Omnic软件使用指南

Omnic软件使用指南一．Omnic与系统Omnic是Nicolet公司的在PC机使用最广泛的窗口软件平台上运行的红外软件，从开始在Windows3.1上运行的版本的1.0到目前的6.1a，现行的的操作系统Windows98/Me/NT/2000/XP都支持。EZ-Omnic是简化的软件，一方面价格比较低，同时更加简明，容易掌握，虽然功能比较简单，仍可以满足目前部分用户的需求。使用的仪器通讯接口有：LTP(并行口)或PCI卡，部分早一些的仪器使用ISA卡。二．文件结构Omnic6.0以上版本的缺省的文件分别存在于三个目录中：C:\MyDocuments\Omnic，在其子目录中分门别类地存放数据与参数等文件，如Spectra存光谱，Param中存设置参数，Quant存定量方法；C:\ProgramFiles\Omnic，存有驱动与程序文件等，系统的卸载命令在它的子目录Uninstall中；C:\MyDocument\Omnic\Lib，存放谱库，包括购买和自建的谱库。软件安装的应用程序除了Omnic外还有BenchDiagnostics，这是一个在系统发生故障时进行判断的重要命令，能够检查从接口卡到仪器的各个重要部件。它们与PDF文件一起置于ThermoNicolet程序组中。三．启动Omnic软件使用下列方法之一启动Omnic红外软件系统：1．在Windows98等的桌面上双击（或者）2．从Srart→Program→ThermoNicolet→Omnic(或者从Srart→Program→Omnic5.0→)3．其他，如Win98中的快捷方式启动。四．Omnic显示面板：1．Omnic是一种与窗口软件充分兼容的软件，可以显示一个或多个显示窗口，当显示多个窗口时可以选择平铺（Tile）或层迭（Cascade）方式，但其中只有一个是活动窗口（被选中的）。光谱图可以在窗口间拖动、复制与粘贴，而且可以把复制的光谱图直接粘贴到其他应用程序的文本文件中，为发表文章或书写报告带来方便。2．在每个显示窗口中，可以显示一个到多个光谱图，最后加入的光谱是自动被选中的，缺省颜色是红色。有些对光谱进行进一步处理时需要或可以同时处理多个光谱。需要有多个被选中的光谱时，通过按住Ctrl或Shift键操作鼠标来增减被选中光谱。3.标题框在光谱窗口的上面，标题内容为人工输入，或根据使用的需要，通过“选项”中所设定的方式中适当选择自动生成。4．按“信息按钮”或双击“标题框”中的标题，打开“选中”光谱的采集和数据处理记录的窗口，在其中的注释（Comment）等若干框中，可以输入文字信息，这些信息可以随同谱图一起打印，其它的记录为非编辑内容。5．当显示多个光谱图时，按“标题框”右边的箭头，显示出所有谱图的标题表。用鼠标击标题表（选中）后，用键盘上的箭头键可以改变被选中的光谱，同时可以编辑被选中的光谱的标题。按住Ctrl或Shift对标题表或窗口中的光谱点击鼠标左键，可以增加或减少一个或多个被选中的光谱。6．图标工具是用来定义鼠标功能的：选择，范围，坐标，峰高，峰面积，标注。7．“取景窗”中显示有完整的光谱图（被选中的），并指明光谱在窗口中的显示范围。通过鼠标及与的联合使用，可以改变光谱在窗格中光谱的水平方向显示区间，另外Omnic软件还有几种调整显示范围的方法。8．快捷工具图标的使用使操作更为便捷。五．数据采集设置从Collect下选ExperimentSetup，就打开了它的窗口，从中选择与采集有关的条件和参数。也可以调用现有的参数组文件(.exp)或保存调整选择好的条件。1.Collect选项卡中可以选择：扫描次数NumberofScans分辨率Resolution光谱格式FinalFormat矫正Correction文件管理FileHandling背景管理BackgroundHandling环境干扰补偿AutomaticAtmosphericSuppresion光谱预览PreviewDataCollection，在采集光谱之前需要核实或调整样品时选用，这一功能对于显微及某些附件应用时非常有效。2.Bench选项卡，从中可以检查红外干涉信号强度并包括：增益Gain，调整红外干涉信号强度，一般将Max调到2~8V速度Velocity，取决于检测器和应用（速度及响应）光阑Aperture，取决于光谱分辨率、光强的调整（也可以使用衰减屏）光谱范围SpectralRange，可根据需要变更样品位置SampleCompartment，对于红外的系统，在指定它后，一系列其它参数均可由软件自动配套完成设置。3.Quality选项卡，通过适当设定需要检查的各个因素及其程度等，系统在采集过程中即时指示并记录相关因素的状态，用于保证光谱质量。使用时注意，因素及其（量化）程度选择必须适当，否则软件不能提供正确的提示。UseSpectralQualityChecks决定是否使用此项功能。4.Advanced选项卡中的参数选择中：ZeroFilling用以改善谱图曲线的连续性。Apodization变迹(切趾)函数，在分辨率与信躁比之间权衡。其中Boxcar应用于高分辨率，Blackman-Harris应用于高信躁比，而Happ-Genzel最常用，它兼顾了信躁比和分辨率。SampleSpacing采样间隔，1自15798CM-1始，2自7899CM-1始，4从3949CM-1始记录光谱数据。PhaseCorrection相位矫正。Low(High)PassFilter低(高)通滤波器转折频率。5.Diagnostic选项卡：电源,氦氖激光器,红外光源,电子部件,分束片与检测器。上面五个是诊断图标，被点击时显示出相应信息，但没有BenchDiagnostic中给出的充分，其中的“a)当Viewreferencedetector被选时，窗口中的红外干涉图就被参考检测器的干涉信号取代，其强度一般在1~2V以上。此信号用于干涉图峰位控制、Nexus中的湿度检查和IR检测器的故障判断。Align,对干涉仪进行自动准直，将仪器调整并保持运行在最佳状态。需人工调整干涉仪的系统，如G系列和大部分Impact，没有此项功能。c)ResetBench,光学台重置（复位）。d)VerifySmartAccessory,有E.S.P.功能的系统中，对智能附件进行确认（识别）。e)ConfigureBench,光学台系统设置，输入光源、分束器、检测器和与计算机通讯的地址参数等。对有E.S.P.功能的系统软件会自动设置，一般不需要人为调整，除非有特殊用户元件。f)CheckDesiccant,干燥状态检查(Nexus系列)。根据结果，决定干燥剂需要更换与否。在Omnic软件中（不含EZ），使用MatchSpectrumSetting，按选定光谱图的实验条件设置有关数据采集的所有参数，确保光谱的可比性。SpectralQualityReference用来评价仪器状态。六．背景与样品数据文件的采集根据上面的顺序，用CollectBackground和CollectSample的指令进行数据采集。在背景管理BackgroundHandling中选择前两项之一时，背景要按照所提示的顺序采集。选择第三项时，后面输入的数值就是设定的背景有效使用分钟数，到时候软件会提示需要重新采集背景。七．显示、打印与存盘1．选择光谱：采集好的光谱可以以重迭(Overlay)或分层(Stack)的方式显示到指定的窗格中。最后加入或被点击的光谱图是红色，即“选中的”。2．显示范围（坐标）：其大小可以通过a)DisplayLimits输入数值，b)拖动鼠标，c)取景窗(X轴)，d)View菜单中Full,Common,Match，Offset-Scale(Y轴)，e)Roll/ZoomWindow工具等等来调整。3．使用FindPeaks或标峰位置，用“图标工具”进行峰高、峰面积测量与标注等等操作。4．通过打开(Open)、剪切(Cut)、删除(Clear)、拷贝(Copy)、粘贴(Paste)、保存光谱图(Save,SaveAs)和保存光谱图组(SaveGroup)进行文件管理。5．显示设置(DisplaySetup)：a)显示项目，b）注释方式及项目，c)X轴格式，是否对低波数范围扩展或者以波长为单位，d)分层(Stack)显示光谱的个数，e)所要显示有关采样信息的选项。6．打印：a)按照显示直接打印，b)按照报告模板(ReportTemplate)打印。显示与打印的有关系统设置在Edit→Option中选择。八．数据的分析处理1．转换：透过(Transmittance)与吸收(Absorbance)之间的转换。OtherConversions其它转换，包括漫反射、光声光谱、反射率的对数和X轴的波数/波长转换。2．数据处理Reprocess再处理，须存有干涉图、单光束光谱图。BaselineCorrect/Automatic~基线校正/自动基线校正：基线校正须对吸收图操作，自动基线校正对于基线不是简单倾斜的图的校正结果较差。OtherCorrections其它校正，包括：K-K、ATR.、H2O和CO2校正。Blank/StraightLine使空白/直线生成Subtract差谱FourierSelf-Deconvolution自去卷积，以改善峰重迭Smooth/Automatic~平滑/自动平滑，以压缩噪声，但分辨率会有不同程度下降ChangeDataSpacing改变数据点的间隔，用以不同分辨率间的比较和处理Derivative导数光谱SpectralMath数学运算Multiply乘(某一系数)Add相加(两个光谱)NormalizeFrequency频率标准化NormalizeScaleY坐标标准化FindPeaks峰查找，点击鼠标设定阈值，灵敏度则与标峰多少有关。3．Analyze分析Noise噪声水平测量Average平均值测量StatisticalSpectra统计光谱，取得多个光谱的平均值与偏差LibrarySetup谱库设置，选择谱库路径/谱库，建立谱库组，选择检索类型、内容、定义光谱检索范围、结果保留及显示的个数。Search光谱检索，在LibrarySetup中选择的算法有：专家检索或相关值、绝对值、平方、导数和平方导数。IRSpectralInterpretation光谱解析点击下的就会出现右边的窗口，解释可能的对应结构信息。QCCompareQC比对，通过将样品图与QC库中标准品图比较并以数字形式的结果说明它们的一致性，用于从原材料到产品的分级分类、品质鉴定，达到量化的质量控制要求。比对的光谱范围取决于三个因素：a)显示的范围，b)QCLibrary光谱范围，c)LibrarySetup中定义的光谱范围。LibraryManager谱库管理，查看谱库信息，建立和删除谱库等在EZOmnic系统中，没有LibraryManager，代之以CreateLibrary和ViewLibrary。九.报告（Report）Report是Omnic软件特有的一种数据输出形式。通过模板(Template)的选用和编辑，使用者可以以各种形式打印、存储报告。报告存储在Notebook中，以便用各方面信息进行查询(检索)。Template调用、编辑模板和新模板创建。Preview/PrintReport预览、打印报告或另选模版。NewNotebook新建Notebook。AddtoNotebook将报告加入Notebook。ViewNotebook查询、浏览和打印Notebook和在Notebook中检索某些相关信息。十．窗口(Window)选择窗口及其排列，建立新的窗口。NewWindow建新窗口。TileWindows窗口平铺。CascadeWindows窗口层迭。十一．帮助(Help)Omnic软件的功能丰富多样，使用过程中，单击鼠标右键或按F1键等启动灵活的在线帮助。在帮助菜单中提供大量的系统的信息，有仪器整