传性肿瘤综合征家族性/遗传性肿瘤人群特征·仅用于初步判断人群是否具有家族性/遗传性肿瘤的特征。·各种遗传性肿瘤高危筛查人群的判断需综合临床表现和权威指南的标准进行。遗传性乳腺癌卵巢癌综合征遗传性乳腺癌/卵巢癌相关基因在乳腺癌人群中的检出情况由于遗传性原因导致的染色体和基因异常，特别是常染色体及其上的基因，而使患某些肿瘤的机会大大增加，病理学上称之为遗传性肿瘤综合征。Nilsetal.DtschArztebl2008;105(41):706–14遗传风险评估：基因检测遗传易感基因与乳腺癌/卵巢癌发病风险乳腺癌44%-78%卵巢癌18%-54%BalmañaJ,etal.AnnOncol2011;22(suppl.6);v131-vi34乳腺癌(31%-56%)卵巢癌(2%-19%)BRCA1突变BRCA2突变BRCA1BRCA2BRCA1——定位于17q21，约100kb，含有24个外显子，其中第1、4号外显子不编码氨基酸，另外22个转录出7.6kbmRNA，最终可编码含1863个氨基酸的蛋白质。而第11号外显子较大，长3.4kb。已报道其突变位点多于1785个BRCA2——定位在13q12-13，有27个外显子,仅编码区就有11.4K。其中11号外显子几乎含编码序列的一半，完整的BRCA2编码3418个氨基酸的蛋白质。已报道其突变位点多于2011个参考数据库：基因没有热点突变遗传性乳腺癌/卵巢癌CACancerJClin2014;64:52-62.遗传性乳腺癌发病年龄较散发性乳腺癌发病年龄低随着时间的发展，乳腺癌的死亡率逐渐下降50岁以上的人群，因为乳腺癌筛查技术的完善有效降低浸润性乳腺癌发病率50岁以下人群发病率无明显变化，死亡率下降缓慢乳腺癌筛查有效降低浸润性乳腺癌发病率，基因检测是否可以降低遗传性乳腺癌发病率？测位点还是测基因外显子？BRCA1基因共5592bp，外显子+内含子共81189bp，其中2600+位点的变异可导致乳腺癌/卵巢癌风险上升。ResearchThemesofHKUDepartmentofSurgery遗传性乳腺癌/卵巢癌基因检测检测基因检测周期遗传性乳腺癌/卵巢癌（21个基因）BRCA1、BRCA2、CHEK2、PALB2、BRIP1、TP53、PTEN、STK11、CDH1、ATM、BARD1、MLH1、MRE11A、MSH2、MSH6、MUTYH、NBN、PMS1、PMS2、RAD50、RAD51C20天遗传性乳腺癌/卵巢癌（2个基因）BRCA1、BRCA220天检测优势科学可检测遗传性结直肠癌的14个易感基因，结合亚洲人群遗传数据库及华大本地12000例样本数据库，综合评估肿瘤风险精准标准化的实验操作工序和数据分析流程，直击突变基因，准确率达99.9%全面目标基因外显子区域捕获测序，全面覆盖，查找突变基因便捷仅需提供5mL外周血或2mL唾液即可完成检测遗传性乳腺癌/卵巢癌基因检测检测基因检测周期遗传性乳腺癌/卵巢癌（21个基因）BRCA1、BRCA2、CHEK2、PALB2、BRIP1、TP53、PTEN、STK11、CDH1、ATM、BARD1、MLH1、MRE11A、MSH2、MSH6、MUTYH、NBN、PMS1、PMS2、RAD50、RAD51C20天遗传性乳腺癌/卵巢癌（2个基因）BRCA1、BRCA220天检测优势科学可检测遗传性结直肠癌的14个易感基因，结合亚洲人群遗传数据库及华大本地12000例样本数据库，综合评估肿瘤风险精准标准化的实验操作工序和数据分析流程，直击突变基因，准确率达99.9%全面目标基因外显子区域捕获测序，全面覆盖，查找突变基因便捷仅需提供5mL外周血或2mL唾液即可完成检测遗传性结直肠癌KennethWKinzler1,etal,Cell,1996.遗传性结直肠癌相关综合征遗传症致病基因遗传特点一生的患癌几率%遗传性非息肉病性结直肠癌(LynchSyndrome/HNPCC)mismatchrepair(MMR)相关基因生殖系突变：MSH2,MLH1,MSH6,PMS2常染色体显性遗传结肠癌50-80家族性腺瘤性息肉病(FAP)APC基因生殖系突变常染色体显性遗传结肠癌100MUTYH相关性息肉病(MAP)MUTYH生殖系双等位基因突变常染色体隐性遗传结肠癌80错构瘤息肉综合征(Hamartomatouspolyposissyndromes)幼年性息肉病综合征(Juvenilepolyposissyndrome)SMAD4orBMPR1A基因生殖系突变常染色体显性遗传结肠癌39Peutz-Jeghers综合征STK11基因生殖系突变常染色体显性遗传结肠癌39遗传性结直肠癌基因检测检测基因检测周期遗传性结直肠癌APC,AXIN2,EPCAM,MLH1,MLH3,MSH2,MSH6,MUTYH,PMS1,PMS2,STK11,PTEN,SMAD4,BMPR1A20天检测优势科学可检测遗传性结直肠癌的14个易感基因，结合亚洲人群遗传数据库及华大本地12000例样本数据库，综合评估肿瘤风险精准标准化的实验操作工序和数据分析流程，直击突变基因，准确率达99.9%全面目标基因外显子区域捕获测序，全面覆盖，查找突变基因便捷仅需提供5mL外周血或2mL唾液即可完成检测APC基因突变的致病风险癌症类型年龄（岁）患癌风险普通人群风险小肠癌到80岁4%-12%0.2%结直肠癌AFAP:到80岁70%3.4%FAP:到21岁7%0.01%FAP:到50岁93%0.3%FAP:到80岁99%3.4%其他硬纤维瘤到80岁10%-30%0.04%胃癌到80岁风险升高0.6%甲状腺癌到80岁1%-2%1%胰腺癌到80岁风险升高1%肝母细胞瘤到5岁1.6%0.001%中枢神经系统癌到80岁1%0.5%APC基因突变的风险管理癌症类型风险管理措施起始年龄频率小肠癌上消化道内镜检查，考虑MRI或者CT25-30岁或根据个体情况每4年一次结直肠癌乙状结肠镜或结肠镜检查10-15岁每年一次考虑药物预防（如非甾体类消炎药）根据个体情况-考虑结直肠预防性手术根据腺瘤的分布和密度情况-其他硬纤维瘤MRI或者CT结肠手术后1-3年每5-10年一次胃癌上消化道内镜检查根据个体情况每3-5年一次甲状腺癌甲状腺检查或超声18-19岁每年一次胰腺癌胰腺癌筛查MRCP（磁共振胰胆管造影）和EUS（超声内镜）根据个体情况-肝母细胞瘤肝脏触诊婴儿期每3-6个月一次中枢神经系统癌考虑CT、MRI等检查中枢神经系统根据个体情况不定遗传性肾癌遗传综合症致病基因遗传特点遗传性乳头状肾癌（HPRC）Metproto-oncogene(MET)常染色体显性Birt–Hogg–Dube综合征（BHD）Folliculin(FLCN)常染色体显性遗传性平滑肌瘤/肾细胞癌（HLRCC）Fumaratedehydratase(FH)常染色体显性VonHippel–Lindau综合征（VHL）VHLgene(VHL)常染色体显性遗传性前列腺癌JohnsLEetal.BJUInt2003;91:789–94.先证者为一级亲属患癌风险先证者为兄弟患癌风险先证者为父亲患癌风险家族性遗传性BRCA1/BRCA2表达对不同肿瘤发病风险的影响为您的健康保驾护航-华大基因遗传性肿瘤基因检测产品肿瘤风险早检测，未病先防保健康！一次检测，指导一生预防！检测项目检测基因检测周期遗传性胃癌CDH1,MLH1,MSH2,MSH6,PMS2,EPCAM20天遗传性肾癌VHL,MET,FH,FLCN20天遗传性前列腺癌BRCA1，BRCA2,CHEK220天遗传性多发性内分泌腺瘤MEN1,RET,CDKN1B20天遗传性甲状腺癌RET,NTRK120天遗传性甲状旁腺癌CDC73,MEN120天遗传性多发性神经纤维瘤NF1,NF220天遗传性嗜铬细胞瘤SDHAF2,SDHB,SDHC,SDHD,RET,VHL,MAX,NF1，TMEM12720天遗传性家族性副神经节瘤SDHB,SDHC，SDHD，SDHAF2，VHL20天遗传性视网膜细胞瘤RB120天遗传性黑色素瘤CDKN2A,CDK420天遗传性多发性软骨肉瘤EXT1,EXT220天遗传性胰腺癌BRCA2，PALB220天遗传性子宫内膜癌MLH1,MSH2,MSH6,PMS2,EPCAM20天华大基因遗传性肿瘤检测覆盖范围及送样比例乳腺癌58%结直肠癌26%副神经节瘤1%胃癌1%多发性神经纤维瘤1%嗜铬细胞瘤8%视网膜母细胞瘤2%甲状腺癌1%前列腺癌1%肾癌1%华大基因遗传性肿瘤基因检测阳性率00.050.10.150.20.25为您的健康保驾